| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,780,700 | T→C | 9.2% | V335A (GTC→GCC) | cvrA → | K(+)/H(+) antiporter NhaP |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,780,700 | 0 | T | C | 9.2% | 178.3 / 6.8 | 67 | V335A (GTC→GCC) | cvrA | K(+)/H(+) antiporter NhaP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (26/33); new base C (3/3); total (29/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.85e-01 | |||||||||||
TCGACGGCATGGCCTGGCTGGCCCAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGCTGATGGCGGGCCTGCCAGACGCCCAGCTGTTCTTCAACCTGGC > NC_002947/5780556‑5780847 | tCGACGGCATGGCCTGGCTGGCCCAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTcg‑cg > 5:154054/1‑149 (MQ=255) gACGGCATGGCCTGGCTGGCCCAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑Cgg < 2:310746/148‑1 (MQ=255) cGGCATGGCCTGTCTGGCCCAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGTGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGACCACCGACAGTGGCcg‑cgcc < 3:234913/147‑3 (MQ=255) aTGGCCTGGCTGGCCCAGATGGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATGGCCCTGCCGGCAGTGGGCCTGGCGCTCTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCctgct < 2:124166/149‑1 (MQ=255) aTGGCCTGGCTGGCCCAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCctgct < 7:225074/149‑1 (MQ=255) ccTGGCTGGCCCAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCt > 6:328999/1‑149 (MQ=255) gctggcCCAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTc > 5:129986/1‑148 (MQ=255) agtatcccAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCa < 7:174355/144‑1 (MQ=255) ctggcCCAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCaa < 1:232075/149‑1 (MQ=255) tggcCCAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAg > 6:147285/1‑149 (MQ=255) tggcCCAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAg < 5:147285/149‑1 (MQ=255) tggcCCAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAg > 4:204888/1‑149 (MQ=255) gcCCAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAgg < 8:208101/148‑1 (MQ=255) gcCCAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAgg < 4:126950/148‑1 (MQ=255) ccAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑Cgg > 2:101184/1‑128 (MQ=255) ccAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCAGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑Cgg < 1:101184/128‑1 (MQ=255) aTCGGCATGTTGCGGGTGCTTGGGTTGCTGGGCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGGGGCGCGGCCACTGTCGGTGGGCGTCGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTcc < 1:173510/149‑1 (MQ=255) cATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGcc > 7:92069/1‑149 (MQ=255) tCCTGGTGCTGGGGTTGGTGGGCCGGCGGCAGTCCCTGTGGCCCATCCCCCTGCCGGCCCGGGGCGTGGGGCGGGGTTTTTTCCATGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTg < 1:258083/148‑1 (MQ=255) cTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGaaaa < 3:204888/149‑1 (MQ=255) cTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGt < 3:103855/148‑1 (MQ=255) cTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGt < 8:92069/148‑1 (MQ=255) cTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGt < 6:129986/148‑1 (MQ=255) gTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TTGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCACTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCAAGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGt > 8:221744/1‑149 (MQ=255) gTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGt > 1:281774/1‑149 (MQ=255) cgccgcACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGc < 8:118389/149‑1 (MQ=255) ccgcACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCt > 3:56915/1‑149 (MQ=255) ccgcACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCt > 7:249394/1‑149 (MQ=255) cACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTgcg < 8:249394/149‑1 (MQ=255) aCCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTgg < 8:266486/134‑1 (MQ=255) aCCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTgg > 7:266486/1‑134 (MQ=255) ccTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTgcgcggcg > 3:229916/1‑149 (MQ=255) ccTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTgcgcggcg < 5:282175/149‑1 (MQ=255) tgctgcCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTgcgcggcgcg > 7:122878/1‑149 (MQ=255) cccATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCtt < 7:245727/116‑1 (MQ=255) cccATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCtt > 8:245727/1‑116 (MQ=255) cTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCt < 1:235651/149‑1 (MQ=255) tGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTc > 4:55853/1‑149 (MQ=255) tGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTc > 6:199113/1‑149 (MQ=255) gCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCg < 4:56915/149‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGCt < 3:55853/149‑1 (MQ=255) gtgGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGGCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGCTGATGGCgg < 5:74112/149‑1 (MQ=255) tgGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGCTGATGGCg < 2:281774/147‑1 (MQ=255) gatgatCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGCTGATGGCGGGcc > 7:2932/1‑149 (MQ=255) gatgatCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGCTGATGGCGGGc < 5:199113/148‑1 (MQ=255) tCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTc < 2:979/128‑1 (MQ=255) tCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTc > 1:979/1‑128 (MQ=255) tggtggCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGCTGATGGCGGGCCTGCCAGAc > 5:200090/1‑149 (MQ=255) tggtggCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGCTGATGGCGGGCCTGCCAGAc > 3:18542/1‑149 (MQ=255) gtggCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGCTGATGGCGGGCCTGCCAGACGc > 4:15728/1‑149 (MQ=255) ggccgcgACCACCGACAGTGGCCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGCTGATGGCGGGCCTGCCAGACGcc > 8:242340/4‑149 (MQ=255) ggCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCg > 2:244158/1‑115 (MQ=255) ggCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCg < 1:244158/115‑1 (MQ=255) gcgcGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGCTGATGGCGGGCCTGCCAGACGCCCa < 6:200090/149‑1 (MQ=255) ccgcgACCACCGACAGTGGCCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGc > 5:59993/2‑124 (MQ=255) ccgcgACCACCGACAGTGGCCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGc < 6:59993/123‑1 (MQ=255) cgcgGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTGAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGCTGATGGCGGGCCTGCCAGACGCCCAg < 5:328999/149‑1 (MQ=255) 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aCTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGCTGATGGCGGGCCTGCCAGACGCCCAGCTGttct < 4:229916/149‑1 (MQ=255) cTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGCTGATGGCGGGCCTGCCAGACGCCCAGCTGttctt < 4:7734/149‑1 (MQ=255) tGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTAc > 1:316850/1‑90 (MQ=255) tGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTAc < 2:316850/90‑1 (MQ=255) gtggtCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGCTGATGGCGGGCCTGCCAGACGCCCAGCTGttct < 5:327007/142‑1 (MQ=255) gtggtCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGCTGATGGCGGGCCTGCCAGACGCCCAGCTGttct > 6:327007/1‑142 (MQ=255) gtCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGCTGATGGCGGGCCTGCCAGACGCCCAGCTGTTCTTCAACCTGGc > 2:298412/1‑149 (MQ=255) | TCGACGGCATGGCCTGGCTGGCCCAGATCGGCATGTTCCTGGTGCTGGGGTTGCTGGTCACGCCGCACGACCTGCTGCCCATCGCCCTGCCGGCACTGGGCCTGGCGCTGTGGATGATCC‑TGGTGGCGCGGCCACTGTCGGTGGTCG‑CGGCCCTGCTGCCTTTCAAGGCTTTCCACGGCCGTGAAAAGGGCTTCATTTCGTGGGTCGGCCTGCGCGGCGCGGTACCGATCATTCTGGCGGTGTTCCCGCTGATGGCGGGCCTGCCAGACGCCCAGCTGTTCTTCAACCTGGC > NC_002947/5780556‑5780847 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |