| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4074049 = | NA (NA) | 14 (0.280) | 12/252 | NT | 24.2% | intergenic (‑587/+37) | mdtA/PP_3586 | multidrug transporter membrane fusion protein/transposase |
| ? | NC_002947 | 4957564 = | 45 (0.890) | intergenic (‑47/+116) | fliH/fliG | flagellar assembly protein FliH/flagellar motor switch protein | |||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
GGGCTCCGGTTCCGGGTCGAAGCTTGGCAGCGTCCACACATCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATACCTTAGATCATTTCCTCGGCGCCCTTGCCGCCGAG > NC_002947/4957416‑4957712 | gcttatgttgaacaaggtcttgaggagttcgaagccagaagccaagaccggcaggtccgggctttgcttcgcaaagcccggaaactggggtatcaactggtggccgcttgagtgcttagaaaacaatgggttgcattttgtttgatgag < 6:291967‑M2/1‑1 (MQ=255) cttatgttgaacaaggtctttaggagttcgaagccagaagccaagaccggcaggtccgggctttgcttcgcaaagcccggaaactggggtatcaactggtggccgcttgagtgcttagaaaacaatgggttgcattttgtttgatgaga < 7:41035‑M2/2‑1 (MQ=255) cttatgttgaacaaggtcttgaggagttcgcagccagaagccaagaccggcaggtacgggctttgcttcgcaaagcccggaaactggggtatcaactggtggccgcttgagtgcttagaaaacaatgggttgcattttgtttgatgaga < 6:160862‑M2/2‑1 (MQ=255) cttatgttgaacaaggtcttgaggagttcgaagccagaagccaagaccggcaggtccgggctttgcttcgcaaagcccggaaactggggtatcaactggtggccgcttgagtgcttagaaaacaatgggttgcattttgtttgatgaga < 7:240037‑M2/2‑1 (MQ=255) tgttgaacaaggtcttgaggagttcgaagccagaagccaagaccggcaggtccgggctttgcttcgcaaagcccggaaactggggtatcaactggtggccgcttgagtgcttagaaaacaatgggttgcattttgtttgatgaGAGCgg > 7:93595‑M2/144‑149 (MQ=255) tgttgaacaaggtcttgaggagttcgaagccagaagccaagaccggcaggtccgggctttgcttcgcaaagcccggaaactggggtatcaactggtggccgcttgagtgcttagaaaacaatgggttgcattttgtttgatgaGAGCgg > 1:91438‑M2/144‑149 (MQ=255) ccGGTTCCGGGTCGAAGCTTGGCAGCGTCCACACATCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCgg < 3:210935/149‑1 (MQ=255) gttgaacaaggtcttgaggagttcgaagccagaagccaagaccggcaggtccgggctttgcttcgcaaagcccggaaactggggtatcaactggtggccgcttgagtgcttagaaaacaatgggttgcattttgtttgatgaGAGCggg > 6:150338‑M2/143‑149 (MQ=255) cGGTTCCGGGTCGAAGCTTGGCAGCGTCCACACATCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGGCGCTGGTGTGGTGTTCTTTGGTGGGCTTGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCgg < 1:245470/148‑1 (MQ=255) ttgaacaaggtcttgaggagttcgaagccagaagccaagaccggcaggtccgggctttgcttcggaaagcccggaaactgggggatcaactggtggccgcttgagtggttagaaaacaatgggttggattttttttgattaGAGCGGGt > 3:274698‑M2/142‑149 (MQ=255) ttgaacaaggtcttgaggagttcgaagccagaagccaagaccggcaggtccgggctttgcttcgcaaagcccggaaactggggtatcaactggtggccgcttgagtgcttagaaaacaatgggttgcattttgtttgatgaGAGCggg < 5:115727‑M2/7‑1 (MQ=255) ttctggcggagttcgatgccagaacccaagcccggctgggccgggttttgcttggaaaagcccggaaactggggtatcaactggtggccgcttgagtgcttagaaaacaatgggttgcattttgtttgatgaGAGCGGGTTCACCcgc < 8:254087‑M2/16‑1 (MQ=255) tcttgaggagttcgaagccagaagccaagaccggcaggtccgggcttttcttagcaaagcccggaaactggggtatcaactggtggccgcttgagtggttagaaaacaatggggtgcattttgtttgatgaTAGCGGGGTCACCcgcg > 6:264503‑M2/132‑148 (MQ=255) gAAGCTTGGCAGCGTCCACACATCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGa < 4:279551/148‑1 (MQ=255) gAAGCTTGGCAGCGTCCACACATCCACGCCCTCAAGGTCGCGGGCACAGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGatcacccagcccttcc < 5:98266‑M2/149‑17 (MQ=255) acacaTCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGatcacccagcccttccgggctgcgctgtcgcg < 6:187399‑M2/148‑33 (MQ=255) acacaTCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACaa > 5:299922/1‑149 (MQ=255) acacaTCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACaa < 6:210922/149‑1 (MQ=255) ctcaTCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGCCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAAc < 7:147189/147‑1 (MQ=255) aTCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTc < 6:89978/149‑1 (MQ=255) aTCCACGCCCTCGAGGTCGAGGGCACCGATCAGGTGGCTGGGGTGGTGTTCTATCGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCACTTGAAGGAGCGTGTTCACAAGCGAATGCTTAGGCAGCGACAAcca > 1:285418/1‑147 (MQ=255) ccTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGc > 5:246868/1‑147 (MQ=255) gctggtccgggctttgcttcgcaaagcccggaaactggggtatcaactggtggccgcttgagtgcttagaaaacaatgggttgcattttgtttgatgaga < 7:182336‑M2/2‑1 (MQ=255) gcaggtccgggctttgcttcgcaaagcccggaaactggggtatcaactggtggccgcttgagtgcttagaaaacaatgggttgcattttgtttgatgaGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGa < 7:38702‑M2/51‑1 (MQ=255) gAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGAc > 1:198406/1‑149 (MQ=255) caggtccgggctttgcttcgcaaagcccggaaactggggtatcaactggtggccgcttgagtgcttagaaaacaatgggttgcattttgtttgatgaGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGAc < 6:186518‑M2/52‑1 (MQ=255) gtccgggcttttcttcgcaaagccccgaaactggggtatcaactggtggccgcttgagtgcttagaaaacaatgggttgcattttgtttgatgaGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGa > 8:74981‑M2/95‑149 (MQ=255) gcgGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGAc < 1:304401/143‑1 (MQ=255) gcgGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGAc > 2:304401/1‑143 (MQ=255) gcgGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGc > 2:69704/1‑149 (MQ=255) cACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGatcacccagcccttccgggctgcgctgtcgcgcagcaaacatgaggtgtacggcttcagt > 2:254125‑M2/1‑89 (MQ=255) gATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCggg > 1:47261/1‑149 (MQ=255) ctcgaGGGCGCTGGGGGGGGGTGCTTGGGGGGGCAGGCTGGCCTGGGCTCACACCAGGTGCGGCCGACACGGTCCCTTGGCGGAGCGGGTTCACCCGCGACTGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCggg < 5:236523/145‑1 (MQ=255) gcaaagcccggaaactggggtatcaactggtggccgcttgagtgcttagaaaacaatgggttgcattttgtttgatgagag > 7:180149‑M2/79‑81 (MQ=255) gcaaagcccggaaactggggtatcaactggtggccgcttgagtgcttagaaaacaatgggttgcattttgtttgatgagag < 8:180149‑M2/3‑1 (MQ=255) ggTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCAGGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGCCACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCCGCGACAACCGCGCGGGCCAGGACCGACGCCTTCGCggggagag > 6:236523/1‑144 (MQ=255) caaagcccggaaactggggtatcaactggtggccgcttgagtgcttagaaaacaatgggttgcattttgtttgatgaGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAAc > 2:21731‑M2/78‑149 (MQ=255) tCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAAccc > 7:246720/1‑149 (MQ=255) gcccggaaactggggtatcaactggtggccgcttgagtgcttagaaaacaatgggttgcattttgtttgatgaGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGc > 5:212951‑M2/74‑149 (MQ=255) tgtTCTTTGGTGGTGATGCTTTCATGTTCTCAATACATGTTCGGCCGACATGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACaaaa < 2:285418/149‑1 (MQ=38) gtTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCt > 1:194251/1‑142 (MQ=255) gtTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCt < 2:194251/142‑1 (MQ=255) ttCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGatcacccagcccttaagggctgcgctgtcgctcagcaaacatgaggtgtacggcttcagttccgcagcgacgctgacattttga < 7:128961‑M2/148‑85 (MQ=255) gtatcaactggtggccgcttgagtgcttagaaaacaatgggttgcattttgtttgatgaGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAggcg < 1:21731‑M2/90‑1 (MQ=255) tttGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCAGCGAATGCGTCGGCAGCCACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGAAAACCCGCACCTACAAAAggcgc > 3:246703/1‑148 (MQ=255) actggtggccgcttgagtgcttagaaaacaatgggttgcattttgtttgatgaGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCg > 3:53780‑M2/54‑149 (MQ=255) gggCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACCACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCgg > 8:235005/1‑149 (MQ=255) gggCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCgg > 8:55328/1‑149 (MQ=255) gtggccgcttgagtgcttagaaaacaatgggttgcattttgtttgatgaGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTa > 3:232056‑M2/50‑149 (MQ=255) cATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGatcacccagcccttccgggctgcgctgtcgcgcagcaaacatgaggtgtacggcttcagttccgcagcgacgctgacattttgaaaaagaaaaggcg > 5:187399‑M2/1‑52 (MQ=255) aTGCTGTCATTTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTAt < 7:55328/149‑1 (MQ=255) aTGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTAt > 6:68249/1‑149 (MQ=255) gccggttgagtgatttgaaatcaatgggttgcattttgtttgatgaGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGGCTTGGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATgg < 4:53780‑M2/103‑1 (MQ=255) tCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGAtt > 4:67835/1‑86 (MQ=255) tCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGAtt < 3:67835/86‑1 (MQ=255) tGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATcgcg < 2:198406/149‑1 (MQ=255) 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gTAGGAGatcacccagcccttccgggctgcgctgtcgcgcagcaaacatgaggtgtacggcttcagttccgcagcgacgctgacattttgaaaaagaaaaggcggttggcccggtagggccagccgccttttgctttgttagggttcgt > 6:19726‑M2/1‑7 (MQ=255) tcggAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGCTTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATACCTTAGATCATTTCCTCGGCGCCCTTgccgcc < 2:238475/147‑1 (MQ=255) tAGGATttcacccacgacttccgggctgcgctgtcgcgcagcaaacatgaggtgtacggcttcagttccgcagcgacggtgacattttgaaaaagaaaaggcggttggcccggtagggccagcggccttttgctttgttagggttcgt > 4:272709‑M2/1‑6 (MQ=255) tAGGATatcacccagcccttccgtgctgcgctgtggcgcagcaaacatgaggtgtacggcttcatttccgcagcgaggctgacattttgaaaaagaaaaggcggttggcccgttagggccagccgccttttgctttgttagggttcgt > 6:182873‑M2/1‑6 (MQ=255) tAGGAGatcacccagcccttccgggctgcgctgtcgcgcagcaaacatgaggtgtacggcttcagttccgcagcgacgctgacattttgaaaaagaaaaggcggttggcccggtagggccagccgccttttgctttgttagggttcgtg < 6:109231‑M2/149‑144 (MQ=255) tAGGAGatcacccagcccttccgggctgcgctgtcgcgcagcaaacatgaggtgtaaggcttcagttccgcagcgacgctgacattttgaaaaagaaaaggcggttggcccggtagggccagccgccttttgctttgttagggttcgtg < 5:227324‑M2/149‑144 (MQ=255) ggAGatcacccagcccttccgggctgcgctgtcgcgcagcaaacatgaggtgtacggcttcagttccgcagcgacgctgacattttgaaaaagaaaaggcggttggcccggtagggccagccgccttttgctttgttagggttcgtgtg < 6:288365‑M2/149‑146 (MQ=255) ggAGatcacccagcccttccgggctgcgctgtcgcgcagcaaacatgaggtgtacggcttcagttccgcagcgacgctgacattttgaaaaagaaaaggcggttggcccggtagggccagccgccttttgctttgttagggttcgtgt > 6:288507‑M2/1‑4 (MQ=255) ggAGatcacccagcccttccgggctgcgctgtcgcgcagcaaacatgaggtgtacggcttcagttccgcagcgacgctgacattttgaaaaagaaaaggcggttggcccggtagggccagccgccttttgctttgttagggttcgtgt > 3:271848‑M2/1‑4 (MQ=255) ggAGatcacccagcccttccgggctgcgctgtcgcgcagcaaacatgaggtgtacggcttcagttccgcagcgacgctgacattttgaaaaagaaaaggcggttggcccggtagggccagccgccttttgctttgttagggttcgtgt > 3:179642‑M2/1‑4 (MQ=255) ggAGatcacccagcccttccgggctgcgctgtcgcgcagcaaacatgaggtgtacggcttcagttccgcagcgacgctgacattttgaaaaagaaaaggcggttggcccggtagggccagccgccttttgctttgtta > 5:163635‑M2/1‑4 (MQ=255) ggAGatcacccagcccttccgggctgcgctgtcgcgcagcaaacatgaggtgtacggcttcagttccgcagcgacgctgacattttgaaaaagaaaaggcggttggcccggtagggccagccgccttttgctttgtta < 6:163635‑M2/138‑135 (MQ=255) aGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATACCTTAGATCATTTCCTCGGCGCCCTTGCCGCCGa < 2:181454‑M2/148‑1 (MQ=255) gagatcacccagcccttccgggctgcgctgtcgcgcagcaaacatgaggtgtacggcttcagttccgcagcgacgctgacattttgaaaaagaaaaggcggttggcccggtagggccagccgccttttgctttgttagggttcgtgtgc < 5:255823‑M2/149‑147 (MQ=255) gagatcacccagcccttccgggctgcgctgtcgcgcagcaaacatgaggtgtacggcttcagttccgcagcgacgctgacattttgaaaaagaaaaggcggttggcccggtagggccagccgccttttgcttt < 7:189292‑M2/133‑131 (MQ=255) gagatcacccagcccttccgggctgcgctgtcgcgcagcaaacatgaggtgtacggcttcagttccgcagcgacgctgacattttgaaaaagaaaaggcggttggcccggtagggccagccgccttttgcttt > 8:189292‑M2/1‑3 (MQ=255) gagatcacccagcccttccgggctgcgctgtcgcgcagcaaacatgaggtgtacggcttcagttccgcagcgacgctgacattttgaaaaagaaaaggcg > 6:172929‑M2/1‑3 (MQ=255) gagatcacccagcccttccgggctgcgctgtcgcgcagcaaacatgaggtgtacggcttcagttacgcagcgccgctgacattttttaaaaagaaaaggcggtttgccccgtagggcccgcccccgtttg < 7:109626‑M2/130‑128 (MQ=255) gagatcacccagcccttccgggctgcgatgtcgcgcagcaaacatgaggtgtacggcttcagttccgcagcgacgctgacattttgaaaaagaaaaggcggttggcccggtagggccagccgccttttgctttgttagggttcgt > 6:242766‑M2/1‑3 (MQ=255) gagatcacccagcccttccgggcagcgctgtcgcgcagcaaacatgaggtgtacggcttcacttacgcagccacgctgacattttgaaaaagaaaaggcggttggcccggtagggccagccgcctattgctttgttagggttcgtgtgc < 7:126597‑M2/149‑147 (MQ=255) | GGGCTCCGGTTCCGGGTCGAAGCTTGGCAGCGTCCACACATCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGATCAGGTCGCTGGGGTGGTGTTCTTTGGTGGGCATGCTGTCATGTTCTCAAACCATGTTCGGCCGACACGGTCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGCAGCGACAACCTCGATTGCCAGGACCGACGCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAAGGCGGCGTCGGCTATGGGATCGCGAATACCTTAGATCATTTCCTCGGCGCCCTTGCCGCCGAG > NC_002947/4957416‑4957712 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |