| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 341,306 | G→A | 7.2% | intergenic (‑200/‑178) | PP_5438 ← / → gabP‑I | hypothetical protein/gamma‑aminobutyrate permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 341,306 | 0 | G | A | 7.2% | 203.0 / 4.5 | 69 | intergenic (‑200/‑178) | PP_5438/gabP‑I | hypothetical protein/gamma‑aminobutyrate permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (32/32); new base A (3/2); total (35/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.72e-01 | |||||||||||
TTGATATCACAAGGTTGTACCCATGGGTTGCACTTTTTGGCATTGCAGTGGTGCACAGGTGTTACCGAGGAGCACCTTTGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAGTGCATTCGTCATATGGCGCGCTTATTGCCAGTTGGAAACCGCCGATTGCAGCGACGCCTAGGTCATCCCCTGGCGCGCTCTGTACCCGCAGTCGGC > NC_002947/341164‑341454 | ttGATATCACAAGGTTGTACCCATGGGTTGCACTTTTTGGCATTGCAGTGGTGCACAGGTGTTACCGAGGAGCACCTTTGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGCCATTGCATGACCGaaa < 4:184691/149‑1 (MQ=255) tGATATCACAAGGTTGTACCCATGGGTTGCACTTTTTGGCATTGCAGTGGTGCACAGGTGTTACCGAGGAGCACCTTTGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGaaa < 4:8283/148‑1 (MQ=255) gATATCACAAGGTTGTACCCATGGGTTGCACTTTTTGGCATTGCAGTGGTGCACAGGTGTTACCGAGGAGCACCTTTGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑Gc > 3:207067/1‑149 (MQ=255) atatCACAAGGTTGTACCCATGGGTTGCACTTTTTGGCATTGCAGTGGTGCACAGGTGTTACCGAGGAGCACCTTTGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑Gcc > 8:260696/1‑149 (MQ=255) tCACAAGGTTGTACCCATGGGTTGCACTTTTTGGCATTGCAGTGGTGCACAGGTGTTACCGAGGAGCACCTTTGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTc < 7:260696/149‑1 (MQ=255) cacaAGGTTGTACCCATGGGTTGCACTTTTTGGCATTGCAGTGGTGCACAGGTGTTACCGAGGAGCACCTTTGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTc > 7:108490/1‑148 (MQ=255) acaAGGTTGTACCCATGGGTTGCACTTTTTGGCATTGCAGTGGTGCACAGGTGTTACCGAGGAGCACCTTTGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTcc < 8:41593/148‑1 (MQ=255) acaAGGTTGTACCCATGGGTTGCACTTTTTGGCATTGCAGTGGTGCACAGGTGTTACCGAGGAGCACCTTTGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTc > 1:60062/1‑147 (MQ=255) ggTTGTACCCATGGGTTGCACTTTTTGGCATTGCAGTGGTGCACAGGTGTTACCGAGGAGCACCTTTGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGcc > 7:217035/1‑149 (MQ=255) tACCCATGGGTTGCACTTTTTGGCATTGCAGTGGTGCACAGGTGTTACCGAGGAGCACCTTTGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATc > 2:321279/1‑149 (MQ=255) aCCCATGGGTTGCACTTTTTGGCATTGCAGTGGTGCACAGGTGTTACCGAGGAGCACCTTTGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATc < 3:315550/148‑1 (MQ=255) gggTTGCACTTTTTGGCATTGCAGTGGTGCACAGGTGTTACCGAGGAGCACCTTTGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAg > 3:306808/1‑149 (MQ=255) ggTTGCACTTTTTGGCATTGCAGTGGTGCACAGGTGTTACCGAGGAGCACCTTTGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAg > 7:244480/1‑148 (MQ=255) ggTTGCACTTTTTGGCATTGCAGTGGTGCACAGGTGTTACCGAGGAGCACCTTTGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAg < 8:244480/148‑1 (MQ=255) cACTTTTTGGCATTGCAGTGGTGCACAGGTGTTACCGAGGAGCACCTTTGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGc < 5:10523/149‑1 (MQ=255) aCTTTTTGGCATTGCAGTGGTGCACAGGTGTTACCGAGGAGCACCTTTGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCa < 7:2768/149‑1 (MQ=255) tttGGCATTGCAGTGGTGCACAGGTGTTACCGAGGAGCACCTTTGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGaa < 2:187038/148‑1 (MQ=255) tttGGCATTGCAGTGGTGCACAGGTGTTACCGAGGAGCACCTTTGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAAt > 1:120283/1‑149 (MQ=255) gCAGTGGTGCACAGGTGTTACCGAGGAGCACCTTTGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGAc < 8:108490/148‑1 (MQ=255) cAGTGGTGCACAGGTGTTACCGAGGAGCACCTTTGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGa > 1:62396/1‑149 (MQ=255) aGTGGTGCACAGGTGTTACCGAGGAGCACCTTTGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGaaa > 2:318926/1‑103 (MQ=255) aGTGGTGCACAGGTGTTACCGAGGAGCACCTTTGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGaaa > 2:324005/1‑103 (MQ=255) aGTGGTGCACAGGTGTTACCGAGGAGCACCTTTGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGaaa < 1:324005/103‑1 (MQ=255) aGTGGTGCACAGGTGTTACCGAGGAGCACCTTTGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGaaa < 1:318926/103‑1 (MQ=255) caGGTGTTACCGAGGAGCACCTTTGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAGTGCATTCGt > 8:86496/1‑149 (MQ=255) aGGTGTTACCGAGGAGCACCTTTGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAGTGCATTCGt > 2:173386/1‑148 (MQ=255) gtgtTACCGAGGAGCACCTTTGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGaaa < 7:102547/91‑1 (MQ=255) gtgtTACCGAGGAGCACCTTTGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGaaa > 8:102547/1‑91 (MQ=255) gtgtTACCGAGGAGCACCTTTGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAGTGCATTCGTCa > 1:273772/1‑148 (MQ=255) ttACCGAGGAGCACCTTTGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAGTGCATTCGTCatat < 1:173386/148‑1 (MQ=255) ttACCAAGGAGCACCTTTTGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAATGCACTCGTCagaaa < 3:189284/149‑5 (MQ=255) aCCGAGGAGCACCTTTGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAGTGCATTCGTCATATGgc > 2:72974/1‑149 (MQ=255) ccGAGGAGCACCTTTGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGcc > 4:282032/1‑112 (MQ=255) ccGAGGAGCACCTTTGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGcc < 3:282032/112‑1 (MQ=255) cACCTTTGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAGTGCATTCGTCATATGGCGCGCTTAtt > 7:226969/1‑149 (MQ=255) tttGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAGTGCATTCGTCATATGGCGCGCTTATTGc > 2:58595/1‑147 (MQ=255) gttGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAGTGCATTCGTCATATGGCGCGCTTATTGc > 4:27520/2‑147 (MQ=255) gTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAGTGCATTCGTCATATGGCGCGCTTATTGCCAGTTg < 4:306808/149‑1 (MQ=255) tGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAGTGCATTCGTCATATGGCGCGCTTATTGCCAGTTgg < 2:197155/149‑1 (MQ=255) ggCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAGTGCATTCGTCATATGGCGCGCTTATTGCCAGTTgg < 2:201793/148‑1 (MQ=255) aGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAGTGCATTCGTCATATGGCGCGCTTATTGCCAGTTGGAAACCGCCGa < 1:58595/149‑1 (MQ=255) aGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAGTGCATTCGTCATATGGCGCGCTTATTGCCAGTTGGAAACCGCCGa < 3:27520/149‑1 (MQ=255) gTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCt > 8:73730/1‑93 (MQ=255) gTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCt < 7:73730/93‑1 (MQ=255) tttCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAGTGCATTCGTCATATGGCGCGCTTATTGCCAGTTGGAAACCGCCGATTGCAGc < 4:207067/148‑1 (MQ=255) tttCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAGTGCATTCGTCATATGGCGCGCTTATTGCCAGTTGGAAACCGCCGATTGCAGc > 5:256817/1‑148 (MQ=255) cAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAGTGCATTCGTCATATGGCGCGCTTATTGCCAGTTGGAAACCGCCGATTGCAGc > 4:222889/1‑145 (MQ=255) cAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAGTGCATTCGTCATATGGCGCGCTTATTGCCAGTTGGAAACCGCCGATTGCAGc < 3:222889/145‑1 (MQ=255) aGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAGTGCATTCGTCATATGGCGCGCTTATTGCCAGTTGGAAACCGCCGATTGCAGCGACGc < 2:60062/149‑1 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tttGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAGTGCATTCGTCATATGGCGCGCTTATTGCCAGTTGGAAACCGCCGATTGCAGCGACGCCTAGGTCATccc < 1:321279/148‑1 (MQ=255) gagggcTTTCGGACATTGCATGACCGAAAGGACCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAGTGCATTCGTCATATGGCGCGCTTATTGCCAGTTGGAAACCGCCGATTGCAGCTACGCCTAGGTCATCCACTgg > 2:71739/6‑149 (MQ=255) aGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAGTGCATTCGTCATATGGCGCGCTTATTGCCAGTTGGAAACCGCCGATTGCAGCGACGCCTAGGTCATCCCCTGgc > 8:152049/1‑149 (MQ=255) gcTTTCGGCCATTGCATGACCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAGTGCATTCGTCATATGGCGCGCTTATTGCCAGTTGGAAACCGCCGATTGCAGCGACGCCTAGGTCATCCCCTGgcgcgc > 1:61119/2‑149 (MQ=255) cTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAGTGCATTCGTCATATGGCGCGCTTATTGCCAGTTGGAAACCGCCGATTGCAGCGACGCCTAGGTCATCCCCTGgcgcgc < 7:86496/148‑1 (MQ=255) tttCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAGTGCATTCGTCATATGGCGCGCTTATTGCCAGTTGGAAACCGCCGATTGCAGCGACGCCTAGGTCATCCCCt > 2:196107/1‑140 (MQ=255) tttCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAGTGCATTCGTCATATGGCGCGCTTATTGCCAGTTGGAAACCGCCGATTGCAGCGACGCCTAGGTCATCCCCt < 1:196107/140‑1 (MQ=255) ggTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAGTGCATTCGTCATATGGCGCGCTTATTGCCAGTTGGAAACCGCCGATTGCAGCGACGCCTAGGTCATCCCCTGGCGCGCTCTGTa > 1:125843/1‑149 (MQ=255) cattgcaTGACCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAGTGCATTCGTCATATGGCGCGCTTATTGCCAGTTGGAAACCGCCGATTGCAGCGACGCCTAGGTCATCCCCTGGCGCGCTCTGTAccc > 8:10361/7‑149 (MQ=255) cattgcaTGACCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAGTGCATTCGTCATATGGCGCGCTTATTGCCAGTTGGAAACCGCCGATTGCAGCGACGCCTAGGTCATCCCCTGGCGCGCTCTGTAccc < 7:10361/143‑1 (MQ=255) ttGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAGTGCATTCGTCATATGGCGCGCTTATTGCCAGTTGGAAACCGCCGATTGCAGCGACGCCTAGGTCATCCCCTGGCGCGCTCTGTACCCg < 3:250345/148‑1 (MQ=255) gCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAGTGCATTCGTCATATGGCGCGCTTATTGCCAGTTGGAAACCGCCGATTGCAGCGACGCCTAGGTCATCCCCTGGCGCGCTCTGTACCCg > 4:247017/1‑147 (MQ=255) gCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAGTGCATTCGTCATATGGCGCGCTTATTGCCAGTTGGAAACCGCCGATTGCAGCGACGCCTAGGTCATCCCCTGGCGCGCTCTGTACCCg > 4:250345/1‑147 (MQ=255) aaTGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAGTGCATTCGTCATATGGCGCGCTTATTGCCAGTTGGAAACCGCCGATTGCAGCGACGCCTAGGTCATCCCCTGGCGCGCTCTGTACCCGCAGt > 3:264470/1‑149 (MQ=255) aaTGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAGTGCATTCGTCATATGGCGCGCTTATTGCCAGTTGGAAACCGCCGATTGCAGCGACGCCTAGGTCATCACCTGGCGCGCTCTGTACCCGCAg > 8:135911/1‑148 (MQ=255) gCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAGTGCATTCGTCATATGGCGCGCTTATTGCCAGTTGGAAACCGCCGATTGCAGCGACGCCTAGGTCATCCCCTGGCGCGCTCTGTACCCGCAGTCGGc > 6:66030/1‑149 (MQ=255) | TTGATATCACAAGGTTGTACCCATGGGTTGCACTTTTTGGCATTGCAGTGGTGCACAGGTGTTACCGAGGAGCACCTTTGGTGCATTTGTAAGTGGGTATTTCAGTAATCCGCTGATTTGAGGTCCTTTCGGTCATGCAATGGCCGAAA‑GCCCTCCAGGCCGCATCCTAAAAGGCCTGCAGAATTTTCTGACGAGTGCATTCGTCATATGGCGCGCTTATTGCCAGTTGGAAACCGCCGATTGCAGCGACGCCTAGGTCATCCCCTGGCGCGCTCTGTACCCGCAGTCGGC > NC_002947/341164‑341454 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |