| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 690,904 | Δ1 bp | 6.0% | coding (505/687 nt) | PP_0592 ← | short‑chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 690,904 | 0 | G | . | 6.0% | 219.1 / 6.3 | 67 | coding (505/687 nt) | PP_0592 | short‑chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (27/36); new base . (2/2); total (29/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AAACGCAGGCCGCCCTTGCCGCTTTGGGCCTTGATCTGTTCGATCATGCCGCGGGTGCTGGTGAGCACATCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCTTGCTGGCCTTGTACAGGCAGATTTCGCCACCGTCTGGGATGGTGACGCTTCCCAGGATCGAGCTCATGAAAGCCAGCACACCACTGCCTTCGCGTAT > NC_002947/690756‑691045 | aaaCGCAGGCCGCCCTTGCCGCTTTGGGCCTTGATCTGTTCGATCATGCCGCGGGTGCTGGTGAGCACATCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCgctg < 4:222688/149‑1 (MQ=255) aaCGCAGGCCGCCCTTGCCGCTTTGGGCCTTGATCTGTTCGATCATGCCGCGGGTGCTGGTGAGCACATCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTAAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCAAGCACGCACAGGTCCGGGCgctgc > 8:87977/1‑149 (MQ=255) gcctccCTTGCAGCTTTGGTCATTGATCTGTTCGATCATGCCGCGGGTGCTGGTGAGCACATCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCaa < 6:266042/149‑1 (MQ=255) gccgccCTTGCCGCTTTGGGCCTTGATCTGTTCGATCATGCCGCGGGTGCTGGTGAGCACATCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATTTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCaa < 3:190294/149‑1 (MQ=255) gccgccCTTGCCGCTTTGGGCCTTGATCTGTTCGATCATGCCGCGGGTGCTGGTGAGCACATCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCaa > 5:311127/1‑149 (MQ=255) gccCTTGCCGCTTTGGGCCTTGATCTGTTCGATCATGCCGCGGGTGCTGGTGAGCACATCTATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGG‑CAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACgaa < 2:70955/149‑1 (MQ=255) ccTTGCCGCTTTGGGCCTTGATCTGTTCGATCATGCCGCGGGTGCTGGTGAGCACATCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACgaag < 4:18929/149‑1 (MQ=255) ccTTGCCGCTTTGGGCCTTGATCTGTTCGATCATGCCGCGGGTGCTGGTGAGCACATCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACg > 4:171517/1‑146 (MQ=255) cTTGCCGCTTTGGGCCTTGATCTGTTCGATCATGCCGCGGGTGCTGGTGAGCACATCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACgaag > 1:309507/1‑148 (MQ=255) gCCGCTTTGGGGCTTGATCTGTTCGATCATGCCGCGGGTGCTGGTGAGCACATCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGaagaag < 2:144450/148‑1 (MQ=255) gCCGCTTTGGGCCTTGATCTGTTCGATCATGCCGCGGGTGCTGGTGAGCACATCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACgaagaa < 1:327399/147‑1 (MQ=255) gCCGCTTTGGGCCTTGATCTGTTCGATCATGCCGCGGGTGCTGGTGAGCACATCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACgaagaa < 6:79652/147‑1 (MQ=255) gCCGCTTTGGGCCTTGATCTGTTCGATCATGCCGCGGGTGCTGGTGAGCACATCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGaagaag < 7:87977/148‑1 (MQ=255) cGCTTTGGGCCTTGATCTGTTCGATCATGCCGCGGGTGCTGGTGAGCACATCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACgaa > 8:227480/1‑142 (MQ=255) cGCTTTGGGCCTTGATCTGTTCGATCATGCCGCGGGTGCTGGTGAGCACATCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACgaa < 7:227480/142‑1 (MQ=255) ccTTGATCTGTTCGATCATGCCGCGGGTGCTGGTGAGCACATCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGatcatc < 2:329/149‑1 (MQ=255) ccTTGATCTGTTCGATCATGCCGCGGGTGCTGGTGAGCACATCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGatcatc < 3:171517/149‑1 (MQ=255) ccTTGATCTGTTCGATCATGCCGCGGGTGCTGGTGAGCACATCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCT‑CTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGatcatc > 6:73297/1‑148 (MQ=255) ccTTGATCTGTTCGATCATGCCGCGGGTGCTGGTGAGCACATCGATTTCGGCGTTTTCGCAACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGAT‑CTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGatcatc > 6:68413/1‑148 (MQ=255) cTTGATCTGTTCGATCATGCCGCGGGTGCTGGTGAGCACATCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCgctgctgc < 7:36137/124‑1 (MQ=255) cTTGATCTGTTCGATCATGCCGCGGGTGCTGGTGAGCACATCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCgctgctgc > 8:36137/1‑124 (MQ=255) cTTGATCTGTTCGATCATGCCGCGGGTGCTGGTGAGCACATCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCg < 6:311127/149‑1 (MQ=255) gATCTGTTCGATCATGCCGCGGGTGCTGGTGAGCACATCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAg < 4:103521/148‑1 (MQ=255) gATCTGTTCGATCATGCCGCGGGTGCTGGTGAGCACATCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCAAGCACAGGTCAGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGt > 1:283022/1‑149 (MQ=255) tGTTCGATCATGCCGCGGGTGCTGGTGAGCACATCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAg > 6:260936/1‑149 (MQ=255) ttCGATCATGCCGCGGGTGCTGGTGAGCACATCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGt < 5:260936/148‑1 (MQ=255) aTCATGCCGCGGGTGCTGGTGAGCACATCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTgccgc > 7:16827/1‑149 (MQ=255) aTGCCGCGGGTGCTGGTGAGCACATCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCtt < 1:185186/149‑1 (MQ=255) gCCGCGGGTGCTGGTGAGCACATCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCTTGc > 3:273249/1‑149 (MQ=255) cTGGTGAGCACATCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCTTGCTGTCCTTGt < 8:191628/148‑1 (MQ=255) gTGAGCACATCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCTTGCTGGCCTTGTACAg > 1:266281/1‑149 (MQ=255) gTGAGCACATCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCTTGCTGGCCTTGTACAg > 6:276988/1‑149 (MQ=255) gTGAGCACATCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCTTGCTGGCCTTGTACAg > 4:3115/1‑149 (MQ=255) aGCACATCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCTTGCTGGCCTTGTACAGGCa < 5:120667/149‑1 (MQ=255) aGCACATCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCTCGCTGGCCTTGTACAgg > 2:172203/1‑147 (MQ=255) acaTCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCTTGCTGGCCTTGTACAGGCAGAt > 1:164647/1‑149 (MQ=255) caTCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCTTGCTGGCCTTGTACAGGCAGAtt < 5:276988/149‑1 (MQ=255) aTCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCTTGCTGGCCTTGTACAGGCAGAttt > 5:308392/1‑149 (MQ=255) tCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCTTGCTGGCCTTGTACAGGCAGATTTc < 6:308392/149‑1 (MQ=255) tCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCTTGCTGGCCTTGTACAGGCAGATTTc < 1:195967/149‑1 (MQ=255) gATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCTTGCTGGCCTTGTACAGGCAGATTTCg < 8:16827/148‑1 (MQ=255) tttCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCTTGCTGGCCTTGTACAGGCAGATTTCGCCa > 1:239165/1‑149 (MQ=255) cGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCTCGCTGGCCTTGTACAGGCAGATTTCGCCACCGTCt < 1:172203/149‑1 (MQ=255) ttttCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCTTGCTGGCCTTGTACAGGCAGATTTCGCCACCGTCTgg < 8:209751/149‑1 (MQ=255) ttCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCTTGCTGGCCTTGTACAGGCAGATTTCGCCACCGTCTggg < 4:273249/148‑1 (MQ=255) 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aGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCTTGCTGGCCTTGTACAGGCAGATTTCGCCACCGTCTGGGATGGTGACGCTTCCCa < 4:73830/149‑1 (MQ=255) gTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCTTGCTGGCCTTGTACAGGCAGATTTCGCCACCGTCTGGGATGGTGACGCTTCCCAg > 8:203271/1‑149 (MQ=255) aCCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACATGTCCGGGCGCT‑CTGCTCAACGAAGAATCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCTTGCTGGCCTTGTACAGGCAGATTTCGCCACCGTCTGGGATGGTGACGCTTCCCAGGATCGa < 5:68413/148‑1 (MQ=255) aCCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCT‑CTGCTCCACGCAGACGCTGTTGATCATCGAGTTCAGGGCCGCCTTGCTGGCCTTGTACAGGCAGATTTCGCCACCGTCTGGGATGGTGACGCTTCCCAGGATCGa < 5:73297/148‑1 (MQ=255) cccAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCTTGCTGGCCTTGTACAGGCAGATTTCGCCACCGTCTGGGATGGTGACGCTTCCCAGGATCGAg > 8:122530/1‑149 (MQ=255) ccAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCTTGCTGGCCTTGTACAGGCAGATTTCGCCACCGTCTGGGATGGTGACGCTTCCCAGGATCGAGc > 1:96615/1‑149 (MQ=255) aGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCTTGCTGGCCTTGTACAGGCAGATTTCGCCACCGTCTGGGATGGTGACGCTTCCCAGGATCGAGCTc < 2:96615/149‑1 (MQ=255) cGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCTTGCTGGCCTTGTACAGGCAGATTTCGCCACCGTCTGGGATGGTGACGCTTCCCAGGATCGAGCTCATg > 4:301563/1‑148 (MQ=255) ggTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCTTGCTGGCCTTGTACAGGCAGATTTCGCCACCGTCTGGGATGGTGACGCTTCCCAGGATCGAGCTCATGaaa < 2:164647/149‑1 (MQ=255) cATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCTTGCTGGCCTTGTACAGGCAGATTTCGCCACCGTCTGGGATGGTGACGCTTCCCAGGATCGAGCTCATGAAAGCCa < 2:266281/149‑1 (MQ=255) cATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCTTGCTGGCCTTGTACAGGCAGATTTCGCCACCGTCTGGGATGGTGACGCTTCCCAGGATCGAGCTCATGAAAGCCa < 5:214494/149‑1 (MQ=255) cAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCTTGCTGGCCTTGTACAGGCAGATTTCGCCACCGTCTGGGATGGTGACGCTTCCCAGGATc > 6:197633/1‑127 (MQ=255) cAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCTTGCTGGCCTTGTACAGGCAGATTTCGCCACCGTCTGGGATGGTGACGCTTCCCAGGATCGAGCTCATGAAAGCCAGCacac < 7:203271/149‑1 (MQ=255) cacgcacAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCTTGCTGGCCTTGTACAGGCAGATTTCGCCACCGTCTGGGATGGTGACGCTTCCCAGGATCGAGCTCATGAAAGCCAGCAcaccac > 6:188092/1‑149 (MQ=255) acaGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCTTGCTGGCCTTGTACAGGCAGATTTCGCCACCGTCTGGGATGGTGACGCTTCCCAGGATCGAGCTCATGAAAGCCAGCACACCACTGCCt > 5:341354/1‑149 (MQ=255) gTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCTTGCTGGCCTTGTACAGGCAGATTTCGCCACCGTCTGGGATGGTGACGCTTCCCAGGATCGAGCTCATGAAAGCCAg > 7:312793/1‑132 (MQ=255) gTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCTTGCTGGCCTTGTACAGGCAGATTTCGCCACCGTCTGGGATGGTGACGCTTCCCAGGATCGAGCTCATGAAAGCCAg < 8:312793/132‑1 (MQ=255) gTCCGGGCGCTGCTGCTCAAAGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTAAGTGCCGCCTTGCAGGACTTGTACAGGCAGATTTCGCCACCGTCTGGGATGGTGACGCTTCCCAGGATCGAGCTCATGAAAGCCAGCACACAACTGCCTTcgc > 3:54528/1‑149 (MQ=255) gggCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCTTGCTGGCCTTGTACAGGCAGATTTCGCCACCGTCTGGGATGGTGACGCTTCCCAGGATCGAGCTCATGAAAGCCAGCACACCACTGCCTTCGCGTAt < 3:301563/149‑1 (MQ=255) | AAACGCAGGCCGCCCTTGCCGCTTTGGGCCTTGATCTGTTCGATCATGCCGCGGGTGCTGGTGAGCACATCGATTTCGGCGTTTTCGCCACCCATGTCAGTTTTCACCCAGCCCGGGTGCATGGCCAGCACGCACAGGTCCGGGCGCTGCTGCTCAACGAAGAAGCTGTTGATCATCGAGTTCAGTGCCGCCTTGCTGGCCTTGTACAGGCAGATTTCGCCACCGTCTGGGATGGTGACGCTTCCCAGGATCGAGCTCATGAAAGCCAGCACACCACTGCCTTCGCGTAT > NC_002947/690756‑691045 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |