Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 925,237 | G→C | 6.1% | A463A (GCC→GCG) | PP_0805 ← | outer membrane efflux protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 925,237 | 0 | G | C | 6.1% | 213.1 / 3.7 | 66 | A463A (GCC→GCG) | PP_0805 | outer membrane efflux protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (31/31); new base C (2/2); total (33/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.82e-01 |
CAACATCACCTCAAGCCAGGGGCCAAGGTCTGGCCGGTGGGCGGCGGCCTGCTCCGGCGCGGGCGCCTGGTTGGGCAGGGTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGTC > NC_002947/925091‑925380 | cAACATCACCTCAAGCCAGGGGCCAAGGTCTGGCCGGTGGGCGGCGGCCTGCTCCGGCGCGGGCGCCTGGTTGGGCAGGGTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAg < 1:54683/147‑1 (MQ=255) cACCTCAAGCCAGGGGCCAAGGTCTGGCCGGTGGGCGGCGGCCTGCTCCGGCGCGGGCGCCTGGTTGGGCAGGGTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTgcg > 2:217311/1‑149 (MQ=255) cTCAAGCCAGGGGCCAAGGTCTGGCCGGTGGGCGGCGGCCTGCTCCGGCGCGGGCGCCTGGTTGGGCAGGGTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAg > 8:156454/1‑149 (MQ=255) cTCAAGCCAGGGGCCAAGGTCTGGCCGGTGGGCGGCGGCCTGCTCCGGCGCGGGCGCCTGGTTGGGCAGGGTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAACGCCGTGCGCAg > 4:74184/1‑149 (MQ=255) cTCAAGCCAGGGGCCAAGGTCTGGCCGGTGGGCGGCGGCCTGCTCCGGCGCGGGCGCCTGGTTGGGCAGGGTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAACGCCGTGCGCAg > 4:69902/1‑149 (MQ=255) aaGCCAGGGGCCAAGGTCTGGCCGGTGGGCGGCGGCCTGCTCCGGCGCGGGCGCCTGGTTGGGCAGGGTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAgg < 1:217311/147‑1 (MQ=255) aaGCCAGGGGCCAAGGTCTGGCCGGTGGGCGGCGGCCTGCTCCGGCGCGGGCGCCTGGTTGGGCAGGGTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAgg < 2:12621/147‑1 (MQ=255) gCCAGGGGCCAAGGTCTGGCCGGTGGGCGGCGGCCTGCTCCGGCGCGGGCGCCTGGTTGGGCAGGGTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑gcgc > 2:302158/1‑149 (MQ=255) gggCCAAGGTCTGGCCGGTGGGCGGCGGCCTGCTCCGGCGCGGGCGCCTGGTTGGGCAGGGTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGgtg > 5:36135/1‑149 (MQ=255) cAAGGTCTGGCCGGTGGGCGGCGGCCTGCTCCGGCGCGGGCGCCTGGTTGGGCAGGGTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGtgttg > 8:19487/1‑148 (MQ=255) gTCTGGCCGGTGGGCGGCGGCCTGCTCCGGCGCGGGCGCCTGGTTGGGCAGGGTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAg < 7:19487/149‑1 (MQ=255) tCTGGCCGGTGGGCGGCGGCCTGCTCCGGCGCGGGCGCCTGGTTGGGCAGGGTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAgg < 6:36135/149‑1 (MQ=255) gcggcCTGCTCCGGCGCGGGCGCCTGGTTGGGCAGGGTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAgg < 2:23127/149‑1 (MQ=255) ccTGCTCCGGCGCGGGCGCCTGGTTGGGCAGGGTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGgcg > 6:133726/1‑147 (MQ=255) ccTGCTCCGGCGCGGGCGCCTGGTTGGGCAGGGTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGgcg > 4:260850/1‑147 (MQ=255) cTGCTCCGGCGCGGGCGCCTGGTTGGGCAGGTTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAgg > 7:205230/1‑129 (MQ=255) cTGCTCCGGCGCGGGCGCCTGGTTGGGCAGGGTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAgg < 8:205230/129‑1 (MQ=255) cTCCGGCGCGGGCGCCTGGTTGGGCAGGGTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCgcag > 6:48399/1‑146 (MQ=255) cGGCGCGGGCGCCTGGTTGGGCAGGGTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATc < 1:302158/149‑1 (MQ=255) gggCGCCTGGTTGGGCAGGGTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCg < 7:156454/149‑1 (MQ=255) ggCGCCTGGTTGGGCAGGGTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAACGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCgg < 3:69902/149‑1 (MQ=255) ggCGCCTGGTTGGGCAGGGTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAACGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCgg < 3:74184/149‑1 (MQ=255) gcCTGGTTGGGCAGGGTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAg < 5:176985/112‑1 (MQ=255) gcCTGGTTGGGCAGGGTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAg > 6:176985/1‑112 (MQ=255) cTGGTTGGGCAGGGTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGcc < 3:173875/149‑1 (MQ=255) cTGGTTGGGCAGGGTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGcc > 1:173357/1‑149 (MQ=255) ggTTGGGGAGGGTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGACCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGAAGCAGATCGGAGCgggagatcg > 7:3954/1‑143 (MQ=255) ggTTGGGCAGGGTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCgg < 8:3954/142‑1 (MQ=255) ggTTGGGCAGGGTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCgg > 6:18198/1‑149 (MQ=255) ttGGGCAGGGTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGAGCGGAGCGGGTGCCGGc > 8:161029/1‑148 (MQ=255) gCAGGGTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑gcgc > 6:219363/1‑89 (MQ=255) gCAGGGTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑gcgc < 5:219363/89‑1 (MQ=255) gCAGGGTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGtt < 5:89153/149‑1 (MQ=255) cAGGGTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTc < 7:212598/149‑1 (MQ=255) ggTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAATGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGTAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGaa < 6:3908/149‑1 (MQ=255) acaTCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGt < 5:48399/149‑1 (MQ=255) atcgatcgAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGa < 4:297477/149‑1 (MQ=255) atcgatcgAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGa > 3:297477/1‑149 (MQ=255) atcgatcgAATCACTCAAGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGa > 5:257262/1‑149 (MQ=255) atcgaATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGcc > 8:276057/1‑127 (MQ=255) atcgaATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGcc < 7:276057/127‑1 (MQ=255) aaTCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTgg > 1:112374/1‑145 (MQ=255) aCTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACAt < 6:59348/91‑1 (MQ=255) aCTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACAt > 5:59348/1‑91 (MQ=255) cTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTcc > 5:227639/1‑149 (MQ=255) aTGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTg < 2:112374/148‑1 (MQ=255) tGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGAc < 6:174390/133‑1 (MQ=255) tGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGAc > 5:174390/1‑133 (MQ=255) cacaCCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCaa > 8:298732/1‑107 (MQ=255) cacaCCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCaa < 7:298732/107‑1 (MQ=255) cacaCCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGaa < 8:183999/114‑1 (MQ=255) cacaCCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGaa > 7:183999/1‑114 (MQ=255) cacaCCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTg < 2:173357/145‑1 (MQ=255) acacCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAg > 2:81922/1‑149 (MQ=255) acCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGGTGCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGCCATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAGGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAgg > 1:223946/1‑149 (MQ=255) acCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGt > 2:217590/1‑149 (MQ=255) gCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGa < 6:227639/147‑1 (MQ=255) cAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGc < 5:18198/148‑1 (MQ=255) gcgcCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGCTCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGcc > 5:254893/1‑149 (MQ=255) gcgcCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGcc > 4:304042/1‑149 (MQ=255) gcCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCa > 3:188736/1‑141 (MQ=255) gcCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCa < 4:188736/141‑1 (MQ=255) gcCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCgt < 1:81922/149‑1 (MQ=255) gcCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCgt > 1:171993/1‑149 (MQ=255) cccTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACGTCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCgtgt < 2:242022/149‑1 (MQ=255) aaGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCt < 1:217590/148‑1 (MQ=255) ccAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGAAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGTc < 3:260850/149‑1 (MQ=255) | CAACATCACCTCAAGCCAGGGGCCAAGGTCTGGCCGGTGGGCGGCGGCCTGCTCCGGCGCGGGCGCCTGGTTGGGCAGGGTCACATCGATCGAATCACTCATGGCTGGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGG‑GCGCCGGTGTTGTACAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGTC > NC_002947/925091‑925380 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |