| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,843,996 | T→G | E266D (GAA→GAC) | gacS ← | sensor protein GacS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,843,996 | 0 | T | G | 100.0% | 88.4 / NA | 26 | E266D (GAA→GAC) | gacS | sensor protein GacS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (13/13); total (13/13) | |||||||||||
CTTTTTTGCAGCAGGTGGGTAAAGCCGAGGATGCCATTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAACTCCGACTTGATGCGGCTGGCCTCAAGTGCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTCGGCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTC > NC_002947/1843853‑1844137 | cTTTTTTGCAGCAGGTGGGTAAAGCCGAGGATGCCATTGCGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAACTCCGACTTGATGCGGCTGGCCTCAAGTGCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATGTCGa > 6:147090/1‑148 (MQ=255) ttttttGCAGCAGGTGGGTAAAGCCGAGGATGCCATTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAACTCCGACTTGATGCGGCTGGCCTCAAGTGCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATGTCGAt < 4:86796/148‑1 (MQ=255) ttttttGCAGCAGGTGGGTAAAGCCGAGGATGCCATTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAACTACGACTTGATGCGGCTGGCCTAAAGTGCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATGTCGAt > 7:48152/1‑148 (MQ=255) agcagGTGGGTAAAGCCGAGGATGCCATTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAACTCCGACTTGATGCGGCTGGCCTCAAGTGCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATGTCGATGGTTTCCa < 4:136979/148‑1 (MQ=255) gTGGGTAAAGCCGAGGATGCCATTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAACTCCGACTTGATGCGGCTGGCCTCAAGTGCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATGTCGATGGTTTCCAGGTTc < 8:87833/148‑1 (MQ=255) gCGGGGTGCGGATTTCGTGGCGCATGTTGGCCAGGAACTCCGACTTGATGCGGCTGGCCTCAAGTGCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATGTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGt < 1:104628/147‑1 (MQ=255) gggTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAACTCCGACTTGATGCGGCTGGCCTCAAGTGCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATGTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGAt < 4:143131/148‑1 (MQ=255) tGGCTCATGTTGGCCAGGAACTCCGACTTGATGCGGCTGGCCTCAAGTGCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATGTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTTGATGCTGTGTTGCAGtt < 2:119780/148‑1 (MQ=255) tGGCTCATGTTGGCCAGGAACTCCGACTTGATGCGGCTGGCCTCAAGTGCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATGTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGtt > 5:71709/1‑148 (MQ=255) ggCTCATGTTGGCCAGGAACTCCGACTTGATGCGGCTGGCCTCAAGTGCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATGTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGttc > 3:71262/1‑148 (MQ=255) tCATGTTGGCCAGGAACTCCGACTTGAGGCGGCTGGCCTCAAGTGCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATGTCGAGGGTTTCGAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGttcttc < 3:69856/148‑1 (MQ=255) gTTGGCCAGGAACTCCGACTTGATGCGGCTGGCCTCAAGTGCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATGTCGATGGTTTCCAGGGTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTgg < 5:105659/148‑1 (MQ=255) aaCTCCGACTTGATGCGGCTGGCCTCAAGTGCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCGCGATGTTCTGGATGTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCa < 1:102526/148‑1 (MQ=255) tCCGACTTGATGCGGCTGGCCTCAAGTGCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATGTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAggg > 5:75082/1‑148 (MQ=255) ccGACTTGATGCGGCTGGCCTCAAGTGCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATGTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGt > 7:6710/1‑148 (MQ=255) cTTGATGCGGCTGGCCTCAAGTGCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATGTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTCg > 3:100016/1‑148 (MQ=255) aTGCGGCTGGCCTCAAGTGCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATGTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTg > 6:107379/1‑125 (MQ=255) aTGCGGCTGGCCTCAAGTGCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATGTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTCGGCCa > 7:75785/1‑148 (MQ=255) tGCGGCTGGCCTCAAGTGCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATGTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTgg < 5:107379/125‑1 (MQ=255) ggCTGGCCTCAAGTGCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATGTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTCGGCCATGc < 7:76644/147‑1 (MQ=255) tGCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATGTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTCGGCCATGCGGTTGATGCCGTgg > 3:44027/1‑148 (MQ=255) ccTCTTTGCGCGCCATGGCCAGCTCGATGTTCTGGATGTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTCGGCCATGCGGTTGATGCCGTGGGc < 3:25364/148‑1 (MQ=255) tctTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATGTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTCGGCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCa > 2:94495/1‑148 (MQ=255) gATGTTCTGGATGTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGc > 2:69945/1‑84 (MQ=255) aTGTTCTGGATGTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCa < 1:69945/84‑1 (MQ=255) cTGGATGTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTCGGCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTc > 1:120988/1‑148 (MQ=255) | CTTTTTTGCAGCAGGTGGGTAAAGCCGAGGATGCCATTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAACTCCGACTTGATGCGGCTGGCCTCAAGTGCCTCTTTGCGCGCCATGTCCAGCTCGATGTTCTGGATTTCGATGGTTTCCAGGTTCTGGCGCACGTCTTCGGTGGCCTGGTCGATGCTGTGTTGCAGTTCTTCGTGGGCATTCTGCAGGGTTTCGGCCATGCGGTTGATGCCGTGGGCCAGTTCGTCCAGCTCATGGCTGCCCATGGTC > NC_002947/1843853‑1844137 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |