New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 296937 | 55 (1.090) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 5.7% | coding (1067/1578 nt) | gshA | glutamate‑‑cysteine ligase |
? | NC_002947 | = 296962 | 47 (0.980) | coding (1042/1578 nt) | gshA | glutamate‑‑cysteine ligase |
ATCGGCTGGCCATTGCGGTGCAACTCCAGGCCCGGACGACGGCCTTCCTTGACCACGGTCAGGAAGTTGCTGGTGCACTGGCCGCACTCGCCGTTGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGA‑TGTCCAGGCAGCGCACTTCCACATACTGCACACCCCGCGAGGTCAGGGCCTGGATCGGTCGCTCG‑CCGGTGTAGGTGACGCGCTTGGGGCGGATGTTCGAGTAG > NC_002947/296814‑297110 | aTCGGCTGGCCATTGCGGTGCAACTCCAGGCCCGGACGACGGCCTTCCTTGACCACGGTCAGGAAGTTGCTGGTGCACTGGCCGCACTCGCCGTTGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGaa < 4:281886/149‑1 (MQ=255) gCTGGCCATTGCGGTGCAACTCCAGGCCCGGACGACGGCCTTCCTTGACCACGGTCAGGAAGTTGCTGGTGTACTGGCCGCACTCGCCGTTGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAgcgc > 1:58192‑M2/1‑145 (MQ=255) tGGCCATTGCGGTGCAACTCCAGGCCCGGACGACGGCCTTCCTTGACCACGGTCAGGAAGTTGCTGGTGCACTGGCCGCACTCGCCGTTGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAgcgcgc < 2:217017‑M2/149‑7 (MQ=255) gCCATTGCGGTGCAACTCCAGGCCCGGACGACGGCCTTCCTTGACCACGGTCAGGAAGTTGCTGGTGCACTGGCCGCACTCGCCGTTGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCt > 8:183662/1‑149 (MQ=255) ttGCGGTGCAACTCCAGGCCCGGACGACGGCCTTCCTTGACCACGGTCAGGAAGTTGCTGGTGCACTGGCCGCACTCGCCGTTGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGt > 2:62019/1‑149 (MQ=255) cAACTCCAGGCCCGGACGACGGCCTTCCTTGACCACGGTCAGGAAGTTGCTGGTGCACTGGCCGCACTCGCCGTTGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGa > 8:32464/1‑149 (MQ=255) cAACTCCAGGCCCGGACGACGGCCTTCCTTGACCACGGTCAGGAAGTTGCTGGTGCACTGGCCGCACTCGCCGTTGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGa > 3:53946/1‑149 (MQ=255) aaCTCCAGGCCCGGACGACGGCCTTCCTTGCCCACGGTCAGGAAGTTGCTGGTGCACTGGCCGCACTCGCCGTTGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGa > 4:287962/1‑148 (MQ=255) aaCTCCAGGCCCGGACGACGGCCTTCCTTGACCACGGTCAGGAAGTTGCTGGTGCACTGGCCGCACTCGCCGTTGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGAt < 3:34950/149‑1 (MQ=255) cGGACGACGGCCTTCCTTGACCACGGTCAGGAAGTTGCTGGTGCACTGGCCGCACTCGCCGTTGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGt < 6:330498/129‑1 (MQ=255) cGGACGACGGCCTTCCTTGACCACGGTCAGGAAGTTGCTGGTGCACTGGCCGCACTCGCCGTTGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGt > 5:330498/1‑129 (MQ=255) ggACGACGGCCTTCCTTGACCACGGTCAGGAAGTTGCTGGTGCACTGGCCGCACTCGCCGTTGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAg > 2:24022/1‑149 (MQ=255) gCCTTCCTTGACCACGGTCAGGAAGTTGCTGGTGCACTGGCCGCACTCGCCGTTGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTc > 6:86879/1‑121 (MQ=255) gCCTTCCTTGACCACGGTCAGGAAGTTGCTGGTGCACTGGCCGCACTCGCCGTTGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTc < 5:86879/121‑1 (MQ=255) gCCTTCCTTGACCACGGTCAGGAAGTTGCTGGTGCACTGGCCGCACTCGCCGTTGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGt < 7:183662/149‑1 (MQ=255) gCCTTCCTTGACCACGGTCAGGAAGTTGCTGGTGCACTGGCCGCACTCGCCGTTGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGt > 5:196018/1‑149 (MQ=255) ccttGACCACGGTCAGGAAGTTGCTGGTGCACTGGCCGTACTCGCCGTTGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGa < 6:62166/147‑1 (MQ=255) ccttGACCACGGTCAGGAAGTTGCTGGTGCACTGGCCGCACTCGCCGTTGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGA‑t < 2:191488/148‑1 (MQ=255) cttGACCACGGTCAGGAAGTTGATGGTGCACTGGCCGCACTCGCCGTTGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGa < 5:300815/146‑1 (MQ=255) cttGACCACGGTCAGGAAGTTGATGGTGCACTGGCCGCACTCGCCGTTGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGa > 6:300815/1‑146 (MQ=255) aCCACGGTCAGGAAGTTGCTGGTGCACTGGCCGCACTCGCCGTTGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGA‑TGTCCAg > 2:48820/1‑149 (MQ=255) ggAAGTTGCTGGTGCACTGGCCGCACTCGCCGTTGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGA‑TGTCCAGGCAGCGCACt < 1:217017/149‑1 (MQ=255) ggAAGTTGCTGGTGCACTGGCCGCACTCGCCGTTGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGA‑TGTCCAGGCAGCGCACt > 3:299137/1‑149 (MQ=255) gTTGCTGGTGCACTGGCCGCACTCGCCGTTGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGA‑TGTCCAGGCAGCGCACTTcc > 2:163702/1‑148 (MQ=255) gTTGCTGGTGCACTGGCCGCACTCGCCGTTGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGA‑TGTCCAGGCAGCGCACTTcc < 1:163702/148‑1 (MQ=255) ttGCTGGTGCACTGGCCGCACTCGCCGTTGTCCAGTTGCGGGCGGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGA‑TGTCCAGGCAGCGCACTTCca < 8:70707/148‑1 (MQ=255) tGGTGCACTGGCCGCACTCGCCGTTGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGA‑TGTCCAGGCAGCGCACTTCCACATAc > 5:58057/1‑149 (MQ=255) ggTGCACTGGCCGCACTCGCCGTTGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGA‑TGTCCAGGCAGCGCACTTCCACATACt > 4:127155/1‑149 (MQ=255) gTGCACTGGCCGCACTCGCCGTTGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGA‑TGTCCAGGCAGCGCACTTCCACATACTg < 6:58057/149‑1 (MQ=255) cACTGGCCGCACTCGCCGTTGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGACTGTCCAGGCAGCGCACTTCCACATACTGc < 1:24022/148‑1 (MQ=255) gCCGCACTCGCCGTTGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGA‑TGTCCAGGCAGCGCACTTCca > 8:68176/1‑134 (MQ=255) gCCGCACTCGCCGTTGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGA‑TGTCCAGGCAGCGCACTTCca < 7:68176/134‑1 (MQ=255) gCCGCACTCGCCGTTGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGA‑TGTCCAGGCAGCGCACTTCCACATACTGCACAcccc > 6:254529/1‑149 (MQ=255) ccGTTGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGA‑TGTCCAGGCAGCGCACTTCCACATACTGCACACCCCGCGAGGTCAg > 4:169351/1‑149 (MQ=255) ttGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCa > 1:166712/1‑88 (MQ=255) ttGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCa < 2:166712/88‑1 (MQ=255) cAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGA‑TGTCCAGGCAGCGCACTTCCACATACTGCACACCCCGCGAGGTCAGGGCCTGGa < 1:62019/149‑1 (MQ=255) aGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGA‑TGTCCAGGCAGCGCACTTCCACATACTGCACACCCCGCGAGGTCAGGGCCTGGAt > 7:205328/1‑149 (MQ=255) aGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGA‑TGTCCAGGCAGCGCACTTCCACATACTGCACACCCCGCGAGGTCAGGGCCTGGAt > 7:127496/1‑149 (MQ=255) tGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGA‑TGTCCAGGCAGCGCACTTCCACATACTGcac > 3:254108/1‑115 (MQ=255) tGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGA‑TGTCCAGGCAGCGCACTTCCACATACTGcac < 4:254108/115‑1 (MQ=255) tGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGA‑TGTCCAGGCAGCGCACTTCCACATACTGCACAcc < 2:16304/118‑1 (MQ=255) tGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGA‑TGTCCAGGCAGCGCACTTCCACATACTGCACAcc > 1:16304/1‑118 (MQ=255) ccAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAgcgcgctggaagacagcccgcaactggacaacggcgagtgcggccagtgcaccagcaacttcctgacc < 1:136075‑M2/102‑69 (MQ=255) ccAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAgcgcgctggaagacagcccgcaactggacaacggcgagtgcggccagtgcaccagcaacttcctgacc > 2:136075‑M2/1‑34 (MQ=255) aGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAgcgcgctggaagacagcccgcaactggacaacggcgagtgcggccagtgcaccagcaacttcctgaccgtggtcaaggaaggccgtcgtccgggcctggagttgcaccgcaatggc < 5:248058‑M2/148‑117 (MQ=255) gcgcgcAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGA‑TGTCCAGGCAGCGCACTTCCACATACTGCACACCCCGCGAGGTCAGGGCCTGGATCGGTCGCTCG‑CCGGTGTAg < 3:287962/149‑1 (MQ=255) gcgcAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGA‑TGTCCAGGCAGCGCACTTCCACATACTGCACACCCCGCGAGGTCAGGGCCTGGATCGGTCGCTCG‑CCGGTGTAGGt < 6:196018/149‑1 (MQ=255) agcagGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGA‑TGTCCAGGCAGCGCACTTCCACATACTGCACACCCCGCGAGGTCAGGGCCTGGATCGGTCGCTCG‑CCGGTGTa < 7:294479/137‑1 (MQ=255) agcagGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGA‑TGTCCAGGCAGCGCACTTCCACATACTGCACACCCCGCGAGGTCAGGGCCTGGATCGGTCGCTCG‑CCGGTGTa > 8:294479/1‑137 (MQ=255) gAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGA‑TGTCCAGGCAGCGCACTTCCACATACTGCACACCCCGCGAGGTCAGGGCCTGGATCGGTCGCTCG‑CCGGTGTAGGTGACGCGCTTGGGGc > 6:313157/1‑149 (MQ=255) aTGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGA‑TGTCCAGGCAGCGCACTTCCACATACTGCACACCCCGCGAGGTCAGGGCCTGGATCGGTCGCTCG‑CCGGTGTAGGTGACGCGCTTGGGGCgg < 5:190118/149‑1 (MQ=255) tCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAACGGGGTTGA‑TGTCCAGGCAGCGCACTTCCACATACTGCACACCCCGCGAGGTCAGGGCCTGGATCGGTCGCTCG‑CCGGTGTAGGTGACGCGCTTGGGGCGGATGt > 1:233512/1‑149 (MQ=255) gAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGA‑TGTCCAGGCAGCGCACTTCCACATACTGCACACCCCGCGAGGTCAGGGCCTGGATCGGTCGCTCG‑CCGGTGTAGGTGACGCGCTTGGGGCGGATGTTCg < 3:127155/149‑1 (MQ=255) ggAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGA‑TGTCCAGGCAGCGCACTTCCACATACTGCACACCCCGCGAGGTCAGGGCCTGGATCGGTCGCTCGTCCGGTGTAGGTGACGCGCTTGGGGCGGATGTTCGa < 1:48820/149‑1 (MQ=255) aaGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGA‑TGTCCAGGCAGCGCACTTCCACATACTGCACACCCCGCGAGGTCAGGGCCTGGATCGGTCGCTCG‑CCGGTGTAGGTGACGCGCTTGGGGCGGATGTTCGagta < 3:169351/149‑1 (MQ=255) aaGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGA‑TGTCCAGGCAGCGCACTTCCACATACTGCACACCCCGCGAGGTCAGGGCCTGGATCGGTCGCTCG‑CCGGTGTAGGTGACGCGCTTGGGGCGGATGTTCGagta < 4:53946/149‑1 (MQ=255) aGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGA‑TGTCCAGGCAGCGCACTTCCACATACTGCACACCCCGCGAGGTCAGGGCCTGGATCGGTCGCTCG‑CCGGTGTAGGTGACGCGCTTGGGGCGGATGTTCGagtag < 8:205328/149‑1 (MQ=255) | ATCGGCTGGCCATTGCGGTGCAACTCCAGGCCCGGACGACGGCCTTCCTTGACCACGGTCAGGAAGTTGCTGGTGCACTGGCCGCACTCGCCGTTGTCCAGTTGCGGGCTGTCTTCCAGCGCGCAGAACAGCAGGAATGCGTCGAGGAAGCGCGCCTCGGTCAGGTCGATACCAACCGGCAGGAAC‑GGGTTGA‑TGTCCAGGCAGCGCACTTCCACATACTGCACACCCCGCGAGGTCAGGGCCTGGATCGGTCGCTCG‑CCGGTGTAGGTGACGCGCTTGGGGCGGATGTTCGAGTAG > NC_002947/296814‑297110 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |