Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,331,476 | A→T | 6.7% | E59V (GAA→GTA) | PP_3803 → | cation ABC transporter permease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,331,476 | 0 | A | T | 6.7% | 207.5 / 3.1 | 69 | E59V (GAA→GTA) | PP_3803 | cation ABC transporter permease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (32/32); new base T (2/3); total (34/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.61e-01 |
CCAGGACTGGGCCACTGCCGGTTATCTGCCCGAGGCGCTGGCCTACGGTTTCGTGGTCAATGCCTTGCTGGCCGGCCTGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACGGCAGCCTGTTCGGCTACTGCCTGCTGTTCGGCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCG > NC_002947/4331330‑4331621 | ccAGGACTGGGCCACTGCCGGTTATCTGCCCGAGGCGCTGGCCTACGGTTTCGTGGTCAATGCCTTGCTGGCCGGCCTGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAg > 7:174565/1‑149 (MQ=255) gACTGGGCCACTGCCGGTTATCTGCCCGAGGCGCTGGCCTACGGTTTCGTGGTCAATGCCTTGCTGGCCGGCCTGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGt > 5:323481/1‑149 (MQ=255) ggCCACTGCCGGTTATCTGCCCGAGGCGCTGGCCTACGGTTTCGTGGTCAATGCCTTGCTGGCCGGCCTGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGc > 7:187945/1‑148 (MQ=255) tGCCGGTTATCTGCCCGAGGCGCTGGCCTACGGTTTCGTGGTCAATGCCTTGCTGGCCGGCCTGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATgcgg > 4:89622/1‑149 (MQ=255) ccGGTTAGCTGGCCGAGGCGCTGGCCTACGGTTTCGTGGTCAATGCCTTGCTGGCCGGCCTGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGTTGGTGGGCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGTAGCGGTCGGCCATgcgg < 2:257621/147‑1 (MQ=255) ggTTATCTGCCCGAGGCGCTGGCCTACGGTTTCGTGGTCAATGCCTTGCTGGCCGGCCTGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCt < 5:293692/149‑1 (MQ=255) ggTTATCTGCCCGAGGCGCTGGCCTACGGCTTCGTGGTCAATGCCTTGCTGGCCGGCCTGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCt > 8:256217/1‑149 (MQ=255) gCCCGAGGCGCTGGCCTACGGTTTCGTGGTCAATGCCTTGCTGGCCGGCCTGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCg > 8:120768/1‑149 (MQ=255) gCCCGAGGCGCTGGCCTACGGTTTCGTGGTCAATGCCTTGCTGGCCGGCCTGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCg > 4:11482/1‑149 (MQ=255) cccGAGGCGCTGGCCTACGGTTTCGTGGTCAATGCCTTGCTGGCCGGCCTGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGt > 1:15033/1‑149 (MQ=255) ccGAGGCGCTGGCCTACGGTTTCGTGGTCAATGCCTTGCTGGCCGGCCTGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAg > 1:142428/1‑120 (MQ=255) ccGAGGCGCTGGCCTACGGTTTCGTGGTCAATGCCTTGCTGGCCGGCCTGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAg < 2:142428/120‑1 (MQ=255) ccGAGGCGCTGGCCTACGGTTTCGTGGTCAATGCCTTGCTGGCCGGCCTGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTg < 3:11482/149‑1 (MQ=255) cgcTGGCCTACGGTTTCGTGGTCAATGCCTTGCTGGCCGGCCTGATGCTCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATc > 1:246906/1‑149 (MQ=255) cgcTGGCCTACGGTTTCGTGGTCAATGCCTTGCTGGCCGGCCTGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCTATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATc < 1:166532/149‑1 (MQ=255) cgcTGGCCTACGGTTTCGTGGTCAATGCCTTGCTGGCCGGCCTGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATc < 1:171730/149‑1 (MQ=255) gcTGGCCTACGGTTTCGTGGTCAATGCCTTGCTGGCCGGCCTGATGTTCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCg < 2:246906/149‑1 (MQ=255) cTACGGTTTCGTGGTCAATGCCTTGCTGGCCGGCCTGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATcc < 7:120768/149‑1 (MQ=255) cTACGGTTTCGTGGTCAATGCCTTGCTGGCCGGCCTGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATcc > 3:163739/1‑149 (MQ=255) ggTTTCGTGGTCAATGCCTTGCTGGCCGGCCTGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCctgct < 5:61839/149‑1 (MQ=255) tttCGTGGTCAATGCCTTGCTGGCCGGCAGGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTgg < 3:72074/149‑1 (MQ=255) cGTGGTCAATGCCTTGCTGGCCGGCCTGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGt < 8:205288/148‑1 (MQ=255) tCAATGCCTTGCTGGCCGGCCTGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGccc < 7:256217/149‑1 (MQ=255) ttGCTGGCCGGCCTGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCgg > 7:758/1‑149 (MQ=255) gCTGGCCGGCCTGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGc < 4:163739/148‑1 (MQ=255) cTGGCCGGCCTGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGcc < 2:15033/148‑1 (MQ=255) tGGCCGGCCTGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCt > 7:289262/1‑149 (MQ=255) tGGCCGGCCTGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCt > 3:148446/1‑149 (MQ=255) caccgggcCGATCATCAGGCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCt > 6:268619/3‑148 (MQ=255) gccggccTGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTAGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTa < 8:160021/149‑1 (MQ=255) gccggccTGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTGGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTa < 4:238324/149‑1 (MQ=255) cggccTGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGt < 6:277749/81‑1 (MQ=255) cggccTGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGt > 5:277749/1‑81 (MQ=255) cggccTGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACg > 7:17848/1‑149 (MQ=255) cggccTGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACg < 6:323481/149‑1 (MQ=255) ggccTGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACgg < 8:174565/149‑1 (MQ=255) ggccTGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACgg < 8:84798/149‑1 (MQ=255) ccTGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACgg > 5:190748/1‑147 (MQ=255) gatgatCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACg < 3:194102/143‑1 (MQ=255) gatgatCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACg > 4:194102/1‑143 (MQ=255) tCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACGGCAGCCTGTTc < 3:89622/149‑1 (MQ=255) gCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCt > 3:206855/1‑82 (MQ=255) gCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCt < 4:206855/82‑1 (MQ=255) gCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACGGCAGCCTGTTCgg < 2:274266/148‑1 (MQ=255) gCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACGGCAGCCTGTTCgg > 1:274266/1‑148 (MQ=255) gCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACGGCAGCCTGTTCGGc < 4:148446/149‑1 (MQ=255) cTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACGGCAGCCTGTTCGGCTActgcct > 5:307026/1‑149 (MQ=255) ggTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGTAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACGGCAGCCTGTTCGGCTACTGCctgct > 6:305480/1‑149 (MQ=255) ggTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGTAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACGGCAGCCTGTTCGGCTACTGCctgct > 6:310052/1‑149 (MQ=255) ggTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCt > 1:293032/1‑71 (MQ=255) ggTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCt < 2:293032/71‑1 (MQ=255) gCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACGGCAGCCTGTTCGGCTa < 8:266429/130‑1 (MQ=255) gCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACGGCAGCCTGTTCGGCTa > 7:266429/1‑130 (MQ=255) cACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACGGCAGCCTGTTCGGCTACTGCCTGCTGTTCGGCATcc > 5:183923/1‑149 (MQ=255) ggtggtggtCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACGGCAGCCTGTTCGGCTACTGCCTGCTGTTCGGCATCCTGCTc < 8:17848/148‑1 (MQ=255) tCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACGGCAGCCTGTTCGGCTACTGCCTGCTGTTCGGCATCCTGCTCAACTTCCTg > 1:133583/1‑149 (MQ=255) tCAAGCGAGTTGCGTTATTCTATGAAGCGGTCGGCCATGCGTCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACGGCAGCCTGTTCGGCTACTGCCTGCTGTTCGGCATCCTGCTCAACTTCCTg < 8:289262/149‑1 (MQ=255) aaGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGTAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACGGCAGCCTGTTCGGCTACTGCCTGCTGTTCGGCATCCTGCTCAACTTCCTgc < 5:305480/148‑1 (MQ=255) aaGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGTAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACGGCAGCCTGTTCGGCTACTGCCTGCTGTTCGGCATCCTGCTCAACTTCCTgc < 5:310052/148‑1 (MQ=255) aaGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACGGCAGCCTGTTCGGCTACTGCCTGCTGTTCGGCATCCTg < 5:75212/135‑1 (MQ=255) aaGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACGGCAGCCTGTTCGGCTACTGCCTGCTGTTCGGCATCCTg > 6:75212/1‑135 (MQ=255) gcTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACGGCAGCCTGTTCGGCTACTGCCTGCTGTTCGGCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAAc > 5:94002/1‑149 (MQ=255) gCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACGGCAGCCTGTTCGGCTACTGCCTGCTGTTCGGCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTAc > 5:298856/1‑149 (MQ=255) cGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACGGCAGCCTGTTCGGCTACTGCCTGCTGTTCGGCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTAcc < 6:183923/149‑1 (MQ=255) ttctCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACGGCAGCCTGTTCGGCTACTGCCTGCTGTTCGGCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCt > 4:158252/1‑149 (MQ=255) ctctGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACGGCAGCCTGTTCGGCTActgcctgc > 4:144815/1‑104 (MQ=255) ctctGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACGGCAGCCTGTTCGGCTActgcctgc < 3:144815/104‑1 (MQ=255) tctGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACGGCAGCCTGTTCGGCTACTGCCTGCTGTTCGGCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTc > 1:2497/1‑149 (MQ=255) tGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACGGCAGCCTGTTCGGCTACTGCCTGCTGTTCGGCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTc < 8:758/147‑1 (MQ=255) aaGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACGGCAGCCTGTTCGGCTACTGCCTGCTGTTCGGCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCg < 6:307026/146‑1 (MQ=255) | CCAGGACTGGGCCACTGCCGGTTATCTGCCCGAGGCGCTGGCCTACGGTTTCGTGGTCAATGCCTTGCTGGCCGGCCTGATGATCGGCCCGGTGCTGGGTGGCCTGGGCACCTTGGTGGTGGTCAAGCGCTTTGCGTTCTTCTCTGAAGCGGTCGGCCATGCGGCGCTGACCGGCGTGGCCATCGGTATCCTGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACGGCAGCCTGTTCGGCTACTGCCTGCTGTTCGGCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCG > NC_002947/4331330‑4331621 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |