| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,317,515 | G→C | 6.9% | R45G (CGT→GGT) | ilvH ← | acetolactate synthase small subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,317,515 | 0 | G | C | 6.9% | 229.0 / 5.2 | 72 | R45G (CGT→GGT) | ilvH | acetolactate synthase small subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/34); new base C (2/3); total (35/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.26e-01 | |||||||||||
GCCTTGACCTTGACCAACATCAGTTCACGCTCGATGTGAGCGCTTTCCGACAGGTCGACAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGTTGCGCTGGGAGAACAGGCCGACCACGCGGGACAACGCACCTGGTTCGTTTTCCAGCAGCAGGGAAATGATGTGCCGCATATCAGGTA > NC_002947/5317370‑5317655 | gCCTTGACCTTGACCAACATCAGTTCACGCTCGATGTGAGCGCTTTCCGACAGGTCGACAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGa > 6:175980/1‑149 (MQ=255) ccttgaccAACATCAGTTCACGCTCGATGTGAGCGCTTTCCGACAGGTCGACAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAgggtc > 5:254561/1‑149 (MQ=255) cttgaccAACATCAGTTCACGCTCGATGTGAGCGCTTTCCGACAGGTCGACAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAgggtcg > 8:186804/1‑149 (MQ=255) cttgaccAACATCAGTTCACGCTCGATGTGAGCGCTTTCCGACAGGTCGACAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAgggtcg > 5:183229/1‑149 (MQ=255) ttgaccAACATCAGTTCACGCTCGATGTGAGCGCTTTCCGACAGGTCGACAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAgggtcgg > 8:152205/1‑149 (MQ=255) tagaccAACATCAGTTCACGCTCGATGTGAGCGCTTTCCGACAGGTCGACAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAgggtcgg > 5:195730/3‑149 (MQ=255) gaccAACATCAGTTCACGCTCGATGTGAGCGCTTTCCGACAGGTCGACAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAgggtcggg < 3:181119/148‑1 (MQ=255) accAACATCAGTTCACGCTCGATGTGAGCGCTTTCCGACAGGTCGACAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAgggtcgggt < 3:151180/148‑1 (MQ=255) ccAACATCAGTTCACGCTCGATGTGAGCGCTTTCCGACAGGTCGACAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCt > 8:36935/1‑149 (MQ=255) ccAACATCAGTTCACGCTCGATGTGAGCGCTTTCCGACAGGTCGACAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCt > 6:209852/1‑149 (MQ=255) cAACATCAGTTCACGCTCGATGTGAGCGCTTTCCGACAGGTCGACAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCtt < 6:183229/149‑1 (MQ=255) cAACATCAGATCACGCTCGATGTGAGCGCTTTCCGACAGGTCGACAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGATGGTCAGCGTCAGACCCGACCCTGTCGCGTCtg < 1:112344/149‑2 (MQ=255) aGTTCACGCTCGATGTGAGCGCTTTCCGACAGGTCGACAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTgg > 1:156316/1‑149 (MQ=255) gTTCACGCTCGATGTGAGCGCTTTCCGACAGGTCGACAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGgc > 2:238705/1‑149 (MQ=255) gTTCACGCTCGATGTGAGCGCTTTCCGACAGGTCGACAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACCCGACCCTGTCGCGTCtga > 6:219598/1‑140 (MQ=255) gTTCACGCTCGATGTGAGCGCTTTCCGACAGGTCGACAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACCCGACCCTGTCGCGTCtga < 5:219598/142‑3 (MQ=255) ttCACGCTCGATGTGAGCGCTTTCCGACAGGTCGACAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGgcg > 7:151771/1‑149 (MQ=255) aCGCTCGATGTGAGCGCTTTCCGACAGGTCGACAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTa < 7:36935/149‑1 (MQ=255) aCGCTCGATGTGAGCGCTTTCCGACAGGTCGACAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTa < 6:300673/149‑1 (MQ=255) gCTCGATGTGAGCGCTTTCCGACAGGTCGACAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAggg > 2:304421/1‑126 (MQ=255) gCTCGATGTGAGCGCTTTCCGACAGGTCGACAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAggg < 1:304421/126‑1 (MQ=255) gCTCGATGTGAGCGCTTTCCGACAGGTCGACAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACa > 2:64001/1‑149 (MQ=255) aTGTGAGCGCTTTCCGACAGGTCGACAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTGTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGTGTCTTCGGTTGTCGCTACAGTCAg < 2:51692/149‑1 (MQ=255) tgAGCGCTTTCCGACAGGTCGACAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGc < 5:175980/148‑1 (MQ=255) aGCGCTTTCCGACAGGTCGACAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCttt < 1:238705/149‑1 (MQ=255) aGCGCTTTCCGACAGGTCGACAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCtt > 3:52426/1‑148 (MQ=255) ccGACAGGTCGACAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAAtgtt < 8:17898/148‑1 (MQ=255) gACAGGTCGACAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTa < 5:209852/149‑1 (MQ=255) aGGTCGACAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCTTGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGtt < 5:159657/149‑1 (MQ=255) aGGTCGACAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGtt < 1:64001/149‑1 (MQ=255) gTCGACAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGTTgc > 1:78093/1‑149 (MQ=255) gTCGACAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACCCGACCCTGTCGCGTCtg > 6:85703/1‑109 (MQ=255) gTCGACAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACCCGACCCTGTCGCGTCtg < 5:85703/110‑2 (MQ=255) aCAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGTTGCGCTg > 3:5941/1‑149 (MQ=255) aCAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGTTGCGCTg < 2:156316/149‑1 (MQ=255) aaGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGTTGCGCTggg < 6:195730/149‑1 (MQ=255) ttGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCa < 1:278090/126‑1 (MQ=255) ttGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCa > 2:278090/1‑126 (MQ=255) tGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGTTGCGCTGGGAGaa > 7:43487/1‑148 (MQ=255) ccACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGTTGCGCTGGGAGAACAgg < 4:52426/149‑1 (MQ=255) ttCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAgggtc > 8:167495/1‑85 (MQ=255) ttCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAgggtc < 7:167495/85‑1 (MQ=255) ttCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGTTGCGCTGGGAGAACAGGCCGa > 1:188624/1‑149 (MQ=255) gACCAGCTTGCTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACGTCGTCATGGCCACCGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGGCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGTTGCGCTGGGAGAACAGGCCGAcc < 8:116529/148‑1 (MQ=255) gCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGTTGCGCTGGGAGAACAGGCCGACCACGCgg < 8:151771/149‑1 (MQ=255) gTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGTTGCGCTGGGAGAACAGGCCGACCACGCGGGAc < 2:78093/148‑1 (MQ=255) ttCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGTTGCGCTGGGAGAACAGGCCGACCACGCGGGACaa > 1:85573/1‑149 (MQ=255) cAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGTTGCGCTGGGAGAACAGGCCGACCACGCgg < 2:203775/142‑1 (MQ=255) cAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGTTGCGCTGGGAGAACAGGCCGACCACGCgg > 1:203775/1‑142 (MQ=255) aGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGTTGCGCTGGGAGAACAGGCCGACCACGCGGGACAACg < 4:5941/148‑1 (MQ=255) gTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGTTGCGCTGGGAGAACAGGCCGACCACGCGGGACAACGCAc > 3:114467/1‑149 (MQ=255) ttCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTGGTTGCGCTGGGAGAACAGGCCGACCACGCGGGACAACGCAcc < 7:186804/149‑1 (MQ=255) gTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGTGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGTTGCGCTGGGAGAACAGGCCGACCACGCGGGACAACGCACCTGGTTc > 5:226096/1‑149 (MQ=255) cGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGTTGCGCTGGGAGAACAGGCCGACCACGCGGGACAACGCACCTGGTTCGTTTTCcag < 4:114467/148‑1 (MQ=255) cTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGTTGCGCTGGGAGAACAGGCCGACCACGCGGGACAACGCACCTGGTTCGTTTTCCAGCAGCAgg > 4:309733/1‑149 (MQ=255) ttCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGTTGCGCTGGGAGAAc < 8:225971/100‑1 (MQ=255) ttCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGTTGCGCTGGGAGAAc > 7:225971/1‑100 (MQ=255) ttCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGTTGCGCTGGGAGAACAGGACGACCACGCGGGACAACGCACCTGGTTCGTTTTCCAGCAGCAgg > 7:219694/1‑148 (MQ=255) gTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGTTGCGCTGGGAGAACAGGCCGACCACGCGGGACAACGCACCTGGTTCGTTTTCCAGCAGCAGGGaaa > 7:268708/1‑149 (MQ=255) tCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGTTGCGCTGGGAGAACAGGCCGACCACGCGGGACAACGCACCTGGTTCGTTTTCCAGCAGCAGGGAAat > 4:286300/1‑149 (MQ=255) aTGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGTTGCGCTGGGAGAACAGGCCGACCACGCGGGACAACGCACCTGGTTCGTTTTCCAGCAGCAGGGAAatg < 2:188624/148‑1 (MQ=255) aTGGCCAACGGTGGTCAGCGGCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGTTGCGCTGGGAGAACAGGCCGACCACGCGGGACAACGCACCTGGTTCGTTTTCCAGCAGCAGGGAAatga < 6:254561/149‑1 (MQ=255) ggCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGTTGCGCTGGGAGAACAGGCCGACCACGCGGGACAACGCACCTGGTTCGTTTTCcagcagc < 1:56271/137‑1 (MQ=255) ggCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGTTGCGCTGGGAGAACAGGCCGACCACGCGGGACAACGCACCTGGTTCGTTTTCcagcagc > 2:56271/1‑137 (MQ=255) ccAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGTTGCGCTGGGAGAACAGGCCGACCACGCGGGACAACGCACCTGGTTCGTTTTCCAGCAGCAGGGa > 7:193797/1‑140 (MQ=255) ccAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGTTGCGCTGGGAGAACAGGCCGACCACGCGGGACAACGCACCTGGTTCGTTTTCCAGCAGCAGGGa < 8:193797/140‑1 (MQ=255) cGGGGGTTATCGTCAGACGCGACATGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGTTGCGCTGGGAGAACAGGCCGACCACGCGGGACAACGCACCTGGTTCGTTTTCCAGCAGCAGGGAAATGATGTGCCGc < 6:226096/149‑1 (MQ=255) taatcGTCAGACGCGACATGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGGTGCGCTGGGAGAACAGGCCGACCACGCGGGACAACGCACCTGGTTCGTTTTCCAGCAGCAGGGAAATGATGTGCCGCATATCa < 8:219694/145‑1 (MQ=255) gCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGTTGCGCTGGGAGAACAGGCCGACCACGCGGGACAACGCACCTGGTTCGTTTTCCAGCAGCAGGGAAATGATGTGCCGCATATc > 2:33671/1‑145 (MQ=255) gCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGTTGCGCTGGGAGAACAGGCCGACCACGCGGGACAACGCACCTGGTTCGTTTTCCAGCAGCAGGGAAATGATGTGCCGCATATc < 1:33671/145‑1 (MQ=255) cGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGTTGCGCTGGGAGAACAGGCCGACCACGCGGGACAACGCACCTGGTTCGTTTTCCAGCAGCAGGGAAATGATGTGCCGCATATCAGGTa < 7:152205/149‑1 (MQ=255) cGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGTTGCGCTGGGAGAACAGGCCGACCACGCGGGACAACGCACCTGGTTCGTTTTCCAGCAGCAGGGAAATGATGTGCCGCATATCAGGTa > 2:977/1‑149 (MQ=255) | GCCTTGACCTTGACCAACATCAGTTCACGCTCGATGTGAGCGCTTTCCGACAGGTCGACAAGCTTGACCACTTCGACCAGCTTGTTCAGGTTCTTGGTGATCTGTTCGATCACTTCGTCATGGCCAACGGTGGTCAGCGTCAGACGCGACAGGGTCGGGTCTTCGGTTGGCGCTACAGTCAGGCTTTCAATGTTGTAGTTGCGCTGGGAGAACAGGCCGACCACGCGGGACAACGCACCTGGTTCGTTTTCCAGCAGCAGGGAAATGATGTGCCGCATATCAGGTA > NC_002947/5317370‑5317655 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |