| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 27,581 | C→T | 7.6% | intergenic (‑428/+18) | PP_0022 ← / ← PP_0023 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 27,581 | 0 | C | T | 7.6% | 227.8 / 6.5 | 79 | intergenic (‑428/+18) | PP_0022/PP_0023 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (39/34); new base T (2/4); total (41/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.20e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.02e-02 | |||||||||||
GTCGTCCGCACTGAAGGGATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTCATTGGTGCGCTTTGGGCCTGGCTTGAT > NC_002947/27442‑27721 | gtcgtcCGCACTGAAGGGATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAATCCACCTCCCGAGA‑‑ggtg > 1:93799/1‑149 (MQ=255)gtcgtcCGCACTGAAGGGATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑gc < 6:283918/147‑1 (MQ=255) gtcCGCACTGAAGGGATAACCGATCCGGATGTAGCTTCATAATCCATCACTCTATGCGTAAGAGTCACGACGCGGTCCGATTGATCTGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCtt < 7:125604/149‑1 (MQ=255) tcCGCACTTCAGGGATAACCGATCCGGTGGTTGCTTCAGAATCCATCAAGGCAAGCGGAAGACTCACGACGCGTTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCTCGGGA‑‑GCTGCttt < 6:317500/149‑1 (MQ=255) gCACTGAAGGGATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCttttt > 1:82124/1‑148 (MQ=255) cACTGAAGGGATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCTCGGGA‑‑GCTGCttttttt < 6:3709/149‑2 (MQ=255) cACTGAAGGGATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTc < 2:305132/149‑1 (MQ=255) aCTGAAGGGATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCATCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCt > 8:235086/1‑149 (MQ=255) tGAAGGGATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCtt > 1:50368/1‑148 (MQ=255) gAAGGGATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCTCGGGA‑‑GCTGCttt < 2:75191/141‑1 (MQ=255) gAAGGGATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCTCGGGA‑‑GCTGCttt > 1:75191/1‑141 (MQ=255) gAAGGGATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTc < 4:39573/145‑1 (MQ=255) gAAGGGATAACAGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTc > 3:39573/1‑145 (MQ=255) aaGGGATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCgaga > 6:20918/1‑132 (MQ=255) aaGGGATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCgaga < 5:20918/132‑1 (MQ=255) aaCCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCAtt > 7:237903/1‑149 (MQ=255) ccGATCCGGAGGTAGCTTAAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTACGATTGATAAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGAACACAGCCCA‑AAAAAAAAAGCAGCACCCGAGC‑‑GATGCTTTTTTCTTACTCCCCCgttt > 8:209774/1‑149 (MQ=255) cGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCttttt > 6:92817/1‑149 (MQ=255) tCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑‑AAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGc > 7:32673/1‑149 (MQ=255) cGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑‑AAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCtt < 8:32673/149‑1 (MQ=255) gTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCCAAAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCttt < 8:301083/138‑1 (MQ=255) gTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCCAAAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCttt > 7:301083/1‑138 (MQ=255) gTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTgg < 2:50368/149‑1 (MQ=255) gTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGATTGTgg > 7:136786/1‑149 (MQ=255) tCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGtt‑‑t > 7:296855/1‑148 (MQ=255) aTCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTc < 8:237903/149‑1 (MQ=255) cATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑Tc > 7:129875/1‑141 (MQ=255) cATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑Tc < 8:129875/141‑1 (MQ=255) aTCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTtgtg > 8:128598/1‑133 (MQ=255) aTCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTtgtg < 7:128598/133‑1 (MQ=255) caagccaagcGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTGTTACTACCACTTTTTGTTGTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATg > 3:186095/1‑149 (MQ=255) caagcGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCt > 4:200875/1‑149 (MQ=255) aagcGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCa > 5:83988/1‑133 (MQ=255) aagcGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCa < 6:83988/133‑1 (MQ=255) cGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTcc > 7:72525/1‑135 (MQ=255) cGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTcc < 8:72525/135‑1 (MQ=255) aaGACTCACCACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGGCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGACCTCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGc < 1:96436/149‑1 (MQ=255) gACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCtttt < 4:125610/149‑1 (MQ=255) tCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCCAAAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTATGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCtttt > 2:36092/1‑147 (MQ=255) tCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAg > 2:198541/1‑149 (MQ=255) tCACGACGCGGTCCGATTGATAAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCAACTTTTTGTGCTTGAGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCGTTATGCtttaaag > 3:210280/1‑145 (MQ=255) acgacgCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTAGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAgg > 1:205310/1‑149 (MQ=255) acgacgCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑Tc < 3:150595/119‑1 (MQ=255) acgacgCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAggg > 1:311137/1‑149 (MQ=255) acgacgCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAggg > 6:120056/1‑149 (MQ=255) acgacgCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAggg < 2:311137/149‑1 (MQ=255) acgacgCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAgg < 2:205310/148‑1 (MQ=255) acgacgCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTATTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑Tc > 4:150595/1‑119 (MQ=255) cgcgGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCt < 7:87938/134‑1 (MQ=255) cgcgGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCt > 8:87938/1‑134 (MQ=255) cgcgGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGa < 8:296855/149‑1 (MQ=255) gcgGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGtt‑‑t > 2:175910/1‑113 (MQ=255) gcgGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGtt‑‑t < 1:175910/113‑1 (MQ=255) ggTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCACCTACCCAGA‑‑GCTGCTATTTTCATAATCACCCATAATGTACTTGTTGGGAT‑‑TCAAGTCCTCATGGACCTTCTTCATTTCAGGGGTGAcaa > 6:121656/1‑147 (MQ=255) gTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCg < 1:198541/149‑1 (MQ=255) gATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGc < 7:235086/149‑1 (MQ=255) aTTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCCAAAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTATGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGc < 1:36092/149‑1 (MQ=255) aTTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGcc > 1:181846/1‑149 (MQ=255) ttGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCt < 5:92817/149‑1 (MQ=255) tCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTg > 8:36511/1‑149 (MQ=255) cGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCg > 8:99017/1‑149 (MQ=255) agaCGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGa < 7:99017/149‑1 (MQ=255) agaCGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTATATTTTAGGGGTTGAGAATGTACGGATTGTACTTATTCTTTTAATGTGTGACTCGCTGACTTTTGTCCg > 1:265051/1‑149 (MQ=255) gTCGT‑GAGGGTTTGCACACATCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGATA‑‑GCAGCTTTTTTCTAACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGcc < 4:186095/149‑1 (MQ=255) tCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTCCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCa > 4:128411/1‑149 (MQ=255) cGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCAt > 6:147202/1‑149 (MQ=255) gT‑GATGGGTTGCACACTGCCCA‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGT‑‑GGTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCAt < 5:121656/148‑1 (MQ=255) t‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCt < 2:181846/149‑1 (MQ=255) aGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCtt < 7:36511/148‑1 (MQ=255) gCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTCATTGGt < 2:156596/148‑1 (MQ=255) cacacaGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTCATTGGTgc < 5:120056/149‑1 (MQ=255) cccc‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTCATTGGTGCGCTTTgg > 2:103796/1‑149 (MQ=255) cc‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTACGGAGTGCCTTCTTCATTGGTGCGGTTTGGGc > 6:271715/1‑149 (MQ=255) cc‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTATGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTCATTGGTGCGCTTTGGGc > 6:95907/1‑149 (MQ=255) aaaaaaaGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTCATTGGTGCGCTTTGGGCCTgg > 4:144181/1‑149 (MQ=255) aaGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTCATTGGTGCGCTTTGGGCCTGGCTTGa < 1:51856/149‑1 (MQ=255) agcagcTCTCGGGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGt < 2:225832/113‑1 (MQ=255) agcagcTCTCGGGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCATGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGt > 1:225832/1‑113 (MQ=255) agcagcTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTCATTGGTGCGCTTTGGGCCTGGCTTGAt < 3:200875/149‑1 (MQ=255) | GTCGTCCGCACTGAAGGGATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGT‑GAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGA‑‑GCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTT‑‑TCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTCATTGGTGCGCTTTGGGCCTGGCTTGAT > NC_002947/27442‑27721 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |