| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,633,811 | C→A | 7.3% | A434S (GCA→TCA) ‡ | uvrC ← | UvrABC system protein C |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,633,811 | 0 | C | A | 7.3% | 210.4 / 3.5 | 67 | A434S (GCA→TCA) ‡ | uvrC | UvrABC system protein C |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (30/32); new base A (2/3); total (32/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CCAGCTCCTGCATCACATCGCGGGCCATGTTCAGCTGGCCCTTGCCGCCGTCCACCAGCAGCACATCGGGCAGCTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGCCGAACACCACGCAACTGGCCACGGTAGCTTCACCACTGGAGTGGCTGATGTCGTAGCATTCCAGGCGTTGCGGCACTTCATCCAGGCCCAG > NC_002947/4633664‑4633958 | ccAGCTCCTGCATCACATCGCTGGCCATGATCAGCTGGCCCTTGCCGCCGTCCACCAGCCGCACATCGCCCAGCTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGCCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCg > 5:91109/1‑149 (MQ=255)ccAGCTCCTGCATCACATCGCGGGCCATGTTCAGCTGGCCCTTGCCGCCGTCCACCAGCAGCACATCGGGCAGCTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCg < 2:98585/149‑1 (MQ=255) aGCTCCTGCATCACATCGCGGGCCATGTTCAGCTGGCCCTTGCCGCCGTCCACCAGCAGCACATCGGGCAGCTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGt < 2:26903/149‑1 (MQ=255) cTGCATCACATCGCGGGCCATGTTCAGCTGGCCCTTGCCGCCGTCCACCAGCAGCACATCGGGCAGCTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGt > 3:226431/1‑149 (MQ=255) cATCACCTCGCGGTCCATGTTCAGCTGGCCCTTGCCGCCGGCCACCAGCAGCACATCGGGCAGGTTGCCCTCGCCGTCCATGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATGGTCACCGCAGGTGACgatt < 4:195990/148‑4 (MQ=255) cATCACATCGCGGGCCATGTTCAGCTGGCCCTTGCCGCCGTCCACCAGCAGCACATCGGGCAGCTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCtt < 4:186018/149‑1 (MQ=255) cATCACATCGCGGGCCATGTTCAGCTGGCCCTTGCCGCCGTCCACCAGCAGCACATCGGGCAGCTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCGCAGGTGACgatt > 3:195990/1‑145 (MQ=255) aTCACATCGCGGGCCATGTTCAGCTGGCCCTTGCCGCCGTCCACCAGCAGCACATCGGGCAGCTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTc < 7:82781/149‑1 (MQ=255) acaTCGCGGGCCATGTTCAGCTGGCCCTTGCCGCCGTCCACCAGCAGCACATCGGGCAGCTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCTTCACCTGCGGTGACGTCTTCGa < 6:178583/148‑1 (MQ=255) aTCGCGGGCCATGTTCAGCTGGCCCTTGCCGCCGTCCACCAGCAGCACATCGGGCAGCTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGt < 3:68743/149‑1 (MQ=255) tCGCGGGCCATGTTCAGCTGGCCCTTGCCGCCGTCCACCAGCAGCACATCGGGCAGCTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGAGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGtt > 4:191214/1‑149 (MQ=255) gcgGGCCATGTTCAGCTGGCCCTTGCCGCCGTCCACCAGCAGCACATCGGGCAGCTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTg < 1:138643/148‑1 (MQ=255) gCCATGTTCAGCTGGCCCTTGCCGCCGTCCACCAGCAGCACATCGGGCAGCTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAgcg > 7:140966/1‑149 (MQ=255) gTTCAGCTGGCCCTTGCCGCCGTCCACCAGCAGCACATCGGGCAGCTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGtt < 6:61052/138‑1 (MQ=255) gTTCAGCTGGCCCTTGCCGCCGTCCACCAGCAGCACATCGGGCAGCTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGtt > 5:61052/1‑138 (MQ=255) ttCAGCTGGCCCTTGCCGCCGTCCACCAGCAGCACATCGGGCAGCTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTa < 2:173963/149‑1 (MQ=255) tGGCCCTTGCCGCCGTCCACCAGCAGCACATCGGGCAGCTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCgta > 8:7923/1‑147 (MQ=255) gCCCTTGCCGCCGTCCACCAGCAGCACATCGGGCAGCTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGAc < 6:199954/148‑1 (MQ=255) gCCCTTGCCGCCGTCCACCAGCAGCACATCGGGCAGCTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACt < 1:141281/149‑1 (MQ=255) gCCCTTGCCGCCGTCCACCAGCAGCACATCGGGCAGCTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGGCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGACGCGGCGGTAGTCGGAc < 6:30552/148‑1 (MQ=255) ccTTGCCGCCGTCCACCAGCAGCACATCGGGCAGCTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACtt > 1:224709/1‑148 (MQ=255) gccgccGTCCACCAGCAGCACATCGGGCAGCTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATc < 8:140966/148‑1 (MQ=255) gccgccGTCCACCAGCAGCACATCGGGCAGCTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACATCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATc < 7:234654/148‑1 (MQ=255) ccgccgTCCACCAGCAGCACATCGGGCAGCTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCg < 5:55800/148‑1 (MQ=255) ccgTCCACCAGCAGCACATCGGGCAGCTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGccc < 3:191214/149‑1 (MQ=255) tCCACCAGCAGCACATCGGGCAGCTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGCCGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCTGACTTGATAGGCCCTTc > 4:197131/1‑149 (MQ=255) cagcagCACATCGGGCAGCTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAgcggc < 6:29349/119‑1 (MQ=255) cagcagCACATCGGGCAGCTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAgcggc > 5:29349/1‑119 (MQ=255) cagcagCACATCGGGCAGCTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGc < 4:226431/149‑1 (MQ=255) aTCGGGCAGCTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGCCGAAcacca > 6:31323/1‑149 (MQ=255) ggCAGCTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGCCGAACACCACGc > 3:47983/1‑148 (MQ=255) ggCAGCTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGCCGAACACCACGc > 8:208077/1‑148 (MQ=255) ggCAGCTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGCCGAACACCACGc > 2:50395/1‑148 (MQ=255) gCTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGCCGAACACCACGCAACTg > 2:210127/1‑149 (MQ=255) cTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTc > 7:167282/1‑108 (MQ=255) cTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTc < 8:167282/108‑1 (MQ=255) ttGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGCCGAACACCACGCAACTGGc > 3:315541/1‑149 (MQ=255) gtCGCGGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCggg < 2:126947/122‑1 (MQ=255) cTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCggg > 1:126947/1‑123 (MQ=255) tGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGAGGTAGTCGTACTTTATCGGCCCTTCGGGGCCGAACACCACGCACCTGGCCACGGTAGCTTcacca > 1:99280/1‑149 (MQ=255) tGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGCCGAACACCACGCAACTGGCCACgg > 3:86199/1‑135 (MQ=255) tGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGCCGAACACCACGCAACTGGCCACgg < 4:86199/135‑1 (MQ=255) cATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGCCGAACACCACg < 6:317317/116‑1 (MQ=255) cATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGCCGAACACCACg > 5:317317/1‑116 (MQ=255) aTAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGCCGAACACCACGCAACTGGCCACGGTAGCTTCACCACTGGAGt < 7:201456/146‑1 (MQ=255) aTAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGCCGAACACCACGCAACTGGCCACGGTAGCTTCACCACTGGAGt > 8:201456/1‑146 (MQ=255) aGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGCCGAACACCACGCAACTGGCCACGGTAGCTTCACCACTGGAGTGGCt > 4:179927/1‑148 (MQ=255) ggcggGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGCCGAACACCACGCAACTGGCCACGGTAGCTTCACCACTGGAGTGGCTGATg < 2:224709/149‑1 (MQ=255) gcggGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGCCGAACACCACGCAACTGGCCACGGTAGCTTCACCACTGGAGTGGCTGATGt > 4:196000/1‑149 (MQ=255) ggCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGCCGAaca < 6:66282/95‑1 (MQ=255) ggCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGCCGAaca > 5:66282/1‑95 (MQ=255) cTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGCCGAACACCACGCAACTGGCCACGGTAGCTTCACCACTGGAGTGGCTGATGTCGTAGCATTCCa < 1:210127/149‑1 (MQ=255) gATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGCCGAACACCACGCAACTGGCCACGGTAGCTTCACCACTGGAGTGGCTGATGTCGTAGCATTCCAgg > 3:251211/1‑149 (MQ=255) aTGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGCCGAACACCACGCAACTGGCCACGGTAGCTTCACCACTGGAGTGGCTGATGTCGTAGCATTCCAg < 7:208077/147‑1 (MQ=255) aTGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGCCGAACACCACGCAACTGGCCACGGTAGCTTCACCACTGGAGTGGCTGATGTCGTAGCATTCCAGGc > 1:78954/1‑149 (MQ=255) atcgCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGCCGAACACCACGCATCTGGCCACGGTAGCTTCACCACTGGAGTGGCTGATGTCGTAGCATTCCAGGCGTTg < 5:241510/146‑1 (MQ=255) gCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGGGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGGCGAACACGACGCAACTGGCCACGGTAGCTTCACCACTGGAGTGGCTGATGTCGTAGGATTCCAGGCGTTGCgg > 1:226384/1‑149 (MQ=255) gCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGCCGAACACCACGCAACTGGCCACGGTAGCTTCACCACTGGAGTGGCTGATGTCGTAGCATTCCAGGCGTTGCGGCAc < 4:315541/149‑1 (MQ=255) cATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGCCGAACACCACGCAACTGGCCACGGTAGCTTCACCACTGGAGTGGCTGATGTCGTAGCATTCCAGGc < 8:288966/138‑1 (MQ=255) cATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGCCGAACACCACGCAACTGGCCACGGTAGCTTCACCACTGGAGTGGCTGATGTCGTAGCATTCCAGGc > 7:288966/1‑138 (MQ=255) aagacGTCACCGCAGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGCCGAACACCACGCAACTGGCCACGGTAGCTTCACCACTGGAGTGGCTGATGTCGTAGCATTCCAGGCGTTGCgg > 5:128424/5‑143 (MQ=255) aagacGTCACCGCAGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGCCGAACACCACGCAACTGGCCACGGTAGCTTCACCACTGGAGTGGCTGATGTCGTAGCATTCCAGGCGTTGCgg < 6:128424/139‑1 (MQ=255) tCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGCCGAACACCACGCAACTGGCCACGGTAGCTTCACCACTGGAGt > 7:133482/1‑109 (MQ=255) tCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGCCGAACACCACGCAACTGGCCACGGTAGCTTCACCACTGGAGt < 8:133482/109‑1 (MQ=255) gTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGCCGAACACCACGCAACTGGCCACGGTAGCTTCACCACTGGAGTGGCTGATGTCGTAGCATTCCAGGCGTTGCGGCACTTCATcc < 4:47983/148‑1 (MQ=255) aCCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGCCGAACACCACGCAACTGGCCACGGTAGCTTCACCACTGGAGTGGCTGATGTCGTAGCATTCCAGGCGTTGCGGCACTTCATCCAGGc > 1:198162/1‑149 (MQ=255) ccTGAGGTGAAGTAGTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGCCGAACACCACGCAACTGGCCACGGTAGCTTCACCACTGGAGTGGCTGATGTCGTAGCATTCCAGGCGTTGCGGCACTTCATCCAGGcc < 5:287627/149‑1 (MQ=255) cGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGCCGAACACCACGCAACTGGCCACGGTAGCTTCACCACTGGAGTGGCTGATGTCGTAGCATTCCAGGCGTTGCGGCACTTCATCCAGGCCCa < 3:179927/147‑1 (MQ=255) cGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGCCGAACACCACGCAACTGGCCACGGTAGCTTCACCACTGGAGTGGCTGATGTCGTAGCATTCCAGGCGTTGCGGCACTTCATCCAGGCCCAg < 1:50395/148‑1 (MQ=255) | CCAGCTCCTGCATCACATCGCGGGCCATGTTCAGCTGGCCCTTGCCGCCGTCCACCAGCAGCACATCGGGCAGCTTGCCCTCGCCGTCCTTGATGCGCCCATAGCGGCGGGTCAGGGCCTGATGCATGGCCGCATAATCGTCACCTGCGGTGACGTCTTCGATGTTGAAGCGGCGGTAGTCGGACTTGATCGGCCCTTCGGGGCCGAACACCACGCAACTGGCCACGGTAGCTTCACCACTGGAGTGGCTGATGTCGTAGCATTCCAGGCGTTGCGGCACTTCATCCAGGCCCAG > NC_002947/4633664‑4633958 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |