Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 541,437 | A→G | 10.6% | Q1272R (CAG→CGG) | rpoB → | DNA‑directed RNA polymerase subunit beta |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 541,437 | 0 | A | G | 10.6% | 201.5 / 12.4 | 75 | Q1272R (CAG→CGG) | rpoB | DNA‑directed RNA polymerase subunit beta |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (35/32); new base G (6/2); total (41/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.80e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.27e-01 |
CAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTACATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGAAATGCTCACAGTGAAGTCGGACGACGTGAACGGCCGTACCAAGATGTACAAG > NC_002947/541292‑541585 | cAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTACATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGcc < 7:88324/149‑1 (MQ=255) tGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTACATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCt < 1:256092/148‑1 (MQ=255) gTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTACATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTggg < 4:185027/149‑1 (MQ=255) tGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTACATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGggt > 4:32979/1‑149 (MQ=255) cTGTTCGCTGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTACATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGggtg < 6:304135/148‑1 (MQ=255) ttCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTACATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTa < 1:229674/148‑1 (MQ=255) gATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTACATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAgg < 6:48912/148‑1 (MQ=255) aTGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTACATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGgcg > 5:324805/1‑149 (MQ=255) cGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTACATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGt‑t < 7:148902/149‑1 (MQ=255) aaacaaGTTCGATCGTCCTGTGACCGTTGGTTACATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCTCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTc < 5:329341/148‑1 (MQ=255) acaaGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTACATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAg > 2:285300/1‑149 (MQ=255) caaGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTACATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGc < 6:251126/149‑1 (MQ=255) gAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTACATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCgg > 2:268317/1‑149 (MQ=255) aGCGTCCTGTGACCGTTGGTTACATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCggtg < 8:85286/135‑1 (MQ=255) aGCGTCCTGTGACCGTTGGTTACATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCggtg > 7:85286/1‑135 (MQ=255) gCGTCCTGTGACCGTTGGTTACATGTACATTCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCTCAGt‑t < 7:290756/129‑1 (MQ=255) gCGTCCTGTGACCGTTGGTTACATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCTCAGt‑t > 8:290756/1‑129 (MQ=255) gTCCTGTGACCGTTGGTTACATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGAAGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGGAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCggg > 6:195297/1‑146 (MQ=255) tgACCGTTGGTTACATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATgg > 1:116533/1‑147 (MQ=255) ccGTTGGTTACATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAgtg < 3:32979/149‑1 (MQ=255) ttGGTTACATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTgg < 1:285300/149‑1 (MQ=255) acatgtacatgCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTg > 7:213700/1‑149 (MQ=255) atgtacatgCTCATGCTGATCCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAg > 5:333018/1‑117 (MQ=255) atgtacatgCTCATGCTGATCCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAg < 6:333018/117‑1 (MQ=255) atgtacatgCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGa < 8:213700/149‑1 (MQ=255) gtacatgCTCAAGCTCAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACCCGCGTTCCACTGGATCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGAGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTCGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAACTCTGGGCGCTGGAAg > 7:12667/1‑149 (MQ=255) tacatgCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGc < 1:87203/149‑1 (MQ=255) tCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGgc > 1:153330/1‑149 (MQ=255) cAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGgcg > 1:106567/1‑149 (MQ=255) aGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGcgcg > 5:247682/1‑149 (MQ=255) gCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCgg < 2:106567/149‑1 (MQ=255) gCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCgg > 8:300241/1‑149 (MQ=255) gCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGAgg > 7:275039/1‑149 (MQ=255) tggCCGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCaa < 6:324805/149‑1 (MQ=255) tggACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGc > 8:164989/1‑147 (MQ=255) gacgacAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAg > 8:7151/1‑148 (MQ=255) acgacAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGa > 4:293310/1‑148 (MQ=255) gacAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGAAAt > 4:73659/1‑149 (MQ=255) aaGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAgt < 1:69322/101‑1 (MQ=255) aaGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAgt > 2:69322/1‑101 (MQ=255) gATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGAAATGCTca < 3:293310/149‑1 (MQ=255) cACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGAAATGCTCACAGt < 6:247682/149‑1 (MQ=255) aCGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTTCCCAGGAGCGGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTTGTCAGCGTTTCGGGGAGTTGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCTGCATACACCCTGCAAGTAATGCTCACAGTg < 8:12667/149‑1 (MQ=255) cgcgcgTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGT‑GGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGAAATGCTCACAGTGaa < 2:116533/149‑1 (MQ=255) gcgTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGAAATGCTCACAGTGAAGt > 1:141749/1‑149 (MQ=255) ttCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGAAATGCTc > 6:307133/1‑136 (MQ=255) ttCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGAAATGCTc < 5:307133/136‑1 (MQ=255) tCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGAAATGCTCACAGTGAAGTCGga > 1:35567/1‑149 (MQ=255) cACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGAAATGCTCACAGTGAAGTCGgac < 7:7151/148‑1 (MQ=255) aCTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGAAATGCTCACAGTGAAGTCGgacga > 8:138373/1‑149 (MQ=255) cTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGAAATGCTCACAGTGAAGTCGga < 4:31439/145‑1 (MQ=255) cTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGAAATGCTCACAGTGAAGTCGga > 3:31439/1‑145 (MQ=255) ttCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGa > 8:95979/1‑90 (MQ=255) ttCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGa < 7:95979/90‑1 (MQ=255) cTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGAAATGCTCACAGTGAAGTCGGACGACGTGAAc < 2:153330/148‑1 (MQ=255) cTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGAAATGCTCACAGTGAAGTCGGACGACGTGAACg > 2:161106/1‑149 (MQ=255) tACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGAAATGCTCACAGTGAAGTCGGACGACGTGAACgg > 4:250235/1‑149 (MQ=255) aCAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGAAATGCTCACAGTGAAGTCGGACGACGTGAACGGc > 7:188825/1‑149 (MQ=255) aCAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGAAATGCTCACAGTGAAGTCGGACGACGTGAACGGc > 6:329950/1‑149 (MQ=255) ccTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGcgcg < 8:43943/94‑1 (MQ=255) ccTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGcgcg > 7:43943/1‑94 (MQ=255) cttaccaCCCAGCGGCTGCTGGGTGGTAAGGCGCAGTGTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGAAATGCTCACAGTGAAGTCGGACGACGTGAACGGCCGTa > 1:219660/7‑149 (MQ=255) cttaccaCCCAGCGGCTGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGAAATGCTCACAGTGAAGTCGGACGACGTGAACGGCCGTAc > 3:63659/7‑149 (MQ=255) ttaccaCCCAGCGGCTGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGAAATGCTCACAGTGAAGTCGGACGACGTGAACGGCCGTAc > 1:125754/6‑148 (MQ=255) ggTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGAAATGCTCACAGTGAAGTCGgac < 2:240417/130‑1 (MQ=255) ggTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGAAATGCTCACAGTGAAGTCGgac > 1:240417/1‑130 (MQ=255) ttACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGAAATGCTCACAGTGAAGTCGGACGACGTGAACGGCCGTACCAAg < 7:138373/149‑1 (MQ=255) ccaCCCAGCGGCTGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGAAATGCTCACAGTGAAGTCGGAGGAGGTCAA‑GGCCGTTCCCAgg > 1:2112/3‑148 (MQ=255) caCCCAGCGGCTGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGc < 7:125251/89‑1 (MQ=255) caCCCAGCGGCTGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGc > 8:125251/2‑90 (MQ=255) caCCCAGCGGCTGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGAAATGCTCACAGTGAAGTCGGACGACGTGAACGGCCGTACCaa < 8:32595/146‑1 (MQ=255) caCCCAGCGGCTGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGAAATGCTCACAGTGAAGTCGGACGACGTGAACGGCCGTACCaa > 7:32595/2‑147 (MQ=255) aCCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGAAATGCTCACAGTGAAGTCGGACGACGTGAACGGCCGTACCAAGAt > 6:175533/1‑149 (MQ=255) cccAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAATAAATGCTCACAGTGAAGTCGGACGACGTGAACGGCCGTAGCAAGAt < 7:164989/148‑1 (MQ=255) ccAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGAAATGCTCACAGTGAAGTCGGACGACGTGAACGGCCGTACCAAGATg > 4:301950/1‑148 (MQ=255) cagcagCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGAAATGCTCACAGTGAAGTCGGACGACGTGAACGGCCGTACCAAGATGTa > 2:215358/1‑149 (MQ=255) agcagcCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGAAATGCTCACAGTGAAGTCGGACGACGTGAACGGCCGTACCAAGATGTa > 2:205700/1‑148 (MQ=255) gcagcCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGAAATGCTCACAGTGAAGTCGGACGACGTGAACGGCCGTACCAAGATGTACa < 2:35567/149‑1 (MQ=255) agcGGCTGGGTGGTAAGGCGATGT‑TGGTTGGTAAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGAAATGCTCACAGTGAAGTCGGACGACGTGAACGGCCGTACCAAGATGTACAAg < 1:268317/149‑1 (MQ=255) agcCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGAAATGCTCACAGTGAAGt > 3:200372/1‑114 (MQ=255) agcCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGAAATGCTCACAGTGAAGt < 4:200372/114‑1 (MQ=255) | CAGATGGTGCTGTTCGATGGCCGTACCGGCAACAAGTTCGAGCGTCCTGTGACCGTTGGTTACATGTACATGCTCAAGCTGAACCACTTGGTGGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACTGGTTCCTACAGCCTGGTTACCCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCGCAGT‑TCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCGGCATACACCCTGCAAGAAATGCTCACAGTGAAGTCGGACGACGTGAACGGCCGTACCAAGATGTACAAG > NC_002947/541292‑541585 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |