| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,527,366 | C→T | 6.0% | R197R (CGC→CGT) | ftsQ → | cell division protein FtsQ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,527,366 | 0 | C | T | 6.0% | 200.0 / 2.7 | 67 | R197R (CGC→CGT) | ftsQ | cell division protein FtsQ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (32/30); new base T (2/2); total (35/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.89e-01 | |||||||||||
GGGGGGACGCAGCCCTGCTCAACAACCAGGGTCAGGCTTTCACCCCGCGCGAGCTGGCCAACTATGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCTGACCACCGGTGCGAGCAGTGCCGGGCCAGGCATCGAGTTGCTGCTGGGGCGCGATCATCTGGTGGAGAAGATGCGCCGTTTCATTGCCATT > NC_002947/1527218‑1527513 | ggggggACGCAGCCCTGCTCAACAACCAGGGTCAGGCTTTCACCCCGCGCGAGCTGGCCAACTATGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTgcgc > 7:143221/1‑149 (MQ=255) gggACGCAGCCCTGCTCAACAACCAGGGTCAGGCTTTCACCCCGCGCGAGCTGGCCAACTATGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGccc > 8:243041/1‑148 (MQ=255) gACGCAGCCCTGCTCAACAACCAGGGTCAGGCTTTCACCCCGCGCGAGCTGGCCAACTATGAGCACATGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATAGAGACAGAGGCTGCGCCCCtt > 8:280944/1‑149 (MQ=255) aGCCCTGCTCAACAACCAGGGTCAGGCTTTCACCCCGCGCGAGCTGGCCAACTATGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCt > 3:307071/1‑149 (MQ=255) gCCCTGCTCAACAACCAGGGTCAGGCTTTCACCCCGCGCGAGCTGGCCAACTATGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCtt < 7:114649/149‑1 (MQ=255) cTCAACAACCAGGGTCAGGCTTTCACCCCGCGCGAGCTGGCCAACTATGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCa < 2:183458/148‑1 (MQ=255) cTCAACAACCAGGGTCAGGCTTTCACCCCGCGCGAGCTGGCCAACTATGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCa > 1:183458/1‑148 (MQ=255) aacaacCAGGGTCAGGCTTTCACCCCGCGCGAGCTGGCCAACTATGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTTGGCTTTTCCAtcgc > 1:83817/1‑149 (MQ=255) aacCAGGGTCAGGCTTTCACCCCGCGCGAGCTGGCCAACTATGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGTCCCTTGGGCTTTTCCAtcgctcg > 3:199964/1‑149 (MQ=255) aacCAGGGTCAGGCTTTCACCCCGCGCGAGCTGGCCAACTATGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGTCCCTTGGGCTTTTCCAtcgctcg > 7:151008/1‑149 (MQ=255) ccAGGGTCAGGCTTTCACCCCGCGCGAGCTGGCCAACTATGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGcc > 7:120771/1‑149 (MQ=255) ccAGGGTCAGGCTTTCACCCCGCGCGAGCTGGCCAACTATGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGcc < 8:120771/149‑1 (MQ=255) aCCCCGCGCGAGCTGGCCAACTATGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCgcgagcg < 6:78679/149‑1 (MQ=255) aCCCCGCGCGAGCTGGCCAACTATGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCgcgagcg < 4:307071/149‑1 (MQ=255) ccccGCGCGAGCTGGCCAACTATGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCgcgagcga < 4:220762/149‑1 (MQ=255) cccGCGCGAGCTGGCCAACTATGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGcgagcgag > 6:273426/1‑149 (MQ=255) cccGCGCGAGCTGGCCAACTATGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATCCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGACCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCATGAGCTGCGcgagcgag > 2:181111/1‑149 (MQ=255) ccGCGCGAGCTGGCCAACTATGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTTCTCAGCAACTAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAgg < 1:181111/149‑1 (MQ=255) ccGCGCGAGCTGGCCAACTATGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAgg > 3:14409/1‑149 (MQ=255) ccGCGCGAGCTGGCCAACTATGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAgg < 2:302166/149‑1 (MQ=255) gcgAGCTGGCCAACTATGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGc < 8:40438/149‑1 (MQ=255) cgAGCTGGCCAACTATGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCCGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTgcgc < 2:133411/136‑1 (MQ=255) cgAGCTGGCCAACTATGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCCGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTgcgc > 1:133411/1‑136 (MQ=255) gCTGGCCAACTATGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGACGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGt > 1:57484/1‑149 (MQ=255) ggCCAACTATGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTcc > 1:125680/1‑149 (MQ=255) gCCAACTATGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCgcga > 1:160469/1‑131 (MQ=255) gCCAACTATGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCgcga < 2:160469/131‑1 (MQ=255) gCCAACTATGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCt < 5:273426/149‑1 (MQ=255) ccAACTATGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCTg < 4:14409/149‑1 (MQ=255) tATGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCTGaccac < 2:83817/149‑1 (MQ=255) aTGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCTGa < 6:256988/144‑1 (MQ=255) aTGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCTGa > 5:256988/1‑144 (MQ=255) tGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCtt > 1:230309/1‑90 (MQ=255) tGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCtt < 2:230309/90‑1 (MQ=255) tGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGTGCttt < 2:124539/97‑1 (MQ=255) tGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCttt > 1:124539/1‑97 (MQ=255) ccGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCTGACCACCGGTg < 2:6014/142‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCTGACCACCGGTg > 1:6014/1‑142 (MQ=255) gccgggccgCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCTGACCACCGGTGCGAGCAGTGCCGGGc > 5:35774/1‑148 (MQ=255) cgggccgCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCTGACCACCGGTGCGAGCAGTGCCGGGCCAg > 8:266978/1‑149 (MQ=255) cgggccgCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCTGACCACCGGTGCGAGCAGTGCCGGGCCAg > 4:186660/1‑149 (MQ=255) cgggccgCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCTGACCACCGGTGCGAGCAGTGCCGGGCCAg < 7:266978/149‑1 (MQ=255) gccgCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCgcgagc > 2:217944/1‑101 (MQ=255) gccgCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCgcgagc < 1:217944/101‑1 (MQ=255) gTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCTGACCACCGGTGCGAGCAGTGCCGGGCCAGGCATCGAg > 3:247307/1‑146 (MQ=255) gTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCTGACCACCGGTGCGAGCAGTGCCGGGCCAGGCATCGAg < 4:247307/146‑1 (MQ=255) gCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCACTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCTGACCACCGGTGCTAGCAGTGCCGGGCCAGGCATCGAGTtgct > 7:149713/1‑149 (MQ=255) cTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCACTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCTGACCACCGGTGCTAGCAGTGCCGGGCCAGGCATCGAGTtgctg < 8:149713/149‑1 (MQ=255) cAGGAACATGTCATGCAGCTGTATGAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGTCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGTAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCTGACCACCGGTGCGAGCAGTGCCGGGCCAGGCATCGAGTtgctgc < 8:151008/148‑1 (MQ=255) cAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCTGACCACCGGTGCGAGCAGTGCCGGGCCAGGCATCGAGTTgctgct > 4:289079/1‑149 (MQ=255) aGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGTCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCTGACCACCGGTGCGAGCAGTGCCGGGCCAGGCATCGAGTtgctgc < 4:199964/147‑1 (MQ=255) caaGTCATGCAGCAGTATGAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTc < 7:194634/96‑1 (MQ=255) caaGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTc > 8:194634/1‑96 (MQ=255) aGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCTGACCACCGGTGCGAGCAGTGCCGGGCCAGGCATCGAGTTGCTGCTGGGGcgcg < 5:208383/149‑1 (MQ=255) gTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCTGACCACCGGTGCGAGCAGTGCCGGGCCAGGCATCGCGTTGCTGCTGGGGCGCGa > 7:247935/1‑149 (MQ=255) gTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCTGACCACCGGTGCGAGCAGTGCCGGGCCAGGCATCGAGTTGCTGCTGGGGCGCGa > 1:55937/1‑149 (MQ=255) tCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCTGACCACCGGTGCGAGCAGTGCCGGGCCAGGCATCGAGTTGCTGCTGGGGCGCGat > 6:216917/1‑149 (MQ=255) gcagcaGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCTGACCACCGGTGCGAGCAGTGCCGGGCCAGGCATCGAGTTGCTGCTGGGgc > 7:238327/1‑140 (MQ=255) gcagcaGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCTGACCACCGGTGCGAGCAGTGCCGGGCCAGGCATCGAGTTGCTGCTGGGgc < 8:238327/140‑1 (MQ=255) gTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCTGACCACCGGTGCGAGCAGTGCCGGGCCAGGCATCGAGTTGCTGCTGGGGCGCGATCATCtggtg > 2:289462/1‑148 (MQ=255) gTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCTGACCACCGGTGCGAGCAGTGCCGGGCCAGGCATCGAGTTGCTGCTGGGGCGCGATCATCtggtg < 1:289462/148‑1 (MQ=255) tCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCTGACCACCGGTGCGAGCAGTGCCGGGCCAGGCATCGAGTTGCTGCTGGGGCGCGATCATCTGGTGgaga < 5:216917/149‑1 (MQ=255) cAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCTGACCACCGGTGCGAGCAGTGCCGGGCCAGGCATCGAGTTGCTGCTGGGGcgcg > 6:284335/1‑133 (MQ=255) cAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCTGACCACCGGTGCGAGCAGTGCCGGGCCAGGCATCGAGTTGCTGCTGGGGcgcg < 5:284335/133‑1 (MQ=255) gAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCTGACCACCGGTGCGAGCAGTGCCGGGCCAGGCATCGAGTTGCTGCTGGGGCGCGATCATCTGGTGGAGAAGATGCGcc > 3:280266/1‑149 (MQ=255) aGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCTGACCACCGGTGCGAGCAGTGCCGGGCCAGGCATCGAGTTGCTGCTGGGGCGCGATCATCTGGTGGAGAAGATgcgc > 8:235409/1‑147 (MQ=255) aGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCTGACCACCGGTGCGAGCAGTGCCGGGCCAGGCATCGAGTTGCTGCTGGGGCGCGATCATCTGGTGGAGAAGATgcgc < 7:235409/147‑1 (MQ=255) ccAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCTGACCACCGGTGCGAGCAGTGCCGGGCCAGGCATCGAGTTGCTGCTGGGGCGCGATCATCTGGTGGAGAAGATGCGCCGtt > 1:280122/1‑149 (MQ=255) gctgcGCCGCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCTGACCACCGGTGCGAGCAGTGCCGGGCCAGGCATCGATTTGCTGCTGGGGCGCGATCATCTGGTGGAGAAGATGCGCCGTTTCAtt < 7:243041/148‑1 (MQ=255) gcCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCTGACCACCGGTGCGAGCAGTGCCGGGCCAGGCATCGAGTTGCTGCTGGGGCGCGATCATCTGGTGGAGAAGATGCGCCGTTTCATTGCCAtt > 6:192975/1‑149 (MQ=255) | GGGGGGACGCAGCCCTGCTCAACAACCAGGGTCAGGCTTTCACCCCGCGCGAGCTGGCCAACTATGAGCACCTGCCGCAGCTGGCCGGGCCGCAGCGTGCTCAGCAACAAGTCATGCAGCAGTATCAGGTATTGAGCCAGATGCTGCGCCCCTTGGGCTTTTCCATCGCTCGCCTGGAGCTGCGCGAGCGAGGCAGCTGGTTCCTGACCACCGGTGCGAGCAGTGCCGGGCCAGGCATCGAGTTGCTGCTGGGGCGCGATCATCTGGTGGAGAAGATGCGCCGTTTCATTGCCATT > NC_002947/1527218‑1527513 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |