| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,469,180 | A→T | 5.8% | L273H (CTC→CAC) | mrdB ← | murein transpeptidase factor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,469,180 | 0 | A | T | 5.8% | 247.2 / 2.6 | 80 | L273H (CTC→CAC) | mrdB | murein transpeptidase factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (39/36); new base T (2/3); total (41/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.71e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 | |||||||||||
CAAAAAAAGTCATGGTCAGGCTGCCCGCAAGCAGCTTGCCGAACAGGGTCTGCGCCTGGGCGGTGATCACCAGGCCACGGCCGATCAGCAGCAGGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGAGCCGATCGCCGCCTTGGACTGGATGATGTTCCAACCGGTGCCCAACGG > NC_002947/5469037‑5469322 | cAAAAAAAGTCATGGTCAGGCTGCCCGCAAGCAGCTTGCCGAACAGGGTCTGCGCCTGGGCGGTGATCACCAGGCCACGGCCGATCAGCAGCAGGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACg > 5:230002/1‑149 (MQ=255) aaaaaaaGTCATGGTCAGGCTGCCCGCAAGCAGCTTGCCGAACAGGGTCTGCGCCTGGGCGGTGATCACCAGGCCACGGCCGATCAGCAGCAGGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACgg > 2:181384/1‑149 (MQ=255) gTCATGGTCAGGCTGCCCGCAAGCAGCTTGCCGAACAGGGTCTGCGCCTGGGCGGTGATCACCAGGCCACGGCCGATCAGCAGCAGGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGTGCTCGGCgaggaa < 5:217871/149‑2 (MQ=255) gTCAGGCTGCCCGCAAGCAGCTTGCCGAACAGGGTCTGCGCCTGGGCGGTGATCACCAGGCCACGGCCGATCAGCAGCAGGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTc > 7:92936/1‑149 (MQ=255) cTGCCCGCAAGCAGCTTGCCGAACAGGGTCTGCGCCTGGGCGGTGATCACCAGGCCACGGCCGATCAGCAGCAGGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCTCCGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGgtgt < 1:187932/149‑1 (MQ=255) ccGCAAGCAGCTTGCCGAACAGGGTCTGCGCCTGGGCGGTGATCACCAGGCCACGGCCGATCAGCAGCAGGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGTGCTCGGCgagg > 1:1304/1‑129 (MQ=255) ccGCAAGCAGCTTGCCGAACAGGGTCTGCGCCTGGGCGGTGATCACCAGGCCACGGCCGATCAGCAGCAGGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGTGCTCGGCgagg < 2:1304/131‑3 (MQ=255) cAAGCAGCTTGCCGAACAGGGTCTGCGCCTGGGCGGTGATCACCAGGCCACGGCCGATCAGCAGCAGGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTcc < 5:203276/149‑1 (MQ=255) aaGCAGCTTGCCGAACAGGGTCTGCGCCTGGGCGGTGATCACCAGGCCACGGCCGATCAGCAGCAGGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCg < 1:181384/149‑1 (MQ=255) gCCGAACAGGGTCTGCGCCTGGGCGGTGATCACCAGGCCACGGCCGATCAGCAGCAGGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCaaaaa < 8:92936/147‑1 (MQ=255) gCCGAACAGGGTCTGCGCCTGGGCGGTGATCACCAGGCCACGGCCGATCAGCAGCAGGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCaaaaa < 2:167493/147‑1 (MQ=255) cGAACAGGGTCTGCGCCTGGGCGGTGATCACCAGGCCACGGCCGATCAGCAGCAGGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCaaaaa < 7:108134/145‑1 (MQ=255) cGAACAGGGTCTGCGCCTGGGCGGTGATCACCAGGCCACGGCCGATCAGCAGCAGGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCaaaaa > 8:108134/1‑145 (MQ=255) aaCAGGGTCTGCGCCTGGGCGGTGATCACCAGGCCACGGCCGATCAGCAGCAGGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAg < 1:131385/149‑1 (MQ=255) gcCTGGGCGGTGATCACCAGGCCACGGCCGATCAGCAGCAGGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGt < 1:50943/149‑1 (MQ=255) gCGGTGATCACCAGGCCACGGCCGATCAGCAGCAGGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAag < 2:277505/149‑1 (MQ=255) tGATCACCAGGCCACGGCCGATCAGCAGCAGGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCaaaaa < 7:219746/121‑1 (MQ=255) tGATCACCAGGCCACGGCCGATCAGCAGCAGGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCaaaaa > 8:219746/1‑121 (MQ=255) aCCAGGCCACGGCCGATCAGCAGCAGGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCagccagcc > 6:115387/1‑149 (MQ=255) aCCAGGCCACGGCCGATCAGCAGCAGGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCAAGGTGCGACTGCGTGCCAAGcagccagc > 8:157891/1‑148 (MQ=255) cAGGCCACGGCCGATCAGCAGCAGGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAagcagc > 7:300418/1‑142 (MQ=255) cAGGCCACGGCCGATCAGCAGCAGGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAagcagc < 8:300418/142‑1 (MQ=255) aGGCCACGGCCGATCAGCAGCAGGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCttt < 6:230002/149‑1 (MQ=255) aGGCCACGGCCGATCAGCAGCAGGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCttt > 6:153798/1‑149 (MQ=255) gCCACGGCCGATCAGCAGCAGGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCaaaaa > 3:201754/1‑111 (MQ=255) gCCACGGCCGATCAGCAGCAGGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCaaaaa < 4:201754/111‑1 (MQ=255) gCCACGGCCGATCAGCAGCAGGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGc > 8:18002/1‑149 (MQ=255) cGGCCGATCAGCAGCAGGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAATCAGCCAGCCTTTGCCaaa < 6:31947/149‑1 (MQ=255) ggCCGATCAGCAGCAGGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCaaa > 5:181818/1‑148 (MQ=255) ggCCGATCAGCAGCAGGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAac < 5:115387/149‑1 (MQ=255) ggCCGATCAGCAGCAGGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAac < 7:157891/149‑1 (MQ=255) cGATCAGCAGCAGGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCaaa < 1:310103/145‑1 (MQ=255) cGATCAGCAGCAGGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCaaa > 2:310103/1‑145 (MQ=255) gATCAGCAGCAGGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACAccc > 4:226226/1‑149 (MQ=255) gcagcagGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCTAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCAAGCCTTTGCCAAACACcccgc > 6:161216/1‑147 (MQ=255) agcagGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGACGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGa > 4:285568/1‑149 (MQ=255) gcagGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGAg > 8:166228/1‑149 (MQ=255) gcagGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGAg < 7:18002/149‑1 (MQ=255) gcagGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGACCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCGTTGCCAAACACCCCGCCCGAg > 4:100524/1‑149 (MQ=255) gTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGa > 7:279613/1‑102 (MQ=255) gTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGACGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGa < 8:279613/102‑1 (MQ=255) tAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCATTTGCCAACACCCCCGCCGGACCCgtt > 3:191056/1‑147 (MQ=255) gACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGcagcca < 4:259188/117‑1 (MQ=255) gACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGcagcca > 3:259188/1‑117 (MQ=255) gACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGAGCCGATcg < 5:153798/149‑1 (MQ=255) cAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGAGCCGATcgcc < 3:226226/149‑1 (MQ=255) tCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGGAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGAGc < 8:179566/138‑1 (MQ=255) tCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGAGc > 7:179566/1‑138 (MQ=255) agcagcagGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGAGCCGATCGCCGCCt < 7:166228/148‑1 (MQ=255) agcagcagGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGAAGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGAGCCGATCGCCGCCtt > 6:154123/1‑149 (MQ=255) gcagcagGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGAGCCGATCGCCGCCTTg > 3:244810/1‑149 (MQ=255) gcaggcagATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGAGcc < 4:145085/133‑1 (MQ=255) gcaggcagATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGAGcc > 3:145085/1‑133 (MQ=255) caggcagATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGAGCCGATCGCCGCCTTGGACt > 3:190895/1‑149 (MQ=255) ggcagATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGAGCCGATCGCCGCCTTGGACTg > 1:200733/1‑148 (MQ=255) gcagATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGAGCCGATCGCCGCCTTGGACTGga > 3:184942/1‑149 (MQ=255) agATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGAGCCGATCGCCGCCTTGGACTGgat > 7:164918/1‑148 (MQ=255) gATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGAGCCGATCGCCGCCTTGGACTGga < 6:112344/146‑1 (MQ=255) gATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGAGCCGATCGCCGCCTTGGACTGga > 5:112344/1‑146 (MQ=255) tGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGAGCCGATCGCCGCCTTGGACTGGatgatg < 2:200733/149‑1 (MQ=255) cTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGAGCCGATCGCCGCCTTGGa > 3:130486/1‑136 (MQ=255) cTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGAGCCGATCGCCGCCTTGGa < 4:130486/136‑1 (MQ=255) cTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGAGCCGATCGCCGCCTTGGACTGGATGATGTTc < 8:164918/149‑1 (MQ=255) tACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGcagcc > 2:85640/1‑92 (MQ=255) tACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGcagcc < 1:85640/92‑1 (MQ=255) tACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGAGCCGATCGCCGCCTTGGACTGGATGATGTTc > 4:152306/1‑148 (MQ=255) ccAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGAGGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCACGCCCGAGCCGATCGCCGCCTTGGACTGGATGATGTTCCaa > 1:107289/1‑149 (MQ=255) aGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGAAGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGAGCCGATCGCCGCCTTGGACTGGATGATGTTCCAAcc < 5:154123/149‑1 (MQ=255) ccGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAGGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGAGCCGATCGCCGCCTTGGACTGGATGATGTTCCAACCGGt > 1:35142/1‑149 (MQ=255) cGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGAGCCGATCGCCGCCTTGGACTGGATGATGTTCCAACCGGTg < 4:244810/149‑1 (MQ=255) tcat‑CGCCGTGCTCGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGAGCCGATCGCCGCCTTGGACTGGATGATGTTCCAACCGGTg < 6:183861/141‑1 (MQ=255) tcat‑CGCCGTGCTCGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGAGCCGATCGCCGCCTTGGACTGGATGATGTTCCAACCGGTg > 5:183861/4‑144 (MQ=255) cT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGAGCCGATCGCCGCCTTGGACTGGATGATGTTCCAACCGGTGCCCAACg > 1:264843/1‑149 (MQ=255) cT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGAGCCGATCGCCGCCTTGGACTGGATGATGTTCCAACCGGTGCCCAACg < 4:190895/149‑1 (MQ=255) cT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGAGCCGATCGCCGCCTTGGACTGGATGATGTTCCAACCGGTGCCCAACg > 2:77327/1‑149 (MQ=255) cT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGAGCCGATCGCCGCCTTGGACTGGATGATGTTCCAACCGGTGCCCAACg > 2:45183/1‑149 (MQ=255) t‑CGCAGAGCACGTCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGAAAAAAGTCGAGGTGCGTCTGGGTGCCAAGCAGGCAGCCTTTGACAAACACCCCGCCGGAGCCGATCGCGGCCTTGGACTGgat < 7:255563/125‑1 (MQ=255) gCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGAGCCGATCGCCGCCTTGGACTGGATGATGtt > 7:39637/1‑129 (MQ=255) gCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGAGCCGATCGCCGCCTTGGACTGGATGATGtt < 8:39637/129‑1 (MQ=255) gCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGAGCCGATCGCCGCCTTGGACTGGATGATGTTCCAACCGGTGCCCAACgg < 4:184942/147‑1 (MQ=255) | CAAAAAAAGTCATGGTCAGGCTGCCCGCAAGCAGCTTGCCGAACAGGGTCTGCGCCTGGGCGGTGATCACCAGGCCACGGCCGATCAGCAGCAGGTAGACAATCAGCAGCAGGCAGATGCCTACCAGGCCGAATTCCT‑CGCCGAGCACGGCGATGATGAAGTCGGTGTGGCTTTCCGGCAAAAAGTCCAGGTGCGACTGCGTGCCAAGCAGCCAGCCTTTGCCAAACACCCCGCCCGAGCCGATCGCCGCCTTGGACTGGATGATGTTCCAACCGGTGCCCAACGG > NC_002947/5469037‑5469322 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |