Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,974,358 | T→C | 6.4% | K416E (AAG→GAG) | flgK ← | flagellar hook‑associated protein FlgK |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,974,358 | 0 | T | C | 6.4% | 184.8 / 2.3 | 62 | K416E (AAG→GAG) | flgK | flagellar hook‑associated protein FlgK |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (30/28); new base C (2/2); total (32/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.66e-01 |
TTCGCCCAGCGTAGGTTGGGTGATGGTGCCGGTACCGCTGTTGCCACTGCCTGCCGCAGCACTGATCGGCCCGGCGAAGGCCAGTTTGTTGGCATCGGTCAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCACCGGTGCCGGGTCGGCATTCAGGTCGAAGCTGCCCATGTCGGTGCCGTCTGAGCGGCGCACACTGTACTGGCTGGCGCTGGTGAACT > NC_002947/4974212‑4974504 | ttCGCCCAGCGTAGGTTGGGTGATGGTGCCGGTACCGCTGTTGCCACTGCCTGCCGCAGCACTGATCGGCCCGGCGAAGGCCAGTTTGTTGGCATCGGTCAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTg < 8:234752/148‑1 (MQ=255) gCCCAGCGTAGGTTGGGTGATGGTGCCGGTACCGCTGTTGCCACTGCCTGCCGCAGCACTGATCGGCCCGGCGAAGGCCAGTTTGTTGGCATCGGTCAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGc > 4:43525/1‑149 (MQ=255) cGTAGGTTGGGTGATGGTGCCGGTACCGCTGTTGCCACTGCCTGCCGCAGCACTGATCGGCCCGGCGAAGGCCAGTTTGTTGGCATCGGTCAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTctc < 4:173152/149‑3 (MQ=255) tAGGTTGGGTGATGGTGCCGGTACCGCTGTTGCCACTGCCTGCCGCAGCACTGATCGGCCCGGCGAAGGCCAGTTTGTTGGCATCGGTCAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCgccg < 1:98637/149‑1 (MQ=255) ggTTGGGTGATGGTGCCGGTACCGCTGTTGCCACTGCCTGCCGCAGCACTGATCGGCCCGGCGAAGGCCAGTTTGTTGGCATCGGTCAGGGGGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCgccggc < 5:65853/149‑1 (MQ=255) ggTGATGGTGCCGGTACCGCTGTTGCCACTGCCTGCCGCAGCACTGATCGGCCCGGCGAAGGCCAGTTTGTTGGCATCGGTCAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGgccgc > 4:263063/1‑147 (MQ=255) ggTGATGGTGCCGGTACCGCTGTTGCCACTGCCTGCCGCAGCACTGATCGGCCCGGCGAAGGCCAGTTTGTTGGCATCGGTCAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCa < 3:38893/149‑1 (MQ=255) tGATGGTGTCGGTACCGCTGTTGCCACTGCCTGCCGCAGCACTGATCGGCCCGGCGAAGGCCAGTTTGTTGGCATCGGTCAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAgg > 2:1090/1‑149 (MQ=255) gTGCCGGTACCGCTGTTGCCTCTGCCTGCCGCAGCACTGATCGGCCCGGCGAAGGCCAGTTTGTTGGCATCGGTCAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGgccgc < 3:204531/148‑1 (MQ=255) gCCGGTACCGCTGTTGCCACTGCCTGCCGCAGCACTGATCGGCCCGGCGAAGGCCAGTTTGTTGGCATCGGTTAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGgccgc‑cgc > 8:168441/1‑149 (MQ=255) ccGGTACCGCTGTGGCCACTGCCTGCCGCAGCACTGATCGGCCCGGCGAAGGCCAGTTTGTTGGCAGCGGTCAGGGTGGTGGTGAGGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGgccgc‑cgcc < 1:127531/149‑1 (MQ=255) gTACCGCTGTTGCCACTGCCTGCGGCAGCACTGATCGGCCCGGCGAAGGCGACGTTGTTGGCATCGGTCAGGGGGGGGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCCCCTTGACGCAGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCttt < 1:231686/149‑1 (MQ=255) gTACCGCTGTTGCCACTGCCTGCCGCAGCACTGATCGGCCCGGCGAAGGCCAGTTTGTTGGCATCGGTCAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCttt > 7:208731/1‑149 (MQ=255) cGCTGTTGCCACTGCCTGCCGCAGCACTGATCGGCCCGGCGAAGGCCAGTTTGTTGGCATCGGTCAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAAc < 1:1090/149‑1 (MQ=255) cGCTGTTGCCACTGCCTGCCGCAGCACTGATCGGCCCGGCGAAGGCCAGTTTGTTGGCATCGGTCAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAAc > 2:96124/1‑149 (MQ=255) gCCACTGCCTGCCGCAGCACTGATCGGCCCGGCGAAGGCCAGTTTGTTGGCATCGGTCAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAgg < 8:208731/148‑1 (MQ=255) ccACTGCCTGCCGCAGCACTGATCGGCCCGGCGAAGGCCAGTTTGTTGGCATCGGTCAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCt < 3:263063/149‑1 (MQ=255) ccACTGCCTGCCGCAGCACTGATCGGCCCGGCGAAGGCCAGTTTGTTGGCATCGGTCAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCt > 4:30861/1‑149 (MQ=255) aCTGCCTGCCGCAGCACTGATCGGCCCGGCGAAGGCCAGTTTGTTGGCATCGGTCAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTg > 7:23232/1‑148 (MQ=255) aCTGCCTGCCGCAGCACTGATCGGCCCGGCGAAGGCCAGTTTGTTGGCATCGGTCAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTg > 1:230302/1‑148 (MQ=255) ccGCAGCACTGATCGGCCCGGCGAAGGCCAGTTTGTTGGCATCGGTCAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑t < 7:37966/147‑1 (MQ=255) aTCGGCCCGGCGAAGGCCAGTTTGTTGGCATCGGTCAGGGTGGTGGTGATGCCGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCAcc > 5:152551/1‑144 (MQ=255) aTCGGCCCGGCGAAGGCCAGTTTGTTGGCATCGGTCAGGGTGGTGGTGATGCCGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCAcc < 6:152551/144‑1 (MQ=255) ggCCCGGCGAAGGCCAGTTTGTTGGCATCGGTCAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCACCGGTGCCgg < 3:43525/149‑1 (MQ=255) ggCCCGGCGAAGGCCAGTTTGTTGGCATCGGTCAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCACCGGTGCCgg < 2:230302/149‑1 (MQ=255) ggCCCGGCGAAGGCCAGTTTGTTGGCATCGGTCAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCACCGGTGCCgg > 4:116679/1‑149 (MQ=255) cccGGCGAAGGCCAGTTTGTTGGCATCGGTTAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCACCGGTGCCGGGt < 7:168441/149‑1 (MQ=255) cGGCGAAGGCCAGTTTGTTGGCATCGGTCAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGgccgc‑cgcc < 6:243321/106‑1 (MQ=255) cGGCGAAGGCCAGTTTGTTGGCATCGGTCAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGgccgc‑cgcc > 5:243321/1‑106 (MQ=255) ggCGAAGGCCAGTTTGTTGGCATCGGTCAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGgccgcc < 5:317266/94‑1 (MQ=255) ggCGAAGGCCAGTTTGTTGGCATCGGTCAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGgccgcc > 6:317266/1‑94 (MQ=255) cGAAGGCCAGTTTGTTGGCATCGGTCAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCACCGGTGCCGGGTCGGCa < 6:112441/149‑1 (MQ=255) ggCCAGTTTGTTGGCATCGGTCAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCACCGGTGCCGGGTCGGCAtt > 6:287743/1‑147 (MQ=255) cAGTTTGTTGGCATCGGTCAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCACCGGTGCCGGGTCGGCATTCAGGt < 3:30861/149‑1 (MQ=255) aGTTTGTTGGCATCGGTCAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCACCGGTGCCGGGTCGGCATTCAGGTc < 5:287743/149‑1 (MQ=255) gCATCGGTCAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCACCGGTGCCGGGTCGGCATTCAGGTCGAAGCTGc < 4:67437/148‑1 (MQ=255) gTCAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTCGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCN‑TCTATCACCGGTGCCGGGTCGGCATTCAgg < 1:26921/132‑1 (MQ=255) gTCAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTCGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCACCGGTGCCGGGTCGGCATTCAgg > 2:22060/1‑132 (MQ=255) gTCAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTCGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCACCGGTGCCGGGTCGGCATTCAgg > 2:26921/1‑132 (MQ=255) gTCAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTCGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCACCGGTGCCGGGTCGGCATTCAgg < 1:22060/132‑1 (MQ=255) gtggtgATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCAcc < 6:47880/102‑1 (MQ=255) gtggtgATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCAcc > 5:47880/1‑102 (MQ=255) gtggtgATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCACCGGTGCCGGGTCGGCATTCAGGTCGAAGCTGCCCATGTCGGTGCCGTc < 8:23232/149‑1 (MQ=255) tggtgATGCTGCCGGCTGACGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGACTTTCAAAGCAAGGCTGAAACCG‑TCTATCACCGGTGCCCGGTCGGCATTCAGGTCTAAGCTGAACATGTCGGTGCCGTCt > 8:279432/1‑149 (MQ=255) gccggctgccgCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCACCGGTGCCGGGTCGGCATTCAGGTCGAAGCTGCCCATGTCGGTGCCGTCTGAGCGGCGca > 6:189933/1‑149 (MQ=255) ccggctgccgCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCCACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCACCGGTGCCGGGTCGGCATTCAGGTCGAAGCTGCCCATGTCGGTGCCGTCTGAGCGGCGca > 1:214912/1‑148 (MQ=255) ccggctgccgCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCACCGGTGCCGGGTCGGCATTCAGGTCGAAGCTGCCCATGTCGGTGCCGTCTGAGCGGCGca > 6:118304/1‑148 (MQ=255) ccggctgccgCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCGTAAACCGCACTATCACCGGTGCCGGGTCGGCATTCAGGTCGAAGCTGCCCATGTCGGTGCCGTCTGAgcggcg < 1:96124/147‑1 (MQ=255) gccgCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCACCGGTGCCGGGTCGGCATTCAGGTCGAAGCTGCCCATGTCGGTGCCGTCTGAGCGGCGCACACTGTa > 2:205584/1‑149 (MQ=255) gccgCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCACCGGTGCCGGGTCGGCATTCAGGTCGAAGCTGCCCATGTCGGTGCCGTCTGAGCGGCGCACACTGTa > 8:166839/1‑149 (MQ=255) ccgCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCACCGGTGCCGGGTCGGCATTCAGGTCGAAGCTGCCCATGTCGGTGCCGTCTGAGCGGCGCACACt < 8:265602/145‑1 (MQ=255) ccgCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCACCGGTGCCGGGTCGGCATTCAGGTCGAAGCTGCCCATGTCGGTGCCGTCTGAGCGGCGCACACt > 7:265602/1‑145 (MQ=255) ggTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCACCGGTGCCGGGTCGGCATTCAGGTCGAAGCTGCCCATGTCGGTGCCGTCTGAGCGGCGCCCACTGTAatggctgg > 7:146240/1‑149 (MQ=255) gTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCACCGGTGCCGGGTCGGTATTCAGGTCGAAGCTGCCCATGTCGGTGCCGTCTGAGCGGCGCACACTGTACtggctggc > 5:303407/1‑149 (MQ=255) gggATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCGAGGCTGAAACCG‑TCTATCACCCGTGCCGGGTCGGCATTCAGGTCGAAGCTGCCCATGTCGGTGCCGTCTGAGCGGCGCACACTGTACTGGCTGGCGCt < 8:291650/149‑1 (MQ=255) cACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCACCGGTGCCGGGTCGGCATTCAGGTCGAAGCTGCCCATGTCGGTGCCGTCTGAGCGGCGCACACTGTACTGGCTGGCGCTGGTg > 8:193747/1‑148 (MQ=255) cACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCACCGGTGCCGGGTCGGCATTCAGGTCGAAGCTGCCCATGTCGGTGCCGTCTGAGCGGCGCACACTGTACTGGCTGGCGCTGGTg > 1:18698/1‑148 (MQ=255) ccTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCACCGGTGCCGGGTCGGCATTCAGGTCGAAGCTGCCCATGTCGGTGCCGTCTGAGCGGCGCACACTGTACTGGCTGGCGCTGGTGAAc > 4:93335/1‑149 (MQ=255) cTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGCACGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTGTCACCGGTGCCGGGTAGGCATTCAGGTCGAAGCTGCCCATGTCGGTGCCGTCTGAGCGGCGCACACTGTActggc > 1:25377/1‑135 (MQ=255) cTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTGTCACCGGTGCCGGGTCGGCATTCAGGTCGAAGCTGCCCATGTCGGTGCCGTCTGAGCGGCGCACACTGTActggc < 2:25377/134‑1 (MQ=255) cTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCACCGGTGCCGGGTCGGCATTCAGGTCGAAGCTGCCCATGTCGGTGCCGTCTGAGCGGCGCACACTGTACTGGCTGGCGCTGGTGAACt > 7:160975/1‑149 (MQ=255) cTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCACCGGTGCCGGGTCGGCATTCAGGTCGAAGCTGCCCATGTCGGTGCCGTCTGAGCGGCGCACACTGTACTGGCTGGCGCTGGTGAACt > 5:305698/1‑149 (MQ=255) ttGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCACCGGTGCCGGGTCGGCAtt > 7:236998/1‑80 (MQ=255) ttGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCACCGGTGCCGGGTCGGCAtt < 8:236998/80‑1 (MQ=255) ttGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCACCGGTGCCGGGTCGGCATTCAGGTCGAAGCTGCCCATGTCGGTGCCGTCTGAGCGGCGCACACTGTACTGGCTGGCGCTg < 7:229389/141‑1 (MQ=255) ttGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCACCGGTGCCGGGTCGGCATTCAGGTCGAAGCTGCCCATGTCGGTGCCGTCTGAGCGGCGCACACTGTACTGGCTGGCGCTg > 8:229389/1‑141 (MQ=255) | TTCGCCCAGCGTAGGTTGGGTGATGGTGCCGGTACCGCTGTTGCCACTGCCTGCCGCAGCACTGATCGGCCCGGCGAAGGCCAGTTTGTTGGCATCGGTCAGGGTGGTGGTGATGCTGCCGGCTGCCGCACGGGTAGGGATCACCTTGAAGCTGTCGCCGGCCGCCAGGCCGC‑CGCCTTTCAACGCCAGGCTGAAACCG‑TCTATCACCGGTGCCGGGTCGGCATTCAGGTCGAAGCTGCCCATGTCGGTGCCGTCTGAGCGGCGCACACTGTACTGGCTGGCGCTGGTGAACT > NC_002947/4974212‑4974504 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |