New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2278188 = | 56 (1.110) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 5.7% | coding (392/1233 nt) | PP_2007 | P‑47‑like protein |
? | NC_002947 | 2278231 = | 46 (0.970) | coding (349/1233 nt) | PP_2007 | P‑47‑like protein |
GGTCGCGAAGGTATGGGTGAACTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCT‑GGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCAGCGAGCGGCTGGTGCCACTGGCCTCGAAAAAACCTGA > NC_002947/2278085‑2278378 | gcggttgccatcatcgaggtcaccctgtcgctgttgccacaaggcaacggccaggtgcagttgaagtcggccttcctgcacaaggccggagccactcaaccccTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAggg > 5:117470‑M1/104‑149 (MQ=255) gTCGCGAAGGTATGGGTGAACTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTACAggg < 2:22509/148‑1 (MQ=255) cgAAGGTATGGGTGAACTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGtt < 3:114247/147‑1 (MQ=255) cgAAGGTATGGGTGAACTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGtt > 4:114247/1‑147 (MQ=255) cgAAGGTATGGGTGAACTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGa < 1:211515/149‑1 (MQ=255) gAAGGTATGGGTGAACTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAg < 5:22223/149‑1 (MQ=255) aaGGTATGGGTGAACTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGt < 5:5446/149‑1 (MQ=255) catcatcgaggtcaccctgtcgctgttgccacaaggcaacggccaggtgcagttgaagtcggccttcctgcacaaggccggagccactcaaccccTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAgg > 7:189213‑M1/96‑140 (MQ=255) catcatcgaggtcaccctgtcgctgttgccacaaggcaacggccaggtgcagttgaagtcggccttcctgcacaaggccggagccactcaaccccTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAgg < 8:189213‑M1/45‑1 (MQ=255) ggTATGGGTGAACTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGTgg < 3:15250/149‑1 (MQ=255) tATGGGTGAACTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGt < 8:33587/145‑1 (MQ=255) tATGGGTGAACTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGt > 7:33587/1‑145 (MQ=255) tATGGGTGAACTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGt < 8:38511/145‑1 (MQ=255) tATGGGTGAACTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGt > 7:38511/1‑145 (MQ=255) aaCTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCt < 1:312550/148‑1 (MQ=255) tAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGc < 2:256527/148‑1 (MQ=255) gCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGcc > 6:205385/1‑149 (MQ=255) tCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCtt > 7:225226/1‑134 (MQ=255) tCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCtt < 8:225226/134‑1 (MQ=255) cAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCGGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGGCTTGTGCAGGTAGGACGaggt > 8:292549/1‑144 (MQ=255) cAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCa < 7:4071/124‑1 (MQ=255) cAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCa > 8:4071/1‑124 (MQ=255) tGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCT‑GGCCg > 5:131384/1‑149 (MQ=255) gCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCT‑GGCCGt > 8:190335/1‑149 (MQ=255) cAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCT‑GGCCGtt < 1:38232/149‑1 (MQ=255) cAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCT‑GGCCGtt < 6:131384/149‑1 (MQ=255) cAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGAGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCAc < 3:140429/135‑1 (MQ=255) cAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGAGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCAc > 4:140429/1‑135 (MQ=255) aaCACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCtt > 1:309803/1‑107 (MQ=255) aaCACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTtgtg < 5:125763/110‑1 (MQ=255) aaCACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTtgtg > 6:125763/1‑110 (MQ=255) aaCACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCT‑GGCCGTTGCCTtg > 4:160025/1‑149 (MQ=255) aaCACCACCGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCtt < 2:309803/107‑1 (MQ=255) caccacGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCT‑GGCCGTTGCCTtgtg < 7:31058/149‑1 (MQ=255) caccacGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCT‑GGCCGTTGCCTtgtg < 7:292549/149‑1 (MQ=255) gAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCT‑GGCCGTTGCCTTGTGGc < 5:120381/139‑1 (MQ=255) gAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCT‑GGCCGTTGCCTTGTGGc > 6:120381/1‑139 (MQ=255) aaaGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCT‑GGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAg < 5:205385/149‑1 (MQ=255) aaGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCT‑GGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAgg > 2:96353/1‑149 (MQ=255) aaCCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCT‑GGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCgat > 4:307681/1‑148 (MQ=255) ccGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCT‑GGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCgatgat < 6:277483/149‑1 (MQ=255) ccctgcagggcgacgaaggcggctggctgcgcggcattaccctgcaGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCT‑GGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACcgc > 5:117470‑M2/47‑149 (MQ=255) cctgcagggcgacgaaggcggctggctgcgcggcattaccctgcaGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCT‑GGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGatgatg > 7:189213‑M2/46‑140 (MQ=255) cctgcagggcgacgaaggcggctggctgcgcggcattaccctgcaGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCT‑GGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGatgatg < 8:189213‑M2/95‑1 (MQ=255) aTGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCT‑GGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCagcg < 7:190335/148‑1 (MQ=255) aTGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCT‑GGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCagc > 8:111908/1‑147 (MQ=255) tGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTCGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCagcga < 1:96353/149‑1 (MQ=255) gcgcAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCT‑GGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAgg < 7:245627/109‑1 (MQ=255) gcgcAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCT‑GGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAgg > 8:245627/1‑109 (MQ=255) accagccGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCT‑GGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCAGCGAGCGGCTGGTg < 5:195710/148‑1 (MQ=255) ccagccGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCT‑GGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCAGCGAGCGGCTGGTGc > 2:6758/1‑149 (MQ=255) cgccTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCT‑GGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCAGCGAGCGGCTGGTGCCACTg > 5:197698/1‑149 (MQ=255) gccTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCT‑GGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCAGCGAGCGGCTGGTGCCACTgg < 7:111908/149‑1 (MQ=255) cgtcgCCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCT‑GGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCAGCGAGCGGCTGGTGCCACTGGCCt < 6:197698/147‑1 (MQ=255) cctgcaGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCT‑GGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCAGCGAGCGGCTGGTGCCACTGGCCTCGaaaaaa > 1:284817‑M2/7‑149 (MQ=255) caGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCT‑GGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCAGCGAGCGGCTGGTGCCACTGGCCTCGAAAAAACCt < 3:307681‑M2/146‑1 (MQ=255) caGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCT‑GGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCAGCGAGCGGCTGGTGCCACTGGCCTCGAAAAAACCTg < 1:6758‑M2/147‑1 (MQ=255) aGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCT‑GGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCAGCGAGCGGCTGGTGCCACTGGCCTCGAAAAAACCt > 2:53168‑M2/2‑147 (MQ=255) aGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCT‑GGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCAGCGAGCGGCTGGTGCCACTGGCCTCGAAAAAACCt > 1:34449‑M2/2‑147 (MQ=255) aGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCT‑GGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCAGCGAGCGGCTGGTGCCACTGGCCTCGAAAAAACCTGa < 2:34449‑M2/148‑1 (MQ=255) | GGTCGCGAAGGTATGGGTGAACTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCGCCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCT‑GGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCAGCGAGCGGCTGGTGCCACTGGCCTCGAAAAAACCTGA > NC_002947/2278085‑2278378 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |