Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 516,282 | A→T | 8.1% | L237Q (CTG→CAG) | PP_0429 ← | short‑chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 516,282 | 0 | A | T | 8.1% | 218.7 / 7.3 | 74 | L237Q (CTG→CAG) | PP_0429 | short‑chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (38/30); new base T (4/2); total (42/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.93e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.68e-01 |
GTCCACAGCACTTGCTCCATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATCGAGCCGCGCAATGCGCCGGCGTGC > NC_002947/516140‑516430 | gTCCACAGCACTTGCTCCATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCcgcg < 7:42730/149‑1 (MQ=255) ccACAGCACTTGCTCCATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGt > 2:83504/1‑149 (MQ=255) cacaGCACTTGCTCCATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTg > 2:212725/1‑149 (MQ=255) acaGCACTTGCTCCATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGc > 1:34498/1‑149 (MQ=255) caGCACTTGCTCCATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCg < 2:34498/149‑1 (MQ=255) cACTTGCTCCATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCTGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGc > 5:277769/1‑145 (MQ=255) cACTTGCTCCATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGc < 6:277769/145‑1 (MQ=255) cTCCATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACgccagc > 7:271125/1‑149 (MQ=255) gTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGt > 6:240401/1‑149 (MQ=255) ggTCGTGCCGAGTGTACTCAGCCGGGAGCCGCTCGCCCAGTGTCTATTCCAAGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTgcgc < 4:232905/149‑1 (MQ=255) gCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACgcca < 8:273101/129‑1 (MQ=255) gCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACgcca > 7:273101/1‑129 (MQ=255) gCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCgccggccg > 5:127045/1‑149 (MQ=255) ccgcgctgcctcagccccgaggaagtggcgctgtacaccgtgcgggcactggacaagaaccgcgcactgatcatgCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGccggccgg > 3:130087‑M1/76‑149 (MQ=255) gAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCggg > 7:141240/1‑148 (MQ=255) gAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCggg > 2:52508/1‑148 (MQ=255) aGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCACCGCGGCTGCTGCCGCGCTggctgg > 1:290803/1‑116 (MQ=255) aGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCACCGCGGCTGCTGCCGCGCTggctgg < 2:290803/121‑6 (MQ=255) gctgcctcagccccgaggaagtggcgctgtacaccgtgcgggcactggacaagaaccgcgcactgatcatgCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCAt > 8:289306‑M1/72‑149 (MQ=255) tACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGAt < 8:135406/149‑1 (MQ=255) cctcagccccgaggaagtggcgctgtacaccgtgcgggcactggacaagaaccgcgcactgatcatgCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCCGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGAt > 1:146444‑M1/68‑148 (MQ=255) cTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCa > 3:205055/1‑149 (MQ=255) tCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAg > 7:245074/1‑149 (MQ=255) tCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAg > 7:181941/1‑149 (MQ=255) tCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAg > 8:35895/1‑149 (MQ=255) ccGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCt > 8:278845/1‑149 (MQ=255) gCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTg < 1:83504/149‑1 (MQ=255) gCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTc < 5:240401/147‑1 (MQ=255) gCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTc < 4:205055/147‑1 (MQ=255) gCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTc > 4:54398/1‑147 (MQ=255) gCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCg > 2:226128/1‑148 (MQ=255) cTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCa > 8:54963/1‑149 (MQ=255) cTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCa > 4:19681/1‑149 (MQ=255) ttCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCAc < 8:271125/147‑1 (MQ=255) ttCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCAc < 1:183961/147‑1 (MQ=255) tCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGccc > 2:155884/1‑142 (MQ=255) tCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGccc < 1:155884/142‑1 (MQ=255) ccATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCCGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGgt < 1:226128/148‑1 (MQ=255) cATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGgtg > 3:305727/1‑148 (MQ=255) cATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGgtg < 8:141240/148‑1 (MQ=255) gCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCa < 6:285719/113‑1 (MQ=255) gCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCa > 5:285719/1‑113 (MQ=255) ccTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAg < 7:54963/149‑1 (MQ=255) aGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAgcg < 8:245074/147‑1 (MQ=255) aTAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCt < 1:212725/149‑1 (MQ=255) aTAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCt > 7:45327/1‑149 (MQ=255) gcggcgGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCg < 6:289427/148‑1 (MQ=255) cggTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCt > 4:101025/1‑149 (MQ=255) gATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGa > 1:216279/1‑146 (MQ=255) gATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGa < 2:216279/146‑1 (MQ=255) aTGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCa < 1:52508/149‑1 (MQ=255) gCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCgg > 6:270095/1‑136 (MQ=255) ccccGGCCAGGTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAgcgc < 6:302071/149‑1 (MQ=255) ccccGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGa < 4:248369/141‑1 (MQ=255) ccccGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGa > 3:248369/1‑141 (MQ=255) CCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGTGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGt > 1:78846‑M1/1‑102 (MQ=255) CCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGCGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGt < 2:78846‑M1/102‑1 (MQ=255) CCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTg > 3:54398‑M1/1‑149 (MQ=255) aGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGc > 5:247130/1‑148 (MQ=255) gcgcACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATc > 2:146521/1‑147 (MQ=255) gcgcACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATc > 6:278602/1‑147 (MQ=255) cACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATCGAGcc < 8:181941/149‑1 (MQ=255) aCCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATCGAGCcg > 1:116810/1‑149 (MQ=255) cagccagcGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATCGAGCcgcg < 8:45327/149‑1 (MQ=255) agccagcGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATCGAGCcgcg > 8:82449/1‑148 (MQ=255) ccagcGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAgg < 7:118367/121‑1 (MQ=255) ccagcGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAgg > 8:118367/1‑121 (MQ=255) cagcGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATCGAGCCGCGCAAt < 6:305455/149‑1 (MQ=255) cagcGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGGGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATCGAGCCGCGCAAt < 6:310029/149‑1 (MQ=255) caccgcgGCTGCTGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCtt > 6:212847/4‑131 (MQ=255) caccgcgGCTGCTGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCtt < 5:212847/128‑1 (MQ=255) gcgcGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATCGAGCCGCGCAATgc < 4:305727/149‑1 (MQ=255) ccgcgGCTGCTGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATCGAGCCGCGCAATgc > 7:278830/2‑149 (MQ=255) ggCTGCTGCCGCGCTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATCGAGCCGCGCAATGCGCCg > 1:290042/1‑149 (MQ=255) cagcagCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATCGAGCCGCGCAATGCGCCGGc < 6:247130/149‑1 (MQ=255) agcCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATCGAGCCGCGCAATGCGCCGGCGTGc < 8:40665/149‑1 (MQ=255) | GTCCACAGCACTTGCTCCATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATCGAGCCGCGCAATGCGCCGGCGTGC > NC_002947/516140‑516430 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |