New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5903760 = | 58 (1.150) | 6 (0.130) | 6/238 | NT | 10.7% | intergenic (+16/+91) | PP_5176/spuH | hypothetical protein/spermidine/putrescine ABC transporter permease |
? | NC_002947 | 5903842 = | 47 (1.010) | intergenic (+98/+9) | PP_5176/spuH | hypothetical protein/spermidine/putrescine ABC transporter permease |
TACCAGGACCATGCGCTGCGGCAGGAAGAGTGTGTGGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGC > NC_002947/5903613‑5903907 | cttcttcgtctggtacttcagccgccaggccgaagagcgtcgtcgcaaggcgattcagcaggcgatcgaagagggtgctgcagccaacgcttcgcagccgcaggtcaagcgcccggcgcaggtggctgcgtcggcctgacctggccctt < 2:33049‑M1/1‑1 (MQ=255) ggACCATGCGCTGCGGCAGGAAGAGTGTGTGGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCGGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCgg < 8:219009/149‑1 (MQ=255) gACCATGCGCTGCGGCAGGAAGAGTGTGTGGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGCGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCgg < 1:24947/149‑1 (MQ=255) gtctggtacttctgccgccaggccgaagatcttcgtcgcaaggcgattcagcaggcgatcgaagagggtgcttcagccaacgcttcgcagccgcatgtcaagcgcccggcgcaggttgctgcgtcggcctgacctggccctttcgctg > 3:81497‑M1/142‑146 (MQ=255) tctggtacttcagccgccaggccgaagagcgtcgtcgcaaggcgattcagcaggcgatcgaagagggtgctgcagccaacgcttcgcagccgcaggtcaagcgcccggcgcaggtggctgcgtcggcctgacctggccctTTCGCggg < 8:192413‑M1/8‑1 (MQ=255) tctggtacttcagccgccaggccgaagagcgtcgtcgcaaggcgattcagcaggcgatcgaagagggtgctgcagccaacgcttcgcagccgcaggtcaagcgcccggcgcaggtggctgcgtcggcctgacctggccctTTCGCggg < 1:64173‑M1/8‑1 (MQ=255) cATGCGCTGCGGCAGGAAGAGTGTGTGGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATTGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCAt > 1:310007/1‑149 (MQ=255) tGCGCTGCGGCAGGAAGAGTGTTTGGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGc < 3:106246/149‑1 (MQ=255) tGCGCTGCGGCAGGAAGAGTGTGTGGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGc < 1:8742/149‑1 (MQ=255) tGCGCTGCGGCAGGAAGAGTGTGTGGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGc > 1:278734/1‑149 (MQ=255) gcTGCGGCAGGAAGAGTGTGTGGTTCATGTAGCCCGGCACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCg > 8:80504/1‑149 (MQ=255) cGGCAGGAAGAGTGTGTGGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTc < 2:278734/148‑1 (MQ=255) agccgccaggccgaagagcgtcgtcgcaaggcgattcagcaggcgatcgaagagggtgctgcagccaacgcttcgcagccgcaggtcaagcgcccggcgcaggtggctgcgtcggcctgacctggccctTTCGCGGGCATGCCCGCTcc < 3:115509‑M1/20‑1 (MQ=255) cAGGAAGAGTGTGTGGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCca > 8:62246/1‑148 (MQ=255) aaGAGTGGGTGGGTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTAGCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAggg < 3:238807/149‑1 (MQ=255) agagTGTGTGGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGc > 7:41538/1‑149 (MQ=255) gagTGTGTGGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCt > 2:263397/1‑149 (MQ=255) gTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCGCCCCCCAAc > 6:291490/1‑149 (MQ=255) aTGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCt < 3:138164/148‑1 (MQ=255) gTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTg > 4:236149/1‑147 (MQ=255) tAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTTCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGaa < 3:61457/148‑1 (MQ=255) aGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTAACCACAACCCGGAAgg > 8:207425/1‑149 (MQ=255) caaggcgattcagcaggcgatcgaagagggtgctgcagccaacgcttcgcagccgcaggtcaagcgcccggcgcaggtggctgcgtcggcctgacctggccctTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAgg > 4:115509‑M1/104‑149 (MQ=255) aaggcgattcagcaggcgatcgaagagggtgctgcagccaacgcttcgcagccgcaggtcaagcgcccggcgcaggtggctgcgtcggcctgacctggccctTTCGCgg < 1:185805‑M1/7‑1 (MQ=255) aaggcgattcagcaggcgatcgaagagggtgctgcagccaacgcttcgcagccgcaggtcaagcgcccggcgcaggtggctgcgtcggcctgacctggccctTTCGCgg > 2:185805‑M1/103‑109 (MQ=255) cGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTc < 8:212306/102‑1 (MQ=255) cGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCtgt < 3:130125/149‑1 (MQ=255) gTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGa < 8:81161/149‑1 (MQ=255) cATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGt < 7:80504/149‑1 (MQ=255) aTTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAggg < 5:211992/120‑1 (MQ=255) aTTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAggg > 6:211992/1‑120 (MQ=255) ttgCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCtg > 3:102279/1‑149 (MQ=255) ttgCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCt < 7:62246/148‑1 (MQ=255) ccAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCTCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTgg < 7:229879/149‑1 (MQ=255) ccAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATACCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTgg > 7:136185/1‑149 (MQ=255) ccAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATACCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTgg < 8:136185/149‑1 (MQ=255) cgatcgaagagggtgctgcagccaacgcttcgcagccgcaggtcaagcgcccggcgcaggtggctgcgtcggcctgacctggccctTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTgg > 4:25539‑M1/87‑149 (MQ=255) cAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTgg > 5:312213/1‑148 (MQ=255) gatcgaagagggtgctgcagccaacgcttcgcagccgcaggtcaagcgcccggcgcaggtggctgcgtcggcctgacctggccctTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCtgtg > 7:90578‑M1/86‑147 (MQ=255) gatcgaagagggtgctgcagccaacgcttcgcagccgcaggtcaagcgcccggcgcaggtggctgcgtcggcctgacctggccctTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCtgtg < 8:90578‑M1/62‑1 (MQ=255) tCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAAcc < 2:98775/121‑1 (MQ=255) tCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAAcc > 1:98775/1‑121 (MQ=255) tCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGc > 7:282034/1‑149 (MQ=255) ttGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTgg < 2:93259/129‑1 (MQ=255) ttGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTgg > 1:93259/1‑129 (MQ=255) ttGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGaa < 4:102279/148‑1 (MQ=255) gccaacgcttcgcagccgcaggtcaagcgcccggcgcaggtggctgcgtcggcctgacctggccctTTGGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGaaa > 6:327435‑M1/67‑149 (MQ=255) gTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCGGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAggg > 6:294425/1‑149 (MQ=255) tCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCGGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGc > 8:30490/1‑149 (MQ=255) cAGAAGTAGCAGGGACTATCCACATGGGGATGCGGTAGG‑GCTTTGAAGCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGcc < 5:291490/149‑1 (MQ=255) aGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTAACCACCAACCGGAAGGCTGTGAGGGACCGGTGGGCCCGGGCGTGCCCGCGCAACGGc > 3:153735/1‑147 (MQ=255) tATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCa < 1:263397/149‑1 (MQ=255) tCAGGGACTATCCACATTGGGCTGGGGTATG‑GCTTTGAATCCGTGCGGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACACCCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAgg < 1:56484/149‑1 (MQ=38) tCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAgg > 7:57364/1‑149 (MQ=255) gccggcaCTACCCACATTGGGAGGCGGAAGG‑GCTTTCAAGCGGGGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACCGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGGGAGGGCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAgg < 7:30490/143‑1 (MQ=37) gcAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑CCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACCGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAgg < 7:207425/148‑1 (MQ=255) aGGTACTATCCACATTGGGTTGCGGTATG‑GCTTTTAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGTAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGcc < 8:282034/149‑1 (MQ=255) gggACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAAcc < 5:211267/89‑1 (MQ=255) gggACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAAcc > 6:211267/1‑89 (MQ=255) ggACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTAACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCACGTCAGGCCGa > 1:33049/1‑149 (MQ=255) ccACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGGGCACCACAACCCGGAAGGGGGTGAGGTGCCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGCAAGGGCCAGGTGAGGCCGACGCAGcc > 6:8668/1‑149 (MQ=38) cacaTTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCCCTCCCCCAGGGCTCACCACAACCCAGAAGGCGGTGGGGTCCCAGTGGGAGCGGGCGTTCCCGCGAAACGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCa > 4:121295/1‑149 (MQ=255) acaTTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCGTGTGGTAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCAc < 4:146995/149‑1 (MQ=255) tGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCgg < 3:121295/149‑1 (MQ=255) gCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCgg < 6:312213/148‑1 (MQ=255) tATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCt > 8:92455/1‑149 (MQ=255) tatttGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACAAAAACCCTTAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGa < 2:290894/146‑1 (MQ=255) tGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTg < 3:236149/148‑1 (MQ=255) gAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCg > 3:248626/1‑149 (MQ=255) gAAGCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGc < 5:8668/148‑1 (MQ=255) aaTCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCgg < 5:294425/149‑1 (MQ=255) ccctTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACCACCCTGAAGGCGGTGAGGTCCCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGCCGCAGCCCCCTGCGCCGGGCGCGGGACCGGCGGCGGCGAAgcggt < 2:64173‑M1/145‑3 (MQ=255) gCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTg > 6:172712/1‑149 (MQ=255) cTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGCCCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGc > 2:250843/1‑149 (MQ=255) TTCGCGGGCATGCCCACTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGaa > 5:322363‑M1/1‑140 (MQ=255) TTCGCGGGCATGCCCACTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGaa < 6:322363‑M1/140‑1 (MQ=255) | TACCAGGACCATGCGCTGCGGCAGGAAGAGTGTGTGGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATG‑GCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGC > NC_002947/5903613‑5903907 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |