Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,205,154 | C→A | 8.8% | E24* (GAG→TAG) | PP_1056 ← | iron‑chelator utilization protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,205,154 | 0 | C | A | 8.8% | 195.8 / 6.8 | 65 | E24* (GAG→TAG) | PP_1056 | iron‑chelator utilization protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (32/27); new base A (2/4); total (34/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.13e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.66e-01 |
CTTGCCCAGATTACGGGCCTCGATGGCCTGTTGTTGCTCCGGCGTTTCGGCGAACAGCAGCTTGATATGGTCGTCGCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGTGAATGGTGTCACTCATGGGGCGTCTCCCTGAAAGGTTCGGTGGGCCCGGAGGCGATGGCCTTGGCGGTATGGTTGAGCAGGTCACGGACCC > NC_002947/1205008‑1205298 | cTTGCCCAGATTACGGGCCTCGATGGCCTGTTGTTGCTCCGGCGTTTCGGCGAACAGCAGCTTGATATGGTCGTCGCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCg < 3:108272/148‑1 (MQ=255) tcccAGATTACGGGCCTCGATGGCCTGGTGTTGCTCCGGCGTTTCGGCGAACAGCAGCTTGATATGGTCGTCGCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGt < 6:173643/146‑1 (MQ=255) gCCCAGATTACGGGCCTCGATGGCCTGTTGTTGCTCCGGCGTTTCGGCGAACAGCAGCTTGATATGGTCGTCGCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGt < 7:100071/147‑1 (MQ=255) ccAGATTACGGGCCTCGATGGCCTGTTGTTGCTCCGGCGTTTCGGCGAACAGCAGCTTGATATGGTCGTCGCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGAcc > 6:246253/1‑149 (MQ=255) cAGAGTACGGGCCTCGATGGCCTGTTGTTGCTCCGGCGGTTCGGCGAACAGCAGCTTGATATGGTCGGCGCTGCCCATGCTGGTACAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAC‑CGAGCTGAccc < 7:275607/149‑1 (MQ=255) aGATTACGGGCCTCGATGGCCTGTTGTTGCTCCGGCGTTTCGGCGAACAGCAGCTTGATATGGTCGTCGCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAC‑CGAGCTGAcccc < 8:209294/149‑2 (MQ=255) aGATTACGGGCCTCGATGGCCGGTTGTTGCTCCGGCGTTTCGGCGAACAGCAGCTTGATATGGTCGTCGCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAC‑CGAGCTGAcccc < 2:70169/149‑2 (MQ=255) gATTACGGGCCTCGATGGCCTGTTGTTGCTCCGGCGTTTCGGCGAACAGCAGCTTGATATGGTCGTCGCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAC‑CGAGCTGAccc < 5:158652/147‑1 (MQ=255) gATTACGGGCCTCGATGGCCTGTTGTTGCTCCGGCGTTTCGGCGAACAGCAGCTTGATATGGTCGTCGCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAC‑CGAGCTGAccc > 6:158652/1‑147 (MQ=255) tACGGGCCTCGATGGCCTGTTGTTGCTCCGGCGTTTCGGCGAACAGCAGCTTGATATGGTCGTCGCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGt < 3:119073/139‑1 (MQ=255) tACGGGCCTCGATGGCCTGTTGTTGCTCCGGCGTTTCGGCGAACAGCAGCTTGATATGGTCGTCGCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGt > 4:119073/1‑139 (MQ=255) gATGGCCTGTTGTTGCTCCGGCGTTTCGGCGAACAGCAGCTTGATATGGTCGTCGCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGAc > 4:169804/1‑149 (MQ=255) tGGCCTGTTGTTGCTCCGGCGTTTCGGCGAACAGCAGCTTGATATGGTCGTCGCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACgg < 5:246253/149‑1 (MQ=255) gttgCTCCGGCGTTTCGGCGAACAGCAGCTTGATATGGTCGTCGCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCg > 2:82416/1‑148 (MQ=255) cTCCGGCGTTTCGGCGAACAGCAGCTTGATATGGTCGTCGCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGAtc < 1:82416/148‑1 (MQ=255) gTTTCGGCGAACAGCAGCTTGATATGGTCGTCGCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGtt > 7:128223/1‑149 (MQ=255) tttCGGCGAACAGCAGCTTGATATGGTCGTCGCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGttt < 6:197064/149‑1 (MQ=255) ttCGGCGAACAGCAGCTTGATATGGTCGTCGCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTa > 6:259855/1‑149 (MQ=255) cGGCGAACAGCAGCTTGATATGGTCGTCGCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTAcg > 1:150444/1‑149 (MQ=255) gCGAACAGCAGCTTGATATGGTCGTCGCTGCCCATGCTGGTAAGGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACg > 2:167005/1‑122 (MQ=255) gCGAACAGCAGCTTGATATGGTCGTCGCTGCCCATGCTGGTAACGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAGCCTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACg < 1:167005/123‑1 (MQ=255) gAACAGCAGCTTGATATGGTCGTCGCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGt > 8:255848/1‑149 (MQ=255) aaCAGCAGCTTGATATGGTCGTCGCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGt > 8:134902/1‑148 (MQ=255) aaCAGCAGCTTGATATGGTCGTCGCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGt > 5:9458/1‑148 (MQ=255) aCAGCAGCTTGATATGGTCGTCGCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGTg > 7:195381/1‑148 (MQ=255) gcagcTTGATATGGTCGTCGCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGTGAATg < 7:255848/149‑1 (MQ=255) gcTTGATATGGTCGTCGCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGTGAATGgtg < 1:137001/149‑1 (MQ=255) tatGGTCGTCGCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCTGTGAAt < 6:42488/139‑1 (MQ=255) tatGGTCGTCGCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGTGAAt > 5:42488/1‑139 (MQ=255) tatGGTCGTCGCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGTGAATGGTGTCACt > 6:6122/1‑148 (MQ=255) taggggcgtcgCTGCCCCTGCTGGGAAAGCCGTGCAGCGCGGCACCCCCCAGGGGGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGTGAATGGTGTCACTc < 8:223403/143‑1 (MQ=255) tGGTCGTCGCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGTGAATGGTGTCACTCAt < 7:134902/149‑1 (MQ=255) ggTCGTCGCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGTGAATGGTGTCACTCATg > 4:87961/1‑149 (MQ=255) gtcgtcGCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGTGAATGgtgt > 2:199099/1‑140 (MQ=255) gtcgtcGCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGTGAATGgtgt < 7:252343/140‑1 (MQ=255) gtcgtcGCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGTGAATGgtgt < 1:199099/140‑1 (MQ=255) gtcgtcGCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGTGAATGgtgt > 8:252343/1‑140 (MQ=255) gtcgtcGCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGTGAATGGTGTCACTCATgg < 3:87961/149‑1 (MQ=255) cgCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCgg > 3:53034/1‑75 (MQ=255) cgCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCgg < 4:53034/75‑1 (MQ=255) cccATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGTGAATGGTGTCACTCATGGGGCGTCTcc < 3:169804/148‑1 (MQ=255) cccATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGTGAATGGTGTCACTCATGGGGCGTCTcc < 8:195381/148‑1 (MQ=255) ccATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGTGAATGGTGTCACTCATGGGGCGTCTCCCt > 7:165158/1‑149 (MQ=255) aTGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGt > 8:257306/1‑118 (MQ=255) aTGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGt < 7:257306/118‑1 (MQ=255) cTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGTGAATGGTGTCACTCATGGGGCGTCTCCCTGaaa < 5:6122/148‑1 (MQ=255) ccTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGTGAATGGTGTCACTCATGGGGCGTCTCCCTGAAAGGTTCGGTgg > 8:152881/1‑149 (MQ=255) cAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGCGGTCAG‑CTAGGTGACCCGCAGCACCTGAAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGTGAATGGTGTCACTCATGGGGCGTCTCCCTGAAAGGTTCGGTGGGCCCg > 5:228238/1‑149 (MQ=255) cTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGTGAATGGTGTCACTCATGGGGCGTCTCCCTGAAAGGTTCGGTGGGCCCGGAg > 7:36540/1‑149 (MQ=255) gCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGTGAATg > 6:48962/1‑99 (MQ=255) gCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGTGAATg > 6:44131/1‑99 (MQ=255) tGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGTGAATGGTGTCACTCATGGGGCGTCTCCCTGAAAGGTTCGGTGGGCCCGGAGGCGATGGCCTTGGCGGt > 5:18851/1‑149 (MQ=255) tGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGAAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGTGAATGGTGTCACTCATGGGGCGTCTCCCTGAAAGGTTCGGTGGGCCCGGAGGCGATGGCCTTGGCGGt < 8:128223/149‑1 (MQ=255) tCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGTGAATGGTGTCACTCATGGGGCGTCTCCCTGAAAGGTTCGGTGGGCCCGGAGGCGATGGCCTTGGCGGTAt < 8:165158/148‑1 (MQ=255) tCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGTGAATGGTGTCACTCATGGGGCGTCTCCCTGAAAGGTTCGGTGGGCCCGGAGGCGATGGCCTTGGCGGTATg > 6:89694/1‑149 (MQ=255) ggCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGTGAATGGTGTCACTCATGGGGCGTCTCCCTGAAAGGTTCGGTGGGCCCGGAGGCGATGGCCTTGGCGGTATGGtt < 6:9458/149‑1 (MQ=255) gcgcATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGTGAATGGTGTCACTCATGGGGCGTCTCCCTGAAAGGTTCGGTGGGCCCGGAGGCGATGGCCTTGGCGGTATGGTTg > 7:244802/1‑149 (MQ=255) gcATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGTGAATGGTGTCACTCATGGGGCGTCTCCCTGAAAGGTTCGGTGGGCCCGGAGGCGATGGCCTTGGCGGTATGGTTGAg > 6:307692/1‑149 (MQ=255) cATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGTCGCTGGCGTATCTCGTGGTTTACGCGTTGAATTGTGTCACTCATGGGGCGTCTCCCTGAAAGGTTCGGTGGGCCCGGAGGCGATGGCCTTGGCGGTATGGTTGAGc < 2:150444/149‑1 (MQ=255) cATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGTGAATGGTGTCACTCATGGGGCGTCTCCCTGAAAGGTTCGGTGGGCCCGGAGGCGATGGCCTTGGCGGTATGGTTGAGc < 5:259855/149‑1 (MQ=255) tGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGGGGTTTACGCGGTGAATGGTGTCACTCATGGGGCGTCTCCCTGAAAGGTTCGGTGGGcc > 8:130696/1‑115 (MQ=255) cgcgGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGTGAATGGTGTCACTCATGGGGCGTCTCCCTGAAAGGTTCGGTGGGCCCGGAGGCGATGGCCTTGGCGGTATGGTTGAGCAgg < 6:18851/148‑1 (MQ=255) gcgGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGTGAATGGTGTCACTCATGGGGCGTCTCCCTGAAAGGTTCGGTGGGCCCGGAGGCGATGGCCTTGGCGGTATGGTTGAGCAGGt > 5:95018/1‑148 (MQ=255) tCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGTGAATGGTGTCACTCATGGGGCGTCTCCCTGAAAGGTTCGGTGGGCCCGGAGGCGATGGCCTTGGCGGTATGGTTGAGCAGGTCACGGAc > 5:51262/1‑149 (MQ=255) aG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGTGAATGGTGTCACTCATGGGGCGTCTCCCTGAAAGGTTCGGTGGGCCCGGAGGCGATGGCCTTGGCGGTATGGTTGAGCAGGTCACGGAccc > 2:216738/1‑149 (MQ=255) | CTTGCCCAGATTACGGGCCTCGATGGCCTGTTGTTGCTCCGGCGTTTCGGCGAACAGCAGCTTGATATGGTCGTCGCTGCCCATGCTGGTAAAGCCTTGCAGCTCGGCACCCCCCAGGGTGATCCGGCGCATGCGCGGGGTCAG‑CTCGGTGACCCGCAGCACCTGCAGACGGCGCTGGCGGATCTCGTGGTTTACGCGGTGAATGGTGTCACTCATGGGGCGTCTCCCTGAAAGGTTCGGTGGGCCCGGAGGCGATGGCCTTGGCGGTATGGTTGAGCAGGTCACGGACCC > NC_002947/1205008‑1205298 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |