New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4388379 | 51 (1.010) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 6.4% | coding (414/1263 nt) | PP_3864 | FluMu DNA circulation protein |
? | NC_002947 | = 4388429 | 40 (0.840) | coding (364/1263 nt) | PP_3864 | FluMu DNA circulation protein |
CCGGCGCACCTTGTTGACCTGCTGTCGCGCCCAGTTGACCTGGGCCATGGCCGCATCGAAACGCGCCTTGGCCGACTCCAGCAGGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGTTGAAGCGCACCATGCCCAGCTCGAAACGGGAATGGGAGATTTCGCAATCCCCCGCCGTGACGGTCAGGCGCCCGAACCACGGGTGTACAAGTTCGCCAGGCCCCGGCGTGTCCAGCGCAACCA > NC_002947/4388286‑4388575 | ccGGCGCACCTTGTTGACCTGCTGTCGCGCCCAGTTGACCTGGGCCATGGCCGCATCGAAACGCGCCTTGGCCGACTCCAGCAGGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGcgtgc > 3:178507‑M2/1‑144 (MQ=255) cGGCGCACCTTGTTGACCTGCTGTCGCGCCCAGTTGACCTGGGCCATGGCCGCATCGAAACGCGCGTTGGCCGACTCCAGAAGGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACTCGCTGCACCGGGAAGGCCAGcgtgcc > 5:189130‑M2/1‑143 (MQ=255) gcgcACCTTGTTGACCTGCTGTCGCGCCCAGTTGACCTGGGCCATGGCCGCATCGAAACGCGCCTTGGCCGACTCCAGCAGGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACC‑GGAAGGCCAGCGTGCCGTc < 7:66836/149‑1 (MQ=255) aCCTTGTTGACCTGCTGTCGCGCCCAGTTGACCTGGGCCATGGCCGCATCGAAACGCGCCTTGGCCGACTCCAGCAGGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGAt < 5:844/149‑1 (MQ=255) aCCTTGTTGACCTGCTGTCGCGCCCAGTTGACCTGGGCCATGGCCGCATCGAAACGCGCCTTGGCCGACTCCAGCAGGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGAt < 3:98481/149‑1 (MQ=255) cTTGTTGACCTGCTGTCGCGCCCAGTTGACCTGGGCCATGGCCGCATCGAAACGCGCCTTGGCCGACTCCAGCAGGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATg > 5:230859/1‑148 (MQ=255) tgttgACCTGCTGTCGCGCCCAGTTGACCTGGGCCATGGCCGCATCGAAACGCGCCTTGGCCGACTCCAGCAGGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGc > 4:33357‑M2/1‑133 (MQ=255) aCCTGCTGTCGCGCCCAGTTGACCTGGGCCATGGCCGCATCGAAACGCGCCTTGGCCGACTCCAGCAGGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAg < 2:40161/149‑1 (MQ=255) ctgctgTCGCGCCCAGTTGACCTGGGCCATGGCCGCATCGAAACGCGCCTTGGCCGACTCCAGCAGGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGAt > 1:160824/1‑138 (MQ=255) ctgctgTCGCGCCCAGTTGACCTGGGCCATGGCCGCATCGAAACGCGCCTTGGCCGACTCCAGCAGGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGAt < 2:160824/138‑1 (MQ=255) ctgctgTCGCGCCCAGTTGACCTGGGCCATGGCCGCATCGAAACGCGCCTTGGCCGACTCCAGCAGGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGt < 1:163040/149‑1 (MQ=255) ctgctgTCGCGCCCAGTTGACCTGGGCCATGGCCGCATCGAAACGCGCCTTGGCCGACTCCAGCAGGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGt > 2:163040/1‑149 (MQ=255) gcCCAGTTGACCTGGGCCATGGCCGCATCGAAACGCGCCTTGGCCGACTCCAGCAGGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGTTGAAGCGCAc > 4:90843/1‑149 (MQ=255) gcCCAGTTGACCTGGGCCATGGCCGCATCGAAACGCGCCTTGGCCGACTCCAGCAGGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGTTGAAGCGCAc > 4:95149/1‑149 (MQ=255) gACCTGGGCCATGGCCGCATCGAAACGCGCCTTGGCCGACTCCAGCAGGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGTTGAAGCGCACCATGccc < 2:44698/148‑1 (MQ=255) aCCTGGGCCATGGCCGCATCGAAACGCGCCTTGGCCGACTCCAGCAGGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGTTGAAGCGCACCATGCCCAg > 8:130575/1‑149 (MQ=255) cTGGGCCATGGCCGCATCGAAACGCGCCTTGGCCGACTCCAGCAGGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGTTGAAGCGCACCATGCCCAGCt > 6:218379/1‑149 (MQ=255) gggCCATGGCCGCATCGAAACGCGCCTTGGCCGACTCCAGCAGGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGCCGATGAACGCCAGGTTGAAGCGCACCATGCCCAGCTc < 5:100311/148‑1 (MQ=255) gggCCATGGCCGCATCGAAACGCGCCTTGGCCGACTCCAGCAGGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGCCGATGAACGCCAGGTTGAAGCGCACCATGCCCAGCTc > 6:100311/1‑148 (MQ=255) ccATGGCCGCATCGAAACGCGACTTGGCCGACTCCAGCAGGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGATGAAGCGCCACAAGCCCAGCTCGaaa > 8:290149/1‑149 (MQ=255) cATGGCCGCATCGAAACGCGCCTTGGCCGACTCCAGCAGGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGTTGAAGCGCACCATGCCCAGCTCGAAAc < 4:129696/149‑1 (MQ=255) cATGGCCGCATCGAAACGCGCCTTGGCCGACTCCAGCAGGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGTTGAAGCGCACCATGCCCAGCTCGAAAc > 5:182681/1‑149 (MQ=255) aTGGCCGCATCGAAACGCGCCTTGGCCGACTCCAGCAGGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGTTGAAGCGCACCATGCCCAGCTCGAAGCg > 6:278736/1‑149 (MQ=255) gCCGCATCGAAACGCGCCTTGGCCGACTCCAGCAGGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGTTGAAGCGCACCATGCCCAGCTCGAAACggg < 1:157608/148‑1 (MQ=255) gCATCGAAACGCGCCTTGGCCGACTCCAGCAGGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGTTGAAGCGCACCATGCCCAGCTCGAAACGGGAATg < 6:230859/149‑1 (MQ=255) gAAACGCGCCTTGGCCGACTCCAGCAGGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCa > 3:125269/1‑107 (MQ=255) gAAACGCGCCTTGGCCGACTCCAGCAGGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCa < 4:125269/107‑1 (MQ=255) gcgcCTTGGCCGACTCCAGCAGGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGTTGAAGCGCACCATGCCCAGCTCGAAACGGTAATGGGAGATTTCg < 6:182681/149‑1 (MQ=255) cGACTCCAGCAGGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGTTGAAGCGCACCATGCCCAGCTCGAAACGGGAATGGga < 1:239266/132‑1 (MQ=255) cGACTCCAGCAGGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGTTGAAGCGCACCATGCCCAGCTCGAAACGGGAATGGga > 2:239266/1‑132 (MQ=255) gACTCCAGCAGGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCTGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGTTGAAGCGCACCATGCCCAGCTCGAAACGGGAATGGGAGATTTCGCAATCCCccgc > 2:280003/1‑149 (MQ=255) tCCAGCAGGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGTTGAAGCGCACCATGCCCAGCt > 4:143707/1‑112 (MQ=255) tCCAGCAGGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGTTGAAGCGCACCATGCCCAGCt < 3:143707/112‑1 (MQ=255) cagcagGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGTTGAAGCGCACCATGCCCAGCTCGAAACGGGAATGGGAGATTTCGCAATCCCCCGCCGTGa > 2:261578/1‑149 (MQ=255) cagcagGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGTTGAAGCGCACCATGCCCAGCTCGAAACGGGAATGGGAGATTTCGCAATCCCCCGCCGTGa > 1:95807/1‑149 (MQ=255) cagGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGTTGAAGCGCACCATGCCCAGCTCGAAACGGGAATGGGAGATTTCGCAATCCCCCGCCGTGACgg > 7:72731/1‑149 (MQ=255) gggTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGcgtgccgaccctgctggagtcggccaaggcgcgtttcgatgcggccatggcccaggtcaactgggcgcgacagcaggtcaacaaggtg < 4:167223‑M2/149‑89 (MQ=255) gggcGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGTTGAAGCGCACCATGCCCAGCTCGAAACGGGAATGGGAGATTTCGCAATCCCCCGCCGTGACGGTCa < 3:54857/146‑1 (MQ=255) ggTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGTTGAAGCGCACCATGCCCAGCTCGAAACGGGAATGGGAGATTTc > 3:303014/1‑126 (MQ=255) ggTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGTTGAAGCGCACCATGCCCAGCTCGAAACGGGAATGGGAGATTTc < 4:303014/126‑1 (MQ=255) tCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGcgtgccgaccctgctggagtcggccaaggcgcgtttcgatgcggccatggcccaggtcaactgggcgcgacagcaggtcaacaaggtgcgc < 5:257581‑M2/149‑92 (MQ=255) cACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGTTGAAGCGCACCATGCCCAGCTCGAAACGGGAATGGGAGATTTCGCAATCCCCCGCCGTGACGGTCAGGCGcc < 8:72731/149‑1 (MQ=255) gTGCGCCGCCTGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCGGCACCGGTAAGTCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGTTGAAGCGCACCATGCCCAGCTCGAAACGGGAATGGGAGATTTCGCAATCCCCCGCCGTGACGGTCAGGCTCCCGa < 8:234509/149‑1 (MQ=255) gCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGTTGAAGCGCACCATGCCCAGCTCGAAACGGGAATGGGAGATTTCGCAATCCCCCGCCGTGACGGTCAGGCGCCCGAACCACGGGTGTAc > 4:71187/1‑148 (MQ=255) ccGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGcgtgccgaccctgctggagtcggccaaggcgcgtttcgatgcggccatggcccaggtcaactgggcgcgacagcaggtcaacaaggtgcgccgggccgtgtccagcgcctat > 6:257581‑M2/1‑36 (MQ=255) ggcggGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGt < 7:207442/57‑1 (MQ=255) ggcggGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGt > 8:207442/1‑57 (MQ=255) cggGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGTTGAAGCGCACCATGCCCAGCTCGAAACGGGAATGGGAGATTTCGCAATCCCCCGCCGTGACGGTCAGGCGCCCGAACCACGGGTGTACAAGTTc < 2:95807/149‑1 (MQ=255) gtgtTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGTTGAAGCGCACCATGCCCAGCTCGAAACGGGAATGGGAGATTTCGCAATCCCCCGCCGTGACGGTCAGGCGCCCGAACCACGGGTGTACAAGTTCGcc < 7:130575/149‑1 (MQ=255) tgtTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGTTGAAGCGCACCATGCCCAGCTCGAAACGGGAATGGGAGATTTCGCAATCCCCCGCCGTGACGGTCAGGCGCCCGAACCACGGGTGTACAAGTTCGCCa < 5:218379/149‑1 (MQ=255) cGCTGCACCTGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGTTGAAGCGCACCATGCCCAGCTCGAAACGGGAATGGGAGATTTCGCAATCCCCCGCCGTGACGGTCAGGCGCCCGAACCACGGGTGTACAAGTTCGCCAGGCCCCgg < 1:280003/149‑1 (MQ=255) cAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGTTGAAGCGCACCATGCCCAGCTCGAAACGGGAATGGGAGATTTCGCAATCCCCCGCCGTGACGGTCAGGCGCCCGAACCACGGGTGTACAAGTTCGCCAGGCCCCGGCGTGTCCAGCGCAACCa > 1:320956/1‑149 (MQ=255) | CCGGCGCACCTTGTTGACCTGCTGTCGCGCCCAGTTGACCTGGGCCATGGCCGCATCGAAACGCGCCTTGGCCGACTCCAGCAGGGTCGGCACGTGCGCCGCCAGTTGCCGGCGGGTGTTCACACGCTGCACCGGGAAGGCCAGCGTGCCGTCGATGAACGCCAGGTTGAAGCGCACCATGCCCAGCTCGAAACGGGAATGGGAGATTTCGCAATCCCCCGCCGTGACGGTCAGGCGCCCGAACCACGGGTGTACAAGTTCGCCAGGCCCCGGCGTGTCCAGCGCAACCA > NC_002947/4388286‑4388575 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |