Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,376,248 | G→A | 6.3% | H439H (CAC→CAT) | dnaK ← | chaperone protein DnaK |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,376,248 | 0 | G | A | 6.3% | 189.5 / 2.6 | 63 | H439H (CAC→CAT) | dnaK | chaperone protein DnaK |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (28/31); new base A (2/2); total (30/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.71e-01 |
TCGCACCTACGTGCAGGATGCCGTTGGCGTCGATGTCGAAGGTCACTTCGATTTGCGGCACGCCGCGCGGTGCTGGCGGAATGTCAGCCAGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGACTTCTTGGTCGGGATGGTGGTGTTCTTCTCGATCAGCGCGGTCATCACGCCGCCCATGGTTTCGATACCCAGGGTCAGCGGGCTGACGTCCAGCAGCA > NC_002947/5376100‑5376396 | tCGCACCTACGTGCAGGATGCCGTTGGCGTCGATGTCGAAGGTCACTTCGATTTGCGGCACGCCGCGCGGTGCTGGCGGAATGTCAGCCAGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACg > 2:323335/1‑149 (MQ=255) aCCTACGTGCAGGATGCCGTTGGCGTCGATGTCGAAGGTCACTTCGATTTGCGGCACGCCGCGCGGTGCTGGCGGAATGTCAGCCAGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGaa > 8:38951/1‑149 (MQ=255) aCCTACGTGCAGGATGCCGTTGGCGTCGATGTCGAAGGTCACTTCGATTTGCGGCACGCCGCGCGGTGCTGGCGGAATGTCAGCCAGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGaa > 4:98984/1‑149 (MQ=255) cTACGTGCAGGATGCCGTTGGCGTCGATGTCGAAGGTCACTTCGATTTGCGGCACGCCGCGCGGTGCTGGCGGAATGTCAGCCAGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATg < 7:38951/149‑1 (MQ=255) cGTGCAGGATGCCGTTGGCGTCGATGTCGAAGGTCACTTCGATTTGCGGCACGCCGCGCGGTGCTGGCGGAATGTCAGCCAGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTc < 2:114883/149‑1 (MQ=255) cGTGCAGGATGCCGTTGGCGTCGATGTCGAAGGTCACTTCGATTTGCGGCACGCCGCGCGGTGCTGGCGGAATGTCAGCCAGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTc < 4:53711/149‑1 (MQ=255) cAGGATGCCGTTGGCGTCGATGTCGAAGGTCACTTCGATTTGCGGCACGCCGCGCGGTGCTGGCGGAATGTCAGCCAGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACgg > 2:320563/1‑149 (MQ=255) tGCCGTTGGCGTCGATGTCGAAGGTCACTTCGATTTGCGGCACGCCGCGCGGTGCTGGCGGAATGTCAGCCAGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGctc > 1:31623/1‑149 (MQ=255) ccGTTGGCGTCGATGTCGAAGGTCACTTCGATTTGCGGCACGCCGCGCGGTGCTGGCGGAATGTCAGCCAGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTg < 5:24111/149‑1 (MQ=255) gTCGATGTCGAAGGTCACTTCGATTTGCGGCACGCCGCGCGGTGCTGGCGGAATGTCAGCCAGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTgtcgt > 7:86152/1‑149 (MQ=255) tCGATGTCGAAGGTCACTTCGATTTGCGGCACGCCGCGCGGTGCTGGCGGAATGTCAGCCAGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTgtcgtc < 4:237492/149‑1 (MQ=255) gATGTCGAAGGTCACTTCGATTTGCGGCACGCCGCGCGGTGCTGGCGGAATGTCAGCCAGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGtcgtcg < 1:320563/148‑1 (MQ=255) aTGTCGAAGGTCACTTCGATTTGCGGCACGCCGCGCGGTGCTGGCGGAATGTCAGCCAGGTCGAACTTGTCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACATGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCgg > 5:37157/1‑148 (MQ=255) aTGTCGAAGGTCACTTCGATTTGCGGCACGCCGCGCGGTGCTGGCGGAATGTCAGCCAGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACATGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCgg > 5:40154/1‑148 (MQ=255) aGGTCACTTCGATGTGCGGCACGCCGCGCGGTTCTGGCGGAATGTCCGCCAGGGCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTTCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCgag < 8:284608/149‑1 (MQ=255) ttCGATTTGCGGCACGCCGCGCGGTGCTGGCGGAATGTCAGCCAGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCt > 2:280241/1‑149 (MQ=255) ttCGATTTGCGGCACGCCGCGCGGTGCTGGCGGAATGTCAGCCAGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCt > 4:194012/1‑149 (MQ=255) cGATTTGCGGCACGCCGCGCGGTGCTGGCGGAATGTCAGCCAGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCt < 1:323335/147‑1 (MQ=255) cGATTTGCGGCACGCCGCGCGGTGCTGGCGGAATGTCAGCCAGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCt < 5:267619/147‑1 (MQ=255) gCGGCACGCCGCGCGGTGCTGGCGGAATGTCAGCCAGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCgg < 5:284966/126‑1 (MQ=255) gCGGCACGCCGCGCGGTGCTGGCGGAATGTCAGCCAGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCgg > 6:284966/1‑126 (MQ=255) cGGCACGCCGCGCGGTGCTGGCGGAATGTCAGCCAGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGaa < 2:42675/98‑1 (MQ=255) cGGCACGCCGCGCGGTGCTGGCGGAATGTCAGCCAGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGaa > 1:42675/1‑98 (MQ=255) cGGCACGCCGCGCGGTGCTGGCGGAATGTCAGCCAGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCgg > 7:270520/1‑125 (MQ=255) cGGCACGCCGCGCGGTGCTGGCGGAATGTCAGCCAGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCgg < 8:270520/125‑1 (MQ=255) cGGCACGCCGCGCGGTGCTGGCGGAATGGCAGCCAGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGActtc < 7:159372/148‑1 (MQ=255) aCGCCGCGCGGTGCTGGCGGAATGTCAGCCAGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGACTTCTTGGt < 1:280241/149‑1 (MQ=255) gccgcGCGGTGCTGGCGGAATGTCAGCCAGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGACTTCTTGGTCg < 2:31623/149‑1 (MQ=255) gcgGTGCTGGCGGAATGTCAGCCAGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCGTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGACTTCTTGGTCGGGAtg < 3:98984/149‑1 (MQ=255) gCGGAATGTCAGCCAGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGATCACTGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCTACTTCTTGGTCGGGATGGTGGTGtt < 1:64950/148‑1 (MQ=255) gCGGAATGGCAGCCTGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACATTGCA‑GCACGTGAATGATCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCTACTTCTTGGTCGGGATGGTGGTGtt < 1:60374/148‑1 (MQ=255) aTGTCAGCCAGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGACTTCTTGGTCGGGATGGTGGTGTTCTtctc < 8:23798/149‑1 (MQ=255) tCAGCCAGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGACTTCTTGGTCGGGATGGTGGTGTTCTTCTCGa > 8:277904/1‑148 (MQ=255) ccAGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGACTTCTTGGTCGGGATGGTGGTGTtcttct < 8:225829/141‑1 (MQ=255) ccAGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGACTTCTTGGTCGGGATGGTGGTGTtcttct > 7:225829/1‑141 (MQ=255) ccAGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCACAGACTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGACGAGAACACCTGCGACTTCTTGGTCGGGATGGTGGTGTTCTTCTCGATCAgc > 7:157892/1‑149 (MQ=255) aGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGACGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGACTTCTTGGTCGGGATGGTGGTGTTCTTCTCGATCAgcgc > 8:122104/1‑149 (MQ=255) ggTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGACTTCTTGGTCGGGATGGTGGTGTTCTTCTCGATCAGcgcg < 5:320125/149‑1 (MQ=255) gTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGACTTCTTGGTCGGGATGGTGGTGTTGTTCTCGATCAGCGCgg > 8:286950/1‑149 (MQ=255) gTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGCTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGCCTTCTTGGTCGGGATGGTGGTGTTCTTCTCGATCAGCGCgg > 8:54475/1‑149 (MQ=255) aaCTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCAGGCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGACTTCTTGGTCGGGATGGTGGTGTTCTTCTCGATCAGCGCGGtca > 1:80032/1‑149 (MQ=255) aCTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGACTTCTTGGTCGGGAtggtg < 8:210169/122‑1 (MQ=255) aCTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGACTTCTTGGTCGGGAtggtg > 7:210169/1‑122 (MQ=255) ttGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGACTTCTTGGTCGGGATGGTGGTGTTCTTCTCGATCAGCGCGGTCATAAc > 4:292062/1‑149 (MQ=255) ccAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGACTTCTTGGTCGGGATGGTGGTGTTCTTCTCGATCAGcgcg > 1:40226/1‑137 (MQ=255) ccAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGACTTCTTGGTCGGGATGGTGGTGTTCTTCTCGATCAGcgcg < 2:40226/137‑1 (MQ=255) gCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGc < 5:109155/92‑1 (MQ=255) gCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGc > 6:109155/1‑92 (MQ=255) cGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGACTTCTTGGTCGGGATGGTGGTGTTCTTCTCGATCAGCGCGGTCATCACGCCGCCCa > 2:229546/1‑149 (MQ=255) ttGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGACTTCTTGGTCGGGAtgg > 4:171866/1‑106 (MQ=255) ttGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGACTTCTTGGTCGGGAtgg < 3:171866/106‑1 (MQ=255) ttCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGACTTCTTGGTCGGGATGGTGGTGTTCTTCTCGATCAGCGCGGTCATCACGCCGCCCATGGTTTc > 6:315975/1‑149 (MQ=255) ttCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACATGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGACTTCTTGGTCGGGATGGTGGTGTTCTTCTCGATCAGCGCGGTCATCACGCCGCCCATGGttt < 6:40154/148‑1 (MQ=255) ttCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACATGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGACTTCTTGGTCGGGATGGTGGTGTTCTTCTCGATCAGCGCGGTCATCACGCCGCCCATGGttt < 6:37157/148‑1 (MQ=255) cgcAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGa > 5:122914/1‑81 (MQ=255) cgcAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGa < 6:122914/81‑1 (MQ=255) cgcAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGACTTCTTGGTCGGGATGGTGGTGTTCTTCTCGATCAGCGCGGTCATAACGCCGCCCATGGTTTCGa < 3:292062/146‑1 (MQ=255) aGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGACTTCTTGGTCGGGATGGTGGTGTTCTTCTCGATCAGCGCGGtcat < 5:197276/123‑1 (MQ=255) aGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGACTTCTTGGTCGGGATGGTGGTGTTCTTCTCGATCAGCGCGGtcat > 6:197276/1‑123 (MQ=255) ccTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGACTTCTTGGTCGGGATGGTGGTGTTCTTCTCGATCAGCGCGGTCATCACGCCGCCCATGGTTTCGATACCCAgg > 7:257560/1‑149 (MQ=255) ttACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGACTTCTTGGTCGGGATGGTGGTGTTCTTCTCGATCAGCGCGGTCATCACGCCGCCCATg > 1:125166/1‑129 (MQ=255) ttACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGACTTCTTGGTCGGGATGGTGGTGTTCTTCTCGATCAGCGCGGTCATCACGCCGCCCATg < 2:125166/129‑1 (MQ=255) aCGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGACTTCTTGGTCGGGATGGTGGTGTTCTTCTCGATCAGCGCGGTCATCACGCCGCCCATGGTTTCGATACCCAGGGTCAGc < 8:86152/148‑1 (MQ=255) gca‑gcaCGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGACTTCTTGGTCGGGATGGTGGTGTTCTTCTCGATCAGCGCGGTCATCACGCCGCCCATGGTTTCGATACCCAGGGTCAGCGGGCTGACGTc < 3:194012/148‑1 (MQ=255) gTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGACTTCTTGGTCGGGATGGTGGTGTTCTTCTCGATCAGCGCGGTCATCACGCCGCCCATGGTTTCGATACCCAGGGTCAGCGGGCTGACTTCcagcagca < 2:80032/149‑1 (MQ=255) gTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGACTTCTTGGTCGGGATGGTGGTGTTCTTCTCGATCAGCGCGGTCATCACGCCGCCCATGGTTTCGATACCCAGGGTCAGCGGGCTGACGTCcagcag > 7:148809/1‑147 (MQ=255) gTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGACTTCTTGGTCGGGATGGTGGTGTTCTTCTCGATCAGCGCGGTCATCACGCCGCCCATGGTTTCGATACCCAGGGTCAGCCCGCTGAccc > 4:285969/1‑138 (MQ=255) gTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGACTTCTTGGTCGGGATGGTGGTGTTCTTCTCGATCAGCGCGGTCATCACGCCGCCCATGGTTTCGATACCCAGGGTCAGCCCGCTGAccc < 3:285969/140‑3 (MQ=255) | TCGCACCTACGTGCAGGATGCCGTTGGCGTCGATGTCGAAGGTCACTTCGATTTGCGGCACGCCGCGCGGTGCTGGCGGAATGTCAGCCAGGTCGAACTTGCCCAGCGACTTGTTCTGCGCAGCCTGCTTACGCTCACCTTGCA‑GCACGTGAATGGTCACGGCGCTCTGGTTGTCGTCGGCAGTCGAGAACACCTGCGACTTCTTGGTCGGGATGGTGGTGTTCTTCTCGATCAGCGCGGTCATCACGCCGCCCATGGTTTCGATACCCAGGGTCAGCGGGCTGACGTCCAGCAGCA > NC_002947/5376100‑5376396 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |