| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,577,815 | G→C | 5.9% | intergenic (+1/‑44) | PP_4906 → / → rhdA | hypothetical protein/thiosulfate sulfurtransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,577,815 | 0 | G | C | 5.9% | 223.2 / 3.7 | 68 | intergenic (+1/‑44) | PP_4906/rhdA | hypothetical protein/thiosulfate sulfurtransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (27/37); new base C (2/2); total (29/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.15e-01 | |||||||||||
TCGCTGGCAGCCAACGACCAGGTGCTGATGCTGCTGGTGGCCGACCAGGGCTGCCGGCCTTTGGCCGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTGGATGACCGACTTTTCCGGCCTGCCCCTGGTGATCGAAGCTGCAGACCTGCTGCCACGCCTGGATTCGCCGCAACTGATCCTGGTCGACCTGAGCAGCGC > NC_002947/5577668‑5577956 | tcgctGGCAGCCAACGACCAGGTGCTGATGCTGCTGGTGGCCGACCAGGGCTGCCGGCCTTTGGCCGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGc > 1:298769/1‑149 (MQ=255) ctGGCAGCCAACGACCAGGTGCTGATGCTGCTGGTGGCCGACCAGGGCTGCCGGCCTTTGGCCGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCtt < 8:69343/149‑1 (MQ=255) gCAGCCAACGACCAGGTGCTGATGCTGCTGGTGGCCGACCAGGGCTGCCGGCCTTTGGCCGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTg < 2:298769/147‑1 (MQ=255) cAGCCAACGACCAGGTGCTGATGCTGCTGGTGGCCGACCAGGGCTGCCGGCCTTTGGCCGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGCTCAACCCTTgcgg < 5:207103/149‑2 (MQ=255) ccAACGACCAGGTGCTGATGCTGCTGGTGGCCGACCAGGGCTGCCGGCCTTTGGCCGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTa > 1:218820/1‑148 (MQ=255) ccAACGACCAGGTGCTGATGCTGCTGGTGGCCGACCAGGGCTGCCGGCCTTTGGCCGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTa > 3:80666/1‑148 (MQ=255) cAACGACCAGGTGCTGATGCTGCTGGTGGCCGACCAGGGCTGCCGGCCTTTGGCCGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTAc > 3:34929/1‑148 (MQ=255) cAACGACCAGGTGCTGATGCTGCTGGTGGCCGACCAGGGCTGCCGGCCTTTGGCCGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTAc > 6:79847/1‑148 (MQ=255) aCGACCAGGTGCTGATGCTGCTGGTGGCCGACCAGGGCTGCCGGCCTTTGGCCGATATCAGCGTGCAATCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAAt < 2:304273/149‑1 (MQ=255) cAGGTGCTGATGCTGCTGGTGGCCGACCAGGGCTGCCGGCCTTTGGCCGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGccc < 6:148465/149‑1 (MQ=255) aGGTGCTGATGCTGCTGGTGGCCGACCAGGGCTGCCGGCCTTTGGCCGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAGCCGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGccc < 1:88883/149‑1 (MQ=255) gTGCTGATGCTGCTGGTGGCCGACCATGGCTGCCGGCCTTTGGCCGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAACCCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGc < 1:196634/145‑1 (MQ=255) gTGCTGATGCTGCTGGTGGCCGACCAGGGCTGCCGGCCTTTGGCCGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGc > 2:196634/1‑144 (MQ=255) cTGATGCTGCTGGTGGCCGACCAGGGCTGCCGGCCTTTGGCCGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCttt < 7:188139/149‑1 (MQ=255) aTGCTGCTGGTGGCCGACCAGGGCTGCCGGCCTTTGGCCGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTc < 6:311843/147‑1 (MQ=255) aTGCTGCTGGTGGCCGACCAGGGCTGCCGGCCTTTGGCCGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTc < 1:252480/147‑1 (MQ=255) gtggCCGACCAGGGCTGCCGGCCTTTGGCCGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTACCCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGga < 1:246174/148‑1 (MQ=255) gtggCCGACCAGGGCTGCCGGCCTTTGGACGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGTTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCTCCCCTCTTTCCAAACTGgaga > 6:78947/1‑149 (MQ=255) tggCCGACCAGGGCTGCCGGCCTTTGGCCGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGAc > 5:328002/1‑149 (MQ=255) gCCGACCAGGGCTGCCGGCCTTTGGCCGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGCTCAACCCTTgcggttggt < 2:274503/122‑7 (MQ=255) gCCGACCAGGGCTGCCGGCCTTTGGCCGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGCTCAACCCTTgcggttggt > 1:274503/1‑116 (MQ=255) cGACCAGGGCTGCCGGCCTTTGGCCGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTg < 3:303875/149‑1 (MQ=255) cGACCAGGGCTGCCGGCCTTTGGCCGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTg > 8:215857/1‑149 (MQ=255) cGACCAGGGCTGCCGGCCTTTGGCCGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTg > 4:59440/1‑149 (MQ=255) gACCAGGGCTGCCGGCCTTTGGCCGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTgg < 6:328002/149‑1 (MQ=255) gACCAGGGCTGCCGGCCTTTGGCCGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTgg < 6:295722/149‑1 (MQ=255) gACCAGGGCTGCCGGCCTTTGGCCGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTgg < 4:70982/149‑1 (MQ=255) gggCTGCCGGCCTTTGGCCGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTGGATGAc > 4:265164/1‑149 (MQ=255) ggCTGCCGGCCTTTGGCCGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTGGATGAcc < 8:73232/149‑1 (MQ=255) ggCTGCCGGCCTTTGGCCGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTGGATGAcc < 4:34929/149‑1 (MQ=255) tGCCGGCCTTTGGCCGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTGGATGACCGAc < 4:217385/149‑1 (MQ=255) ccGGCCTTTGGCCGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTGGATGACCGAc < 2:218820/147‑1 (MQ=255) ggCCTTTGGCCGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTGGATGACCGACtttt > 3:267989/1‑149 (MQ=255) gCCTTTGGCCGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTGGATGACCGACTTTTc < 5:79847/149‑1 (MQ=255) ccTTTGGCCGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTGGATGACCGACTTTTcc < 5:141877/149‑1 (MQ=255) ccTTTGGCCGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTGGATGACCGACTTTTcc < 3:280847/149‑1 (MQ=255) ccGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGAATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCAGACTCGAGACCGTGGATGACCGACTATTCCGGCCTGc > 8:251234/1‑149 (MQ=255) tCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTGGATGACCGACTTTTCCGGCCTGCCCCTgg < 7:105667/149‑1 (MQ=255) tCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTGGATGACCGACTTTTCCGGCCTGCCCCTgg < 3:59440/149‑1 (MQ=255) aGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTGGATGACCGACTTTTCCGGCCTGCCCCTGGTg < 5:1752/149‑1 (MQ=255) aaGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTGGATGACCGACTTTTCCGGCCTGCCCCTGGTGATCGAAg > 1:172273/1‑149 (MQ=255) ccTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTGGATGACCGACTTTTCCGGCCTGCCCCTGGTGATCGAAGCTg < 4:267989/149‑1 (MQ=255) cTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTGGATGACCGACTTTTCCGGCCTGCCCCTGGTGAt > 6:166559/1‑140 (MQ=255) cTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTGGATGACCGACTTTTCCGGCCTGCCCCTGGTGAt < 5:166559/140‑1 (MQ=255) aGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTGGATGACCGACTTTTCCGGCCTGCCCCTGGTGATCGAAGCTGCAGACctgc < 2:172273/149‑1 (MQ=255) gACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTGGATGACCGACTTTTCCGGCCTGCCCCTGGTGATCGAAGCTGCAGACctgct > 7:16005/1‑149 (MQ=255) ccGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTGGATGACCGACTTTTCCGGCCTGCCCCTGGTGATCGAAGCTGCAGACCtgctgc < 7:256091/149‑1 (MQ=255) cgcgCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTGGATGACCGACTTTTCCGGc > 7:266074/1‑114 (MQ=255) cgcgCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTGGATGACCGACTTTTCCGGc < 8:266074/114‑1 (MQ=255) aTGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGCCCGTGGATGACCGACTTTTCCGGCCTGCCCCTGGTGATCGAAGCTGCAGACCTGCTGCCACGCCt > 7:206283/1‑149 (MQ=255) aTCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTGGATGACCGACTTTTCCGGCCTGCCCCTGGTGATCGAAGCTGCAGACCTGCTGCCACGCCTGGAt > 5:164546/1‑149 (MQ=255) aG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTGGATGACCGACTTTTCCGGCCTGCCCCTGGTGATCGAAGCTGCAGACCTGCTGCCACGCCTGGATTcgc > 5:36451/1‑149 (MQ=255) ggCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTGGATGACCGACTTTTCCGGCCTGCCCCTGGTGATCGAAGCTGCAGACCTGCTGCCACGCCTGGATTcaccgc > 8:244567/1‑148 (MQ=255) tCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTGGATGACCGACTTTTCCGGCCTGCCCCTGGTGATCGAAGCTGCAGACCTGCTGCCACGCCTGGATTCACCGCAACTGATc < 7:244567/149‑1 (MQ=255) ggTGTTTA‑CCAA‑CCGCAATGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTGGATGACCGACTTTTCCGGCCTGCCCCTGGTGATCGAAGCTGCAGACCTGCTGCCACGCCTGGATTCGCCGCAACTGATcc < 4:80666/148‑1 (MQ=255) 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a‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGCGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTGGATGACCGACTTTTCCGGCCTGCCCCTGGTGATCGAAGCTGCAGACCTGCTGCCACGCCTGGATTCGCCGCAACTGATCCTGGTCGAc > 8:236142/1‑149 (MQ=255) a‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTGGATGACCGACTTTTCCGGCCTGCCCCTGGTGAt < 3:43668/94‑1 (MQ=255) a‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTGGATGACCGACTTTTCCGGCCTGCCCCTGGTGAt > 4:43668/1‑94 (MQ=255) cAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTGGATGACCGACTTTTCCGGCCTGCCCCTCGAGATCGAAGCTGCAGACCTGCTGCCACGCCTGGATTCGCCGCAACTGATCCTGGACGACCt > 3:108334/1‑149 (MQ=255) tagcGCAAGGCTCAACCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTGGATGACCGACTTTTCCGGCCTGCCCCTGGTGATCGAAGCTGCAGACCTGCTGCCACGCCTGGATTCGCCGCAACTGATCCTGGTCGACCt > 5:24475/4‑148 (MQ=255) cAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTGGATGACCGACTTTTCCGGCCTGCCCCTGGTGATCGAAGCTGCAGACCTGCTGCCACGCCTGGATTcgc < 6:10068/121‑1 (MQ=255) cAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTGGATGACCGACTTTTCCGGCCTGCCCCTGGTGATCGAAGCTGCAGACCTGCTGCCACGCCTGGATTcgc > 5:10068/1‑121 (MQ=255) gggTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTGGATGACCGACTTTTCCGGCCTGCCCCTGGTGATCGAAGCTGCAGACCTGCTGCCACGCCTGGATTCGCCGCAACTGATCCTGGTCGACCTGAGCAgcgc < 7:215857/149‑1 (MQ=255) | TCGCTGGCAGCCAACGACCAGGTGCTGATGCTGCTGGTGGCCGACCAGGGCTGCCGGCCTTTGGCCGATATCAGCGTGCAAGCCTTCGGCAAGACCGCGCAATGCATCGAG‑CGGGCCTTGTCGGTGTTTA‑CCAA‑CCGCAAGGGTTGAGCCTTGCGCTACAATCGCCCCTCTTTCCACACTGGAGACCGTGGATGACCGACTTTTCCGGCCTGCCCCTGGTGATCGAAGCTGCAGACCTGCTGCCACGCCTGGATTCGCCGCAACTGATCCTGGTCGACCTGAGCAGCGC > NC_002947/5577668‑5577956 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |