| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,820,992 | T→G | 5.9% | M297L (ATG→CTG) | ptxD ← | phosphonate dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,820,992 | 0 | T | G | 5.9% | 196.0 / 2.2 | 62 | M297L (ATG→CTG) | ptxD | phosphonate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (26/32); new base G (2/2); total (28/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CGGGGTATCGCAAGGCAGGCAACTGCCGCTGACCGT‑TTCAAAGGCTGCGCGGCCCCTGTGGGAGCGGGGGCGCGTCAGCCGTTGACCAGGTTTACCGGCCGCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAGCGGCGAGTCGATCGGCAGTGGCTCGTGCACGAACACGTCCAGCCCCGCACCGCGGATGCGCCTGGCCCGCAGCGCTTCG > NC_002947/3820844‑3821140 | cGGGGTATCGCAAGGCAGGCAACTGCCGCTGACCGT‑TTCAAAGGCTGCGCGGCCCCTGTGGGAGCGGGGGCGCGTCAGCCGTTGACCAGGTTTACCGGCCGCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCAt > 7:239043/1‑149 (MQ=255) cGCAAGGCAGGCAACTGCCGCTGACCGTGTTCAAAGGCTGCGCGGCCCCTGTGGGAGCGGGGGCGCGTCAGCCGTTGACCAGGTTTACCGGCCGCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTgg > 1:182609/1‑149 (MQ=255) gCAAGGCAGGCAACTGCCGCTGACCGT‑TTCAAAGGCTGCGCGGCCCCTGTGGGAGCGGGGGCGCGTCAGCCGTTGACCAGGTTTACCGGCCGCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGc < 6:114332/148‑1 (MQ=255) cAAGGCAGGCAACTGCCGCTGACCGT‑TTGAAAGGCTGCGCGGCCCCTGTGGGAGCGGGGGCGCGTCAGCCGTTGACCAGGTTTACCGGCCGCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCgg > 1:182956/1‑149 (MQ=255) cAAGGCAGGCAACTGCCGCTGACCGT‑TTCAAAGGCTGCGCGGCCCCTGTGGGAGCGGGGGCGCGTCAGCCGTTGACCAGGTTTACCGGCCGCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCgg < 8:239043/149‑1 (MQ=255) aggcaggcAACTGCCGCTGACCGT‑TTCAAAGGCTGCGCGGCCCCTGTGGGAGCGGGGGCGCGTCAGCCGTTGACCAGGTTTACCGGCCGCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGt > 1:98627/1‑149 (MQ=255) ggcaggcaACTGGCGCTGACCGT‑TTCAAAGGCTGCGCGGCCCCTGTGGGAGCGGGGGCGGGTCAGCCGTTGACCAGGTTTACCGGCCGCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGtt < 2:182609/149‑1 (MQ=255) caACTGCCGCTGACCGT‑TTCAAAGGCTGCGCGGCCCCTGTGGGAGCGGGGGCGCGTCAGCCGTTGACCAGGTTTACCGGCCGCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCg < 5:115072/149‑1 (MQ=255) caACTGCCGCTGACCGT‑TTCAAAGGCTGCGCGGCCCCTGTGGGAGCGGGGGCGCGTCAGCCGTTGACCAGGTTTACCGGCCGCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGACCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCg < 7:60097/149‑1 (MQ=255) ccGCTGACCGT‑TTCAAAGGCTGCGCGGCCCCTGTGGGAGCGGGGGCGCGTCAGCCGTTGACAAGGTTTACCTGCCGCTCACCGGCCATCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAAAGCGCCATGGCCTGGCGGCTTTCCTCGGTCgcc > 8:219693/1‑149 (MQ=255) ccGT‑TTCAAAGGCTGCGCGGCCCCTGTGGGAGCGGGGGCGCGTCAGCCGTTGACCAGGTTTACCGGCCGCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCGCCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCgccgagccga > 4:7028/1‑149 (MQ=255) cGT‑TTCAAAGGCTGCGCGGCCCCTGTGGGAGCGGGGGCGCGTCAGCCGTTGACCAGGTTTACCGGCCGCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCgccgagccga > 1:211708/1‑148 (MQ=255) cGT‑TTCAAAGGCTGCGCGGCCCCTGTGGGAGCGGGGGCGCGTCAGCCGTTGACCAGGTTTACCGGCCGCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCgccgagccga > 4:304315/1‑148 (MQ=255) gcgGCCCCTGTGGGAGCGGGGGCGCGTCAGCCGTTGACCAGGTTTACCGGCCGCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTAc < 2:98627/149‑1 (MQ=255) ggCCCCTGTGGGAGCGGGGGCGCGTCAGCCGTTGACCAGGTTTACCGGCCGCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCa < 2:320030/149‑1 (MQ=255) gCCCCTGTGGGAGCGGGGGCGCGTCAGCCGTTGACCAGGTTTACCGGCCGCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCAc > 5:186014/1‑149 (MQ=255) gCCCCTGTGGGAGCGGGGGCGCGTCAGCCGTTGACCAGGTTTACCGGCCGCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGGCGCTACCAc < 3:189833/149‑1 (MQ=255) ccccTGTGGGAGCGGGGGCGCGTCAGCCGTTGACCAGGTTTACCGGCCGCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACg < 2:182956/149‑1 (MQ=255) gggAGCGGGGGCGCGTCAGCCGTTGACCAGGTTTACCGGCCGCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATc > 4:239168/1‑147 (MQ=255) gggAGCGGGGGCGCGTCAGCCGTTGACCAGGTTTACCGGCCGCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATc < 3:239168/147‑1 (MQ=255) gcgcGTCAGCCGTTGACCAGGTTTACCGGCCGCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAg > 3:27386/1‑149 (MQ=255) gTCAGCCGTTGACCAGGTTTACCGGCCGCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAgcggc < 2:211708/149‑1 (MQ=255) cAGCCGTTGACCAGGTTTACCGGCCGCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCgg > 2:208416/1‑113 (MQ=255) cAGCCGTTGACCAGGTTTACCGGCCGCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCgg < 1:208416/113‑1 (MQ=255) aGCCGTTGACCAGGTTTACCGGCCGCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAGCGGCGa < 3:215905/148‑1 (MQ=255) aGCCGTTGACCAGGTTTACCGGCCGCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGGCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAGCGGCGAg < 8:47315/149‑1 (MQ=255) aGCCGTTGACCAGGTTTACCGGCCGCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCAGGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAGCGGCGAg < 8:43229/149‑1 (MQ=255) gCCGTTGACCAGGTTTACCGGCCGCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAGCGGCGAGt < 3:304315/149‑1 (MQ=255) gTTGACCAGTTTTACCGTCCGCTCACCGGCCAGTTCGATGAGCAGGTTGTCAACCGCTCAACGCGCCATGGCCTGGCTGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAGCGGCGAGTCGa < 7:219693/149‑1 (MQ=255) ctgaGGTTTAACGGGCTGTCACGGGCCTGCGCGCTGAGCTGGTTGTCAACCGCTCAACGCGCCATGGCCTGGTGGGTTTGCTCGGTCGGCGAGCGGATATGGGGGGTCGCTACCAGTTTATCCTGCTGCTTGAGCGGGGAGTCGATCg < 4:38795/145‑1 (MQ=255) aCCAGGTTTACCGGCCGCTCACAGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAGCGGCGAGTCGATCgg > 4:311277/1‑149 (MQ=255) ccAGGTTTACCGGCCGCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCt > 5:52131/1‑126 (MQ=255) ccAGGTTTACCGGCCGCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCt < 6:52131/126‑1 (MQ=255) aGGTTTACCGGCCGCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGCGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAGCGGCGAGTCGATCg > 3:38795/1‑145 (MQ=255) ccGGCCGCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAGCGGCGAGTCGATCGGCAGTGGCTCg > 1:157745/1‑149 (MQ=255) cGGCCGCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAgc > 6:63297/1‑124 (MQ=255) cGGCCGCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAgc < 5:63297/124‑1 (MQ=255) ccGCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCGCCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCGACAGCGGCGAGTCGATCGGCAGTGGCTCGTGCa < 3:7028/149‑1 (MQ=255) gCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAGCGGCGAGTCGATCGGCAGTGGCTCGTGCACg < 2:157745/149‑1 (MQ=255) cGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAGCGGCGAGTCGATCGGCAGTGGCTCGTGCACGAACACg > 4:78423/1‑149 (MQ=255) cGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAGCGGCGAGTCGATCGGCAGTGGCTCGTGCACGAACACg > 7:45491/1‑149 (MQ=255) gCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAGCGGCGAGTCGATCGGCAGTGGCTCGTGCACGAACACGTc < 3:78423/149‑1 (MQ=255) ccAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAGCGGCGAGTCGATCGGCAGTGTATCGTGCACGAACACGTcc < 4:27386/149‑1 (MQ=255) cAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATCCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAGCGGCGAGTCGATCGGCAGTGGCTCGTGCACGAACACGTCCa > 4:245225/1‑149 (MQ=255) gcgcTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAGCGGCGAGTCGATCGGCAGTGGCTCGTGCACGAACACGTCCAGccc > 2:174850/1‑149 (MQ=255) gcTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAGCGGCGAGTCGATCGGCAGTGGCTCGTGCACGAACACGTCCAGCCCCg > 3:142277/1‑149 (MQ=255) tGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAGCGGCGAGTCGATCGGCAGTGGCTCGTGCACGAACACGTCCAGCCCCGCa > 3:25709/1‑149 (MQ=255) gTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAGCGGCGAGTCGATCGGCAGTGGCTCGTGCACGAACACGTCCAGCCCCGCACCGCGGa > 4:141469/1‑149 (MQ=255) gTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAGCGGCGAGTCGATCGGCAGTGGCTCGTGCACGAACACGTCCAGCCCCGCACCGCGGa < 1:174850/149‑1 (MQ=255) ttGTCCTCCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTAGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAGCGGCGAGTCGATCGGCAGTGGCTCGTGCACGAACACGTCCAGCCCCGCACCGCGGAt < 1:233934/149‑1 (MQ=255) tCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAGCGGCGAGTCGATCGGCAGTGGCTCGTGCACGAACACGTCCAGCCCCGCACCGCGGATgc < 6:186014/148‑1 (MQ=255) gaggaaaCCCGCCAGGCCATGGCGCGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAGCGGCGAGTCGATCGGCAGTGGCTCGTGCACGAACACGTCCAGCCCCGCACCGCGGATGCGCCTgg > 2:18945/6‑149 (MQ=255) cgcgCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAGCGGCGAGTCGATCGGCAGTGGCTCGTGCACGAACACGTCCAGCCCCGCACCGCGGATGCGCCt > 6:124077/1‑147 (MQ=255) cgcgCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAGCGGCGAGTCGATCGGCAGTGGCTCGTGCACGAACACGTCCAGCCCCGCACCGCGGATGCGCCt < 5:124077/147‑1 (MQ=255) gcgcAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAGCGGCGAGTCGATCGGCAGTGGCTCGt < 4:192040/109‑1 (MQ=255) gcgcAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAGCGGCGAGTCGATCGGCAGTGGCTCGt > 3:192040/1‑109 (MQ=255) ctcagcgcgCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAGCGGCGAGTCGATCGGCAGTGGCTCGTGCACGAACACGTCCAGCCCCGCACCGCGGATGCGCCTGGc < 6:56583/143‑1 (MQ=255) gcAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAGCGGCGAGTCGATCGGCAGTGGCTCGTGCACGAACACGTCCAGCCCCGCACCGCGGATgcgc > 6:285288/1‑142 (MQ=255) gcAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAGCGGCGAGTCGATCGGCAGTGGCTCGTGCACGAACACGTCCAGCCCCGCACCGCGGATgcgc < 5:285288/142‑1 (MQ=255) aaCCCGCCAGGCCATGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAGCGGCGAGTCGATCGGCAGTGGCTCGTGCACGAACACGTCCAGCCCCGCACcgc < 6:180918/132‑1 (MQ=255) aaCCCGCCAGGCCATGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAGCGGCGAGTCGATCGGCAGTGGCTCGTGCACGAACACGTCCAGCCCCGCACcgc > 5:180918/1‑132 (MQ=255) gcgcCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAGCGGCGAGTCGATCGGCAGTGGCTCGTGCACGAACACGTCCAGCCCCGCACCGCGGATGCGCCTGGCCCGCAgc < 3:311277/149‑1 (MQ=255) cgcCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAGCGGCGAGTCGATCGGCAGTGGCTCGTGCACGAACACGTCCAGCCCCGCACCGCGGATGCGCCTGGCCCGCAgcg < 4:25709/149‑1 (MQ=255) tGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAGCGGCGAGTCGATCGGCAGTGGCTCGTGCACGAACACGTCCAGCCCCGCACCGCGGATGCGCCTGGCCCGCAGCGCTTCg < 7:20747/149‑1 (MQ=255) | CGGGGTATCGCAAGGCAGGCAACTGCCGCTGACCGT‑TTCAAAGGCTGCGCGGCCCCTGTGGGAGCGGGGGCGCGTCAGCCGTTGACCAGGTTTACCGGCCGCTCACCGGCCAGCGCGCTGAGCAGGTTGTCCACCGCGCAACGCGCCATGGCCTGGCGGGTTTCCTCGGTCGCCGAGCCGATATGCGGGGTCGCTACCACGTTATCCAGCTGCAACAGCGGCGAGTCGATCGGCAGTGGCTCGTGCACGAACACGTCCAGCCCCGCACCGCGGATGCGCCTGGCCCGCAGCGCTTCG > NC_002947/3820844‑3821140 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |