Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,081 | G→C | 6.2% | A434G (GCC→GGC) | trmF ← | tRNA uridine 5‑carboxymethylaminomethyl modification protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,081 | 0 | G | C | 6.2% | 201.3 / 3.9 | 64 | A434G (GCC→GGC) | trmF | tRNA uridine 5‑carboxymethylaminomethyl modification protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (30/30); new base C (2/2); total (32/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.49e-01 |
GATTTCAGGCGCTGTTCCTCACGCTCGATACCGTCGCGCTTGGCGCAGAATGCGGCCCAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCCAGCAG > NC_002947/2934‑3226 | gATTTCAGGCGCTGTTCCTCACGCTCGATACCGTCGCGCTTGGCGCAGAATGCGGCCCAGCGCAAGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCCCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCgg > 1:72446/1‑148 (MQ=255) tttCAGGCGCTGTTCCTCACGCTCGATACCGTCGCGCTTGGCGCAGAATGCGGCCCAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCAc > 5:199652/1‑149 (MQ=255) aGGCGCTGTTCCTCACGCTCGATACCGTCGCGCTTGGCGCAGAATGCGGCCCAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGa < 1:202503/149‑1 (MQ=255) ggCGCTGTTCCTCACGCTCGATACCGTCGCGCTTGGCGCAGAATGCGGCCCAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAg > 2:45303/1‑149 (MQ=255) gcgcTGTTCCTCACGCTCGATACCGTCGCGCTTGGCGCAGAATGCGGCCCAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAgg < 6:171073/149‑1 (MQ=255) ttCCTCACGCTCGATACCGTCGCGCTTTGCGCAGAATGCGGCCCAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACa < 6:276635/149‑1 (MQ=255) aCGCTCGATACCGTCGCGCTTGGCGCAGAATGCGGCCCAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCgg < 6:199652/148‑1 (MQ=255) aCGCTCGATACCGTCGCGCTTGGCGCAGAATGCGGCCCAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCg < 1:45303/147‑1 (MQ=255) gCTCGATACCGTCGCGCTTGGCTCAGAATGCGGCCCAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTAc < 5:144429/149‑1 (MQ=255) gCTCGATACCGTCGCGCTTGGCGCAGAATGCGGCCCAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTAc > 7:289013/1‑149 (MQ=255) gCTCGATACCGTCGCGCTTGGCGCAGAATGCGGCCCAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTAc < 7:200870/149‑1 (MQ=255) tCGATACCGTCGCGCTTGGCGCAGAATGCGGCCCAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACgg > 7:26382/1‑149 (MQ=255) aTACCGTCGCGCTTGGCGCAGAATGCGGCCCAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTc < 6:158207/149‑1 (MQ=255) tACCGTCGCGCTTGGCGCAGAATGCGGCCCAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCTGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTcc < 4:244567/149‑1 (MQ=255) tACCGTCGCGCTTGGCGCAGAATGCGGCCCAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTcc > 7:230669/1‑149 (MQ=255) gcTTGGCGCAGAATGCGGCCCAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTAccc < 4:163210/149‑1 (MQ=255) ggCGCAGAATGCGGCCCAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAg < 8:26382/148‑1 (MQ=255) gcgcAGAATGCGGCCCAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAgg < 6:97596/148‑1 (MQ=255) aaTGCGGCCCAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAg > 4:2087/1‑149 (MQ=255) cGGCCCAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGgtcg > 3:204706/1‑149 (MQ=255) ggCCCAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAgg > 5:82095/1‑137 (MQ=255) ggCCCAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAgg < 6:82095/137‑1 (MQ=255) gCCCAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCCCGCAGTATCAGCCGGTACTCTGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGgtcgt > 1:290595/1‑148 (MQ=255) ccAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTcca < 8:289013/149‑1 (MQ=255) cAGCTCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTccac < 6:241282/149‑1 (MQ=255) cAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTccac > 5:34721/1‑149 (MQ=255) aGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTccac > 3:148098/1‑148 (MQ=255) gcTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTAACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAg > 5:237358/1‑148 (MQ=255) gTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGc < 6:237358/149‑1 (MQ=255) tCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGAt > 8:284172/1‑149 (MQ=255) gATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATg > 8:155274/1‑148 (MQ=255) aTCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGt < 5:190783/97‑1 (MQ=255) aTCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGt > 6:190783/1‑97 (MQ=255) gCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGAt > 8:286110/1‑141 (MQ=255) gCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGAt < 7:286110/141‑1 (MQ=255) gCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCt > 7:72439/1‑149 (MQ=255) gCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCt > 2:111176/1‑149 (MQ=255) cACGGGCCTTTTCGGTCAGGCCGAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCTGTTCTCGGCACTCGAGGTAAACTTGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTcgcg < 8:265835/148‑1 (MQ=255) cACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTcgcg < 7:155274/148‑1 (MQ=255) cACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCCGTACGTCTCCTGATTCCCCAAGGTAATAACGTCGACCACCAGTAAGCCGATGTATGCCTCGTcccg > 7:265835/1‑148 (MQ=255) aCGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTcgcggc > 1:102619/1‑149 (MQ=255) aCGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTcgcggc > 5:281208/1‑149 (MQ=255) ggCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTcgcggcgc < 2:290595/149‑1 (MQ=255) cccTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTcgcggcgcgg > 3:282374/1‑149 (MQ=255) cccTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCACGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTcgcggcgcgg > 8:89244/1‑149 (MQ=255) cgttttCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCTCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGAACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCggg < 2:72446/147‑1 (MQ=255) cTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCggg > 3:311400/1‑148 (MQ=255) ggTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAg < 3:2087/148‑1 (MQ=255) ggTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGc > 3:27039/1‑149 (MQ=255) tCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTg < 8:230669/149‑1 (MQ=255) gcAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACgg > 7:118008/1‑149 (MQ=255) cAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGCCCCGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGc > 4:231238/1‑149 (MQ=255) cAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGCCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGATCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGc > 4:226978/1‑149 (MQ=255) aGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGcc < 8:72439/149‑1 (MQ=255) tCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGACTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGaa < 3:35808/148‑1 (MQ=255) tCTTCGCGAAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTTATCAGGTCTTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACAAg > 7:133260/1‑126 (MQ=255) tCTACGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGATGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAg < 8:133260/126‑1 (MQ=255) gcgcAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTgcg < 6:281208/148‑1 (MQ=255) aTCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTa > 7:244120/1‑147 (MQ=255) aTCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTa < 8:244120/147‑1 (MQ=255) aGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTccc < 4:204706/149‑1 (MQ=255) tACTCGCCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCcag < 3:226978/149‑1 (MQ=255) tACTCGCCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCcag < 3:231238/149‑1 (MQ=255) aCTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCcag > 4:116058/1‑148 (MQ=255) tCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTAGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCcagcag > 7:14220/1‑149 (MQ=255) | GATTTCAGGCGCTGTTCCTCACGCTCGATACCGTCGCGCTTGGCGCAGAATGCGGCCCAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCCAGCAG > NC_002947/2934‑3226 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |