New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 66103 | 58 (1.150) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 5.0% | coding (1161/1653 nt) | betA‑I | choline dehydrogenase |
? | NC_002947 | = 66147 | 58 (1.210) | coding (1205/1653 nt) | betA‑I | choline dehydrogenase |
GCTGGCCATGGCGCCGAGCCAGTTAGGCGCGTTCGTGCGTTCAAGCCCCGAACAGGCCACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAATTACCTCAGTGCTCCGCAGGACTTGCGGGTTGCTGCCGATGCCATTCGCCTTACCCGGCGCATC > NC_002947/65956‑66247 | gCTGGCCATGGCGCCGAGCCAGTTAGGCGCGTTCGTGCGTTCAAGCCCCGAACAGGCCACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGgtgt < 1:252951/149‑1 (MQ=255) gCCATGGCGCCGAGCCAGTTAGGCGCGTTCGTGCGTTCAAGCCCCGAACAGGCCACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCTCTTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGtgtg < 1:92472/147‑1 (MQ=255) gcgcCGAGCCAGTTAGGCGCGTTCGTGCGTTCAAGCCCCGAACAGGCCACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTgcg > 1:78732/1‑149 (MQ=255) gcgcCGAGCCAGTTAGGCGCGTTCGTGCGTTCAAGCCCCGAACAGGCCACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTgc < 7:235999/148‑1 (MQ=255) cgcCGAGCCAGTTAGGCGCGTTCGTGCGTTCAAGCCCCGAACAGGCCACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTgcgc < 5:196340/149‑1 (MQ=255) cGAGCCAGGTAGGCGCGGTCGTGCGTTCCAGCCCCGAACAGGCCACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCC‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCg < 8:89675/149‑1 (MQ=255) gAGCCAGTTAGGCGCGTTCGTGCGTTCAAGCCCCGAACAGGCCACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCgg > 1:38608/1‑149 (MQ=255) ggCGCGTTCGTGCGTTCAAGCCCCGAACAGGCCACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCcgcg < 3:232927/148‑1 (MQ=255) aaGCCCCGAACAGGCCACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTgc < 5:210334/148‑1 (MQ=255) aaGCCCCGAACAGGCCACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTg > 8:23039/1‑147 (MQ=255) ccccGAACAGGCCACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCgg > 2:82045/1‑129 (MQ=255) ccccGAACAGGCCACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCgg < 1:82045/129‑1 (MQ=255) aCAGGCCACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGctgcagatgtcgatgcgcccgcggctggccgggcgcaggttgcacaccgagg < 6:220211‑M1/149‑53 (MQ=255) aGGCCACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATg < 2:38608/149‑1 (MQ=255) gCCACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGaa > 1:274528/1‑149 (MQ=255) cACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGctgcagatgtcgatgcgcccgcggctggccgggcgcaggttgcacaccgag > 8:79595‑M1/1‑91 (MQ=255) cACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGctgcagatgtcgatgcgcccgcggctggccgggcgcaggttgcacaccgag < 7:79595‑M1/142‑52 (MQ=255) aCCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTgcag < 2:124855/134‑1 (MQ=255) aCCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTgcag > 1:124855/1‑134 (MQ=255) cGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCa > 2:41230/1‑149 (MQ=255) cGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCa > 2:36405/1‑149 (MQ=255) cGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCa > 4:279895/1‑149 (MQ=255) cAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCAcgc > 6:321450/1‑149 (MQ=255) aCCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCAcgccg > 8:197693/1‑149 (MQ=255) gTATCACGTGCAGCCGCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCg > 2:239574/1‑149 (MQ=255) cGTGCAGCCGCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGTCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGAccc < 8:128791/147‑1 (MQ=255) cGTGCAGCCGCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGACGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGAccc > 7:128791/1‑147 (MQ=255) gTGCAGCCGCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCa > 2:151569/1‑148 (MQ=255) gCAGCCGCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAAtt < 1:41230/149‑1 (MQ=255) cAGCCGCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCgg > 2:20782/1‑92 (MQ=255) cAGCCGCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCgg < 1:20782/92‑1 (MQ=255) cAGCCGCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAAtt < 1:36405/148‑1 (MQ=255) cAGCCGCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAAtt < 3:279895/148‑1 (MQ=255) ccGCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGAccc < 2:297864/140‑1 (MQ=255) ccGCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGAccc > 1:297864/1‑140 (MQ=255) gCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCgg < 4:311479/77‑1 (MQ=255) gCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCgg > 3:311479/1‑77 (MQ=255) gCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGGGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAATTACCTCa < 6:142347/149‑1 (MQ=255) gAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAATTACCTCAGTGCTCCg > 1:37498/1‑147 (MQ=255) cGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCggg > 5:217664/1‑75 (MQ=255) cGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCggg < 6:217664/75‑1 (MQ=255) gCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAATTACCTCAGTGCTCCGCAGGAc < 2:274528/149‑1 (MQ=255) cTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAATTACCTCAGTGCTCCGCAGGACt < 5:321450/149‑1 (MQ=255) ttCAGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCCGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAATTACCTCAGTGCTCCGCAGGACtt > 5:321807/1‑149 (MQ=255) gAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAATTACCTCAGTGCTCCGCAGGACTTGCGGGt > 4:258800/1‑149 (MQ=255) gCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAATTACCTCAGTGCTCCGCAGGACTTGCGGGTtg < 7:197693/149‑1 (MQ=255) aTCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAATTACCTCAGTGCTCCGCAGGACTTGCGGGTTGCTGCCGAt > 8:58119/1‑149 (MQ=255) tCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAATTACCTCAGTGCTCCGCAGGACTTGCGGGTTGCTGCCGATg > 5:17794/1‑149 (MQ=255) cAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAATTACCTCAGTGCTCCg > 1:217975/1‑123 (MQ=255) cAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAATTACCTCAGTGCTCCg < 2:217975/123‑1 (MQ=255) aGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAATTACCTCAGTGCTCCGCAGGACTTGCGGGTTGCTGCCGATGc < 1:151569/148‑1 (MQ=255) aGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAATTACCTCAGTGCTCCGCAGGACTTGCGGGTTGCTGCCGATGc > 2:32968/1‑148 (MQ=255) cccGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAATTAGCTCAGTGCTCCGCAGGACTTGCGGGTTGCTGCCGATGCCATTc > 2:220994/1‑149 (MQ=255) ccGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAATTACCTCAGTGCTCCGCAGGACTTGCGGGTTGCTGCCGATGCCATTc < 7:58119/148‑1 (MQ=255) ccGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAATTACCTCAGTGCTCCGCAGGACTTGCGGGTTGCTGCCGATGCCATTCg > 2:20125/1‑149 (MQ=255) cGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAATTACCTCAGTGCTCCGCAGGACTTGCGGGTTGCTGCCGATGCCATTCGc > 2:222055/1‑149 (MQ=255) cTTTACTGCCTCGGTGTGCAACGTGCCCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGAAATCTGCAGCACCGAAATGAACAGCACGCCGCGGAGCGCCCCAAATTACCTAAGTGCACCGAAGGACTTGCGGGTTGCTGCCGATGc > 7:202854/1‑138 (MQ=255) cTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAATTACCTCAGTGCTCCGCAGGACTTGCGGGTTGCTGCCGATGCCATTCGCCTTa < 2:37498/149‑1 (MQ=255) cTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCGGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAATTACCTCAGTGCTCCGCAGGACTTGCGGGTTGCTGCCGATGc < 8:202854/138‑1 (MQ=255) ttACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAATTACCTCAGTGCTcc > 4:288066/1‑109 (MQ=255) ttACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAATTACCTCAGTGCTcc < 3:288066/109‑1 (MQ=255) ccTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGcaccgaggcagtaaaggccgggaactgatgcaacggctcaccgaagcgttccagtgacagcggctgcacgtgatactgaaggttggcggtggcctgt < 6:220211‑M2/149‑98 (MQ=255) ccTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACCGCACGCCGCGGATCGACCCCAATTACCTCAGTGCTCCGCAGGACTTGCGGGTTGCTGCCGATGCCATTCGCCTTACCCGgcg > 5:70860/1‑148 (MQ=255) ccTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAATTACCTCAGTGCTCCGCAGGACTTGCGGGTTGCTGCCGATGCCATTCGCCTTACCCGgcg > 1:240055/1‑148 (MQ=255) cTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGcaccgaggcagtaaaggccgggaactgatgcaacggctcaccgaagcgttccagtgacagcggctgcacgtgatactgaaggttggcggtg < 7:79595‑M2/142‑92 (MQ=255) cTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGcaccgaggcagtaaaggccgggaactgatgcaacggctcaccgaagcgttccagtgacagcggctgcacgtgatactgaaggttggcggtg > 8:79595‑M2/1‑51 (MQ=255) gtgtGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAATTACCTCAGTGCTCCGCAGGACTTGCGGGTTGCTGCCGATGCCATTCGCCTTACCCGGCGCATc < 4:316532/147‑1 (MQ=255) gtgtGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAATTACCTCAGTGCTCCGCAGGACTTGCGGGTTGCTGCCGATGCCATTCGCCTTACCCGGCGCATc > 3:316532/1‑147 (MQ=255) | GCTGGCCATGGCGCCGAGCCAGTTAGGCGCGTTCGTGCGTTCAAGCCCCGAACAGGCCACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCT‑GTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTGTGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAATTACCTCAGTGCTCCGCAGGACTTGCGGGTTGCTGCCGATGCCATTCGCCTTACCCGGCGCATC > NC_002947/65956‑66247 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |