Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,147,304 | A→T | 5.3% | A1072A (GCT→GCA) | rne ← | ribonuclease E |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,147,304 | 0 | A | T | 5.3% | 229.8 / 2.3 | 76 | A1072A (GCT→GCA) | rne | ribonuclease E |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (32/40); new base T (2/2); total (34/42) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.11e-01 |
TTTACCCGCGAAGAGGCCCGTCAGGCAAACCAAAAAAAGCCCCGCCAGTTTGCACTGGCGGGGCTTTTTCATTCAGCTTTGGCTATCAGCCGTGATGAGGTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTGGCCAGCATGACAGTGGCAGGTTCGACCACTGCAGGTGCAGGTTCGACCACCG > NC_002947/2147159‑2147443 | tttACCCGCGAAGAGGCCCGTCAGGCAAACCAAAAAAAGCCCCGCCAGTTTGCACTGGCGGGGCTTTTTCATTCAGCTTTGGCTATCAGCCGTGATGAGGTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTgcagca > 4:69895/1‑149 (MQ=255) ccGCGAAGAGGCCCGTCAGGCAAACCAAAAAAAGCCCCGCCAGTTTGCACTGGCGGGGCTTTTTCATTCAGCTTTGGCTATCAGCCGTGATGAGGTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCtt > 2:296860/1‑148 (MQ=255) ccGCGAAGAGGCCCGTCAGGCAAACCAAAAAAAGCCCCGCCAGTTTGCACTGGCGGGGCTTTTTCATTCAGCTTTGGCTATCAGCCGTGATGAGGTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTc > 7:238936/1‑149 (MQ=255) cgcgAAGAGGCCCGTCAGGCAAACCAAAAAAAGCCCCGCCAGTTTGCACTGGCGGGGCTTTTTCATTCAGCTTTGGCTATCAGCCGTGATGAGGTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTcc > 1:234651/1‑149 (MQ=255) gcgAAGAGGCCCGTCAGGCAAACCAAAAAAAGCCCCGCCAGTTTGCACTGGCGGGGCTTTTTCATTCAGCTTTGGCTATCAGCCGTGATGAGGTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCt < 3:160254/149‑1 (MQ=255) cgAAGAGGCCCGTCAGGCAAACCAAAAAAAGCCCCGCCAGTTTGCACTGGCGGGGCTTTTTCATTCAGCTTTGGCTATCAGCCGTGATGAGGTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCTGCAGCTTccca < 3:187756/149‑3 (MQ=255) gAAGAGGCCCGTCAGGCAAACCAAAAAAAGCCCCGCCAGTTTGCACTGGCGGGGCTTTTTCATTCAGCTTTGGCTATCAGCCGTGATGAGGTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCtgt < 1:283192/149‑1 (MQ=255) ccGTCAGGCAAACCAAAAAAAGCCCCGCCAGTTTGCACTGGCGGGGCTTTTTCATTCAGCTTTGGCTATCAGCCGTGATGAGGTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCttt < 2:234651/149‑1 (MQ=255) atgCAAACCAAAAAAAGCCCCGCCAGTTTTCACTGGCTGGGCTTTTTCATTCAGATTTGTCTATCAGCCGTGATGAGGTTTTTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGgca < 7:47729/146‑1 (MQ=255) aGGCAAACCAAAAAAAGCCCCGCCAGTTTGCACTGGCGGGGCTTTTTCATTCAGCTTTGGCTATCAGCCGTGATGAGGTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGgcag < 4:177579/149‑1 (MQ=255) gCAAACCAAAAAAAGCCCCGCCAGTTTGCACTGGCGGGGCTTTTTCATTCAGCTTTGGCTATCAGCCGTGATGAGGTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGgcagca < 7:7012/149‑1 (MQ=255) gCAAACCAAAAAAAGCCCCGCCAGTTTGCACTGGCGGGGCTTTTTCATTCAGCTTTGGCTATCAGCCGTGATGAGGTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGgcagca > 6:262964/1‑149 (MQ=255) aaaCCAAAAAATGCCCCGCCAGTTTGCACTGGCGGGGCTTTCTAATTCAGCTTTTGCTATCAGCCGTTATGAGGTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCagcagc < 5:920/149‑1 (MQ=255) aaCCAAAAAAAGCCCCGCCAGTTTGCACTGGCGGGGCTTTTTCATTCAGCTTTGGCTATCAGCCGTGATGAGGTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGcc > 1:224662/1‑149 (MQ=255) cAAAAAAAGCCCCGCCAGTTTGCACTGGCGGGGCTTTTTCATTCAGCTTTGGCTATCAGCCGTGATGAGGTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCg > 7:8407/1‑149 (MQ=255) cAAAAAAAGCCCCGCCAGTTTGCACTGGCGGGGCTTTTTCATTCAGCTTTGGCTATCAGCCGTGATGAGGTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCg > 3:295318/1‑149 (MQ=255) aatgCCCCGCCAGTTTGCACTGGCGGGGCTTTTTCATTCAGCTTTGGCTATCAGCCGTGATGAGGTTTGTGCTCATCGGAGGCTTCCAGGGCTGGTTCGTGTGAAGCTGCTGCAGCTTccc < 4:231582/118‑2 (MQ=255) aaaGCCCCGCCAGTTTGCACTGGCGGGGCTTTTTCATTCAGCGTTGGCTATCAGCCGTGATGAGGTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCTGCAGCTTccc > 3:227327/1‑120 (MQ=255) aaaGACCCGCCAGTTTGCACTGGCGGGGCTTTTTCATTCAGCATTGGATATCAGCCGTGATGAGGTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCTGCAGCTTcca > 3:231582/1‑120 (MQ=255) aGCCCCGCCAGTTTGCACTGGCGGGGCTTTTTCATTCAGCTTTGGCTATCAGCCGTGATGAGGTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTccc < 3:69895/149‑1 (MQ=255) cccGCCAGTGCAAACTGGCGGGGCTTTTTCATTCAGCTTTGGCTATCAGCCGTGATGAGGTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTgcag < 7:301399/107‑1 (MQ=39) cccGCCAGTGCAAACTGGCGGGGCTTTTTCATTCAGCTTTGGCTATCAGCCGTGATGAGGTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTgcag > 8:301399/1‑107 (MQ=39) cGCCAGTTTGCACTGGCGGGGCTTTTTCATTCAGCTTTGGCTATCAGCCGTGATGAGGTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTg > 1:147588/1‑149 (MQ=255) ccAGTTTGCACTGGCGGGGCTTTTTCATTCAGCTTTGGCTATCAGCCGTGATGAGGTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTgcg < 2:147588/149‑1 (MQ=255) gtgcaaaCTGGCGGGGCTTTTTCATTCAGCTTTGGCTATCAGCCGTGATGAGGTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTgcggcg < 4:135799/143‑1 (MQ=255) aCTGGCGGGGCTTTTTCATTCAGCTTTGGCTATCAGCCGTGATGAGGTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCAc > 4:151157/1‑149 (MQ=255) gCGGGGCTTTTTCATTCAGCTTTGGCTATCAGCCGTGATGAGGTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTc < 3:151157/148‑1 (MQ=255) gCTTTTTCATTCAGCTTTGGCTATCAGCCGTGATGAGGTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACACACTTCACGTgg < 8:238936/149‑1 (MQ=255) tcattcaGCTTTGGCTATCAGCCGTGATGAGGTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGt < 1:160679/148‑1 (MQ=255) caGCTTTGGCTATCAGCCGTGATGAGGTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGt < 6:263861/148‑1 (MQ=255) aGCTTTGGCTATCAGCCGTGATGAGGTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTg > 6:101608/1‑148 (MQ=255) gCTATCAGCCGTGATGAGGTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGcc < 2:288900/148‑1 (MQ=255) tCAGCCGTGATGAGGTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTgg > 3:209436/1‑149 (MQ=255) tgatgaGGTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGGTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTGGCCAGCAt < 7:131556/149‑1 (MQ=255) atgaGGTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTGGCCAGCATGa < 5:262964/149‑1 (MQ=255) aGGTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTGGCCAGCATGACa < 4:295318/148‑1 (MQ=255) ggTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACtt < 4:163053/106‑1 (MQ=255) ggTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACtt > 3:163053/1‑106 (MQ=255) ggTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTGGCCAGCATGACAGt < 2:224662/149‑1 (MQ=255) gTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGtt > 5:131686/1‑118 (MQ=255) gTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGtt < 6:131686/118‑1 (MQ=255) gTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGtt < 4:294977/133‑1 (MQ=255) gTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGtt > 3:294977/1‑133 (MQ=255) tCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTGGCCAGCATGACAGTGGCAGGTTc > 6:86423/1‑149 (MQ=255) aTCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTc > 3:110006/1‑105 (MQ=255) aTCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTc < 4:110006/105‑1 (MQ=255) aTCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTGGCCAGCATGACAGTGGCAgg > 6:276741/1‑144 (MQ=255) aTCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTGGCCAGCATGACAGTGGCAgg < 5:276741/144‑1 (MQ=255) aTCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTGGCCAGCATGACAGTGGCAGGTTc < 5:86423/147‑1 (MQ=255) aTCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTGGCCAGCATGACAGTGGCAGGTTc < 8:8407/147‑1 (MQ=255) aTCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTGGCCAGCATGACAGTGGCAGGTTc < 4:209436/147‑1 (MQ=255) aTCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTGGCCAGCATGACAGTGGCAGGTTCGa < 6:318548/149‑1 (MQ=255) cggcggCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTGGCCAGCATGACAGTGGCAGGTTCGAc > 1:231102/1‑148 (MQ=255) ttCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACg > 8:267518/1‑81 (MQ=255) ttCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACg < 7:267518/81‑1 (MQ=255) ttCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTGGCCAGCATGACAGttg < 7:207471/131‑3 (MQ=255) ttCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTGGCCAGCATGACAGTgg > 8:207471/1‑131 (MQ=255) ttCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCACTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTGGCCAGCATGACAGTGGCAGGTTCGACCACtgcag > 3:50111/1‑149 (MQ=255) tCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTGGCCAGc < 1:155584/120‑1 (MQ=255) tCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTGGCCAGc > 2:155584/1‑120 (MQ=255) tCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTGGCCAGCATGACAGTGGCAGGTTc > 3:302977/1‑137 (MQ=255) tCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTGGCCAGCATGACAGTGGCAGGTTc < 4:302977/137‑1 (MQ=255) gTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTGGcc < 2:276453/107‑1 (MQ=255) gTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTGGcc > 1:276453/1‑107 (MQ=255) gTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTGGCCAGCATGACAGTGGCAGGTTCGACCACtgc < 5:286787/136‑1 (MQ=255) gTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTGGCCAGCATGACAGTGGCAGGTTCGACCACtgc > 6:286787/1‑136 (MQ=255) gTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTGGCCAGCATGACAGTGGCAGGTTCGACCACTGCAGGTGCAGGTTc > 3:140346/1‑148 (MQ=255) cTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCACTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTGGCCAGCATGACAGTGGCAGGTTCGACCACTGCAGGTGCAGGTTCGacca < 4:50111/149‑1 (MQ=255) tGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGt < 7:68558/87‑1 (MQ=255) tGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGt > 8:68558/1‑87 (MQ=255) ggAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTGGCCAGCATGACAGTGGCAGGTTCg > 1:114021/1‑121 (MQ=255) ggAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTGGCCAGCATGACAGTGGCAGGTTCg < 2:114021/121‑1 (MQ=255) gAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTGGCCAGCATGACAGTGGCAGGTTCGACCACTGCAGGTGCAGGTTCGACCACCg > 8:99962/1‑148 (MQ=255) aaGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTTGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTGGCCAGCATGACAGTGGCAGGTTc < 6:185980/118‑1 (MQ=255) aaGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTGGCCAGCATGACAGTGGCAGGTTc > 5:185980/1‑118 (MQ=255) aaGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTGGCCAGCATGACAGTGGCAGGTTc < 6:190527/118‑1 (MQ=255) aaGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTGGCCAGCATGACAGTGGCAGGTTc > 5:190527/1‑118 (MQ=255) tGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTGGCCAGCATGACAGTGGc < 8:211367/108‑1 (MQ=255) tGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTGGCCAGCATGACAGTGGc > 7:211367/1‑108 (MQ=255) | TTTACCCGCGAAGAGGCCCGTCAGGCAAACCAAAAAAAGCCCCGCCAGTTTGCACTGGCGGGGCTTTTTCATTCAGCTTTGGCTATCAGCCGTGATGAGGTTTGTGCTCATCGGCGGCTTCCAGGGCTGGTTCCTGGGAAGCTGCAGCAGCTTCCTGTGCCGCTTTGGCAGCAGCCTCGGCCTCCCGCTTGCGGCGACGCACTTCACGTGGGTCGTTCGGTGCACGGCCGTTGGCCAGCATGACAGTGGCAGGTTCGACCACTGCAGGTGCAGGTTCGACCACCG > NC_002947/2147159‑2147443 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |