Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 559,579 | G→T | 8.7% | G43V (GGT→GTT) | rplO → | 50S ribosomal protein L15 |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 559,579 | 0 | G | T | 8.7% | 170.9 / 4.4 | 57 | G43V (GGT→GTT) | rplO | 50S ribosomal protein L15 |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (26/26); new base T (2/3); total (28/29) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.47e-01 |
GGCTAATCGATGAAACTCAATGATCTGAGTCCAGCGCCGGGTTCCCGTCGCGAGAAGCATCGTCCAGGTCGTGGTATCGGTAGCGGTCTGGGTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTGAAAGCCATGGACCGCGCTGAAGTGCGTCTGTCCGAGCTGGCCAAAGTGGAAGGCGACGTGATCTCCGTG > NC_002947/559443‑559727 | ggCTAATCGATGAAACTCAATGATCTGAGTCCAGCGCCGGGTTCCCGTCGCGAGAAGCATCGTCCAGGTCGTGGTATCGGTAGCGGTCTGGGTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑ACGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCg > 2:144663/1‑148 (MQ=255) aTCGATGAAACTCAATGATCTGAGTCCAGCGCCGGGTTCCCGTCGCGAGAAGCATCGTCCAGGTCGTGGTATCGGTAGCGGTCTGGGTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTc‑c < 4:249072/147‑1 (MQ=255) tCGATGAAACTCAATGATCTGAGTCCAGCGCCGGGTTCCCGTCGCGAGAAGCATCGTCCAGGTCGTGGTATCGGTAGCGGTCTGGGTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTgg > 7:228908/1‑149 (MQ=255) cTGAGTCCAGCGCCGGGTTCCCGTCGCGAGAAGCATCGTCCAGGTCGTGGTATCGGTAGCGGTCTGGGTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACa > 8:57625/1‑149 (MQ=255) cAGCGCCGGGTTCCCGTCGCGAGAAGCATCGTCCAGGTCGTGGTATCGGTAGCGGTCTGGGTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTg > 5:277973/1‑149 (MQ=255) gcgcCGGGTTCCCGTCGCGAGAAGCATCGTCCAGGTCGTGGTATCGGTAGCGGTCTGGGTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCa > 1:235954/1‑149 (MQ=255) gcgcCGGGTTCCCGTCGCGAGAAGCATCGTCCAGGTCGTGGTATCGGTAGCGGTCTGGGTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCa < 3:138575/149‑1 (MQ=255) cgcCGGGTTCCCGTCGCGAGAAGCATCGTCCAGGTCGTGGTATCGGTAGCGGTCTGGGTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCAc < 6:277973/149‑1 (MQ=255) gcCGGGTTCCCGTCGCGAGAAGCATCGTCCAGGTCGTGGTATCGGTAGCGGTCTGGGTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGACGCTGcccc > 4:239009/1‑149 (MQ=255) ttCCCGTCGCGAGAAGCATCGTCCAGGTCGTGGTATCGGTAGCGGTCTGGGTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGcc > 7:130899/1‑149 (MQ=255) cccGTCGCGAGAAGCATCGTCCAGGTCGTGGTATCGGTAGCGGTCTGTGTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCt < 7:127750/148‑1 (MQ=255) cccGTCGCGAGAAGCATCGTCCAGGTCGTGGTATCGGTAGCGGTCTGGGTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCt < 6:119472/148‑1 (MQ=255) cgAGAAGCATCGTCCAGGTCGTGGTATCGGTAGCGGTCTGGGTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAg < 8:228908/148‑1 (MQ=255) gaAGCATCGTCCAGGTCGTGGTATCGGTAGCGGTCTGGGTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGATCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCg < 5:318938/149‑1 (MQ=255) aGCATCGTCCAGGTCGTGGTATCGGTAGCGGTCTGGGTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGc < 8:130899/149‑1 (MQ=255) aTCGTCCAGGTCGTGGTATCGGTAGCGGTCTGGGTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTc < 2:235954/149‑1 (MQ=255) tCCAGGTCGTGGTATCGGTAGCGGTCTGGGTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGcc < 7:227247/114‑1 (MQ=255) tCCAGGTCGTGGTATCGGTAGCGGTCTGGGTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGcc > 8:227247/1‑114 (MQ=255) tCCAGGTCGTGGTATCGGTAGCGGTCTGGGTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGttt > 3:76348/1‑149 (MQ=255) gTCGTGGTATCGGTAGCGGTCTGGGTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGGTCGGCTTCGTTTCCCt > 2:220967/1‑148 (MQ=255) tCGTGGTATCGGTAGCGGTCTGGGTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGTTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTg > 5:325034/1‑148 (MQ=255) tCGTGGTATCGGTAGCGGTCTGGGTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGTGGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTg > 5:231375/1‑148 (MQ=255) gTGGTATCGGTAGCGGTCTGGTTAAGACCGGCGGCCGTGGCCAAAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTGaaa < 6:282665/149‑1 (MQ=255) ggTATCGGTAGCGGTCTGGGTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTGAAAGc > 5:49692/1‑149 (MQ=255) ggTAGCGGTCTGGGTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTGAAAGCCATgg < 2:100642/148‑1 (MQ=255) ggTAGCGGTCTGGGTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTGAAAGCCATGGa > 1:110534/1‑149 (MQ=255) gCGGTCTGGGTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAAc < 7:280643/90‑1 (MQ=255) gCGGTCTGGGTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAAc > 8:280643/1‑90 (MQ=255) gCGGTCTGGGTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGCTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTGAAAGCCATGGACcgc < 4:86892/149‑1 (MQ=255) cGGTCTGGGTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAACAGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTACGTTTCCCTGAAAGCCATGGACcgc > 1:201045/1‑149 (MQ=255) ggTCTGGGTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGTTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTGAAAGCCATGGACCgcgc < 6:325034/149‑1 (MQ=255) ggTCTGGGTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGTTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTGAAAGCCATGGACCgcgc < 6:231375/149‑1 (MQ=255) ggTCTGGGTAAGACCAGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGATCGATCACTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTGAAAGCCATGGACCgcgc < 8:199408/149‑1 (MQ=255) gTCTGGGTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTGAAAGCCATGGACCGCGCt > 5:106492/1‑149 (MQ=255) gTCTGGGTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTGAAAGCCATGGACCGCGCt < 2:201045/149‑1 (MQ=255) ggTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTGAAAGCCATGGACCGCGCTGaa < 6:130550/147‑1 (MQ=255) gTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTCTGTGGCTACGAAGGC‑GGTCAACAGCCGGTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCGTGAAAGCCATGGACCGCGCTGAAGt > 1:92312/1‑149 (MQ=255) tAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTGAAAGCCATGGACCGCGCTGAAGTGc > 5:329411/1‑149 (MQ=255) aCCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTGAAAGCCATGGACCGCGCTGAAGTGCGTCt > 5:156389/1‑149 (MQ=255) cggcggCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGTTGGTTCGATCGCTC‑CTTGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTGAAAGCCATGGAcc < 1:323799/131‑1 (MQ=255) cggcggCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTGAAAGCCATGGAcc > 2:323799/1‑131 (MQ=255) cggcggCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTGAAAGCCATGGACCGCGCTGAAGTGCGTCTGt < 7:57625/149‑1 (MQ=255) gcggcCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTGAAAGCCATGGACCGCGCTGAAGTGCGTCTGTcc > 8:236404/1‑149 (MQ=255) ccGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACAGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTGAAAGCCATGGACCGCGCTGAAGTGCGTCTGTCCGAGc > 7:20398/1‑149 (MQ=255) gTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGTTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTGAAAGCCATGGACCGCGCTGAAGTGCGTCTGTCCGAGCTg < 3:286121/149‑1 (MQ=255) gCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTGAAAGCCATGGACCGCGCTGAAGTGCGTCTGTCCGAGCTGGc < 6:49692/148‑1 (MQ=255) ccACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTGAAAGCCATGGACCGCGCTGAAGTGCGTCTGTCCGAGCTGGCCa < 4:76348/149‑1 (MQ=255) cacaA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGCGGGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTGAAAGCCATGGACCGCGCTGAAGTGCGTCTGTCCGAGCTGGcc > 1:245623/1‑148 (MQ=255) a‑aGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTGAAAGCCATGGACCGCGCTGAAGTGCGTCTGTCCGAGCTGGCCAAAGTg < 2:92312/149‑1 (MQ=255) tCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTGAAAGCCATGGACCGCGCTGAAGTGCGTCt > 2:47649/1‑126 (MQ=255) tCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTGAAAGCCATGGACCGCGCTGAAGTGCGTCt < 1:47649/126‑1 (MQ=255) tCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTGAAAGCCATGGACCGCGCTGAAGTGCGTCTGTCCGAGCTGGCCAAAGTGGAAg > 8:89024/1‑149 (MQ=255) tCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTGAAAGCCATGGACCGCGCTGAAGTGCGTCTGTCCGAGCTGGCCAAAGTGGAAg < 6:106492/149‑1 (MQ=255) tCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTGAAAGCCATGGACCGCGCTGAAGTGCGTCTGTCCGAGCTGGCCAAAGTGGAAGGCGACGt > 7:305183/1‑149 (MQ=255) cccGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTGAAAGCCATGGACCGCGCTGAAGTGCGTCTGTCCGAACTGGCCAAAGTGGAAGGCGACg < 2:110534/147‑1 (MQ=255) ccGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTGAAAGCCATGGACCGCGCTGAAGTGCGTCTGTCCGAGCTGGCGAAAGTGGAAGGCGACGTGa > 3:182510/1‑149 (MQ=255) cGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTGAAAGCCATGGACCGCGCTGAAGTGCGTCTGTCCGAGCTGGCCAAAGTGGAAGGCGACGTGAt < 1:144663/149‑1 (MQ=255) gtggtTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTGAAAGCCATGGACCGCGCTGAAGTGCGTCTGTCCGAGCTGGCCAAAGTGGAAGGCGACGTGATCTCCGTg < 7:236404/149‑1 (MQ=255) gtggtTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTGAAAGCCATGGACCGCGCTGAAGTGCGTCTGTCCGAGCTGGCCAAAGTGGAAGGCGACGTGATCTCCGTg < 6:156389/149‑1 (MQ=255) | GGCTAATCGATGAAACTCAATGATCTGAGTCCAGCGCCGGGTTCCCGTCGCGAGAAGCATCGTCCAGGTCGTGGTATCGGTAGCGGTCTGGGTAAGACCGGCGGCCGTGGCCACAA‑AGGTCAGACTTCCCGTTCGGGTGGTTCGATCGCTC‑CTGGCTTCGAAGGC‑GGTCAACAGCCGCTGCACCGTCGCCTGCCGAAGTTCGGCTTCGTTTCCCTGAAAGCCATGGACCGCGCTGAAGTGCGTCTGTCCGAGCTGGCCAAAGTGGAAGGCGACGTGATCTCCGTG > NC_002947/559443‑559727 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |