New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2505333 | 30 (0.600) | 4 (0.080) | 4/244 | NT | 10.5% | coding (1120/1146 nt) | yliI | aldose sugar dehydrogenase |
? | NC_002947 | = 2505360 | 40 (0.840) | intergenic (+1/‑41) | yliI/PP_2199 | aldose sugar dehydrogenase/hypothetical protein |
GCAGGAATTGATCCGCTTGCAACTGGATGGCGACAAGGTGGTGCACGAAGAGCGGTTGCTCGGTGACCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGC > NC_002947/2505188‑2505478 | gCAGGAATTGATCCGCTTGCAACTGGATGGCGACAAGGTGGTGCACGAAGAGCGGTTGCTCGGTGACCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTAc < 5:204904/149‑1 (MQ=255) tCCGCTTGCAACTGGATGGCGACAAGGTGGTGCACGAAGAGCGGTTGCTCGGGTACCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCTGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGc < 5:234217/149‑1 (MQ=255) cccGCTTGCAACTGGATGGCGACAAGGTGGTGCACGAAGAGCGGTTGCTCGGTGACCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGc < 5:238760/148‑1 (MQ=255) cTTGCAACTGGATGGCGACAAGGTGGTGCACGAAGAGCGGTTGCTCGGTGACCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCgtcagtcggccaggccga > 6:260828‑M1/1‑131 (MQ=255) gATGGCGACAAGGTGGTGCACGAAGAGCGGTTGCTCGGTGACCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGAc < 6:132790/148‑1 (MQ=255) aCAAGGTGGTGCACGAAGAGCGGTTGCTCGGTGACCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCt > 8:145577/1‑149 (MQ=255) gtggtgCACGAAGAGCGGTTGCTCGGTGACCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCgtcagtcggccaggccgaccttgagtagcgcgccatcctt < 5:260828‑M1/149‑41 (MQ=255) gCACGAAGAGCGGTTGCTCGGTGACCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAggg > 6:105276/1‑149 (MQ=255) cGAAGAGCGGTTGCTCGGTGACCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGa < 5:105276/149‑1 (MQ=255) cGGTTGCTCGGTGACCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACgcgc < 5:262118‑M2/125‑5 (MQ=255) cGGTTGCTCGGTGACCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACgcgc > 6:262118‑M2/1‑121 (MQ=255) tGCTCGGTGACCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGAGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGAACGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGACGACTGACGCGAGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCggg > 5:94688/1‑146 (MQ=255) gCTCGGTGACCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGa < 7:283214/137‑1 (MQ=255) gCTCGGTGACCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGa > 8:283214/1‑137 (MQ=255) cTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCgtcagtcggccaggccgaccttgagtagcgcgccatcc < 4:81326‑M1/117‑39 (MQ=255) cTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCgtcagtcggccaggccgaccttgagtagcgcgccatcc > 3:81326‑M1/1‑79 (MQ=255) aaGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGcc > 3:72702/1‑149 (MQ=255) gTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGAcc < 7:145577/149‑1 (MQ=255) tCCGTGATGTGCTGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATTGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGTGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGAcccc < 6:94688/148‑1 (MQ=255) tCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCGTGGCCGACTGACGCGCGCCTACACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGAccccc < 1:72170/149‑1 (MQ=255) ccGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGAccccc > 6:195420/1‑148 (MQ=255) cGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCa > 1:282607/1‑148 (MQ=255) gTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCaaa > 5:299351/1‑149 (MQ=255) tGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAAc < 4:72702/149‑1 (MQ=255) tgCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCctc < 2:282607/148‑1 (MQ=255) cGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTAc < 6:307458/149‑1 (MQ=255) gCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGc > 3:302966/1‑149 (MQ=255) tGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAg < 6:299351/149‑1 (MQ=255) cTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCgg > 5:34112/1‑149 (MQ=255) tatgtaCTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGAcccc > 1:280232/1‑113 (MQ=255) tatgtaCTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGAcccc < 2:280232/113‑1 (MQ=255) tGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTg > 5:98736/1‑149 (MQ=255) aTGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGa > 5:119541/1‑147 (MQ=255) aTGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGa < 6:119541/147‑1 (MQ=255) aaGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACgcgcgccatccttgtcatcggtcagtacatacaggtaaccatctggccccacccgcacatcacggatacgcgccttcaggtcaccgagcaaccgctcttcgtgcaccac < 5:260828‑M2/149‑110 (MQ=255) aaGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGTGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGcc > 8:183807/1‑149 (MQ=255) aaGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGcc > 8:274992/1‑149 (MQ=255) ggATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACgcgcgccatccttgtcatcggtcagtacatacaggtaaccatctggccccacccgcacatcacggatacgcgccttcag < 4:81326‑M2/117‑80 (MQ=255) ggATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACgcgcgccatccttgtcatcggtcagtacatacaggtaaccatctggccccacccgcacatcacggatacgcgccttcag > 3:81326‑M2/1‑38 (MQ=255) ggATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGcc > 7:204741/1‑147 (MQ=255) gcgcgtcagtcggccaggccgaccttgagtagcgcgccatccttgtcatcggtcagtacatacaggtaaccatctggccccacccgcacatcacggatacgcgccttcaggtcaccgagcaaccg > 6:262118‑M1/1‑4 (MQ=255) gcgcgtcagtcggccaggccgaccttgagtagcgcgccatccttgtcatcggtcagtacatacaggtaaccatctggccccacccgcacatcacggatacgcgccttcaggtcaccgagcaaccg < 5:262118‑M1/125‑122 (MQ=255) gcgcTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCcgc > 7:128692/1‑149 (MQ=255) cTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCctct < 6:57576/93‑1 (MQ=255) cTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCctct > 5:57576/1‑93 (MQ=255) | GCAGGAATTGATCCGCTTGCAACTGGATGGCGACAAGGTGGTGCACGAAGAGCGGTTGCTCGGTGACCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGC > NC_002947/2505188‑2505478 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |