| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,806,116 | A→T | 7.1% | R592R (CGT→CGA) | PP_4234 ← | bifunctional aldehyde oxidase/xanthine dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,806,116 | 0 | A | T | 7.1% | 219.2 / 5.3 | 75 | R592R (CGT→CGA) | PP_4234 | bifunctional aldehyde oxidase/xanthine dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (34/35); new base T (2/3); total (37/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.89e-01 | |||||||||||
ATGGCGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCT > NC_002947/4805974‑4806264 | aTGGCGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCg < 4:281678/149‑1 (MQ=255) tGGCGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAAc < 6:226083/143‑1 (MQ=255) tGGAGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAAc > 5:226083/1‑143 (MQ=255) gCGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGTTCGGCCGac < 7:112014/148‑2 (MQ=255) cGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAgg > 2:310492/1‑148 (MQ=255) gCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAAt > 1:217681/1‑148 (MQ=255) gCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAAt < 2:217681/148‑1 (MQ=255) gCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATc < 6:308539/149‑1 (MQ=255) gCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATc < 7:239676/149‑1 (MQ=255) ccAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCg < 8:207298/149‑1 (MQ=255) cTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGa < 2:49869/149‑1 (MQ=255) cgGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGTTCGGcccacgag > 8:42931/1‑120 (MQ=255) cgGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGTTCGGCcgacg‑ag < 7:42931/126‑2 (MQ=255) ttGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGt < 7:158709/149‑1 (MQ=255) ttGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGt < 1:310492/149‑1 (MQ=255) gcAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGTTCGGCCGac < 7:201652/115‑2 (MQ=255) gcAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGTTCGGCCGac > 8:201652/1‑114 (MQ=255) gcAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGa > 8:122439/1‑148 (MQ=255) cAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACa < 4:12982/149‑1 (MQ=255) gcgcGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATg < 6:325920/149‑1 (MQ=255) tCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGa > 2:308078/1‑103 (MQ=255) tCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGa < 1:308078/103‑1 (MQ=255) ccTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGcc > 6:94119/1‑148 (MQ=255) cTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCa > 6:37595/1‑149 (MQ=255) gCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGc > 4:164766/1‑149 (MQ=255) gctggctgATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTg > 2:294633/1‑149 (MQ=255) ctggctgATCAGGTACGGGTTTCCTCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGc < 5:6845/149‑1 (MQ=255) gctgATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCTGGTGCCCAGCTCGGTGCCGa > 6:129788/1‑149 (MQ=255) ctgATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGat < 5:73625/149‑1 (MQ=255) ggTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGgcgc < 5:169120/149‑1 (MQ=255) gTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCa < 1:123669/149‑1 (MQ=255) ggTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTg < 5:94119/149‑1 (MQ=255) gTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGc < 5:252531/113‑1 (MQ=255) gTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGc > 6:252531/1‑113 (MQ=255) tttCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGAt > 5:167064/1‑149 (MQ=255) cGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCgg < 3:164766/149‑1 (MQ=255) gTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCAt < 1:294633/148‑1 (MQ=255) tGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCg < 2:17444/149‑1 (MQ=255) cTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGgc > 1:239058/1‑149 (MQ=255) tCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTGGGGCGAACGGGCGAGG‑AAATCGCTGTGCACCAAAGCCTTGGAGGTTGACATGCCGGTGGCCAGCTCGGTGCCGATATGgc < 5:168361/126‑1 (MQ=255) tCAAGTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGGAGTCTTCAGCTCGTCGGCCGAGCGGCCGAGG‑AAATCGCTGACGCCCAAAGCCTGGGACGTGGAGATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCGGGCTGATGCGGCCCTCGgcg > 8:175972/1‑149 (MQ=255) aaTTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGCAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGa < 1:39010/93‑1 (MQ=255) aaTTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGa > 2:39010/1‑92 (MQ=255) ttGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTg > 5:217555/1‑148 (MQ=255) cAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCTGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACt < 5:129788/149‑1 (MQ=255) ctctGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGAGCTGAACTCGa > 7:301407/1‑149 (MQ=255) ctGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGaca < 7:122439/149‑1 (MQ=255) ccATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGCGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGGCACTgg > 4:213258/1‑149 (MQ=255) gTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCgg < 2:99652/149‑1 (MQ=255) aCTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCt > 6:198541/1‑125 (MQ=255) tGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTgg > 3:218452/1‑137 (MQ=255) tGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTgg < 4:218452/137‑1 (MQ=255) gCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATg < 5:8824/95‑1 (MQ=255) gCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATg > 6:8824/1‑95 (MQ=255) cAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCg > 6:314476/1‑149 (MQ=255) tCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTc < 7:299804/124‑1 (MQ=255) tCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTc > 8:299804/1‑124 (MQ=255) tCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGaa < 2:132442/149‑1 (MQ=255) tCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGaa > 8:256897/1‑149 (MQ=255) tCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGaa > 6:35817/1‑149 (MQ=255) ttCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAgg < 1:252201/96‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) ccTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTa > 4:21980/1‑149 (MQ=255) cTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTAc < 6:217555/149‑1 (MQ=255) cTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTAc < 2:239058/149‑1 (MQ=255) gtcgGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTTGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCg < 5:37595/148‑1 (MQ=255) tcgGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCg > 5:313016/1‑147 (MQ=255) ccGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTcc > 8:150378/1‑149 (MQ=255) ccGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTcc > 5:190634/1‑149 (MQ=255) cGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCt > 1:255152/1‑149 (MQ=255) aaCGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTc < 5:314476/149‑1 (MQ=255) aaCGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTc < 7:150378/149‑1 (MQ=255) aCGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCt < 6:167064/149‑1 (MQ=255) | ATGGCGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGG‑AAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCT > NC_002947/4805974‑4806264 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |