Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,396,385 | C→T | 6.7% | R1091H (CGC→CAC) | PP_2100 ← | two‑component system sensor protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,396,385 | 0 | C | T | 6.7% | 177.5 / 2.4 | 61 | R1091H (CGC→CAC) | PP_2100 | two‑component system sensor protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (30/26); new base T (2/2); total (33/28) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.25e-01 |
GCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAGGGTGCTCAGGCTGATGGGCTTGAGCAGACAGTCGTCCATGCCGGCGGTCAGGCACTTGCGGCGTACTTCCGGCTGTGCGTTGGCGGTATAGCCGA > NC_002947/2396243‑2396532 | gccgcTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCggg > 8:295121/1‑149 (MQ=255) gccgcTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCggg < 7:148101/149‑1 (MQ=255) cgcTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCggggg > 8:34229/1‑149 (MQ=255) tGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGt < 6:319507/149‑1 (MQ=255) tgtTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTg > 4:275848/1‑149 (MQ=255) tGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCgg > 7:272021/1‑149 (MQ=255) aaGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGc < 5:66907/149‑1 (MQ=255) aGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGTGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGc > 6:1700/1‑148 (MQ=255) aGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGTGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGc > 2:49373/1‑148 (MQ=255) ccATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATg > 4:80512/1‑149 (MQ=255) aTCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATgc > 2:92863/1‑148 (MQ=255) aGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATgccagc < 7:295121/149‑1 (MQ=255) gCTCGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCATGCGTCGGGTGCGTTGCTG‑GCG‑GCCCGGGCGAATgccacc > 8:98471/1‑145 (MQ=255) ggCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGTGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGa < 5:1700/149‑1 (MQ=255) ggCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGCTCAGGCCCGACAACCGCGGCCACGCCGTGCACCT‑GGTACACCTTGGGTAGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCCGGCGAATGCAAGCCACGCcctggct > 1:242474/1‑147 (MQ=255) gCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGTGTCGGGGGCGTTGCTGTGCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGa < 1:49373/149‑1 (MQ=255) gCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGCAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTCCTTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGa < 1:92863/149‑1 (MQ=255) cTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAggg > 3:43881/1‑149 (MQ=255) cTGAAGGCTCGGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGCGcctggctggcat < 7:121229/149‑5 (MQ=255) aaGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTg‑gcg > 6:323478/1‑111 (MQ=255) aaGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTg‑gcg < 5:323478/111‑1 (MQ=255) aaGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGa < 8:82653/143‑1 (MQ=255) aaGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGa > 7:82653/1‑143 (MQ=255) tctGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAGGGTGCTCAgg > 3:251087/1‑149 (MQ=255) tctGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAGGGTGCTCAgg > 3:48903/1‑149 (MQ=255) gCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAGGGTGCTCAGGCTGATg > 7:233505/1‑149 (MQ=255) cAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAgg > 6:131593/1‑133 (MQ=255) cAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAgg < 5:131593/133‑1 (MQ=255) aaGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAGGGTGCTCAGGCTGATggg > 3:172068/1‑149 (MQ=255) aGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAGGGTGCTCAGGCt > 8:263556/1‑142 (MQ=255) aGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAGGGTGCTCAGGCt < 7:263556/142‑1 (MQ=255) gTTTCCAGGAAGCGCTGACGGGCAACCGGGGCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAGGGTGCTCAGGCTGATGGGCtt < 1:288761/149‑1 (MQ=255) ttgccATGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCGGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGTGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCTCTGGCTGAGGGTGCTCAGGCTGATGGGCtt < 7:98471/145‑1 (MQ=255) tCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGAGCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAGGGTGCTCAGGCTGATGGGCTTGa < 4:48903/148‑1 (MQ=255) ccAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAGGGTGCTCAGGCTGATGGGCTTGAg > 5:105948/1‑148 (MQ=255) cAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCGCGCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAgg < 1:206518/125‑1 (MQ=255) cAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAgg > 2:206518/1‑124 (MQ=255) cgcTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAGGGTGCTCAGGCTGATGGGCTTGAGCAGACAgtc < 8:233505/149‑1 (MQ=255) gcTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAGGGTGCTCAGGCTGATGGGCTTGAGCAGACAgtcg > 6:282425/1‑149 (MQ=255) cTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAGGGTGCTCAGGCTGATGGGCTTGAGCAGACAgtcgt > 4:237313/1‑149 (MQ=255) ggTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAGGGTGc > 1:8241/1‑114 (MQ=255) ggTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAGGGTGc < 2:8241/114‑1 (MQ=255) ggTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAGGGTGCTCAGGCTGATGGGCTTGAGCAGACAgtcgtc < 8:189430/145‑1 (MQ=255) ggTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAGGGTGCTCAGGCTGATGGGCTTGAGCAGACAgtcgtc > 7:189430/1‑145 (MQ=255) gTCAACCGTGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGGCGTCCAGCT‑GGTACTGGTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGGGCTGGCTGAGGGTGCTCAGGCTGATGGGCTTGAGCAGACAGTCGTCCATGc < 4:96353/149‑1 (MQ=255) aaCCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAGGGTGCTCAGGCTGATGGGCTTGAGCAGACAGTCGTCCATGCcgg > 6:33002/1‑149 (MQ=255) aaCCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAGGGTGCTCAGGCTGATGGGCTTGAGCAGACAGTCGTCCATGCcg < 4:43881/148‑1 (MQ=255) gggTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATgcca > 4:194885/1‑84 (MQ=255) gggTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATgcca < 3:194885/84‑1 (MQ=255) ggTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAGGGTGCTCAGGCTGATGGGCTTGAGCAGACAGTCGTCCATGCCGGCGGt > 4:130870/1‑148 (MQ=255) ccGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAGGGTGCTCAGGCTGATGGGCTTGa < 1:319476/115‑1 (MQ=255) ccGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAGGGTGCTCAGGCTGATGGGCTTGa > 2:319476/1‑115 (MQ=255) gACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAGGGTGCTCAGGCTGATGGGCTTGAGCAGACAGTCGTCCATGCCGGCGGTCAGGCACTTgc < 4:172068/149‑1 (MQ=255) aCCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAGGGTGCTCAGGCTGATGGGCTTGAGCAGACAGTCGTCCATGCCGGCGGTCAGGCACTTgcg < 3:80512/149‑1 (MQ=255) cACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAGGGTGCTCAGGCTGATGGGCTTGAGCAGACAGTCGTCCATGCCGGCGGTCAGGCACTTgcggc > 1:316041/1‑149 (MQ=255) cggcggCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAGGGTGCTCAGGCTGATGGGCTTGAGCAGACAGTCGTCCATGCCGGCGGTCAGGCACTTGCGGCGt < 8:272021/149‑1 (MQ=255) ggcggcCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAGGGTGCTCAGGCTGATGGGCTTGAGCAGACAGTCGTCCATGCCGGCGGTCAGGCACTTGCGGCGTa > 8:28250/1‑149 (MQ=255) aGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAGGGTGCTCAGGCTGATGGGCTTGAGCAGACAGTCGTCCATGCCGGCGGTCAGGCACTTGCGGCGTACTTCCgg < 5:282425/149‑1 (MQ=255) aGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAGGGTGCTCAGGCTGATGGGCTTGAGCAGACAGTCGTCCATGCCGGCGGTCAGGCACTTGCGGCGTACTTCCgg < 4:251087/149‑1 (MQ=255) cT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAGGGTGCTCAGGCTGATGGGCTTGAGCAGACAGTCGTCCATGCCGGCGGTCAGGCACTTGCGGCGTACTTCCGGCTGTGCGTTgg > 5:275014/1‑149 (MQ=255) cTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAGGGTGCTCAGGCTGATGGGCTTGAGCAGACAGTCGTCCATGCCGGCGGTCAGGCACTTGCGGCGTACTTCCGGCTGTGCGTTGGCGGTATAGc > 5:68289/1‑149 (MQ=255) cGTCGGGGTGGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAGGGTGCTCAGGCTGATGGGCTTGAGCAGACAGTCGTCCATGCCGGCGGTCAGGCACTTGCGGCGTACTTCCGGCTGTGCGTTGGCGGTATAGCCGa < 2:242474/148‑1 (MQ=255) | GCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCT‑GGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTG‑GCG‑GCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAGGGTGCTCAGGCTGATGGGCTTGAGCAGACAGTCGTCCATGCCGGCGGTCAGGCACTTGCGGCGTACTTCCGGCTGTGCGTTGGCGGTATAGCCGA > NC_002947/2396243‑2396532 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |