| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,789,980 | C→A | 5.9% | G379G (GGC→GGA) | ynfM → | efflux transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,789,980 | 0 | C | A | 5.9% | 220.1 / 3.6 | 68 | G379G (GGC→GGA) | ynfM | efflux transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (33/31); new base A (2/2); total (35/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.51e-01 | |||||||||||
TCCACTGGTGATGGTGATCGTGGGCATGCTGGTGTTCACCTTCGGCTTCTTTGGTGCGCACTCGGTGGCCAGCAGCTGGATC‑GGCCGCCGGGCGCTGAAGGCCAAGGGGCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTC > NC_002947/5789833‑5790128 | tCCACTGGTGATGGTGATCGTGGGCATGCTGGTGTTCACCTTCGGCTTCTTTGGTGCGCACTCGGTGGCCAGCAGCTGGATC‑GGCCGCCGGGCGCTGAAGGCCAAGGGGCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCCACTACGCT‑‑‑GGCt > 8:282385/1‑149 (MQ=255) tggtgatggtgaTCGTGGGCATGCTGGTGTTCACCTTCGGCTTCTTTGGTGCGCACTCGGTGGCCAGCAGCTGGATC‑GGCCGCCGGGCGCTGAAGGCCAAGGGGCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCCGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGc > 2:254022/1‑149 (MQ=255) gtgatggtgatCGTGGGCATGCTGGTGTTCACCTTCGGCTTCTTTGGTGCGCACTCGGTGGCCAGCAGCTGGATC‑GGCCGCCGGGCGCTGAAGGCCAAGGGGCAGACGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGt > 5:19300/1‑149 (MQ=255) gtgatCGTGGGCATGCTGGTGTTCACCTTCGGCTTCTTTGGTGCGCACTCGGTGGCCAGCAGCTGGATC‑GGCCGCCGGGCGCTGAAGGCCAAGGGGCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCgg > 8:147282/1‑149 (MQ=255) gtgatCGTGGGCATGCTGGTGTTCACCTTCGGCTTCTTTGGTGCGCACTCGGTGGCCAGCAGCTGGATC‑GGCCGCCGGGCGCTGAAGGCCAAGGGGCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCgg < 2:270754/149‑1 (MQ=255) gtgatCGTGGGCATGCTGGTGTTCACCTTCGGCTTCTTTGGTGCGCACTCGGTGGCCAGCAGCTGGATC‑GGCCGCCGGGCGCTGAAGGCCAAGGGGCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCgg < 1:61006/149‑1 (MQ=255) tgatCGTGGGCATGCTGGTGTTCACCTTCGGCTTCTTTGGTGCGCACTCGGTGGCCAGCAGCTGGATC‑GGCCGCCGGGCGCTGAAGGCCAAGGGGCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGt < 8:101858/149‑1 (MQ=255) tCGTGGGCATGCTGGTGTTCACCTTCGGCTTCTTTGGTGCGCACTCGGTGGCCAGCAGCTGGATC‑GGCCGCCGGGCGCTGAAGGCCAAGGGGCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTAcg < 7:147282/149‑1 (MQ=255) gTGGGCATGCTGGTGTTCACCTTCGGCTTCTTTGGTGCGCACTCGGTGGCCAGCAGCTGGATC‑GGCCGCCGGGCGCTGAAGGCCAAGGGGCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTAcggc < 1:323212/149‑1 (MQ=255) tGCTGGTGTTCACCTTCGGCTTCTTTGGTGCGCACTCGGTGGCCAGCAGCTGGATC‑GGCCGCCGGGCGCTGAAGGCCAAGGGGCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGcgggcggg < 5:109522/149‑1 (MQ=255) tGCTGGTGTTCACCTTCGGCTTCTTTGGTGCGCACTCGGTGGCCAGCAGCTGGATC‑GGCCGCCGGGCGCTGAAGGCCAAGGGGCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGcgggcggg < 5:326193/149‑1 (MQ=255) cTGGTGTTCACCTTCGGCTTCTTTGGTGCGCACTCGGTGGCCAGCAGCTGGATC‑GGCCGCCGGGCGCTGAAGGCCAAGGGGCAGGCGTCGCTCGCTGTACCTGTTCCGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCgggg < 1:254022/149‑1 (MQ=255) cACCTTCGGCTTCCTTGGTGCGCACTCGGTGGCCAGCAGCTGGATC‑GGCCGCCGGGCGCTGAAGGCCAGGGGGCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTgg < 1:111573/148‑1 (MQ=255) cTTCGGCTTCTTTGGTGCGCACTCGGTGGCCAGCAGCTGGATCAGGCCGCCGGGCGCTGAAGGCCAAGGGGCAGGCGTCG‑TCGATGTACCTGTTATGATACTACGAT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTATgcaa > 1:63179/1‑145 (MQ=255) ttCGGCTTCTTTGGTGCGCACTCGGTGGCCAGCAGCTGGATC‑GGCCGCCGGGCGCTGAAGGCCAAGGGGCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGAGCCAGCGtagta < 1:98518/120‑5 (MQ=255) ttCGGCTTCTTTGGTGCGCACTCGGTGGCCAGCAGCTGGATC‑GGCCGCCGGGCGCTGAAGGCCAAGGGGCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGAGCCAGCGtagta > 2:98518/1‑116 (MQ=255) tGGTGCGCACTCGGTGGCCAGCAGCTGGATC‑GGCCGCCGGGCGCTGAAGGCCAAGGGGCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCTGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTgg < 6:19390/148‑1 (MQ=255) gTGCGCACTCGGTGGCCAGCAGCTGGATC‑GGCCGCCGGGCGCTGAAGGCCAAGGGGCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAAc > 1:185072/1‑149 (MQ=255) gcACTCGGTGGCCAGCAGCTGGATC‑GGCCGCCGGGCGCTGAAGGCCAAGGGGCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGa > 1:174897/1‑149 (MQ=255) tCGGTGGCCAGCAGCTGGATC‑GGCCGCCGGGCGCTGAAGGCCAAGGGGCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCgg > 1:49116/1‑149 (MQ=255) ggTGGCCAGCAGCTGGATC‑GGCCGCCGGGCGCTGAAGGCCAAGGGGCAGTCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCgg < 6:19300/147‑1 (MQ=255) cagcagCTGGATC‑GGCCGCCGGGCGCTGAAGGCCAAGGGGCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTgg > 4:72532/1‑115 (MQ=255) cagcagCTGGATC‑GGCCGCCGGGCGCTGAAGGCCAAGGGGCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTgg < 3:72532/115‑1 (MQ=255) agcTGGATC‑GGCCGCCGGGCGCTGAAGGCCAAGGGGCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTgg < 2:63179/149‑1 (MQ=255) cTGGATC‑GGCCGCCGGGCGCTGAAGGCCAAGGGGCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCa < 2:185072/149‑1 (MQ=255) gATC‑GGCCGCCGGGCGCTGAAGGCCAAGGGGCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTgg > 7:257246/1‑144 (MQ=255) gATC‑GGCCGCCGGGCGCTGAAGGCCAAGGGGCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTgg < 8:257246/144‑1 (MQ=255) tC‑GGCCGCCGGGCGCTGAAGGCCAAGGGGCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCTGAGGGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGGTGTTCATTGGAAGc > 1:96602/1‑149 (MQ=255) gccgccGGGCGCTGAAGGCCAAGGGGCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTc < 6:140415/98‑1 (MQ=255) gccgccGGGCGCTGAAGGCCAAGGGGCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTc > 5:140415/1‑98 (MQ=255) gccgGGCGCTGAAGGCCAAGGGGCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCg > 7:32217/1‑149 (MQ=255) gcgcTGAAGGCCAAGGGGCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGc < 2:52079/63‑1 (MQ=255) gcgcTGAAGGCCAAGGGGCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGc > 1:52079/1‑63 (MQ=255) aGGCCAAGGGGCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGAtg < 2:49116/149‑1 (MQ=255) ggCCAAGGGGCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTgg < 6:36407/134‑1 (MQ=255) ggCCAAGGGGCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTgg > 5:36407/1‑134 (MQ=255) ccAAGGGGCAGGCGTCG‑TCGGTGTACCTGTTCTGCTACTACGCG‑‑‑GGCTCCCGCGTGGCCGGTAGGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGTGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGGAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGAtggtg < 7:129816/149‑1 (MQ=255) ggggCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGt > 1:222782/1‑149 (MQ=255) gCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGAtg > 5:185806/1‑139 (MQ=255) gCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGAtg < 6:185806/139‑1 (MQ=255) cAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCa > 7:53834/1‑149 (MQ=255) gtcg‑tcGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCt > 6:129789/1‑147 (MQ=255) gtcg‑tcGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGa < 1:129503/149‑1 (MQ=255) cg‑tcgCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGc < 2:96602/149‑1 (MQ=255) tcgCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGc > 5:328584/1‑147 (MQ=255) gCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATc < 8:124346/88‑1 (MQ=255) gCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATc > 7:124346/1‑88 (MQ=255) cTGTACCTGTTCTGCCACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGtt < 7:282385/149‑1 (MQ=255) tGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGc > 3:159805/1‑143 (MQ=255) aCCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTGGAGCGTGGCCGGTAGGGCTGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCTTTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGTCTTTGCAcc < 3:202131/135‑1 (MQ=255) aCCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCAGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTAATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCAcc > 4:202131/1‑135 (MQ=255) cTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGa > 5:246836/1‑118 (MQ=255) cTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGa < 6:246836/118‑1 (MQ=255) ttCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCa < 2:222782/148‑1 (MQ=255) tGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCaaa > 3:217110/1‑147 (MQ=255) tGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCaaa < 4:217110/147‑1 (MQ=255) gccacGCT‑‑‑GGAGCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTgg < 2:181182/99‑1 (MQ=255) gccacGCT‑‑‑GGAGCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTgg > 1:181182/4‑102 (MQ=255) ctacGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGgtgt > 5:130831/1‑149 (MQ=255) ctacGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGgtgt > 4:116065/1‑149 (MQ=255) ctacGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGCCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGgtgt > 8:257357/1‑149 (MQ=255) tacGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGgtgt > 6:333022/1‑148 (MQ=255) cGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGAt < 6:328584/149‑1 (MQ=255) gCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATg > 3:49518/1‑149 (MQ=255) t‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGTGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCa < 6:130831/149‑1 (MQ=255) t‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCa > 6:189645/1‑149 (MQ=255) t‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCa > 7:300087/1‑149 (MQ=255) gCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCAtt > 3:295772/1‑149 (MQ=255) cTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTc > 6:312587/1‑149 (MQ=255) | TCCACTGGTGATGGTGATCGTGGGCATGCTGGTGTTCACCTTCGGCTTCTTTGGTGCGCACTCGGTGGCCAGCAGCTGGATC‑GGCCGCCGGGCGCTGAAGGCCAAGGGGCAGGCGTCG‑TCGCTGTACCTGTTCTGCTACTACGCT‑‑‑GGCTCCAGCGTGGCCGGTACGGCGGGCGGGGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTC > NC_002947/5789833‑5790128 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |