Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,417,332:1 | +A | 5.6% | coding (580/759 nt) | PP_1239 → | metallo‑beta‑lactamase family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,417,332 | 1 | . | A | 5.6% | 291.7 / 10.8 | 72 | coding (580/759 nt) | PP_1239 | metallo‑beta‑lactamase family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (33/35); new base A (2/2); total (35/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.01e-01 |
GCTGTTGCTGGAGCGTTACCAGGGCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCTTTGTCGACACCCTCGGGTGTGACCCGGACTGGCTCCAGGTGGCGAATCA > NC_002947/1417184‑1417477 | gcTGTTGCTGGAGCGTTACCAGGGCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGACTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTgcgc > 2:175504/1‑149 (MQ=255) cTGGAGCGTTACCAGGGCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCATGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTgg < 2:989/148‑1 (MQ=255) cTGGAGCGTTACCAGGGCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTgg < 2:309280/148‑1 (MQ=255) cTGGAGCGTTACCAGGGCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTgg < 7:45293/148‑1 (MQ=255) tGGAGCGTTACCAGGGCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTg > 5:166402/1‑149 (MQ=255) gAGCGTTACCAGGGCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCT‑GCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑Ac > 3:131234/1‑149 (MQ=255) agtgTTACCAGGGCCTGGATGCAGTGCTGATCGAGGCTAACCACTTTCGCGACGTGGTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAATCAGCGTGTGGGTGGCATGCAAGGTGATTTGAACATCCTCGAGGGTGCGC‑GCCTGGTT‑C‑Ac < 4:118380/146‑1 (MQ=255) tACCAGGGCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGtt > 8:35774/1‑149 (MQ=255) aCCAGGGCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGtt < 8:224592/148‑1 (MQ=255) aCCAGGGCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTg > 6:211042/1‑149 (MQ=255) ccAGGGCCTGGATGCACTGCTTATAGAGGCTAACCAATGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCAGTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGtttg < 8:291942/149‑3 (MQ=255) ccAGGGCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTgg > 8:123326/1‑149 (MQ=255) ccAGGGCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCT‑GCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTgg < 4:131234/148‑1 (MQ=255) ccAGGGCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAAACACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTgg > 6:314770/1‑149 (MQ=255) aGGGCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGc < 7:123326/149‑1 (MQ=255) ggCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTg > 2:37688/1‑149 (MQ=255) gCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTg > 8:96286/1‑148 (MQ=255) aCTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGc < 3:20142/149‑1 (MQ=255) ctgATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGTCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCaa < 1:175504/147‑1 (MQ=255) ctgATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAaca > 4:248065/1‑149 (MQ=255) tgATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGCCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAacac > 4:102862/1‑149 (MQ=255) gATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACAcc > 7:229510/1‑149 (MQ=255) aTCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCt > 7:11838/1‑149 (MQ=255) tAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTgg > 4:60016/1‑149 (MQ=255) ccACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGcc > 4:190754/1‑148 (MQ=255) cTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGAAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTACTGTCGAGAAGTTGGGGTGGAAAAACCTCAAACACATGTTGCTGGccac > 1:107501/1‑147 (MQ=255) tGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCt > 7:43100/1‑149 (MQ=255) gcgACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTcag < 3:102862/148‑1 (MQ=255) ccTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCagcagc > 1:252524/1‑148 (MQ=255) ctgGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAg < 5:314770/147‑1 (MQ=255) ctgGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCCGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGaa > 3:231236/1‑149 (MQ=255) ggCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGaac > 3:118384/1‑148 (MQ=255) tGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGc < 8:229510/149‑1 (MQ=255) tGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCCGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGc < 8:95441/149‑1 (MQ=255) gTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGcc < 5:41922/148‑1 (MQ=255) tCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCca > 8:168216/1‑148 (MQ=255) cccGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCt < 5:1899/111‑1 (MQ=255) cccGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCt > 6:1899/1‑111 (MQ=255) cccGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTgg < 3:190754/149‑1 (MQ=255) ccGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGATCAACCTGCCACACTTGGc > 2:221024/1‑149 (MQ=255) ggCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGccc < 5:211042/149‑1 (MQ=255) cTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCCGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGt < 4:231236/148‑1 (MQ=255) gAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACACCCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCt > 1:215356/1‑149 (MQ=255) aaGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCt < 3:282088/148‑1 (MQ=255) agcagcGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCttt < 2:252524/149‑1 (MQ=255) gcagcGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCTTTg > 4:312202/1‑149 (MQ=255) agcGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCTTTGTc < 8:11838/149‑1 (MQ=255) gcGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGc > 4:300794/1‑80 (MQ=255) gcGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGc < 3:300794/80‑1 (MQ=255) gcGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCACGCCAGTGCTTTGTc > 5:21073/1‑148 (MQ=255) gggtgggtGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCTTTGTCGac < 6:166402/149‑1 (MQ=255) gtgggtggCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAAcc < 8:73368/115‑1 (MQ=255) gtgggtggCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAAcc > 7:73368/1‑115 (MQ=255) ggtggCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCt > 4:5513/1‑95 (MQ=255) ggtggCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCt < 3:5513/95‑1 (MQ=255) tggCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACTCTTGGCCCGCCAGTGCTTTGTCGACACCCTCg < 1:37688/149‑1 (MQ=255) ggCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCTTTGTCGACACCCTCGGGTGTGACCCg > 1:157915/1‑149 (MQ=255) cATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCTTTGTCGACACCCTCGGGTGTGACCCGGa < 3:312202/149‑1 (MQ=255) aTTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCTTTGTCGACACCCTCGGGTGTGACCCGGAc < 4:118384/149‑1 (MQ=255) tttGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCTTTGTCGACACCCTCGGgt < 6:177755/137‑1 (MQ=255) tttGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCTTTGTCGACACCCTCGGGTGTGACCCGGACt < 7:168216/149‑1 (MQ=255) tttGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCTTTGTCGACACCCTCGGGTGTGACCCGGACt > 2:109080/1‑149 (MQ=255) tttGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCGTTGTCGACACCCTCGGgt > 5:177755/1‑137 (MQ=255) acaacCACCAGGCTGCGC‑GCCTTGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCTCCAGTGCTTTGTCGACACCCTCGGGTGTGACCCGGACTGGCt < 7:35774/148‑1 (MQ=255) aacCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCTTTGTCGACACCCTCGGGTGTGACCCGGACTGGCTcc > 2:77639/1‑148 (MQ=255) tgcaccaGGC‑GCGCAGCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCTTTGTCGACACCCTCGGGTGTGAcc < 3:245184/133‑1 (MQ=255) tgcaccaGGC‑GCGCAGCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCTTTGTCGACACCCTCGGGTGTGAcc > 4:245184/3‑135 (MQ=255) tgcaccaGGC‑GCGCAGCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCTTTGTCGACACCCTCGGGTGTGACCCGGACTGGCt > 7:268934/3‑145 (MQ=255) tgcaccaGGC‑GCGCAGCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCTTTGTCGACACCCTCGGGTGTGACCCGGACTGGCt < 8:268934/143‑1 (MQ=255) ccaccaGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGaacaa < 3:25826/84‑1 (MQ=255) ccaccaGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGaacaa > 4:25826/1‑84 (MQ=255) ccaGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCTTTGTCGACACCCTCGGGTGTGACCCGGACTGGCTCCAGGTgg < 3:60016/149‑1 (MQ=255) ccaGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCTTTGTCGACACCCTCGGGTGTGACCCGGACTGGCTCCAGGTgg < 8:43100/149‑1 (MQ=255) cgc‑gcCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCTTTGTCGACACCCTCGGGTGTGACCCGGACTGGCTCCAGGTGGCGAATCa < 1:109080/148‑1 (MQ=255) | GCTGTTGCTGGAGCGTTACCAGGGCCTGGATGCACTGCTGATCGAGGCTAACCACTGTCGCGACCTGCTGGCACGTGGTCACTACCCGGCTTTTCTGAAGCAGCGGGTGGGTGGCATGCAAGGGCATTTGAACAACCACCAGGCTGCGC‑GCCTGGTG‑C‑ACGAGTTGGGCTGGAACAACCTGCAACACCTGGTGCTGGCCCACCTCAGCAGCAAGAACAACCTGCCACACTTGGCCCGCCAGTGCTTTGTCGACACCCTCGGGTGTGACCCGGACTGGCTCCAGGTGGCGAATCA > NC_002947/1417184‑1417477 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |