| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,790,281 | A→G | 7.2% | L1187L (TTG→CTG) | pvdI ← | non‑ribosomal peptide synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,790,281 | 0 | A | G | 7.2% | 201.5 / 4.3 | 69 | L1187L (TTG→CTG) | pvdI | non‑ribosomal peptide synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (30/34); new base G (2/3); total (32/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCCCATCGACCAGCCGTCGGAGACGATGTGGTGCAGGGTCACGAGCAGTAGGTGCTCCTGCTC‑‑GCCACGCTGATACAGCTTCATGCGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCAAGCCAGGCACACCTTGCTGCTCTTCGAAACAGGTACGCAATGATTCATGCCGTGACACCAGCGCCGAAAACGCTTGG > NC_002947/4790135‑4790429 | gCCCATCGACCAGCCGTCGGAGACGATGTGGTGCAGGGTCACGAGCAGTAGGTGCTCCTGCTCAGGCCACGCTGATACAGCTTCATGCGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCaa > 1:96405/1‑149 (MQ=255)gCCCATCGACCAGCCGTCGGAGACGATGTGGTGCAGGGTCACGAGCAGTAGGTGCTCCTGCTC‑‑GCCACGCTGATACAGCTTCATGCGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCaa > 4:142035/1‑147 (MQ=255)gCCCATCGACCAGCCGTCGGAGACGATGTGGTGCAGGGTCACGAGCAGTAGGTGCTCCTGCTC‑‑GCCACGCTGATACAGCTTCATGCGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACa < 2:181297/149‑1 (MQ=255) gACCACCCGTCGCACCCGTTGTGGGCCAGGGTCCCGAGCAGTAGGTGCCCCTGCCC‑‑GCCACGCTGAAACAGCTTCATCCCAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGGCTAAGGGCTGCTGGATGGCGGCCTGCAACTGTTGCAGCAGTTgcag < 6:197176/149‑3 (MQ=255) ccAGCCGTCGGAGACGATGTGGTGCAGGGTCACGAGCAGTAGGTGCTCCTGCTC‑‑GCCACGCTGATACAGCTTCATGCGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCgg < 5:128886/149‑1 (MQ=255) cAGCCGTCGGAGACGATGTGGTGCAGGGTCACGAGCAGTATGTGCTCCTGCTC‑‑GCCACGCTGATACAGCTTCATGCGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCggg < 6:160128/149‑1 (MQ=255) cAGCCGTCGGAGACGATGTGGTGCAGGGTCACGAGCAGTAGGTGCTCCTGCTC‑‑GCCACGCTGATACAGCTTCATGCGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCggg < 4:60748/149‑1 (MQ=255) cAGCCGTCGGAGACGATGTGGTGCAGGGTCACGAGCAGTAGGTGCTCCTGCTC‑‑GCCACGCTGATACAGCTTCATGCGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCggg < 7:78147/149‑1 (MQ=255) gTCGGAGACGATGTGGTGCAGGGTCACGAGCAGTAGGTGCTCCTGCTC‑‑GCCACGCTGATACAGCTTCATGCGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCa > 4:256126/1‑148 (MQ=255) gTCGGAGACGATGTGGTGCAGGGTCACGAGCAGTAGGTGCTCCTGCTC‑‑GCCACGCTGATACAGCTTCATGCGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCa > 5:133364/1‑148 (MQ=255) aTGTGGTGCAGGGTCACGAGCAGTAGGTGCTCCTGCTC‑‑GCCACGCTGATACAGCTTCATGCGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTg‑cgc < 2:96405/149‑1 (MQ=255) tgtgGTGCAGGGTCACGAGCAGTAGGTGCTCCTGCTC‑‑GCCACGCTGATACAGCTTCATGCGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGcc < 3:256126/149‑1 (MQ=255) gtgCAGGGTCACGAGCAGTAGGTGCTCCTGCTC‑‑GCCACGCTGATACAGCTTCATGCGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCggg < 6:276776/129‑1 (MQ=255) gtgCAGGGTCACGAGCAGTAGGTGCTCCTGCTC‑‑GCCACGCTGATACAGCTTCATGCGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCggg > 5:276776/1‑129 (MQ=255) gtgCAGGGTCACGAGCAGTAGGTGCTCCTGCTC‑‑GCCACGCTGATACAGCTTCATGCGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCctgc < 1:289780/148‑1 (MQ=255) cGAGCAGTAGGTGCTCCTGCTC‑‑GCCACGCTGATACAGCTTCATGCGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAgg < 3:142035/149‑1 (MQ=255) aGCAGTAGGTGCTCCTGCTC‑‑TCCACGCTGATACAGCTGCATGCGAATCAGCGGCACGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGt < 8:249220/149‑1 (MQ=255) gTAGGTGCTCCTGCTC‑‑GCCACGCTGATACAGCTTCATGCGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCtgctgctgc < 5:111186/137‑1 (MQ=255) gTAGGTGCTCCTGCTC‑‑GCCACGCTGATACAGCTTCATGCGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCtgctgctgc > 6:111186/1‑137 (MQ=255) tGCTCCTGCTC‑‑GCCACGCTGATACAGCTTCATGCGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACcgc > 4:280922/1‑146 (MQ=255) tCCTGCTC‑‑GCCACGCTGATACAGCTTCATGCGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGTTGCAGCAGTTgc > 5:156903/1‑99 (MQ=255) tCCTGCTC‑‑GCCACGCTGATACAGCTTCATGCGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGTTGCAGCAGTTgc < 6:156903/99‑1 (MQ=255) tCCTGCTC‑‑GCCACGCTGATACAGCTTCATGCGAATCAGAGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTTACCGCGAGAtt > 2:156361/1‑149 (MQ=255) cTC‑‑GCCACGCTGATACAGCTTCATGCGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGc < 4:173222/147‑1 (MQ=255) gCCACGCTGATACAGCTTCATGCGAATCAGCGGCCCGTTGGTAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTg < 2:115012/147‑1 (MQ=255) gCCACGCTGATACAGCTTCATGCGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGa > 8:29012/1‑149 (MQ=255) cACGCTGATACAGCTTCATGCGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGc > 8:152272/1‑103 (MQ=255) cACGCTGATACAGCTTCATGCGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGc < 7:152272/103‑1 (MQ=255) cACGCTGATACAGCTTCATGCGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGAcg > 5:294671/1‑149 (MQ=255) aCGCTGATACAGCTTCATGCGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGAcgc < 1:156361/149‑1 (MQ=255) aCGCTGATACAGCTTCATGCGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGAcgc < 2:196299/149‑1 (MQ=255) cGCTGATACAGCTTCATGCGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGAcgcg < 3:280922/149‑1 (MQ=255) aCAGCTTCATGCGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCAAGc > 3:45455/1‑147 (MQ=255) aGCTTCATGCGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCAAGCCAgg < 4:45455/149‑1 (MQ=255) aTGCGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCaa > 6:204109/1‑137 (MQ=255) aTGCGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCaa < 5:204109/137‑1 (MQ=255) gCGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCAAGCCAGGCACACCt > 6:125719/1‑148 (MQ=255) gCGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCAAGCCAGGCACACCt < 5:125719/148‑1 (MQ=255) cGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCAAGCCAGGCACACCTtg < 3:225763/149‑1 (MQ=255) gAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCAAGCCAGGCACACCTtgc > 5:143995/1‑149 (MQ=255) aTCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCAAGCCAGGCACACCTtgctg < 6:294671/149‑1 (MQ=255) cAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCAAGCCAGGCACACCTTgctgct > 7:8422/1‑149 (MQ=255) cGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCAAGCCAGGCACACCTTGCTGCTCtt > 4:91803/1‑149 (MQ=255) ggCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCAAGCCAGGCACACCTTGCTGCTCTTc < 8:8422/149‑1 (MQ=255) cGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCAAGCCAGGca > 4:89142/1‑129 (MQ=255) cGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCAAGCCAGGca < 3:89142/129‑1 (MQ=255) ttGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCAAGCCAGGCACACCTTGCTGCTCTTCGAAACa < 3:91803/149‑1 (MQ=255) aaGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCAAGCCAGGCACACCTTGCTGCTCTTCGAAACAGGTAc > 6:31822/1‑149 (MQ=255) aGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCAAGCCAGGCACACCTTGCTGCTCTTCGAAACAGGTACg < 7:29012/149‑1 (MQ=255) tCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCAAGCCAGGCACACCTtgct < 5:4999/127‑1 (MQ=255) tCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCAAGCCAGGCACACCTtgct > 6:4999/1‑127 (MQ=255) tCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCAAGCCAGGCACACCTTGCTGCTCTTCGAAACAGGTACGCaa > 3:100754/1‑149 (MQ=255) gAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCAAGCCAGGCACACCTTGCTGCTCTTCGAAACa < 3:57174/138‑1 (MQ=255) gAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCAAGCCAGGCACACCTTGCTGCTCTTCGAAACa < 3:61584/138‑1 (MQ=255) gAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCAAGCCAGGCACACCTTGCTGCTCTTCGAAACa > 4:57174/1‑138 (MQ=255) gAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCAAGCCAGGCACACCTTGCTGCTCTTCGAAACa > 4:61584/1‑138 (MQ=255) aaTGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCAAGCCAGGcac > 7:216993/1‑116 (MQ=255) aaTGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCAAGCCAGGcac < 8:216993/116‑1 (MQ=255) tGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCaa > 1:31684/1‑94 (MQ=255) tGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCaa < 2:31684/94‑1 (MQ=255) cGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCAAGCCAGGCACACCTTGCTGCTCTTCGAAACAGGTACGCAATGATTCATGCCGTGacac > 8:199471/1‑148 (MQ=255) gCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTGCCGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTgg < 1:205714/77‑1 (MQ=255) gCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTgg > 2:205714/1‑76 (MQ=255) cTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCAAGCCAGGCACACCTTGCTGCTCTTCGAAACAGGTACGCAATGATTCATGCCGTGACACCAgcg > 5:269682/1‑149 (MQ=255) gCAACTGTTGCAGCAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCAAGCCAGGCACACCTTGCTGCTCTTCGAAACAg > 3:70757/1‑116 (MQ=255) gCAACTGTTGCAGCAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCAAGCCAGGCACACCTTGCTGCTCTTCGAAACAg < 4:70757/116‑1 (MQ=255) aCTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCTAGCCAGGCACACCTTGCTGCTCTTCGAAACAGGTACGCAATGATTCATGCCGTGACACCAGCGCCGa > 6:301371/1‑148 (MQ=255) tgctgcAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCAAGCCAGGCACACCTTGCTGCTCTTCGAAACAGGTACGCAATGATTCATGCCGTGACACCAGCGCCGaaaa > 7:234012/1‑149 (MQ=255) tgcAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCAAGCCAGGCACACCTTGCTGCTCTTCGAAACAGGTACGCAATGATTCATGCCGTGACACCAGCGCCGAAAACGc > 3:29516/1‑149 (MQ=255) cAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCAAGCCAGGCACACCTTGCTGCTCTTCGaaa < 8:289996/103‑1 (MQ=255) cAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCAAGCCAGGCACACCTTGCTGCTCTTCGaaa > 7:289996/1‑103 (MQ=255) aaCAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCAAGCCAGGCACACCTTGCTGCTGTTCGAAACAGGTACGCAATGATTCATGCCGTGACACCAGCGCCGAAAACGCTTg > 8:259953/1‑149 (MQ=255) aCAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCAAGCCAGGCACACCTTGCTGCTCTTCGAAACAGGTACGCAATGATTCATGCCGTGACACCAGCGCCGAAAACGCTTgg < 6:133364/149‑1 (MQ=255) | GCCCATCGACCAGCCGTCGGAGACGATGTGGTGCAGGGTCACGAGCAGTAGGTGCTCCTGCTC‑‑GCCACGCTGATACAGCTTCATGCGAATCAGCGGCCCGTTGGCAAGGTCGAATGGCTGCTGGATGTCGGCCTGCAACTGCTGCAACAGTTGCGCGGGGTCAAAGGCTTG‑CGCCTGCTGCTGCTCAAGGGTGACCGCGAGATTGGCGTGGACGCGCAAGCCAGGCACACCTTGCTGCTCTTCGAAACAGGTACGCAATGATTCATGCCGTGACACCAGCGCCGAAAACGCTTGG > NC_002947/4790135‑4790429 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |