Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,666,371 | C→T | 5.9% | P129S (CCC→TCC) | nhaP → | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,666,371 | 0 | C | T | 5.9% | 207.4 / 2.1 | 68 | P129S (CCC→TCC) | nhaP | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (27/37); new base T (2/2); total (29/39) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.71e-01 |
TTTGCCGGCGCCCTGCACGTCAACCTCAGCGACCTGCGCAGCTACCGCTGGCCGATCGGCCTGCTGGCTACCTTGGGCGTGCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTACTGCCAATGCGCCCAAACCGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCA > NC_002947/5666224‑5666509 | tttGCCGGCGCCCTGCACGTCAACCTCAGCGACCTGCGCAGCTACCGCTGGCCGATCGGCCTGCTGGCTACCTTGGGCGTGCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGcc > 4:261582/1‑149 (MQ=255) cGGCGCCCTGCACGTCAACCTCAGCGACCTGCGCAGCTACCGCTGGCCGATCGGCCTGCTGGCTACCTTGGGCGTGCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGa > 8:65194/1‑149 (MQ=255) cGGCGCCCTGCACGTCAACCTCAGCGACCTGCGCAGCTACCGCTGGCCGATCGGCCTGCTGGCTACCTTGGGCGTGCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGa < 3:261582/149‑1 (MQ=255) ggCGCCCTGCACGTCAACCTCAGCGACCTGCGCAGCTACCGCTGGCCGATCGGCCTGCTGGCTACCTTGGGCGTGCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGAt < 5:17775/149‑1 (MQ=255) ggCGCCCTGCACGTCAACCTCAGCGACCTGCGCAGCTACCGCTGGCCGATCGGCCTGCTGGCTACCTTGGGCGTGCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGAt > 7:7379/1‑149 (MQ=255) cTGCACGTCAACCTCAGCGACCTGCGCAGCTACCGCTGGCCGATCGGCCTGCTGGCTACCTTGGGCGTGCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTActg > 5:303142/1‑149 (MQ=255) gCACGTCAACCTCAGCGACCTGCGCAGCTACCGCTGGCCGATCGGCCTGCTGGCTACCTTGGGCGTGCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTAc > 8:174993/1‑145 (MQ=255) gCACGTCAACCTCAGCGACCTGCGCAGCTACCGCTGGCCGATCGGCCTGCTGGCTACCTTGGGCGTGCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTAc < 7:174993/145‑1 (MQ=255) cACGTCAACCTCAGCGACCTGCGCAGCTACCGCTGGCCGATCGGCCTGCTGGCTACCTTGGGCGTGCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTActgcc < 6:303142/148‑1 (MQ=255) cACGTCAACCTCAGCGACCTGCGCAGCTACCGCTGGACGATCGGCCTGCTGGCTACCTTGGGCGTGCTGATCGCCACCGTGGTGATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTActgcc < 8:303140/148‑1 (MQ=255) aCGTCAACCTCAGCGACCTGCGCAGCTACCGCTGGCCGATCGGCCTGCTGGCTACCTTGGGCGTGCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTActgcctg < 3:280487/149‑1 (MQ=255) gTCAACCTCAGCGACCTGCGCAGCTACCGCTGGCCGATCGGCCTGCTGGCTACCTTGGGCGTGCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCctgct > 5:49533/1‑149 (MQ=255) gTCAACCTCAGCGACCTGCGCAGCTACCGCTGGCCGATCGGCCTGCTGGCTACCTTGGGCGTGCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCctgct > 6:998/1‑149 (MQ=255) aaCCTCAGCGACCTGCGCAGCTACCGCTGGCCGATCGGCCTGCTGGCTACCTTGGGCGTGCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGtt < 3:256542/149‑1 (MQ=255) ccTCAGCGACCTGCGCAGCTACCGCTGGCCGATCGGCCTGCTGGCTACCTTGGGCGTGCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCg < 8:111002/149‑1 (MQ=255) ccTCAGCGACCTGCGCAGCTACCGCTGGCCGATCGGCCTGCTGGCTACCTTGGGCGTGCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCg < 8:40508/149‑1 (MQ=255) ccTCAGCGACCTGCGCAGCTACCGCTGGCCGATCGGCCTGCTGGCCACCTTGGGCGTGCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCg < 6:165684/149‑1 (MQ=255) aGCGACCTGCGCAGCTACCGCTGGCCGATCGGCCTGCTGGCTACCTTGGGCGTGCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGt < 8:216932/147‑1 (MQ=255) gACCTGCGCAGCTACCGCTGGCCGATCGGCCTGCTGGCTACCTTGGGCGTGCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACt > 2:236422/1‑149 (MQ=255) aCCTGCGCAGCTACCGCTGGCCGATCGGCCTGCTGGCTACCTTGGGCGTGCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTg < 7:65194/149‑1 (MQ=255) gcgcAGCTACCGCTGGCCGATCGGCCTGCTGGCTACCTTGGGCGTGCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCCCTGAtct > 7:116582/1‑149 (MQ=255) gcgcAGCTACCGCTGGCCGATCGGCCTGCTGGCTACCTTGGGCGTGCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGAtct > 5:136277/1‑149 (MQ=255) cgccgcTACCGCTGGCCGATCGGCCTGCTGGCTACCTTGGGCGTGCTGCTCGCCACCGTGGTCAGCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGAtctc < 3:185416/149‑1 (MQ=255) cAGCTACCGCTGGCCGATCGGCCTGCTGGCTACCTTGGGCGTGCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCac < 5:232540/149‑1 (MQ=255) tACCGCTGGCCGATCGGCCTGCTGGCTACCTTGGGCGTGCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCaccgac > 2:101894/1‑149 (MQ=255) tCGGCCTGCTGGCTACCTTGGGCGTGCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGcc < 6:49533/149‑1 (MQ=255) gCCTGCTGGCTACCTTGGGCGTGCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGTCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGt > 5:314642/1‑148 (MQ=255) gCCTGCTGGCTACCTTGGGCGTGCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTAGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGTCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTAGGTGCACTGATGTAACCTCAAGACCCGAATCCCGt > 3:189815/1‑148 (MQ=255) ctgGCTACCTTGGGCGTGCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCtt < 1:236422/147‑1 (MQ=255) ctgGCTACCTTGGGCGTGCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACAGACCCGATTGCCGTGCTTgg > 4:267600/1‑149 (MQ=255) tACCTTGGGCGTGCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGgcgcgc > 4:114410/1‑149 (MQ=255) tACCTTGGGCGTGCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGgcgcgc > 3:199994/1‑149 (MQ=255) ccTTGGGCGTGCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTg < 7:87363/149‑1 (MQ=255) cTTGGGCGTGCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGc > 3:291065/1‑149 (MQ=255) cGTGCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCg > 4:176744/1‑95 (MQ=255) cGTGCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCg < 3:176744/95‑1 (MQ=255) gCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTa < 8:104628/143‑1 (MQ=255) gCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTa > 7:104628/1‑143 (MQ=255) cTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTACTGCCaa < 4:110445/149‑1 (MQ=255) gATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTACTGc < 8:96078/144‑1 (MQ=255) gATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTACTGc < 8:91614/144‑1 (MQ=255) gATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTACTGc > 7:96078/1‑144 (MQ=255) gATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTACTGc > 7:91614/1‑144 (MQ=255) aTCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTACTGCCAATgc < 4:199994/149‑1 (MQ=255) gCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTACTGCCAATgcgc < 1:16309/148‑1 (MQ=255) gCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTACTGCCAATgcgc < 1:27074/148‑1 (MQ=255) gCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTACTGCCAATGCGcc > 3:83128/1‑149 (MQ=255) gCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTACTGCCAATGCGcc < 6:5433/149‑1 (MQ=255) ccACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTACTGCCAATGCGccc < 4:291065/149‑1 (MQ=255) tCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTACTGCCAATGCGCCCAAACCGCt > 4:261103/1‑148 (MQ=255) tCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTACTGCCAATGCGCCCAAACCGCTTaa > 7:28991/1‑148 (MQ=255) ggattccTGGCTCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGTTGTCCCTGATCTTCTGGCTGCTGTTCGGTGCACTGATATCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGTCGCGCTTCGTACTTCCAATGCGCCCAAACCGCTTaaaa < 4:189815/143‑1 (MQ=255) ggCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGTCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTACTGCCAATGCGCCCAAACCGCTTaaaa < 6:314642/148‑1 (MQ=255) ggCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTACTGCCAATGCGCCCAAACCGCTTaaaa < 8:7379/148‑1 (MQ=255) gCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTACTGCCAATGCGCCCAAACCGCTTAAAacc < 4:83128/149‑1 (MQ=255) aCCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTACTGc < 4:127995/121‑1 (MQ=255) aCCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTACTGc > 3:127995/1‑121 (MQ=255) tGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTACTGCCAATGCGCCCAAACCGCTTAAAACCACCAtc > 6:133838/1‑149 (MQ=255) gcgcATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCAGTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTACTGCCAATGCGCCCAAACCGCTTAAAACCACCAtcgt > 2:299735/1‑149 (MQ=255) gcgcATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTACTGCCAATGCGCCCAAACCGCTTAAAACCACCAtcgt < 5:998/149‑1 (MQ=255) gcgcATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTACTGCCAATGCGCCCAAACCGCTTAAAACCACCAtc < 3:261103/147‑1 (MQ=255) gcATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCATTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTACTGCCAATGCGCCCAAACCGCTTAAAACCACCAtcgtcg < 1:299735/149‑1 (MQ=255) gcATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTACTGCCAATGCGCCCAAACCGCTTAAAACCACCAtcgtcg < 6:136277/149‑1 (MQ=255) aTTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGc < 7:66196/105‑1 (MQ=255) aTTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTAACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGc > 8:66196/1‑105 (MQ=255) ggCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTACTGCCAATGCGCCCAAACCGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAacgacg < 3:123649/148‑1 (MQ=255) gCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTACTGCCAATGCGCCCAAACCGCTTaa < 2:3300/112‑1 (MQ=255) gCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTACTGCCAATGCGCCCAAACCGCTTaa > 1:3300/1‑112 (MQ=255) cTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTACTGCCAATGCGCCCAAACCGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGacggca > 4:301295/1‑149 (MQ=255) | TTTGCCGGCGCCCTGCACGTCAACCTCAGCGACCTGCGCAGCTACCGCTGGCCGATCGGCCTGCTGGCTACCTTGGGCGTGCTGATCGCCACCGTGGTCATCGGCTACCTGGCGCATTGGGTGTTTGCCCTGTTCGGCTGGCAGGTGCCCCTGATCTACTGCCTGCTGTTCGGTGCACTGATCTCACCGACCGACCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTACTGCCAATGCGCCCAAACCGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCA > NC_002947/5666224‑5666509 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |