| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 885,372 | C→G | 7.8% | P428R (CCG→CGG) | PP_0767 → | LuxR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 885,372 | 0 | C | G | 7.8% | 186.0 / 4.8 | 61 | P428R (CCG→CGG) | PP_0767 | LuxR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (31/25); new base G (2/3); total (33/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.53e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.19e-01 | |||||||||||
TGCGTGCCGGCCACCTCGATGTTGCCGCCGACCTGGTGCAAAGTCTGTCCGAGGAGCAACTGCTGGCCGAGCAGAATGTCGGCATGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCGAGGAACTGGCTGGCTACCTCAGTCGCTTTCTGCCCGCGCCTTCGGCGACTGCGCAAAAGTCGATGCTGGCCCAATGGCTGGCACT > NC_002947/885237‑885516 | tGCGTGCCGGCCACCTCGATGTTGCCGCCGACCTGGTGCAAAGTCTGTCCGAGGAGCAACTGCTGGCCGAGCAGAATGTCGGCATGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGt < 6:156606/148‑1 (MQ=255) gCGTGCCGGCCACCTCGATGTTGCCGCCGACCTGGTGCAAAGTCTGTCCGAGGAGCAACTGCTGGCCGAGCAGAATGTCGGCATGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTg < 6:260650/148‑1 (MQ=255) cGTGCCGGCCACCTCGATGTTGCCGCCGACCTGGTGCAAAGTCTGTCCGATGAGCAACTGCTGGCCGAGCAGAATGTCGGCATGTTGCTGCGCTGGAATATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGC‑CGCGGCGTGCTGATcaaca < 1:143391/148‑5 (MQ=255) gTGCCGGCCACCTCGATGTTGCCGCCGACCTGGTGCAAAGTCTGTCCGAGGAGCAACTGCTGGCCGAGCAGAATGTCGGCATGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGC‑CGCGGCGTGCTGATcaacaga < 8:66769/149‑7 (MQ=255) gCCGGCCACCTCGATGTTGCCGCCGACCTGGTGCAAAGTCTGTCCGAGGAGCAACTGCTGGCCGAGCAGAATGTCGGCATGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTa > 3:199621/1‑149 (MQ=255) cACCTCGATGTTGCCGCCGACCTGGTGCAAAGTCTGTCCGAGGAGCAACTGCTGGCCGAGCAGAATGTCGGCATGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCt < 8:266468/140‑1 (MQ=255) cACCTCGATGTTGCCGCCGACCTGGTGCAAAGTCTGTCCGAGGAGCAACTGCTGGCCGAGCAGAATGTCGGCATGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCt > 7:266468/1‑140 (MQ=255) aCCTCGATGTTGCCGCCGACCTGGTGCAAAGTCTGTCCGAGGAGCAACTGCTGGCCGAGCAGAATGTCGGCATGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTgg > 3:153454/1‑149 (MQ=255) cTCGATGTTGCCGCCGACCTGGTGCAAAGTCTGTCCGAGGAGCAACTGCTGGCCGAGCAGAATGTCGGCATGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGc > 4:182013/1‑149 (MQ=255) ccgccgACCTGGTGCAAAGTCTGTCCGAGGAGCAACTGCTGGCCGAGCAGAATGTCGGCATGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGggctg > 6:110347/1‑149 (MQ=255) cgccgACCTGGTGCAAAGTCTGTCCGAGGAGCAACTGCTGGCCGAGCAGAATGTCGGCATGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGggctgg > 5:27631/1‑149 (MQ=255) cTGGTGCAAAGTCTGTCCGAGGAGCAACTGCTGGCCGAGCAGAATGTCGGCATGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGc > 6:52910/1‑147 (MQ=255) cTGGTGCAAAGTCTGTCCGAGGAGCAACTGCTGGCCGAGCAGAATGTCGGCATGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCa < 4:199621/149‑1 (MQ=255) tGGTGCAAAGTCTGTCCGAGGAGCAACTGCTGGCCGAGCAGAATGTCGGCATGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCTCGACAGTCTGTTGATCAGC‑CGCGGCGTGCTGAt < 5:265247/112‑1 (MQ=255) tGGTGCAAAGTCTGTCCGAGGAGCAACTGCTGGCCGAGCAGAATGTCGGCATGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCTCGACAGTCTGTTGATCAGC‑CGCGGCGTGCTGAt > 6:265247/1‑112 (MQ=255) ggTGCAAAGTCTGTCCGAGGAGCAACTGCTGGCCGAGCAGAATGTCGGCATGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTgg > 1:300257/1‑134 (MQ=255) ggTGCAAAGTCTGTCCGAGGAGCAACTGCTGGCCGAGCAGAATGTCGGCATGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTgg < 2:300257/134‑1 (MQ=255) gTGCAAAGTCTGTCCGAGGAGCAACTGCTGGCCGAGCAGAATGTCGGCATGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCCCGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAg < 1:79826/147‑1 (MQ=255) gTGCAAAGTCTGTCCGAGGAGCAACTGCTGGCCGAGCAGAATGTCGGCATGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCt > 8:10514/1‑149 (MQ=255) gTGCAAAGTCTGTCCGAGGAGCAACTGCTGGCCGAGCAGAATGTCGGCATGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCt > 3:211892/1‑149 (MQ=255) gTGCAAAGTCTGTCCGAGGAGCAACTGCTGGCCGAGCAGAATGTCGGCATGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCt < 2:29462/149‑1 (MQ=255) gCAAAGTCTGTCCGAGGAGCAACTGCTGGCCGAGCAGAATGTCGGCATGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTg > 2:7661/1‑148 (MQ=255) aaaGTCTGTCCGAGGAGCAACTGCTGGCCGAGCAGAATGTCGGCATGTTGCTGCGATGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGAt > 4:108510/1‑149 (MQ=255) cTGTCCGAGGAGCAACTGCTGGCCGAGCAGAATGTCGGCATGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGc > 5:216029/1‑135 (MQ=255) cTGTCCGAGGAGCAACTGCTGGCCGAGCAGAATGTCGGCATGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCACCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGc < 6:216029/135‑1 (MQ=255) tCCGAGGAGCAACTGCTGGCCGAGCAGAATGTCGGCATGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCg < 3:182013/148‑1 (MQ=255) cGAGGAGCAACTGCTGGCCGAGCAGAATGTCGGCATGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCGAg > 6:22348/1‑148 (MQ=255) gCAACTGCTGGCCGAGCAGAATGTCGGCATGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCGAGGAActgg > 3:254640/1‑149 (MQ=255) ctctgctgGCCGAGCAGAATGTCGGCATGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCGAGGAActggc < 7:174411/146‑1 (MQ=255) aCTGCTGGCCGAGCAGAATGTCGGCATGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCGAGGAActggctg < 7:10514/149‑1 (MQ=255) tgctgGCCGAGCAGAATGTCGGCATGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCGAGGAActggc > 8:174411/1‑145 (MQ=255) gCAGAATGTCGGCATGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCGAGGAACTGGCTGGCTACCTCAGTc < 2:322876/149‑1 (MQ=255) gCAGAATGTCGGCATGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCGAGGAACTGGCTGGCTACCCCAGTc < 5:22348/149‑1 (MQ=255) gAATGTCGGCATGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCGAGGAACTGGCTGGCTACCTCAGTCGCt > 4:153982/1‑149 (MQ=255) aTGTCGGCATGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCGAGGAACTGGCTGGCTACCTCAGTCGCttt < 4:153454/149‑1 (MQ=255) gCATGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCGAGGAACTGGCTGGCTACCTCAGTCGCTTTCTGccc > 3:255629/1‑149 (MQ=255) aTGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACACCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCGAGGAACTGGCTGGCTACCTCAGTCGCTTTCTGCCcgc < 7:166908/149‑1 (MQ=255) ctgcGCTGGAAGAGGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCGAGGAACTGGCTGGCTACCTCAGTCGCTTTCTGCCCGCGCCTTc < 6:275266/149‑1 (MQ=255) cgcTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCGAGGAACTGGCTGGCTACCTCAGTCGCTTTCTGCCCGCGCCTTCgg < 4:211892/148‑1 (MQ=255) cgcTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCGAGGAACTGGCTGGCTACCTCAGTCGCTTTCTGCCCGCGCCTTCGGc < 4:254640/149‑1 (MQ=255) cgcTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCGAGGAACTGGCTGGCTACCTCAGTCGCTTTCTGCCCGCGCCTTCGGc < 1:7661/149‑1 (MQ=255) tGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCGAGGAACTGGCTGGTTACCTCAGTCGCTTTCTGCCCGCGCCTTCGGCGAc > 4:77480/1‑149 (MQ=255) gAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCGAGGAACTGGCTGGCTACCTCAGTCGCTTTCTGCCCGCGCCTTCGGCGACTg > 4:24838/1‑149 (MQ=255) aGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCACCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCTACGAACTGGCTGGCTACCTCAGTCGCTTTCTGCCCGCGCCTTCGGCGACTgcg > 4:84599/1‑149 (MQ=255) ccTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGAtgctg > 3:100391/1‑86 (MQ=255) ccTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGAtgctg < 4:100391/86‑1 (MQ=255) cTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCAGGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCGAGGAACTGGCTGGCTACCTCAGTCGCTTTCTGCCCGCTCCTTCGGCGACTgcg < 7:217010/141‑1 (MQ=255) cTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCGAGGAACTGGCTGGCTACCTCAGTCGCTTTCTGCCCGCGCCTTCGGCGACTGCGCAAAAGTc > 6:36151/1‑149 (MQ=255) cTGCCCCACAGTCTGTTGAACAGCACGCCGCC‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGCATGCTGCCGAGGCACTGGATGGCTACCTCAGTCGCTTTCTGCCCGCGCCTTCGGCGACTgcg > 8:217010/1‑141 (MQ=255) cccGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCGAGGAACTGGCTGGCTACCTCAGTCGCTTTCTGCCCGCGCCTTCGGCGACTGCGCAAAAGTCGAt < 3:153982/149‑1 (MQ=255) ccGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCGAGGAACTGGCTGGCTACCTCAGTCGCTTTCTGCCCGCGCCTTCGGCGACTGCGCAAAAGTCGATg > 8:54437/1‑149 (MQ=255) gACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGTTCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCGAGGAACTGGCTGGCTACCTCAGTCGCTTTCTGCCCGCGCCTTCGGCGACTGCGCAAAAGTCGATGCt > 1:26378/1‑149 (MQ=255) aGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCGAGGAACTGGCTGGCTACCTCAGTCGCTTTCTGCCCGCGCCTTCGGCGACTGCGCAAAAGTCGATGCTGGc < 5:110347/149‑1 (MQ=255) tCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCGAGGAACTGGCTGGCTACCTCAGTCGCTTTCTGCCCGCGCCTTCGGCGACTGCGCAAAAGTCGATGCTg > 5:244151/1‑145 (MQ=255) tCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCGAGGAACTGGCTGGCTACCTCAGTCGCTTTCTGCCCGCGCCTTCGGCGACTGCGCAAAAGTCGATGCTg < 6:244151/145‑1 (MQ=255) tCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCGAGGAACTGGCTGGCTACCTCAGTCGCTTTCTGCCCGCGCCTTCGGCGACTGCGCAAAAGTCGATGCTGGcc > 5:114185/1‑148 (MQ=255) tGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCGAGGAACTGGCTGGCTACCTCAGTCGCTTTCTGCCCGCGCCTTCGGCGACTGCGCAAAAGTCGATGCTGGCCCaa > 4:228823/1‑149 (MQ=255) ttGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCGAGGAACTGGCTGGCTACCTCAGTCGCTTTCTGCCCGCGCCTTCGGCGACTGCGCAAAAGTCGATGCTGGCCCAAtg > 8:175054/1‑149 (MQ=255) acgATCAGC‑CGCGGCGTGCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCGAGGAACTGGCTGGCTACCTCAGTCGCTTTCTGCCCGCGCCTTCGGCGACTGCGCAAAAGTCGATGCTGGCCCAAtg > 8:53131/3‑149 (MQ=255) gATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCGAGGAACTGGCTGGCTACCTCAGTCGCTTTCTGCCCGCGCCTTCGGCGACTGCGCAAAAGTCGATGCTGGCCCAAtggc > 1:76734/1‑149 (MQ=255) aCGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCGAGGAACTGGCTGGCTACCTCAGTCGCTTTCTGCCCGCGCCTTCGGCGACTGCGCAAAAGTCGATGCTGGCCCAATGGCTGGCACt < 5:36151/149‑1 (MQ=255) gccgcG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCGAGGAACTGGCTGGCTACCTCAGTCGCTTTCTGCCcgc < 2:304894/99‑1 (MQ=255) gccgcG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCGAGGAACTGGCTGGCTACCTCAGTCGCTTTCTGCCcgc > 1:304894/1‑99 (MQ=255) | TGCGTGCCGGCCACCTCGATGTTGCCGCCGACCTGGTGCAAAGTCTGTCCGAGGAGCAACTGCTGGCCGAGCAGAATGTCGGCATGTTGCTGCGCTGGAAGATGGACCTGCCCGACAGTCTGTTGATCAGCACGCCGCG‑GCTGATCGTGCTGTACAGCTGGGCGTTGGGGCTGGCTTGCCAGCTGGATGCTGCCGAGGAACTGGCTGGCTACCTCAGTCGCTTTCTGCCCGCGCCTTCGGCGACTGCGCAAAAGTCGATGCTGGCCCAATGGCTGGCACT > NC_002947/885237‑885516 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |