New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1436010 = | 63 (1.250) | 5 (0.100) | 5/258 | NT | 7.9% | intergenic (‑47/+106) | PP_1256/PP_1257 | alpha‑ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase/1‑pyrroline‑4‑hydroxy‑2‑carboxylate deaminase |
? | NC_002947 | 1436103 = | 53 (1.050) | intergenic (‑140/+13) | PP_1256/PP_1257 | alpha‑ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase/1‑pyrroline‑4‑hydroxy‑2‑carboxylate deaminase |
CGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGG‑AGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTG > NC_002947/1435862‑1436158 | cGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGAc > 5:270884/1‑149 (MQ=255) gCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGAccc < 4:259782/149‑1 (MQ=255) gCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGAccc < 4:157261/149‑1 (MQ=255) tCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCt > 2:300326/1‑149 (MQ=255) tCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCt > 2:195083/1‑149 (MQ=255) ccAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTg > 3:139343/1‑149 (MQ=255) cAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTg > 7:241300/1‑148 (MQ=255) aCGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGTGGGGGATTACGACCCCTGTAg > 7:103407/1‑149 (MQ=255) aCGTCTGACCGGTGGTGGGGTCGCTTGCAGGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTCCCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAg < 8:52674/149‑1 (MQ=255) gACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGAc < 6:32810/135‑1 (MQ=255) aCCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGc < 5:124312/146‑1 (MQ=255) cctgcacttcaacgagaccgacgtcctgaccgacgctcagcgcaactatgccgaacagcagtacgcgctgttccgcagctggtatgccagctggtcggccgagcaaaacatcgcctgagcagccactgctcCCCCTGTAGGAGCGGGtt < 2:85864‑M1/18‑1 (MQ=255) gtTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCAccc < 4:270182/149‑1 (MQ=255) ttGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTa > 1:269553/1‑133 (MQ=255) ttGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTa < 2:269553/133‑1 (MQ=255) ttGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCcg < 8:241300/149‑1 (MQ=255) gggTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCcgc > 4:196732/1‑148 (MQ=255) tCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATCGGGGGGATTACGACCCCTGTCGGAGCGGAGTAACACGCGaa > 1:112086/1‑148 (MQ=255) gCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGTCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCgg < 2:245773/148‑1 (MQ=255) cACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAg > 5:62253/1‑122 (MQ=255) cACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAg < 6:62253/122‑1 (MQ=255) ccGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCAGGTAGCCTCCGTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTCGGCGCGGGTTCACCCGCGAACCCCGGCGa > 8:28259/2‑149 (MQ=255) aCGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCg > 8:28257/1‑148 (MQ=255) gATGGCGTCGCCGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCACATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGc > 8:37522/1‑149 (MQ=255) tGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCg < 5:256243/149‑1 (MQ=255) ggCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCgg > 2:191891/1‑149 (MQ=255) tCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCGTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGAccc > 1:66709/1‑106 (MQ=255) tCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGAccc < 2:66709/105‑1 (MQ=255) ggCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCCCCCGCGCACACCGGCGAAGCCGGTGCCCTGc > 7:38437/1‑149 (MQ=255) ggCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGc < 6:270884/149‑1 (MQ=255) ggCTGACGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATCCAAGGGCGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCCAACCCGCTGCCCTg > 8:251560/1‑148 (MQ=38) ccGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCgg > 5:264361/1‑149 (MQ=255) ggCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGa < 1:300326/149‑1 (MQ=255) gCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGaa < 1:159178/121‑1 (MQ=255) gCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGaa > 2:159178/1‑121 (MQ=255) gCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGAt > 1:215528/1‑149 (MQ=255) ggCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCgg < 3:196732/149‑1 (MQ=255) gCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCgg < 4:139343/148‑1 (MQ=255) gATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTc > 5:171877/1‑92 (MQ=255) gATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTc < 6:171877/92‑1 (MQ=255) gcagGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCg < 2:215528/149‑1 (MQ=255) agGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCt < 7:37522/149‑1 (MQ=255) gTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCggg < 6:302886/137‑1 (MQ=255) gTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCggg > 5:302886/1‑137 (MQ=255) gCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGc < 6:93655/107‑1 (MQ=255) gCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGc > 5:93655/1‑107 (MQ=255) cc‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCcac < 8:103407/148‑1 (MQ=255) c‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAg > 5:218325/1‑149 (MQ=255) ccgcagctggtatgccagctggtcggccgagcaaaacatcgcctgagcagccactgctcTCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCcaca > 7:62124‑M1/60‑148 (MQ=255) tgtgAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAgg > 5:219260/1‑149 (MQ=255) tgtgAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAgg > 6:253407/1‑149 (MQ=255) gtgAGGGGCGTGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAgg > 8:137066/1‑148 (MQ=255) tgAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAggg < 5:253407/148‑1 (MQ=255) tAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGG‑AGAGCAGTGgc < 7:28257/148‑1 (MQ=255) tAGCCGCCTTGGAACTCTACTGCCGCTGCATGGGGGGGAGTACGACCCCTGTCGGAGCGGGGGCACCCGCGAACACCGGCGACGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGG‑AGAGCCGTGgc < 7:28259/148‑1 (MQ=21) gCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGG‑AGAGCAGTGgctg < 3:59822/148‑1 (MQ=255) cctcctTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGG‑AGAGCAg > 3:218529/1‑141 (MQ=255) cctcctTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGG‑AGAGCAg < 4:218529/141‑1 (MQ=255) ctgcattgAAATCGAAAGCAGTATCAAGGTGGGTATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGG‑AGAGCAGTGGCTGCTc < 4:185337/142‑1 (MQ=21) ctcctTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGG‑AGAGCAGTGgctgct > 3:281501/1‑148 (MQ=255) tcggccgagcaaaacatcgcctgagcagccactgctcCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGG‑AGAGCAGTGGCTGCTCAGGc > 1:85864‑M1/38‑149 (MQ=255) ggAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGG‑AGAGCAGTGGCTGCTCAgg > 2:208455/1‑146 (MQ=255) ggAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGG‑AGAGCAGTGGCTGCTCAgg < 1:208455/146‑1 (MQ=255) ggAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGGCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGG‑AGAGCAGTGGCTGCTCAGGc < 2:95642/147‑1 (MQ=255) gccgagcaaaacatcgcctgagcagccactgctcCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGG‑agag > 2:280225‑M1/35‑130 (MQ=255) gccgagcaaaacatcgcctgagcagccactgctcCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGG‑agag < 1:280225‑M1/96‑1 (MQ=255) gAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGG‑AGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGAt < 6:219260/149‑1 (MQ=255) aaTGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGG‑AGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGc > 1:143879/1‑149 (MQ=255) aTGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGc < 1:191891/149‑1 (MQ=255) gCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACAGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGG‑AGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGAc > 5:189530/1‑149 (MQ=255) cATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGG‑AGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGAc < 4:281501/148‑1 (MQ=255) aTGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGG‑AGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGAc > 7:123808/1‑147 (MQ=255) ggggATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGG‑AGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTgg < 6:218325/149‑1 (MQ=255) ggATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGG‑AGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCa > 8:268400/1‑149 (MQ=255) aTTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGG‑AGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATa > 7:23457/1‑149 (MQ=255) ttACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGG‑AGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATAc < 1:195083/149‑1 (MQ=255) cGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGG‑AGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCg < 3:11998/132‑1 (MQ=255) cGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGG‑AGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCg > 4:11998/1‑132 (MQ=255) cGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGG‑AGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCa < 6:189530/148‑1 (MQ=255) gACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGG‑AGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGc > 7:157659/1‑149 (MQ=255) ccccTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGG‑AGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTg > 4:67547/1‑149 (MQ=255) | CGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCC‑TGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGG‑AGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTG > NC_002947/1435862‑1436158 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |