| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,581,575 | C→G | 6.1% | P204A (CCG→GCG) | PP_4910 → | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,581,575 | 0 | C | G | 6.1% | 213.7 / 3.0 | 65 | P204A (CCG→GCG) | PP_4910 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (29/32); new base G (2/2); total (31/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.58e-01 | |||||||||||
GAGCCAGTTCCAGCAGCCGATGCTGATCAGCCTGCAGAGCATGGGCATTCTGGCCGCCATCCTGCTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAGCTGCATGCACGCCTGGCCCCGCCTCCGCCCCCGGAGCCGGAGCCCGAGGAAGACGACGACGAGCAGTTCGACGACCTGCACGCAG > NC_002947/5581427‑5581719 | gAGCCAGTTCCAGCAGCCGATGCTGATCAGCCTGCAGAGCATGGGCATTCTGGCCGCCATCCTGCTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGAcc > 6:314084/1‑149 (MQ=255)gAGCCAGTTCCAGCAGCCGATGCTGATCAGCCTGCAGAGCATGGGCATTCTGGCCGCCATCCTGCTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGAcc > 5:98116/1‑149 (MQ=255) aGCCAGTTCCAGCAGCCGATGCTGATCAGCCTGCAGAGCATGGGCATTCTGGCCGCCATCCTGCTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGAccc > 8:39617/1‑149 (MQ=255) ccAGTTCCAGCAGCCGATGCTGATCAGCCTGCAGAGCATGGGCATTCTGGCCGCCATCCTGCTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCg > 5:15294/1‑148 (MQ=255) ttCCAGCAGCCGATGCTGATCAGCCTGCAGAGCATGGGCATTCTGGCCGCCATCCTGCTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGGGTCGCGCAGcc < 3:201328/149‑1 (MQ=255) tGCTGATCAGCCTGCAGAGCATGGGCATTCTGGCCGCCATCCTGCTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGcc < 6:280687/149‑1 (MQ=255) cTGATCAGCCTGCAGAGCATGGGCATTCTGGCCGCCATCCTGCTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCa < 7:39617/148‑1 (MQ=255) ccTGCAGAGCATGGGCATTCTGGCCGCCATCCTGCTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGcc < 5:162577/126‑1 (MQ=255) ccTGCAGAGCATGGGCATTCTGGCCGCCATCCTGCTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGcc > 6:162577/1‑126 (MQ=255) ccTGCAGAGCATGGGCATTCTGGCCGCCATCCTGCTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGcc > 6:158008/1‑126 (MQ=255) ccTGCAGAGCATGGGCATTCTGGCCGCCATCCTGCTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGcc < 5:158008/126‑1 (MQ=255) tGCAGAGCATGGGCATTCTGGCCGCCATCCTGCTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGAccc > 5:203800/1‑118 (MQ=255) tGCAGAGCATGGGCATTCTGGCCGCCATCCTGCTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGAccc < 6:203800/118‑1 (MQ=255) gCAGAGCATGGGCATTCTGGCCGCCATCCTGCTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGc < 2:39092/122‑1 (MQ=255) gCAGAGCATGGGCATTCTGGCCGCCATCCTGCTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGc > 1:39092/1‑122 (MQ=255) gCATTCTGGCCGCCATCCTGCTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGc < 6:41/149‑1 (MQ=255) gCATTCTGGCCGCCATCCTGCTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGc < 4:121165/149‑1 (MQ=255) ggCCGCCATCCTGCTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCgg < 4:291377/116‑1 (MQ=255) ggCCGCCATCCTGCTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCgg > 3:291377/1‑116 (MQ=255) ggCCGCCATCCTGCTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATcg > 1:175866/1‑149 (MQ=255) gccgccATCCTGCTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATcgc > 5:127285/1‑149 (MQ=255) gccgccATCCTGCTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATc < 4:20275/147‑1 (MQ=255) ccgccATCCTGCTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATcgcc < 4:153912/149‑1 (MQ=255) ccgccATCCTGCTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATcgcc < 5:262916/149‑1 (MQ=255) cgccATCCTGCTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATcgccc < 3:142870/149‑1 (MQ=255) cATCCTGCTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATcgcccgcc > 4:309652/1‑149 (MQ=255) aTCCTGCTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCg > 8:216971/1‑108 (MQ=255) aTCCTGCTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCg < 7:216971/108‑1 (MQ=255) tCCTGCTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGc < 1:204439/134‑1 (MQ=255) tCCTGCTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGc > 2:204439/1‑134 (MQ=255) tCCTGCTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAg > 5:186947/1‑149 (MQ=255) cTGCTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAGc < 5:314084/148‑1 (MQ=255) gCTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAGCtg > 5:191633/1‑148 (MQ=255) cTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACgag > 1:21718/1‑123 (MQ=255) cTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACgag < 2:21718/123‑1 (MQ=255) cTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAGCtg < 3:148226/147‑1 (MQ=255) aCCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAGCtgcatg > 4:190625/1‑148 (MQ=255) tGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACGCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAGCTGCATGCACGc > 1:102502/1‑149 (MQ=255) tGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAGCTGCATGCACGc > 7:139557/1‑149 (MQ=255) gCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAGCTGCATGCACGcc < 8:139557/148‑1 (MQ=255) gCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAGCTGCATGCACGCCt < 3:190625/149‑1 (MQ=255) gCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAGCTGCATGCACGCCTGGcccc < 6:98116/149‑1 (MQ=255) gCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAGCTGCATGCACGCCTGGcccc < 6:191633/149‑1 (MQ=255) gCCCGCAGCTCGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCGGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGACAGGCCGATATTGGCGACATAGCCCGCCATATGCATGCACGCCTGGcccc < 4:86156/149‑1 (MQ=255) cTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCaccgacc > 1:18694/1‑89 (MQ=255) cTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCaccgacc < 2:18694/89‑1 (MQ=255) ttGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAGCTGCATGCACGCCTGCCCCCGCCTCCGcc > 4:213328/1‑149 (MQ=255) tGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAGCTGCATGCACGCCTGGCCCCGCCTCCg > 5:287210/1‑146 (MQ=255) tGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAGCTGCATGCACGCCTGGCCCCGCCTCCg < 6:287210/146‑1 (MQ=255) cGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAGCTGCATGCACGCCTGGCCCCGCCTCCGCCCccggagccgga < 6:15294/149‑1 (MQ=255) tcaCCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAGCTGCATGCACGCCTGGCCCCGCCTCCGCCCCCGGAGCCGGAGCCCGAg > 8:174148/1‑149 (MQ=255) aCCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGCCCGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAGCTGCATGCACGCCTGGCCCCGCCTCCGCCCCCGGAGCCGGCGCCCGAgg > 3:193595/1‑148 (MQ=255) cccTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAGCTGCATGCACGCCTGGCCCCGCCTCCGCCCCCGGAGCCGGAGCCCGAgg > 5:241650/1‑147 (MQ=255) cTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAGCTGCATGCACGCCTGGCCCCGCCTCCGCCCCCGGAGCCGGAGCCCGAGGAAga > 4:24298/1‑149 (MQ=255) ctgcAACTGCGGGTATGGCTTCGAGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACAGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAGCTGCATGCACGCCTGGCCCCGCCTCCGCCCCCGGAGCCGGAGCCCGAGGAAgacgacgac < 4:206005/147‑1 (MQ=255) ctgcAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAGCTGCATGCACGCCTGGCCCCGCCTCCGCCCCCGGAGCCGGAGCCCGAGGAAgacgacgac > 6:241018/1‑147 (MQ=255) ctgcAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAGCTGCATGCACGCCTGGCCCCGCCTCCGCCCCCGGAGCCGGAGCCCGAGGAAg < 3:288869/139‑1 (MQ=255) ctgcAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAGCTGCATGCACGCCTGGCCCCGCCTCCGCCCCCGGAGCCGGAGCCCGAGGAAg > 4:288869/1‑139 (MQ=255) tgcAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAGCTGCATGCACGCCTGGCCCCGCCTCCGCCCCCGGAGCCGGAGCCCGAGGAAGACGACGACGAg > 6:83303/1‑149 (MQ=255) aCTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAGCTGCATGCACGCCTGGCCCCGCCTCCGCCCCCGGAGCCGGAGCCCGAGGAAGACGACGACGAGCAGt < 2:102502/149‑1 (MQ=255) gggTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAGCTGCATGCACGCCTGGCCCCGCCTCCGCCCCCGGAGCCGGAGCCCGAGGAAGACGACGACGAGCAGTTcgac < 7:174148/149‑1 (MQ=255) atagggCTGCGGGTCGCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAGCTGCATGCACGCCTGGCCCCGCCTCCGCCCCCGGAGCCGGAGCCCg < 2:42860/117‑1 (MQ=255) atagggCTGCGGGTCGCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAGCTGCATGCACGCCTGGCCCCGCCTCCGCCCCCGGAGCCGGAGCCCg > 1:42860/5‑121 (MQ=255) tATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAGCTGCATGCACGCCTGGCCCCGCCTCCGCCCCCGGAGCCGGAGCCCGAGGAAGACGACGACGAg < 6:88475/137‑1 (MQ=255) tATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACACCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAGCTGCATGCACGCCTGGCCCCGCCTCCGCCCCCGGAGCCGGAGCCCGAGGAAGACGACGACGAg > 5:88475/1‑137 (MQ=255) cgcgACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAGCTGCATGCACGCCTGGCCCCGCCTCCGCCCCCGGAGCCGGAGCCCGAGGAAgac > 4:211465/1‑120 (MQ=255) cgcgACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAGCTGCATGCACGCCTGGCCCCGCCTCCGCCCCCGGAGCCGGAGCCCGAGGAAGACGACGACGAGCAGTTCGACGACCTGCAc < 5:241018/147‑1 (MQ=255) gcgACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAGCTGCATGCACGCCTGGCCCCGCCTCCGCCCCCGGAGCCGGAGCCCGAGGAAGACGACGACGAGCAGTTCGACGAcc > 7:223220/1‑141 (MQ=255) gcgACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAGCTGCATGCACGCCTGGCCCCGCCTCCGCCCCCGGAGCCGGAGCCCGAGGAAGACGACGACGAGCAGTTCGACGAcc < 8:223220/141‑1 (MQ=255) cgACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAGCTGCATGCACGCCTGGCCCCGCCTCCGCCCCCGGAGCCGGAGCCCGAGGAAGACGACGACGAGCAGTTCGACGACCTGCACGCAg > 5:232632/1‑149 (MQ=255) | GAGCCAGTTCCAGCAGCCGATGCTGATCAGCCTGCAGAGCATGGGCATTCTGGCCGCCATCCTGCTTACCCTGGCCTTGGCCCTCAGCTTGCGTCAGGGTCGCTTCATCACCCTGCCACTGCTGCAACTGCGGGTATGGCTGCGCGACCCGCAGCCCTATACCCCGGCCACCGACCGCCAGGACGAGATTGGCGACATCGCCCGCCAGCTGCATGCACGCCTGGCCCCGCCTCCGCCCCCGGAGCCGGAGCCCGAGGAAGACGACGACGAGCAGTTCGACGACCTGCACGCAG > NC_002947/5581427‑5581719 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |