Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,376,321 | A→T | 10.0% | intergenic (+30/+19) | kup → / ← PP_1201 | potassium transport system protein Kup/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,376,321 | 0 | A | T | 10.0% | 153.2 / 8.1 | 60 | intergenic (+30/+19) | kup/PP_1201 | potassium transport system protein Kup/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (22/31); new base T (3/3); total (26/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.91e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.33e-01 |
CTGGCGGGGCAACCTGTTCGCGTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGA‑‑‑TCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGCAGTTTCAGGCGCTCACCTACTGCC > NC_002947/1376180‑1376469 | cTGGCGGGGCAACCTGTTCGCGTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGA‑‑‑TCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGc < 1:20659/149‑1 (MQ=255) cTGGCGGGGCAACCTGTTCGCGTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGA‑‑‑TCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGc < 4:210221/149‑1 (MQ=255) gCGGGGCAACCTGTTCGCGTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCTTTGAACCGGGTGA‑‑‑TCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGTTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCt < 4:158256/149‑1 (MQ=255) ggggAACATTTTCGCGTTCTTTCTTTATAATTGCAAAGGCAACTTTCGCTTCTTCAACCTTCCCTTTAAACGGGTGATCCTCAAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCt < 1:257800/149‑1 (MQ=255) ggCAACCTGTTCGCGTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGA‑‑‑TCGAGCTAGGGACCCAGGGCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCTCTGCGGCCCTGAGc < 7:6652/149‑1 (MQ=255) aaCCTGTTCGCGTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGA‑‑‑TCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCtt < 5:326751/149‑1 (MQ=255) cTGTTCGCGTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGA‑‑‑TCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCTCTGCGGCCCt > 5:140564/1‑139 (MQ=255) cTGTTCGCGTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGA‑‑‑TCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCTCTGCGGCCCt < 6:140564/139‑1 (MQ=255) gtCTTGCTGACGAATTCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGGGA‑‑‑TCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCt < 7:245200/148‑1 (MQ=255) tCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGA‑‑‑TCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGt < 8:263490/138‑1 (MQ=255) tCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGA‑‑‑TCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGt > 7:263490/1‑138 (MQ=255) cTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGA‑‑‑TCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCt < 2:71040/148‑1 (MQ=255) gaagaaTGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGA‑‑‑TCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCa > 8:121772/1‑112 (MQ=255) gaagaaTGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGA‑‑‑TCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCa < 7:121772/112‑1 (MQ=255) aagaaTGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGA‑‑‑TCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTAc < 3:230236/147‑1 (MQ=255) aagaaTGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGA‑‑‑TCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTGATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGc < 6:136098/149‑1 (MQ=255) agaaTGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGA‑‑‑TCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCCCAGAGCGGCCCTGAGCATTGGACGTTATGATCAGCTaac > 3:155922/1‑145 (MQ=255) tGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGA‑‑‑TCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGCGCCGTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGcgtgcc > 8:223533/1‑144 (MQ=255) ccAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGCACCGGGTGA‑‑‑TCGAGCTAGGGACCCCGGTCGAGAGCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACtt < 7:223533/149‑1 (MQ=255) ttGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGA‑‑‑TCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGcgcg > 1:171448/1‑149 (MQ=255) gcgcTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGA‑‑‑TCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTg < 7:69281/142‑1 (MQ=255) gcgcTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGA‑‑‑TCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTg > 8:69281/1‑142 (MQ=255) gcTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGA‑‑‑TCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTc > 3:206290/1‑149 (MQ=255) cttcttCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGA‑‑‑TCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTc < 8:151790/108‑1 (MQ=255) tcttcAACCTGCCGTTGAACCGGGTGA‑‑‑TCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCtt < 3:1142/103‑1 (MQ=255) gcaagttGCCGTTGAACCGGGTGA‑‑‑TCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGAtctc < 1:289737/143‑1 (MQ=255) cAACCTGCCGTTGAACCGGGTGA‑‑‑TCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCg > 5:47975/1‑149 (MQ=255) cTGCCGTTGAACCGGGTGA‑‑‑TCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCaa < 1:145813/149‑1 (MQ=255) tGCCGTTGAACCGGGTGA‑‑‑TCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCGCAGGGCCGCCCAGCGGCCCAGAGCCCTGTGAGTTGTGCTCAGCTACCCGGGGCGTGCCATGGGGCGGTTGGATGTGGCCaa > 6:222288/1‑148 (MQ=255) ccGTTGAACCGGGTGA‑‑‑TCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCaa < 5:222288/146‑1 (MQ=255) ccGTTGAACCGGGTGA‑‑‑TCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATc < 6:47975/148‑1 (MQ=255) tCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGc > 5:83140/1‑149 (MQ=255) gAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCt > 1:128867/1‑96 (MQ=255) gAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCt < 2:128867/96‑1 (MQ=255) aGGGACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGGTCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAg > 4:66155/1‑149 (MQ=255) gggACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTa < 3:37660/147‑1 (MQ=255) gggACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGt > 6:110468/1‑149 (MQ=255) ggACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGtt > 1:230329/1‑149 (MQ=255) gACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATAAAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGATCCTTGTAAGTTCTGCTCAGCTTAGCAGGAATTTCCTTGTCGCGGTTCGATATAGCCCATCAACCGCTTGGCGAGTTCACGGGAGTtc > 4:30541/1‑149 (MQ=255) cccAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTa < 1:277847/143‑1 (MQ=255) cccAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTa > 2:277847/1‑143 (MQ=255) cAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCtcgt > 5:320846/1‑149 (MQ=255) aGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCtcgtc < 6:168455/149‑1 (MQ=255) tCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGaa > 1:235012/1‑149 (MQ=255) tCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGaa < 5:110468/149‑1 (MQ=255) aaTGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCg < 1:236533/123‑1 (MQ=255) gggtataCAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCCGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAgg < 2:44065/146‑1 (MQ=255) gTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGCTCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGc < 3:66155/149‑1 (MQ=255) cttATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCAAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGc < 8:290501/148‑1 (MQ=255) taCAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGCAGt < 6:320846/148‑1 (MQ=255) cagcagGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGTCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGCAGTTTc < 4:155922/149‑1 (MQ=255) cagGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGaa < 7:178103/124‑1 (MQ=255) cagGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGaa > 8:178103/1‑124 (MQ=255) cagGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGCAGTTTCAgg > 5:42179/1‑149 (MQ=255) gcgcAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGCAGTTTCAGgcg < 7:293822/145‑1 (MQ=255) gCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTCGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAATGCCGGGTAGTTCACGTCGAAGTGGTGCCCGCAAGGAAGTTTCAGgcg > 8:293822/1‑148 (MQ=255) cTCAGGGCCGCTCTGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGc > 7:235546/1‑131 (MQ=255) cTCAGGGCCGCTCTGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGc < 8:235546/131‑1 (MQ=255) tCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGCAGTTTCAGGCGCt > 1:174911/1‑148 (MQ=255) cAGGGCCGCTCTGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGCAGTTTCAGGCGCTCa > 5:193170/1‑149 (MQ=255) gCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGCAGTTTCAGGCGCTCACCTa > 5:123969/1‑149 (MQ=255) cGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGCAGTTTCAGGCGCTCACCTACt > 2:105775/1‑149 (MQ=255) agagCGGACCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACTCTTGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGGAGTTATCGTCGAAGTGGTGCACTCCAGGCAGTTTCAGTCGCTCACATCCTgac > 2:179546/1‑147 (MQ=255) | CTGGCGGGGCAACCTGTTCGCGTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGA‑‑‑TCGAGCTAGGGACCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGCAGTTTCAGGCGCTCACCTACTGCC > NC_002947/1376180‑1376469 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |