Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,368,671 | A→C | 7.7% | A13A (GCT→GCG) | greA ← | transcription elongation factor GreA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,368,671 | 0 | A | C | 7.7% | 179.4 / 7.2 | 65 | A13A (GCT→GCG) | greA | transcription elongation factor GreA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/29); new base C (2/3); total (33/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.72e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.77e-01 |
TTCGACCATGCCCTGCTCCTCACGGGCGGCATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTCACCAGCCGCAATGGTAGTGGTG > NC_002947/5368527‑5368811 | ttCGACCATGCCCTGCTCCTCACGGGCGGCATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAgcgc > 1:62683/1‑149 (MQ=255) cATGCCCTGCTCCTCACGGGCGGCATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACGAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGa > 5:225127/1‑149 (MQ=255) cATGCCCTGCTCCTCACGGGCGGCATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGa < 2:79094/149‑1 (MQ=255) ccTGCTCCTCACGGGCGGCATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGt > 6:148662/1‑148 (MQ=255) ccTGCTCCTCACGGGCGGCATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGt > 2:24519/1‑148 (MQ=255) cTGCTCCTCACGGGCGGCATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCTCGCGCCCTGGaagaaga < 1:262865/149‑7 (MQ=255) tGCTCCTCACGGGCGGCATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCAt > 8:22878/1‑149 (MQ=255) aCGGGCGGCATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTAtt > 1:299078/1‑149 (MQ=255) gggCGGCATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTg < 7:59597/149‑1 (MQ=255) gcggcATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCTCGCGCCCTg > 4:16890/1‑128 (MQ=255) gcggcATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCTCGCGCCCTg < 3:16890/128‑1 (MQ=255) ggcATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTaa < 2:62683/149‑1 (MQ=255) ttCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGc > 1:65900/1‑149 (MQ=255) cGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGGGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCt < 2:65900/148‑1 (MQ=255) ggCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCttt < 2:299078/149‑1 (MQ=255) gCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGc > 4:68557/1‑145 (MQ=255) gCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGc < 3:68557/145‑1 (MQ=255) gCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCCGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCttt > 6:213608/1‑148 (MQ=255) ccTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGGTTTCAGTCCtg > 3:59267/1‑149 (MQ=255) ccTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCt < 3:40236/148‑1 (MQ=255) cTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCtg > 6:250850/1‑148 (MQ=255) ttGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCa < 3:256253/141‑1 (MQ=255) ttGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCa > 4:256253/1‑141 (MQ=255) gAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCtgca < 8:176587/147‑1 (MQ=255) aGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCtgcatgc < 1:145918/149‑1 (MQ=255) ggcACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTTTGTCAGGGTCGGGCGGTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACTGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCGtgcatgca < 7:129397/146‑1 (MQ=255) tCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGa < 5:250850/149‑1 (MQ=255) ccAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCt < 3:163318/149‑1 (MQ=255) cAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCttt < 8:1636/128‑1 (MQ=255) cAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCttt > 7:1636/1‑128 (MQ=255) tCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGc > 1:61957/1‑147 (MQ=255) cACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGc > 6:192401/1‑149 (MQ=255) aCGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGc > 6:196029/1‑148 (MQ=255) cgcgCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGcga < 6:225127/149‑1 (MQ=255) cACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACCGGTGCTCTTCTTCCCGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACg < 8:69534/148‑1 (MQ=255) cACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGc < 6:35126/136‑1 (MQ=255) cACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGc > 5:35126/1‑136 (MQ=255) aCCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGt > 3:261996/1‑149 (MQ=255) cAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCt < 7:24915/103‑1 (MQ=255) cAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCt > 8:24915/1‑103 (MQ=255) ccTGACTCAGGCGCGGTCGCTC‑GTTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGTGCGCGAGCTCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGTTAATGCTAATTCTTTCAGTCCTTCATGCAGATCCTGCAAGAGACGAACGGTCTTTTCCg < 8:104709/149‑1 (MQ=255) ccTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCtgcatgc < 2:260781/118‑1 (MQ=255) ccTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCtgcatgc > 1:260781/1‑118 (MQ=255) cTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCg > 3:113411/1‑148 (MQ=255) gACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGAc > 5:194836/1‑149 (MQ=255) aCTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGAcc > 1:235214/1‑149 (MQ=255) tCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGcccac > 8:180965/1‑147 (MQ=255) aGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAAt < 6:194836/149‑1 (MQ=255) gcgcGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAAttt < 5:192401/149‑1 (MQ=255) gcgcTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAgcgc > 4:6369/1‑149 (MQ=255) gcTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCtt < 4:261996/149‑1 (MQ=255) tC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCg > 7:75039/1‑149 (MQ=255) tCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACgg < 8:28132/116‑1 (MQ=255) tCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACgg > 7:28132/1‑116 (MQ=255) gCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATgg < 3:6369/148‑1 (MQ=255) cAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCtt > 3:176126/1‑148 (MQ=255) aGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCtt < 2:61957/147‑1 (MQ=255) ggTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTCACCAGCCg < 7:22878/149‑1 (MQ=255) tcttctTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTCACCAGCCGCAATg > 5:238073/1‑149 (MQ=255) cttcCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCTGTTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCATATACTGCAAGCTACGAACTGTCTTTTACGGACAGATTTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTCACAAGACGCAATGGTAg > 2:220705/1‑149 (MQ=255) tcCAGGGCGCTCGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAg < 3:273549/112‑1 (MQ=255) tcCAGGGCGCTCGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAg > 4:273549/1‑112 (MQ=255) aGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTCACCAGCCGCAATGGTAgtggtg < 7:261534/149‑1 (MQ=255) gggCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTCACCAGCCGCAAt > 3:65627/1‑138 (MQ=255) gggCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTCACCAGCCGCAAt < 4:65627/138‑1 (MQ=255) | TTCGACCATGCCCTGCTCCTCACGGGCGGCATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTC‑GGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTCACCAGCCGCAATGGTAGTGGTG > NC_002947/5368527‑5368811 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |