| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,202,854 | A→C | 6.1% | Q228P (CAG→CCG) | xcpY → | type II secretion pathway protein XcpY |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,202,854 | 0 | A | C | 6.1% | 203.8 / 3.5 | 65 | Q228P (CAG→CCG) | xcpY | type II secretion pathway protein XcpY |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/28); new base C (2/2); total (35/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.51e-01 | |||||||||||
CGTGCCGCAGCCACCGTGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGC‑‑AACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCACGCGGCACAGGCCCT > NC_002947/1202708‑1203001 | cGTGCCGCAGCCACCGTGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCagcagcagc > 8:91653/1‑149 (MQ=255) tGCCGCAGCCACCGTGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCgg < 6:159885/149‑1 (MQ=255) ccACCGTGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTgg > 4:312791/1‑148 (MQ=255) cACCGTGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCCGCTGCTGCTGGcg < 8:122089/149‑2 (MQ=255) gCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCGCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCGTGCCt > 3:201594/1‑149 (MQ=255) aGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTgg < 1:193947/149‑1 (MQ=255) ctgcACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCt > 7:2388/1‑149 (MQ=255) gACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCCGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCg > 4:232983/1‑149 (MQ=255) tCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTg > 2:14933/1‑149 (MQ=255) cGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTgg < 2:224124/149‑1 (MQ=255) gCTGAGCGGCAAGTGGGCAACCGTATTTGCGCCGCGCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTggg < 4:201594/149‑1 (MQ=255) gCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGtt > 4:239479/1‑140 (MQ=255) gCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGtt < 3:239479/140‑1 (MQ=255) ggCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCt > 1:219396/1‑149 (MQ=255) gCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCtg < 7:91653/149‑1 (MQ=255) ggCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCGCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGtt < 3:289967/148‑1 (MQ=255) ccAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCCGCTGCTGCTGGcg < 6:67333/105‑2 (MQ=255) ccAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCCGCTGCTGCTGGcg > 5:67333/1‑104 (MQ=255) ccAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAg > 7:36163/1‑149 (MQ=255) cAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGt > 5:61452/1‑149 (MQ=255) cAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGt < 8:6996/149‑1 (MQ=255) aCCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGc < 1:312578/135‑1 (MQ=255) aCCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGc > 2:312578/1‑135 (MQ=255) cGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGc < 7:5940/149‑1 (MQ=255) aTTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCtgtg < 4:101734/135‑1 (MQ=255) aTTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCtgtg > 3:101734/1‑135 (MQ=255) gccgcTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGt > 6:295703/1‑148 (MQ=255) ctgcTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGAGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGt > 3:236230/3‑147 (MQ=255) cTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGtt < 6:237931/128‑1 (MQ=255) cTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGtt > 5:237931/1‑128 (MQ=255) cacacTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGa < 4:179250/125‑1 (MQ=255) cacacTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGa > 3:179250/1‑125 (MQ=255) acTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTggg > 8:4708/1‑107 (MQ=255) acTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTggg < 7:4708/107‑1 (MQ=255) acTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGC‑‑AActct > 7:125093/1‑149 (MQ=255) cccGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGC‑‑AACTCTGgc < 4:236230/148‑1 (MQ=255) cccGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGC‑‑AACTCTGgc < 2:256515/148‑1 (MQ=255) gCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGC‑‑AACTCTGGCGCAGc > 7:42603/1‑149 (MQ=255) ttCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGC‑‑AACTCTGgc < 4:47713/139‑1 (MQ=255) ttCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGC‑‑AACTCTGgc > 3:47713/1‑139 (MQ=255) gACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGACCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGC‑‑AACTCTGGCGCAGCCAGGTCAt < 6:220708/149‑1 (MQ=255) cgcgCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGC‑‑AACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGc > 5:160076/1‑149 (MQ=255) cgcgCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGC‑‑AACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGc > 8:152376/1‑149 (MQ=255) gcgcCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGC‑‑AACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGcc < 6:160076/149‑1 (MQ=255) cccGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCa > 7:91868/1‑106 (MQ=255) cccGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCa < 8:91868/106‑1 (MQ=255) cccGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGC‑‑AACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTg < 2:219396/149‑1 (MQ=255) cAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCAAGCAGCAGCGGATCCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTCGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGC‑‑AACACTGGAGCAGCCAGGTCATTGCCGTgcacg > 8:259912/1‑145 (MQ=255) aGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGC‑‑AACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCggg < 5:295703/149‑1 (MQ=255) tGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGC‑‑AACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAg < 8:2388/149‑1 (MQ=255) gcTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCCCCAAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAg > 1:107806/1‑148 (MQ=255) gccgccTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGC‑‑AACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGc < 3:295748/136‑1 (MQ=255) gccgccTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGC‑‑AACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGc > 4:295748/1‑136 (MQ=255) gccgccTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGC‑‑AACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCg < 7:152376/149‑1 (MQ=255) cgccTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGC‑‑AACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGt > 4:122132/1‑123 (MQ=255) cgccTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGC‑‑AACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGt < 3:122132/123‑1 (MQ=255) cgccTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGC‑‑AACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGc < 6:61452/149‑1 (MQ=255) gccTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGC‑‑AACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCa > 7:57689/1‑149 (MQ=255) gccTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGC‑‑AACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCa > 1:261014/1‑149 (MQ=255) cTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGC‑‑AACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCAcg > 8:154188/1‑149 (MQ=255) cTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGC‑‑AACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCAcg > 5:76089/1‑149 (MQ=255) tgCCAGCAGCCGCTGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGC‑‑AACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCACGCgg > 8:48206/2‑148 (MQ=255) cGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGC‑‑AACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCACGCGGc > 4:223830/1‑149 (MQ=255) cGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGC‑‑AACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCACGCGGc < 7:90460/149‑1 (MQ=255) gCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGC‑‑AACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCACGCGGca > 7:179749/1‑149 (MQ=255) ccAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGC‑‑AACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCACGCGGca > 4:44715/1‑148 (MQ=255) cagcagcGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGC‑‑AACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCACGCGGCACAGGc < 8:36163/149‑1 (MQ=255) agcagcGCCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGC‑‑AACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCACGCGGCACAGGcc > 5:230704/1‑149 (MQ=255) cagcGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGC‑‑AACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCACGCGGCACAGGCCCt < 8:179749/149‑1 (MQ=255) | CGTGCCGCAGCCACCGTGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGC‑‑AACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCACGCGGCACAGGCCCT > NC_002947/1202708‑1203001 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |