Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,244,358 | G→C | 7.6% | S221R (AGC→AGG) | aruH ← | arginine‑‑pyruvate transaminase AruH |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,244,358 | 0 | G | C | 7.6% | 205.8 / 6.4 | 66 | S221R (AGC→AGG) | aruH | arginine‑‑pyruvate transaminase AruH |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (27/34); new base C (2/3); total (29/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.99e-01 |
GCCGTAGAGCATGCACAGGGCGAGGTTTTCCAGATGCGTGGCCAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTCCCAGGTGGCGCGCGG‑CAGGCTCGCCCCTGAAGGGTTGTGCGGG > NC_002947/4244214‑4244502 | gCCGTAGAGCATGCACAGGGCGAGGTTTTCCAGATGCGTGGCCAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGc > 1:121595/1‑149 (MQ=255) gTAGAGCATGCACAGGGCGAGGTTTTCCAGATGCGTGGCCAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCgg > 3:102764/1‑149 (MQ=255) agagCATGCACAGGGCGAGGTTTTCCAGATGCGTGGCCAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCgggg > 5:14943/1‑149 (MQ=255) cATGCACAGGGCGAGGTTTTCCAGATGCGTGGCCAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGa < 5:2940/149‑1 (MQ=255) cATGCACAGGGCGAGGTTTTCCAGATGCGTGGCCAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGCCTGCCgggcatgg < 5:80022/149‑6 (MQ=255) aTGCACAGGGCGAGGTTTTCCAGATGCGTGGCCAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGAc < 2:89361/149‑1 (MQ=255) cacaGGGCGAGGTTTTCCAGATGCGTGGCCAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCTGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATg < 7:208358/149‑1 (MQ=255) acaGGGCGAGGTTTTCCAGATGCGTGGCCAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGCCTGCCgggc > 4:53976/1‑139 (MQ=255) acaGGGCGAGGTTTTCCAGATGCGTGGCCAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGCCTGCCgggc < 3:53976/140‑2 (MQ=255) acaGGGCGAGGTTTTCCAGATGCGTGGCCAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGCCATCCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGAGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATg > 2:309218/1‑148 (MQ=255) aGGGCGAGGTTTTCCAGATGCGTGGCCAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTc > 7:12544/1‑149 (MQ=255) aGGGCGAGGTTTTCCAGATGCGTGGCCAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTc < 6:14943/149‑1 (MQ=255) ggCGAGGTTTTCCAGATGCGTGGCCAGTNCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGc > 1:183891/1‑149 (MQ=255) ggCGAGGTTTTCCAGATGCGTGGCCAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGCCTGCCgggcat > 6:184069/1‑135 (MQ=255) ggCGAGGTTTTCCAGATGCGTGGCCAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGCCTGCCgggcat < 5:184069/138‑4 (MQ=255) ccAGATGCGTGGCCAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATAcag > 5:38807/1‑148 (MQ=255) cAGATGCGTGGCCAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATAcagca < 6:279681/149‑1 (MQ=255) gTGGCCAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCt > 1:193382/1‑149 (MQ=255) ccAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGa < 7:120976/117‑1 (MQ=255) ccAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGa > 8:120976/1‑117 (MQ=255) tGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGt < 8:223115/149‑1 (MQ=255) gTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGt > 1:135258/1‑148 (MQ=255) tCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATTGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTc < 6:142622/148‑1 (MQ=255) tCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCa < 6:258116/149‑1 (MQ=255) acGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCa < 6:225698/148‑1 (MQ=255) gAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCaga < 4:262290/149‑1 (MQ=255) ccGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGAt < 2:183891/149‑1 (MQ=255) gACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGAt > 6:180282/1‑147 (MQ=255) accaccCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAg > 1:137741/1‑149 (MQ=255) cacccaccCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGc > 5:260695/1‑148 (MQ=255) acccacccCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCca < 2:137741/149‑1 (MQ=255) ccacccCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTc > 5:237203/1‑102 (MQ=255) ccacccCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTc < 6:237203/102‑1 (MQ=255) ccacccCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCca > 6:289520/1‑147 (MQ=255) ccacccCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCca > 8:128102/1‑147 (MQ=255) acccCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGa < 2:113007/149‑1 (MQ=255) cccATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTAATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGAt > 6:260123/1‑148 (MQ=255) ccATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCa > 7:182300/1‑149 (MQ=255) cATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATAca > 8:26838/1‑107 (MQ=255) cATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATAca < 7:26838/107‑1 (MQ=255) aTGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATg < 2:193382/149‑1 (MQ=255) tGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATgg < 2:135258/149‑1 (MQ=255) cAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAAc < 8:12544/149‑1 (MQ=255) cAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAAc < 4:102764/149‑1 (MQ=255) ggTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATgg < 1:288890/139‑1 (MQ=255) ggTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATgg > 2:288890/1‑139 (MQ=255) gTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAg > 2:68251/1‑149 (MQ=255) tGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGAGCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAg > 2:119379/1‑149 (MQ=255) cGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGATATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAgc < 1:309218/148‑1 (MQ=255) cGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAgcg < 6:38807/149‑1 (MQ=255) aTTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGcc > 8:4321/1‑149 (MQ=255) gACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTcc > 8:130270/1‑147 (MQ=255) gACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTCCCa < 1:68251/149‑1 (MQ=255) aaCGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTCCCAGGTGGcgcgcg < 5:289520/148‑1 (MQ=255) aaCGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCACCTGGGAGgcgctgg < 5:180282/148‑4 (MQ=255) aaCGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGACCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTCCCAGGTGGCGCGCgg > 6:194399/1‑149 (MQ=255) tcGTTGCAGTGCGCTGGGCCATGCCCGGCAGGGTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATTCAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGACACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTCCCAGGTg < 2:71681/139‑1 (MQ=255) aCGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTCCCAGGTGGCGCGCGG‑c < 7:4321/149‑1 (MQ=255) aCGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCACCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTCCCAGGTggagatagg > 1:71681/1‑141 (MQ=255) gTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTCCCAGGTGGCGCGCGG‑CAg < 7:130270/149‑1 (MQ=255) cAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGACCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTCCCAGGTGGCGCGCGG‑CAGGCt < 5:194399/148‑1 (MQ=255) ggCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTCCCAGGTGGCGCGCGG‑CAGGCTCGCCCCTGaa < 2:121595/148‑1 (MQ=255) gCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTCCCAGGTGGCGCGCGG‑CAGGCTCGCCCCTGAAgg < 7:128102/149‑1 (MQ=255) ccGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTCCCAGGTGGCGCGCGG‑CAGGCTCGCCCCTGAAGGGTTGTGc > 2:18885/1‑149 (MQ=255) gCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTCCCAGGTGGCGCGCGG‑CAGGCTCGCCCCTGAAGGGTTGTGCggg < 6:260695/149‑1 (MQ=255) cAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTCCCAGGTGGCGCGCGGTCAGGCTCGCCCCTGAAGGGTTGTGCggg < 1:18885/149‑1 (MQ=255) | GCCGTAGAGCATGCACAGGGCGAGGTTTTCCAGATGCGTGGCCAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGCCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTCCCAGGTGGCGCGCGG‑CAGGCTCGCCCCTGAAGGGTTGTGCGGG > NC_002947/4244214‑4244502 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |