Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,000,135 | C→T | 6.6% | Q274* (CAG→TAG) ‡ | PP_3528 → | ABC transporter substrate‑binding protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,000,135 | 0 | C | T | 6.6% | 172.9 / 2.3 | 60 | Q274* (CAG→TAG) ‡ | PP_3528 | ABC transporter substrate‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (28/28); new base T (2/2); total (30/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.69e-01 |
CTTCTACCTGTCCACAGCCAGCTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTACAGGTGGCCGAAGCGGTCTACC > NC_002947/3999987‑4000282 | cTTCTACCTGTCCACAGCCAGCTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCAccc < 3:46642/149‑1 (MQ=255) cTACCTGTCCACAGCCAGCTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAg < 4:203583/148‑1 (MQ=255) tACCTGTCCACAGCCAGCTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGt > 7:29359/1‑149 (MQ=255) tGTCCACAGCCAGCTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTg > 7:219607/1‑149 (MQ=255) gTCCACAGCCAGCTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTg > 3:238793/1‑148 (MQ=255) cacaGCCAGCTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAg > 4:20989/1‑149 (MQ=255) cagccagcTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTg < 5:19880/149‑1 (MQ=255) cagccagcTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTg < 2:181531/149‑1 (MQ=255) agccagcTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTgg < 2:171526/149‑1 (MQ=255) agccagcTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTgg > 5:141649/1‑149 (MQ=255) ccagcTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGcc < 1:45674/149‑1 (MQ=255) agcTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCAGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAg > 6:138887/1‑149 (MQ=255) gcTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGc > 2:261080/1‑149 (MQ=255) cTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCg < 8:29359/149‑1 (MQ=255) ccGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACg < 8:125550/148‑1 (MQ=255) cACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTa < 3:105566/149‑1 (MQ=255) ctgAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACACCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGc < 4:308928/149‑1 (MQ=255) aaCCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCa < 5:193070/149‑1 (MQ=255) aaCCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCa < 4:238793/149‑1 (MQ=255) ttcttTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCAcccc > 1:136040/1‑149 (MQ=255) tcttTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCAAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCg > 3:282161/1‑149 (MQ=255) cGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCg > 7:166424/1‑149 (MQ=255) cGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCg > 3:86708/1‑149 (MQ=255) gCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTg < 2:136040/149‑1 (MQ=255) gggCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGcc > 7:65372/1‑148 (MQ=255) cAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGaac < 3:20989/149‑1 (MQ=255) cAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGaac < 4:86708/149‑1 (MQ=255) ggTCTGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACACCGCAGATCGTTGCCGaacaa > 6:64252/1‑148 (MQ=255) aGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAg > 2:60926/1‑147 (MQ=255) aGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAgctg < 1:60926/149‑1 (MQ=255) ggCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAgctggct < 5:138887/148‑1 (MQ=255) ggCCAACGCCAAGCCTGCCAAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAgctggct < 4:282161/148‑1 (MQ=255) ccAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCa < 6:94450/118‑1 (MQ=255) ccAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCa > 5:94450/1‑118 (MQ=255) cAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGaca > 6:199439/1‑149 (MQ=255) gcaaaGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCTGGGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCt > 1:228729/4‑149 (MQ=255) aaGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTc > 2:259755/1‑147 (MQ=255) ccGAAGTGGCCGCGCTGCAGGCACCGCAGAT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGAGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCAGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAACCTGGCTGACACCTTCCAggccctg > 8:223797/1‑149 (MQ=255) aaGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAgggcctgggc > 7:98733/1‑149 (MQ=255) ctgGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCaa < 8:166424/149‑1 (MQ=255) ggCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGc > 8:32911/1‑149 (MQ=255) gCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGc > 2:227415/1‑148 (MQ=255) gCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGc < 8:98733/148‑1 (MQ=255) gCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGc > 8:170856/1‑148 (MQ=255) gCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCATGATTCCACGCAAGc > 7:237256/1‑148 (MQ=255) aCCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTa > 3:174384/1‑148 (MQ=255) cAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTACAGGt > 1:114127/1‑149 (MQ=255) aGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTACAGGTg < 7:170856/149‑1 (MQ=255) gCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAgg > 6:188613/1‑116 (MQ=255) gCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAgg < 5:188613/116‑1 (MQ=255) cT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTACAGGTg < 8:65372/147‑1 (MQ=255) ccacttccAGCACCTGGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTAc > 6:306774/8‑141 (MQ=255) ccacttccAGCACCTGGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTAc < 5:306774/134‑1 (MQ=255) gggATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTACAGGTGGCCg < 5:199439/148‑1 (MQ=255) acttccAGCACCTGGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGa < 6:235830/96‑1 (MQ=255) acttccAGCACCTGGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGa > 5:235830/6‑101 (MQ=255) tCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTACAGGTGGCCGAAGCg < 1:227415/149‑1 (MQ=255) cAGGACCCAGGTGCTTGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTACAGGTGGCCGAAGCg < 7:223797/148‑1 (MQ=255) cAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCaa < 6:83243/129‑1 (MQ=255) cAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCaa > 5:83243/1‑129 (MQ=255) aGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTACAGGTGGCCGAAGCgg < 2:228729/148‑1 (MQ=255) cccAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTACAGGTGGCCGAAGCGGTCTAc > 1:57561/1‑149 (MQ=255) ccAGGTGCTGGACGTGGCCAGCTAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGATATCACCCCGCAGATCGTTGCCTAAATACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAgggcctgggc < 1:47601/109‑1 (MQ=255) ccAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAgggcctgggc > 2:47601/1‑109 (MQ=255) ccAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTACAGGTGGCCGAAGCGGTCTAcc > 1:219122/1‑149 (MQ=255) | CTTCTACCTGTCCACAGCCAGCTTTGCCGACCAGCACCGTGCTCTGCTGAAAACCTTCTTTGCCGAGCTGGGCAAGGTCAGCCAGTGGGCCAACGCCAAGCCTGCCGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCACCGCAGCT‑GGGGATCAGCACCCAGGTGCTGGAAGTGGCCAGCGAACGGCGCAACTACAACGCCGTCGCTATCACCCCGCAGATCGTTGCCGAACAACAGAAGCTGGCTGACACCTTCCAGGGCCTGGGCCTGATTCCACGCAAGCTACAGGTGGCCGAAGCGGTCTACC > NC_002947/3999987‑4000282 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |