| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,780,691 | T→C | 7.3% | L332P (CTG→CCG) | cvrA → | K(+)/H(+) antiporter NhaP |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,780,691 | 0 | T | C | 7.3% | 191.6 / 5.1 | 68 | L332P (CTG→CCG) | cvrA | K(+)/H(+) antiporter NhaP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (26/37); new base C (3/2); total (29/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.44e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.61e-01 | |||||||||||
ATCCTGCACATGCTCGACGGCATGGCCTGGCTGGCCCAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGCTGATGGCGGGCCTGCCAGACGCCCAGCTGTTCTT > NC_002947/5780543‑5780838 | aTCCTGCACATGCTCGACGGCATGGCCTGGCTGGCCCAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACt > 2:258083/1‑149 (MQ=255) ccTGCACATGCTCGACGGCATGGCCTGGCTGGCCCAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGt > 2:248062/1‑149 (MQ=255) cacaTGCTCGACGGCATGGCCTGGCTGGCCCAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCggt < 1:248062/149‑1 (MQ=255) cacaTGCTCGACGGCATGGCCTGGCTGGCCCAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCgg < 1:260169/148‑1 (MQ=255) tCGACGGCATGGCCTGGCTGGCCCAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTcg‑cg > 5:154054/1‑149 (MQ=255) gACGGCATGGCCTGGCTGGCCCAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑Cgg < 2:310746/148‑1 (MQ=255) cGGCATGGCCTGTCTGGCCCAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGTGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGACCACCGACAGTGGCcg‑cgcc < 3:234913/147‑3 (MQ=255) aTGGCCTGGCTGGCCCAGATGGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATGGCCCTGCCGGCAGTGGGCCTGGCGCTCTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCctgct < 2:124166/149‑1 (MQ=255) aTGGCCTGGCTGGCCCAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCctgct < 7:225074/149‑1 (MQ=255) ccTGGCTGGCCCAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCt > 6:328999/1‑149 (MQ=255) gctggcCCAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTc > 5:129986/1‑148 (MQ=255) agtatcccAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCa < 7:174355/144‑1 (MQ=255) ctggcCCAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCaa < 1:232075/149‑1 (MQ=255) tggcCCAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAg > 6:147285/1‑149 (MQ=255) tggcCCAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAg < 5:147285/149‑1 (MQ=255) tggcCCAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAg > 4:204888/1‑149 (MQ=255) gcCCAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAgg < 8:208101/148‑1 (MQ=255) gcCCAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAgg < 4:126950/148‑1 (MQ=255) ccAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑Cgg > 2:101184/1‑128 (MQ=255) ccAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCAGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑Cgg < 1:101184/128‑1 (MQ=255) aTCGGCATGTTGCGGGTGCTTGGGTTGCTGGGCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGGGGCGCGGCCACTGTCGGTGGGCGTCGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTcc < 1:173510/149‑1 (MQ=255) cATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGcc > 7:92069/1‑149 (MQ=255) tCCTGGTGCTGGGGTTGGTGGGCCGGCGGCAGTCCCTGTGGCCCATCCCCCTGCCGGCCCGGGGCGTGGGGCGGGGTTTTTTCCATGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTg < 1:258083/148‑1 (MQ=255) cTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGaaaa < 3:204888/149‑1 (MQ=255) cTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGt < 8:92069/148‑1 (MQ=255) cTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGt < 6:129986/148‑1 (MQ=255) cTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGt < 3:103855/148‑1 (MQ=255) gTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TTGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCACTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCAAGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGt > 8:221744/1‑149 (MQ=255) gTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGt > 1:281774/1‑149 (MQ=255) cgccgcACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGc < 8:118389/149‑1 (MQ=255) ccgcACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCt > 3:56915/1‑149 (MQ=255) ccgcACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCt > 7:249394/1‑149 (MQ=255) cACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTgcg < 8:249394/149‑1 (MQ=255) aCCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTgg < 8:266486/134‑1 (MQ=255) aCCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTgg > 7:266486/1‑134 (MQ=255) ccTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTgcgcggcg > 3:229916/1‑149 (MQ=255) ccTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTgcgcggcg < 5:282175/149‑1 (MQ=255) tgctgcCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTgcgcggcgcg > 7:122878/1‑149 (MQ=255) cccATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCtt > 8:245727/1‑116 (MQ=255) cccATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCtt < 7:245727/116‑1 (MQ=255) cTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCt < 1:235651/149‑1 (MQ=255) tGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTc > 6:199113/1‑149 (MQ=255) tGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTc > 4:55853/1‑149 (MQ=255) gCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCg < 4:56915/149‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGCt < 3:55853/149‑1 (MQ=255) gtgGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGGCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGCTGATGGCgg < 5:74112/149‑1 (MQ=255) tgGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGCTGATGGCg < 2:281774/147‑1 (MQ=255) gatgatCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGCTGATGGCGGGcc > 7:2932/1‑149 (MQ=255) gatgatCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGCTGATGGCGGGc < 5:199113/148‑1 (MQ=255) tCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTc > 1:979/1‑128 (MQ=255) tCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTc < 2:979/128‑1 (MQ=255) tggtggCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGCTGATGGCGGGCCTGCCAGAc > 3:18542/1‑149 (MQ=255) tggtggCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGCTGATGGCGGGCCTGCCAGAc > 5:200090/1‑149 (MQ=255) gtggCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGCTGATGGCGGGCCTGCCAGACGc > 4:15728/1‑149 (MQ=255) ggccgcgACCACCGACAGTGGCCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGCTGATGGCGGGCCTGCCAGACGcc > 8:242340/4‑149 (MQ=255) ggCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCg > 2:244158/1‑115 (MQ=255) ggCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCg < 1:244158/115‑1 (MQ=255) gcgcGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGCTGATGGCGGGCCTGCCAGACGCCCa < 6:200090/149‑1 (MQ=255) ccgcgACCACCGACAGTGGCCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGc > 5:59993/2‑124 (MQ=255) ccgcgACCACCGACAGTGGCCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGc < 6:59993/123‑1 (MQ=255) cgcgGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTGAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGCTGATGGCGGGCCTGCCAGACGCCCAg < 5:328999/149‑1 (MQ=255) cgcgGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGCTGATGGCGGGCCTGCCAGACGCCCAg < 3:76367/149‑1 (MQ=255) gcgGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGa < 3:184191/101‑1 (MQ=255) gcgGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGa > 4:184191/1‑101 (MQ=255) gcgGCCACTGTCGGTGGCCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGc < 7:272160/122‑1 (MQ=255) gcgACCACCGACAGTGGCCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGCTGATGGCGGGCCTGCCAGACGCCCAGc > 6:87367/1‑149 (MQ=255) gCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGCTGATGGCGGGCCTGCCAGACGCCCAGCTGt > 2:220255/1‑149 (MQ=255) aCTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGCTGATGGCGGGCCTGCCAGACGCCCAGCTGttct < 4:229916/149‑1 (MQ=255) cTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGCTGATGGCGGGCCTGCCAGACGCCCAGCTGttctt < 4:7734/149‑1 (MQ=255) tGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTAc < 2:316850/90‑1 (MQ=255) tGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTAc > 1:316850/1‑90 (MQ=255) | ATCCTGCACATGCTCGACGGCATGGCCTGGCTGGCCCAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGCTGATGGCGGGCCTGCCAGACGCCCAGCTGTTCTT > NC_002947/5780543‑5780838 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |