| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 797,509 | G→A | 7.1% | intergenic (+33/‑44) | PP_0682 → / → PP_0683 | inner membrane protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 797,509 | 0 | G | A | 7.1% | 206.9 / 3.1 | 70 | intergenic (+33/‑44) | PP_0682/PP_0683 | inner membrane protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/31); new base A (2/3); total (36/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.69e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.37e-01 | |||||||||||
ATGGATGCGCAGAACATCTCCACCGATTACCTGATGTGGTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTGCTCTCATGAACCTGCATCAGCTCAA > NC_002947/797363‑797656 | aTGGATGCGCAGAACATCTCCACCGATTACCTGATGTGATACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGgg‑gc > 3:169626/1‑149 (MQ=255) cgcAGAACATCTCCCCCGATTACCTGATGTGGTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCAt < 3:210634/148‑1 (MQ=255) gAACATCTCCCCCGATAACCTGATGTGGTACGTGATCATCCACCTGACCTTCGTGGGCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCg < 3:185204/149‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCGATTACCTGATGTGGTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGc > 3:266052/1‑149 (MQ=255) cATCTCCACCGATTACCTGATGTGGTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGA‑GCGGGCATGCCCGccc < 5:306472/149‑3 (MQ=255) tcCACCGATTACCTGATGTGGTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGA‑GCGGGCATGCCCGCCCCca > 2:213248/1‑148 (MQ=255) ccACCGATTACCTGATGTGGTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTccc < 4:276586/146‑1 (MQ=255) ccACCGATTACCTGATGTGGTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTccc > 3:276586/1‑146 (MQ=255) ccACCGATTACCTGATGTGGTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCca > 6:276411/1‑147 (MQ=255) cACCGATTACCTGATGTGGTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGTGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCcaca < 2:138902/148‑1 (MQ=255) cACCGATTACCTGATGTGGTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGTGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCca > 1:138902/1‑146 (MQ=255) cACCGATTACCTGATGTGGTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCca > 1:196819/1‑146 (MQ=255) cACCGATTACCTGATGTGGTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCca > 3:26362/1‑146 (MQ=255) ccGATTACCTGATGTGGTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGA‑GCGGGCATGCCCGCCCCCACAgga < 1:213248/149‑3 (MQ=255) ttACCTGATGTGGTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCg < 4:266052/149‑1 (MQ=255) ccTGATGTGGTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAg < 2:259638/148‑1 (MQ=255) ccTGATGTGGTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGA‑GCGGGCAt > 3:226436/1‑126 (MQ=255) ccTGATGTGGTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGA‑GCGGGCAt < 4:226436/126‑1 (MQ=255) ctcaTGTGGTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTCGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGCG‑GCGGGCATGcc > 3:39402/4‑128 (MQ=255) cTGATGTGGTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAgg > 6:289104/1‑148 (MQ=255) tGATGTGGTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTcc < 3:294437/133‑1 (MQ=255) tGATGTGGTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTcc > 4:294437/1‑133 (MQ=255) ggTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGa < 1:24453/140‑1 (MQ=255) ggTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGa > 2:24453/1‑139 (MQ=255) gTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCATCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTcc > 6:322680/1‑126 (MQ=255) gTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCATCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTcc < 5:322680/126‑1 (MQ=255) cGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGa < 5:276411/149‑1 (MQ=255) cGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGa < 4:169626/149‑1 (MQ=255) atcatcCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTg < 5:289104/148‑1 (MQ=255) ccACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACAAAGCACTGAGTCCCACCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGTG‑GCGGGCATTCCCGCTACCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCgt > 5:292533/1‑147 (MQ=255) cacaTGAGATTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATTGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGAAACTCCTGTGGGG‑GCGGGAATGCCCGATCCCACAGATAACGATGCTCAACTGACGAATGGCgtcag > 6:292445/1‑149 (MQ=255) acaTGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCgtcagt < 2:247590/149‑1 (MQ=255) aTGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCgtcagtca > 8:243874/1‑149 (MQ=255) tGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCAt < 1:73560/149‑1 (MQ=255) tctcGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGa > 1:296298/1‑123 (MQ=255) tctcGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGa < 2:296298/123‑1 (MQ=255) ctcGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATtc > 6:134240/1‑149 (MQ=255) tcGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTCACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATtct > 8:102673/1‑149 (MQ=255) ggCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATtctc < 7:102673/148‑1 (MQ=255) ggCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATtctc < 4:274975/148‑1 (MQ=255) ggCGGTCTGCAGGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCACGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATtctc < 8:297305/148‑1 (MQ=255) gTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCtt > 8:87628/1‑149 (MQ=255) cATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCt < 5:134240/146‑1 (MQ=255) ggCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACaa > 6:45946/1‑148 (MQ=255) ccTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGT‑CCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAAt > 3:124304/1‑147 (MQ=255) tcgACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTACCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAg > 8:170927/3‑149 (MQ=255) ggACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGc > 5:171262/1‑149 (MQ=255) cAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGACctc > 2:305359/1‑148 (MQ=255) gCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGa > 1:157401/1‑141 (MQ=255) gCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGa < 2:157401/141‑1 (MQ=255) gCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGct < 1:34569/144‑1 (MQ=255) gCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGct > 2:34569/1‑144 (MQ=255) cAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTgg < 4:26362/149‑1 (MQ=255) cAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTgg > 1:95077/1‑149 (MQ=255) aGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGtt > 7:110708/1‑149 (MQ=255) aCTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTccc < 4:246112/149‑1 (MQ=255) aCTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTcc > 3:246112/1‑148 (MQ=255) tGAGTCCCCCAATGCCTCACTGCAACTCCTGTGGTG‑GGGGTCATGCCCGCTCCCACATATATCTAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATg < 3:118965/127‑1 (MQ=255) tttCCGCCAAGGCCTCACTGCATCTCCTGTGGGG‑GCGGGCATTCCCGCTCCCACAGATATCGATGCTCAACTTACGAGTGGGGTCAGTCATGCCTTGCTCATTCTCCCTTCCTTTAGAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCAta < 5:292445/146‑2 (MQ=255) aGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATc < 6:171262/148‑1 (MQ=255) aGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATc < 6:175971/148‑1 (MQ=255) gTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATcgc > 2:212645/1‑149 (MQ=255) ccAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTg < 5:45946/149‑1 (MQ=255) gCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTGctc > 7:163346/1‑148 (MQ=255) ccTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTGCtctc < 4:124304/149‑1 (MQ=255) aCTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTGCTCTCATg > 6:121786/1‑148 (MQ=255) cTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACATATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTGCTCTCATGAACCTGCa < 2:196819/149‑1 (MQ=255) cTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTGCTCTCATGAACCTGCa > 6:293929/1‑149 (MQ=255) tCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTGCTCTCATGAACCTGCAt > 1:311100/1‑149 (MQ=255) cTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTGCTCTCATGAACCTGCAt < 2:95077/147‑1 (MQ=255) tgtgGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTGCTCTCATGAACCTGCATCAg > 2:307955/1‑149 (MQ=255) gggg‑gCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTGCTCTCATg > 2:98024/1‑134 (MQ=255) gggg‑gCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTGCTCTCATg < 1:98024/134‑1 (MQ=255) gg‑gcgggcATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTGCTCTCATGAACCTGCATCAGCTCaa < 7:87628/149‑1 (MQ=255) g‑gcgggcATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTGCTCTCATGAACCTGCATCAGCTCaa > 5:270527/1‑148 (MQ=255) g‑gcgggcATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTGCTCTCATGAACCTGCATCAGCTCaa > 4:27508/1‑148 (MQ=255) | ATGGATGCGCAGAACATCTCCACCGATTACCTGATGTGGTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGG‑GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTGCTCTCATGAACCTGCATCAGCTCAA > NC_002947/797363‑797656 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |