Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 262,746 | Δ1 bp | 8.2% | coding (263/282 nt) | PP_0211 → | hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 262,746 | 0 | G | . | 8.2% | 190.5 / 10.3 | 61 | coding (263/282 nt) | PP_0211 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (29/27); new base . (3/2); total (32/29) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.38e-01 |
TCACAATGCCGTGCGGCGCGCCTGTCCGGAGGGATCAGCCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGAGTGTGGGTACAGGGCGCAACTGGGCAACGTGC > NC_002947/262598‑262894 | tCACAATGCCGTGCGGCGCGCCTGTCCGGAGGGATCAGCCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCg > 6:231968/1‑149 (MQ=255) acaATGCCGTGCGGCGCGCCTGTCCGGAGGGATCAGCCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCg < 3:325506/147‑1 (MQ=255) acaATGCCGTGCGGCGCGCCTGTCCGGAGGGATCAGCCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGt > 1:35236/1‑148 (MQ=255) caATGCCGTGCGGCGCGCCTGTCCGGAGGGATCAGCCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGa > 4:169823/1‑149 (MQ=255) cagTGCGGCGCGCCTGTCCGGAGTGATCAGCCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATTGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTg < 8:171337/146‑1 (MQ=255) gTGCGGCGCGCCTGTCCGGAGGGATCAGCCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGt > 3:111897/1‑148 (MQ=255) gcCTGTCCGGAGGGATCAGCCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGa < 2:203271/149‑1 (MQ=255) cTGTCCGGAGGGATCAGCCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAg > 6:80587/1‑149 (MQ=255) tGTCCGGAGGGATCAGCCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCGAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCCGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGc > 7:212117/1‑149 (MQ=255) tCCGGAGGGATCAGCCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGc < 5:231968/147‑1 (MQ=255) aGGGATCAGCCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATccc < 3:169823/149‑1 (MQ=255) gggATCAGCCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATc < 6:318916/146‑1 (MQ=255) gggATCAGCCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATc > 5:318916/1‑146 (MQ=255) ccTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGAGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACACTAGGGCTTACTAGCGTGACCTGGACA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTAGc > 2:269869/1‑149 (MQ=255) cTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGcc < 4:111897/149‑1 (MQ=255) tGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGAc > 8:164547/1‑113 (MQ=255) tGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGAc < 7:164547/113‑1 (MQ=255) gcgcGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGC‑TGACCAGGTCacgcaa > 4:245551/1‑115 (MQ=255) gcgcGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGC‑TGACCAGGTCacgcaa < 3:245551/120‑6 (MQ=255) gacgaTGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGt > 5:269637/1‑149 (MQ=255) acgaTGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCGAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTg < 8:212117/149‑1 (MQ=255) cgaTGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTg > 3:89653/1‑148 (MQ=255) tgCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGaa < 6:33438/148‑1 (MQ=255) cgTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAg > 7:117208/1‑148 (MQ=255) gtggtgCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGga < 6:125550/149‑1 (MQ=255) gtggtgCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGga > 4:64632/1‑149 (MQ=255) gCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGAcc > 2:123866/1‑149 (MQ=255) cAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCg > 8:185293/1‑149 (MQ=255) cAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCg < 6:269637/149‑1 (MQ=255) aaaTCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGc < 2:185105/149‑1 (MQ=255) aTCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGAt > 6:97831/1‑106 (MQ=255) aTCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGAt < 5:97831/106‑1 (MQ=255) tCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTa < 7:185293/149‑1 (MQ=255) aGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGc > 6:178061/1‑148 (MQ=255) gCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAAc < 1:123866/148‑1 (MQ=255) gCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGa < 2:294525/148‑1 (MQ=255) cTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCt > 3:110373/1‑149 (MQ=255) cGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCg < 8:117208/149‑1 (MQ=255) tGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGaca > 6:347657/1‑149 (MQ=255) cATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACAcccc > 5:117885/1‑149 (MQ=255) cATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTAGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGAcccccc > 1:292505/1‑149 (MQ=255) tGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGa < 3:64632/149‑1 (MQ=255) gAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCa > 4:120182/1‑65 (MQ=255) gAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCa < 3:120182/65‑1 (MQ=255) aGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGAgt < 5:178061/149‑1 (MQ=255) gcgcGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGAgtg > 5:78367/1‑149 (MQ=255) cgGGATCTACCCTTGGGCTTTCTTGCGTGAGCTGGTCA‑GGAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGACGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACGTTCTCTTTGGCGACACCCCGAGTGTgg < 1:269869/149‑1 (MQ=255) cgGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGAGTGTgg < 3:164738/149‑1 (MQ=255) cgGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGAGTGTgg < 4:110373/149‑1 (MQ=255) gATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGAGTGTGGGTa > 8:121012/1‑149 (MQ=255) aCCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCAGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGAGTGTGGGTACAggg > 2:322732/1‑149 (MQ=255) cTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGAGTGTGGGTACAGGgcg > 4:144894/1‑148 (MQ=255) cTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCAGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGAGTGTGGGTACAGGgcg > 2:226701/1‑148 (MQ=255) gggCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGAGTGTGGGTACAGGGCGCaa < 6:78367/148‑1 (MQ=255) ggCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGctc > 6:158682/1‑112 (MQ=255) ggCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGAGTGTGGGTACAGGGCGCAAc < 3:144894/148‑1 (MQ=255) cttcaCTTGC‑TGACCAGGTCACGCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGAGTGTGGGTACAGGGCGCAACTg > 6:326456/5‑149 (MQ=255) ttcaCTTGC‑TGACCAGGTCACGCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGAGTGTGGGTACAGGGCGCAACTgg > 5:286978/4‑149 (MQ=255) ttcaCTTGC‑TGACCAGGTCACGCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGAGTGTGGGTACAGGGCGCAACTgg < 5:326456/146‑1 (MQ=255) cTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGACCTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGAGTGTGGGTACAGGGCGCAACTgg < 2:35236/149‑1 (MQ=255) cTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGAGTGTGGGTACAGGGCGCAACTgg < 5:347657/149‑1 (MQ=255) ttGCGTGACCTGGTCA‑GTAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGAGTGTGGGTACAGGGCGCAACTGGGCAAc > 5:265893/1‑149 (MQ=255) cGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGAGTGTGGGTACAGGGCGCAACTGGGCAACGTg > 7:287136/1‑149 (MQ=255) gTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGAGTGTGGGTACAGGGCGCAACTGGGCAACGTGc > 4:151565/1‑149 (MQ=255) gTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGAGTGTGGGTACAGGGCGCAACTGGGCAACGTGc > 4:57153/1‑149 (MQ=255) | TCACAATGCCGTGCGGCGCGCCTGTCCGGAGGGATCAGCCTGGTGCGCGACGATGTGCGCGTGGTGCAAATCGAGTCGCAAGGGTATGGCGTACAACTGGTGTTCAGCGATGGGCATGAGCGCGGGATCTACCCTTGGGCTTACTTGCGTGACCTGGTCA‑GCAAGTGAAGCTGATCCCTTCAGTTGCCGGAAGGGGTGCAGAAGCAGGACGACCGCCTAGCCAACGAACTGGCCGAGGGTAACCTGCTCTTTGGCGACACCCCGAGTGTGGGTACAGGGCGCAACTGGGCAACGTGC > NC_002947/262598‑262894 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |