| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,980 | A→G | 8.4% | intergenic (‑599/+32) | trmF ← / ← trmE | tRNA uridine 5‑carboxymethylaminomethyl modification protein/GTPase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,980 | 0 | A | G | 8.4% | 202.8 / 6.9 | 71 | intergenic (‑599/+32) | trmF/trmE | tRNA uridine 5‑carboxymethylaminomethyl modification protein/GTPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (34/31); new base G (4/2); total (38/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.79e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.11e-01 | |||||||||||
TCGAGCCCGCGAAAGGATGGGTACATCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAG > NC_002947/4832‑5125 | tCGAGCCCGCGAAAGGATGGGTACATCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTaa < 2:108345/149‑1 (MQ=255) ccGCGAAAGGATGGGTACATCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCTTAGGGAgcg > 5:99247/1‑149 (MQ=255) gcgAAAGGATGGGTACATCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAgcggc > 3:264110/1‑149 (MQ=255) gAAAGGATGGGTACATCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCTTAGGGAgcggctt < 8:194250/149‑3 (MQ=255) gAAAGGATGGGTACATCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAACAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGgcgc < 8:47997/149‑1 (MQ=255) aaaGGATGGGTACATCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCt < 4:264110/149‑1 (MQ=255) aTGGGTACATCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGcc > 2:323802/1‑149 (MQ=255) tGGGTACATCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAg > 3:106190/1‑136 (MQ=255) tGGGTACATCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAg < 4:106190/136‑1 (MQ=255) gTACATCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑c > 3:203951/1‑149 (MQ=255) aTCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCGGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTgg > 6:265878/1‑149 (MQ=255) tCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGc > 2:22700/1‑149 (MQ=255) ccACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCt < 3:150400/149‑1 (MQ=255) ccACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCt > 6:323380/1‑149 (MQ=255) gagaTCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGa < 4:228407/149‑1 (MQ=255) gagaTCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGa < 4:194630/149‑1 (MQ=255) agaTCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGAt > 5:129529/1‑149 (MQ=255) tGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACtt > 6:298825/1‑149 (MQ=255) ggTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACtt < 1:323802/148‑1 (MQ=255) gTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGc < 4:203951/149‑1 (MQ=255) gTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGc < 4:244236/149‑1 (MQ=255) gTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGc > 1:179266/1‑149 (MQ=255) gCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCTTAGGGAgcggcttt > 1:222619/1‑116 (MQ=255) gCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCTTAGGGAgcggcttt < 2:222619/119‑4 (MQ=255) cTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCg < 1:6181/148‑1 (MQ=255) tGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGa < 5:164804/108‑1 (MQ=255) tGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGa > 6:164804/1‑108 (MQ=255) gTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATg > 3:88567/1‑148 (MQ=255) tAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGc < 5:323380/148‑1 (MQ=255) agCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAg > 5:103086/1‑149 (MQ=255) cTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCtgtg > 1:305861/1‑126 (MQ=255) catcaCGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTgg < 6:129529/148‑1 (MQ=255) cgatgtcACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGaaaa < 3:118334/143‑1 (MQ=255) gggTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑AGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGaaaa > 2:144484/1‑149 (MQ=255) gggTCCACCCGCTCCCACAGGTGATTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCGTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTGG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGCAAAt > 2:201866/1‑149 (MQ=255) gTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAACTGGAGAAAATcc < 2:179266/149‑1 (MQ=255) tCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCg > 5:89580/1‑149 (MQ=255) tCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCg < 1:22700/149‑1 (MQ=255) aCCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGaaaa > 4:118334/1‑142 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGc > 7:166391/1‑145 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGc < 8:166391/145‑1 (MQ=255) gTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGCAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATcc > 6:107700/1‑148 (MQ=255) gCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAg > 2:256881/1‑149 (MQ=255) cTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAg < 6:103086/148‑1 (MQ=255) tGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCt > 5:109909/1‑148 (MQ=255) gTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAgg > 5:18365/1‑134 (MQ=255) gTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAgg < 6:18365/134‑1 (MQ=255) gCCAGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCtg < 5:265878/149‑1 (MQ=255) aTTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGTCAAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGAtc < 1:144484/149‑1 (MQ=255) aTTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGa < 3:13877/129‑1 (MQ=255) aTTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGa > 4:13877/1‑129 (MQ=255) cATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTccc > 6:34670/1‑149 (MQ=255) aTCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAATAGCCGCTCCCTAAGGATCGGCGCTTGGAATTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGGAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCATGAAGGTCATCCGAGCTGAATTCTCCTGTGATCTcccc < 4:245937/149‑1 (MQ=255) cttctGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTcccc > 3:315607/1‑147 (MQ=255) ctGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAgc < 4:88567/148‑1 (MQ=255) cAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAgcgc < 6:109909/147‑1 (MQ=255) cGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGAGGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGc > 1:80447/1‑149 (MQ=255) aaTTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCtgt < 5:298825/149‑1 (MQ=255) ttCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGAtc > 1:23093/1‑128 (MQ=255) ttCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGAtc < 2:23093/128‑1 (MQ=255) ggC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGc > 8:60802/1‑149 (MQ=255) gC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCg < 4:175267/63‑1 (MQ=255) gC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCg > 3:175267/1‑63 (MQ=255) aaaaaaaGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTaa < 6:89580/149‑1 (MQ=255) gcgCCGCTCCTTAGGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGGTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCt > 6:208186/3‑149 (MQ=255) gCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCa < 5:107700/149‑1 (MQ=255) ccGCTCCTTAGGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAg > 6:250861/1‑149 (MQ=255) tCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTg > 7:215342/1‑131 (MQ=255) tCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTg < 8:215342/131‑1 (MQ=255) ccTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAg > 8:111267/1‑147 (MQ=255) cTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAg > 7:193252/1‑146 (MQ=255) tAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAg > 7:195363/1‑148 (MQ=255) | TCGAGCCCGCGAAAGGATGGGTACATCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTG‑CGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAG > NC_002947/4832‑5125 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |