Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,215,672 | C→G | 8.0% | L529L (CTC→CTG) ‡ | mexD → | multidrug RND transporter MexD |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,215,672 | 0 | C | G | 8.0% | 190.4 / 3.8 | 61 | L529L (CTC→CTG) ‡ | mexD | multidrug RND transporter MexD |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (30/26); new base G (2/3); total (32/29) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.62e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CCTGGCCCTGACCTTCACCCCGGCGCTGTGCGCCACGCTGCTCAAGCCGGTGCCCCATGGCCACCATGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGGCATCCTGGTGGTGCTGGGCTATTCCTACCTGCGCTTGCCGGAGGCCTTCGTGCCGGCCGAGGACCTTGGCTATAGCGTCGTGGATGTGCAGTTGC > NC_002947/3215537‑3215817 | ccTGGCCCTGACCTTCACCCCGGCGCTGTGCGCCACGCTGCTCAAGCCGGTGCCCCATGGCCACCATGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGTTGAGCGGCGaatag < 2:273588/148‑4 (MQ=255) cTGGCCCTGACCTTCACCCCGGCGCTGTGCGCCACGCTGCTCAAGCCGGTGCCCCATGGCCACCATGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACtggt < 1:203285/149‑1 (MQ=255) ggCCCTGACCTTCACCCCGGCGCTGTGCGCCACGCTGCTCAAGCCGGTGCCCCATGGCCACCATGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACtggtg‑g > 6:222532/1‑149 (MQ=255) ccTGACCTTCACCCCGGCGCTGTGCGCCACGCTGCTCAAGCCGGTGCCCCATGGCCACCATGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGTTGAGCAGCGaatagcgtt < 7:231879/146‑8 (MQ=255) ccTGACCTTCACCCCGGCGCTGTGCGCCACGCTGCTCAAGCCGGTGCCCCATGGCCACCATGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGTTGAGCAGCGaatagcgtt > 8:231879/1‑139 (MQ=255) ccTGACCTTCACCCCGGCGCTGTGCGCCACGCTGCTCAAGCCGGTGCCCCATGGCCACCATGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTc > 4:2500/1‑130 (MQ=255) ccTGACCTTCACCCCGGCGCTGTGCGCCACGCTGCTCAAGCCGGTGCCCCATGGCCACCATGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTc < 3:2500/130‑1 (MQ=255) cccGGCGCTGTGCGCCACGCTGCTCAAGCCGGTGCCCCATGGCCACCATGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACa < 8:61835/122‑1 (MQ=255) cccGGCGCTGTGCGCCACGCTGCTCAAGCCGGTGCCCCATGGCCACCATGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACa > 7:61835/1‑122 (MQ=255) cccGGCGCTGTGCGCCACGCTGCTCAAGCCGGTGCCCCATGGCCACCATGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGaata > 7:175505/1‑127 (MQ=255) cccGGCGCTGTGCGCCACGCTGCTCAAGCCGGTGCCCCATGGCCACCATGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGaata < 8:175505/129‑3 (MQ=255) ccGGCGCTGTGCGCCACGCTGCTCAAGCCGGTGCCCCATGGCCACCATGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTg > 5:305562/1‑149 (MQ=255) cGGCGCTGTGCGCCACGCTGCTCAAGCCGGTGCCCCATGGCCACCATGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTgg < 4:305320/149‑1 (MQ=255) tgtgCGCCACGCTGCTCAAGCCGGTGCCCCATGGCCACCATGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTg > 8:93960/1‑149 (MQ=255) cgcCACGCTGCTCAAGCCGGTGCCCCATGGCCACCATGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTgccggcc < 7:25448/134‑1 (MQ=255) cgcCACGCTGCTCAAGCCGGTGCCCCATGGCCACCATGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTgccggcc > 8:25448/1‑134 (MQ=255) cgcCACGCTGCTCAAGCCGGTGCCCCATGGCCACCATGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCg > 7:99037/1‑148 (MQ=255) cgcCACGCTGCTCAAGCCGGTGCCCCATGGCCACCATGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCg > 6:284185/1‑148 (MQ=255) ccACGCTGCTCAAGCCGGTGCCCCATGGCCACCATGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTAt > 3:78234/1‑149 (MQ=255) aCGCTGCTCAAGCCGGTGCCCCATGGCCACCATGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTAtgt < 2:59537/149‑1 (MQ=255) aCGCTGCTCAAGCCGGTGCCCCATGGCCACCATGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTAtgt < 5:62739/149‑1 (MQ=255) gctgctCAAGCCGGTGCCCCATGGCCACCATGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTgg < 7:93960/149‑1 (MQ=255) ctgctCAAGCCGGTGCCCCATGGCCACCATGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTGCGCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTgg < 1:44417/149‑1 (MQ=255) ctCAAGCCGGTGCCCCATGGCCACCATGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGt > 3:63396/1‑139 (MQ=255) ctCAAGCCGGTGCCCCATGGCCACCATGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGt < 4:63396/139‑1 (MQ=255) tCAAGCCGGTGCCCCATGGCCACCATGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGGCATc > 3:276910/1‑149 (MQ=255) cAAGCCGGTGCCCCATGGCCACCATGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGGCATcc > 4:110570/1‑149 (MQ=255) aaGCCGGTGCCCCATGGCCACCATGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGGCATc < 8:99037/147‑1 (MQ=255) aaGCCGGTGCCCCATGGCCACCATGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGGCATCCt > 5:202427/1‑149 (MQ=255) cGGTGCCCCATGGCCACCATGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGGCATCCtggtg < 5:284185/149‑1 (MQ=255) cccATGGCCACCATGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGGCATCCTGGTGGTGCTg < 6:305562/149‑1 (MQ=255) ccATGGCCACCATGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGGCATCCTGGTGGTGCTgg > 4:267044/1‑149 (MQ=255) cATGGCCACCATGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGGCATCCTGGTGGTGCTggg > 4:28920/1‑149 (MQ=255) ccaccaTGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGGCATCCTGGTGGTGCTGGGCTAtt < 4:276910/149‑1 (MQ=255) caccaTGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGGCATCCTGGTGGTGCTGGGCTATTc > 8:115054/1‑149 (MQ=255) ccaTGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGGCATCCTGGTGGTGCTGGGCTATTcc > 6:183526/1‑148 (MQ=255) caTGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGGCATCCTGGTGGTGCTGGGCTATTCCTa > 6:187001/1‑149 (MQ=255) aaaaGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGGCATCCTGGTGGTGCTGGGCTATTCCTACCt < 7:115054/148‑1 (MQ=255) aaaGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGGCATCCTGGTGGTGCTGGGCTATTCCTACCTg < 4:120763/148‑1 (MQ=255) aGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGGCATCCTGGTGGTGCTGGGCTATTCCTACCTgcgc > 2:193098/1‑149 (MQ=255) cTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGACATCCTGGTGGTGCTGGGCTATTCCTACCTGCGCTTGCCGGAGGCCTTCGTgc > 1:122938/1‑149 (MQ=255) ttCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCAGTGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGGCATCCTGGTGGTGCTGGGCTATTCCTACCTGCGCTTGCCGGAGGCCTTCGTgc > 1:258024/1‑149 (MQ=255) ttCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGGCATCCTGGTGGTGCTGGGCTATTCCTACCTGCGCTTGCCGGAGGCCTTCGTgcc > 6:218390/1‑149 (MQ=255) tCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGGCATCCTGGTGGTGCTGGGCTATTCCTACCTGCGCTTGCCGGAGGCCTTCGTgccg > 2:223135/1‑149 (MQ=255) tCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGAGTATGTGGGCATCCTGGTGGTGCTGGGCTATTCCTACCTGCGCTTGCCGGAGGCCTTCGTgccg > 5:217279/1‑149 (MQ=255) gTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGGCATCCTGGTGGTGCTGGGCTATTCCTACCTGCGCTTGCCGGAGGCCTTCGTGCCGGCCGAg < 5:183526/149‑1 (MQ=255) gCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGGCATCCTGGTGGTGCTGGGCTATTCCTACCTGCGCTTGCCGGAGGCCTTCGTGCCGGCCGAGGAc < 5:187001/149‑1 (MQ=255) cTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGGCATCCTGGTGGTGCTGGGCTATTCCTACCTGCGCtt < 1:74022/120‑1 (MQ=255) cTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGGCATCCTGGTGGTGCTGGGCTATTCCTACCTGCGCtt > 2:74022/1‑120 (MQ=255) gtCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGGCATCCTGGTGGTGCTGGGCTATTCCTAc > 4:241585/1‑102 (MQ=255) gtCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGGCATCCTGGTGGTGCTGGGCTATTCCTAc < 3:241585/102‑1 (MQ=255) ccGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGGCATCCTGGTGGTGCTGGGCTATTCCTACCTGCGCTTGCCGGAGGCCTTCGTGCCGGCCGAGGACCTTGGCTATAGcgtc > 6:256745/1‑149 (MQ=255) gAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGACATCCTGGTGGTGCTGGGCTATTCCTACCTGCGCTTGCCGGAGGCCTTCGTGCCGGCCGAGGACCTTGGCTATAGcgtcgt < 2:122938/149‑1 (MQ=255) aCGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGGCATCCTGGTGGTGCTGGGCTATTCCTACCTGCGCTTGCCGGAGGCCTTCGTGCCGGCCGAGGACCTTGGCTATAGCGTCGTgg < 5:222532/149‑1 (MQ=255) aCGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGGCATCCTGGTGGTGCTGGGCTATTCCTACCTGCGCTTGCCGGAGGCCTTCGTGCCGGCCGAGGACCTTGGCTATAGCGTCGTgg < 2:258024/149‑1 (MQ=255) aCGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGGCATCCTGGTGGTGCTGGGCTATTCCTACCTGCGCTTGCCGGAGGCCTTCGTGCCGGCCGAGGACCTTGGCTATAGCGTCGTgg < 3:81965/149‑1 (MQ=255) cGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGGCATCCTGGTGGTGCTGGGCTATTCCTACCTGCGCTTGCCGGAGGCCTTCGTGCCGGCCGAGGACCTTGGCTATAGCGTCGTGGa > 3:246462/1‑149 (MQ=255) gCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGGCATCCTGGTGGTGCTGGGCTATTCCTACCTGCGCTTGCCGGAGGCCTTCGTGCCGGCCGAGGACCTTGGCTATAGCGTCGTGGAt < 3:267044/149‑1 (MQ=255) agttCGCTGTTGAGCAGCGAAATGGTG‑TCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATTCTGGCGTATGTGTGCATCCTGGTGGTGGTGGGCTATTCCTACCTGCGCTTGCCGGAGGCCTTCGTGCCGGCCGAGGACCTTGGCTGTAGCGTCGTgg < 6:16532/143‑1 (MQ=255) agttCGCTGTTGACCAGCGAACTGGTT‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGGCATCCTGGTGGTGCTGGGCTATTCCTACCTGCGCTTGCCGGAGGCATTCGTGCCGGCCGAGGACCTTGGCTGTAGAGTCGTGGaag > 5:16532/3‑146 (MQ=255) gctgctCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGGCATCCTGGTGGTGCTGGGCTATTCCTACCTGCGCTTGCCGGAGGCCTTCGTGCCGGCCGAGGACCTTGGCTATAGCGTCGTGGATGTGCAGt > 5:251816/1‑149 (MQ=255) ctCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGGCATCCTGGTGGTGCTGGGCTATTCCTACCTGCGCTTGCCGGAGGCCTTCGTGCCGGCCGAGGACCTTGGCTATAGCGTCGTGGATGTGCAGTTg < 3:110570/147‑1 (MQ=255) ctCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGGCATCCTGGTGGTGCTGGGCTATTCCTACCTGCGCTTGCCGGAGGCCTTCGTGCCGGCCGAGGACCTTGGCTATAGCGTCGTGGATGTGCAGTTGc > 6:273523/1‑148 (MQ=255) | CCTGGCCCTGACCTTCACCCCGGCGCTGTGCGCCACGCTGCTCAAGCCGGTGCCCCATGGCCACCATGAAAAGGCCGGTTTCTTCGGCGCCTTCAACCGTGGCTTCGCCCGTGTCACCGAACGCTATTCGCTGCTCAACAGCGAACTGGTG‑GCA‑CGTGCCGGCCGCTGGATGCTGGCGTATGTGGGCATCCTGGTGGTGCTGGGCTATTCCTACCTGCGCTTGCCGGAGGCCTTCGTGCCGGCCGAGGACCTTGGCTATAGCGTCGTGGATGTGCAGTTGC > NC_002947/3215537‑3215817 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |