New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 721227 = | 50 (0.930) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 5.8% | intergenic (‑32/+75) | PP_0614/PP_0615 | bifunctional N‑carbamoyl‑beta‑alanine amidohydrolase/allantoine amidohydrolase/ABC transporter ATP‑binding protein |
? | NC_002947 | 721286 = | 52 (1.050) | intergenic (‑91/+16) | PP_0614/PP_0615 | bifunctional N‑carbamoyl‑beta‑alanine amidohydrolase/allantoine amidohydrolase/ABC transporter ATP‑binding protein |
CCCTTGGCGGTGGCGCCGAGTTGGGCCAGGTCCATCAATGATTGCCACAGGCGCTCGCGGTTGATCAGAGGGCCTTGGCCGAGCAGGTGCTGCGAGGGATCGATGCGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCGGTACAGGTAAGCACGGTCGGGTCAGGCGCTAAGGGCCAGGTAACGGTTCTTGATGCTCGGGTCCTCGCGGAACTGCGCCGCACTGCCCTGGT > NC_002947/721080‑721372 | taatggtctgcgatgcccttgctgatcgccactatgtgctggagcagggccgcgtcgcttaccagggcagtgcggcgcagttccgcgaggacccgagcatcaagaaccgttacctggcccttagcgcctgacccgaccgtgcttaccTg < 3:224056‑M1/2‑1 (MQ=255) aatggtctgcgatgcccttgctgatcgccactatgtgctggagcagggccgcgtcgcttaccagggcagtgcggcgcagttccgcgaggacccgagcatcaagaaccgttacctggcccttagcgcctgacccgaccgtgcttaccTg < 6:157590‑M1/2‑1 (MQ=255) tctgcgatgcccttgctgatcgccactatgtgctggagcagggccgcgtcgcttaccagggcagtgcggcgcagttccgcgaggacccgagcatcaagaaccgttacctggcccttagcgcctgacccgaccgtgcttaccTGTACCgg < 2:11773‑M1/8‑1 (MQ=255) tgcgatgcccttgctgatcgccactatgtgctggagcagggccgcgtcgcttaccagggcagtgcggcgcagttccgcgaggacccgagcatcaagaaccgttacctggcccttagcgcctgacccgaccgtgcttaccTGTACCGGc < 7:189322‑M1/9‑1 (MQ=255) ggTGGCGCCGAGTTGGGCCAGGTCCATCAATGATTGCCACAGGCGCTCGCGGTTGATCAGAGGGCCTTGGCCGAGCAGGTGCTGCGAGGGATCGATGCGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGcc > 7:191900/1‑149 (MQ=255) cgatgcccttgctgatcgccactatgtgctggagcagggccgcgtcgcttaccagggcagtgcggcgcagttccgcgaggacccgagcatcaagaaccgttacctggcccttagcgcctgacccgaccgtgcttaccTGTACCGGc > 2:311872‑M1/138‑146 (MQ=255) ccGAGTTGGGCCAGGTCCATCAATGATTGCCACAGGCGCTCGCGGTTGATCAGAGGGCCTTGGCCGAGCAGGTGCTGCGAGGGATCGATGCGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTcgc < 4:320564/149‑1 (MQ=255) gAGTTGGGCCAGGTCCATCAATGATTGCCACAGGCGCTCGCGGTTGATCAGAGGGCCTTGGCCGAGCAGGTGCTGCGAGGGATCGATGCGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCgg < 1:166598/149‑1 (MQ=255) gAGTTGGGCCAGGTCCATCAATGATTGCCACAGGCGCTCGCGGTTGATCAGAGGGCCTTGGCCGAGCAGGTGCTGCGAGGGATCGATGCGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCgg < 6:215338/149‑1 (MQ=255) cAGGTCCATCAATGATTGCCACAGGCGCTCGCGGTTGATCAGAGGGCCTTGGCCGAGCAGGTGCTGCGAGGGATCGATGCGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTcgc < 1:319244/138‑1 (MQ=255) cAGGTCCATCAATGATTGCCACAGGCGCTCGCGGTTGATCAGAGGGCCTTGGCCGAGCAGGTGCTGCGAGGGATCGATGCGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTcgc > 2:319244/1‑138 (MQ=255) gTCCATCAATGATTGCCACAGGCGCTCGCGGTTGATCAGAGGGCCTTGGCCGAGCAGGTGCTGCGAGGGATCGATGCGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTc < 3:61219/149‑1 (MQ=255) tCCATCAATGATTGCCACAGGCGCTCGCGGTTGATCAGAGGGCCTTGGCCGAGCAGGTGCTGCGAGGGATCGATGCGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTcc < 2:209411/149‑1 (MQ=255) cATCAATGATTGCCACAGGCGCTCGCGGTTGATCAGAGGGCCTTGGCCGAGCAGGTGCTGCGAGGGATCGATGCGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTa > 8:45640/1‑149 (MQ=255) tCAATGATTGCCACAGGCGCTCGCGGTTGATCAGAGGGCCTTGGCCGAGCAGGTGCTGCGAGGGATCGATGCGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTAc > 8:29786/1‑148 (MQ=255) aaTGATTGCCACAGGCGCTCGCGGTTGATCAGAGGGCCTTGGCCGAGCAGGTGCTGCGAGGGATCGATGCGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACa > 3:107652/1‑147 (MQ=255) aTTGCCACAGGCGCTCGCGGTTGATCAGAGGGCCTTGGCCGAGCAGGTGCTGCGAGGGATCGATGCGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGc < 7:29786/148‑1 (MQ=255) ttGCCACAGGCGCTCGCGGTTGATCAGAGGGCCTTGGCCGAGCATGTGCTGCGAGGGATCGATGCGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCt < 7:290656/149‑1 (MQ=255) gCCACAGGCGCTCGCGGTTGATCAGAGGGCCTTGGCCGAGCAGGTGCTGCGAGGGATCGATGCGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTg < 2:188841/148‑1 (MQ=255) acaGGCGCTCGCGGTTGATCAGAGGGCCATGGCCGAGCAGGTGCTGCGAGGGATCGATGCGGGTGTTCATGGTTCATATCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCCCACATACAAAGGCCTGGCAg > 7:244315/1‑149 (MQ=255) gcTCGCGGTTGATCAGAGGGCCTTGGCCGAGCAGGTGCTGCGAGGGATCGATGCGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCg < 7:199420/149‑1 (MQ=255) cTCGCGGTTGATCAGAGGGCCTTGGCCGAGCAGGTGCTGCGAGGGATCGATGCGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCgg > 1:133809/1‑149 (MQ=255) gcttaccagggcagtgcggcgcagttccgcgaggacccgagcatcaagaaccgttacctggcccttagcgcctgacccgaccgtgcttaccTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCGGTAc > 2:339796‑M1/92‑149 (MQ=255) tCAGAGGGCCTTGGCCGAGCAGGTGCTGCGAGGGATCGATGCGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGc < 3:280183/124‑1 (MQ=255) tCAGAGGGCCTTGGCCGAGCAGGTGCTGCGAGGGATCGATGCGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGc > 4:280183/1‑124 (MQ=255) tCAGAGGGCCTTGGCCGAGCAGGTGCTGCGAGGGATCGATGCGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCGGTACAGGTAAg > 5:114767/1‑148 (MQ=255) tCAGAGGGCCTTGGCCGAGCAGGTGCTGCGAGGGATCGATGAGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCGGTACAGGTAAGc > 2:291675/1‑149 (MQ=255) gagGGCCTTGGCCGAGCAGGTGCTGCGAGGGATCGATGCGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTTGCCGGTACAGGTAAGAACg > 5:238202/1‑149 (MQ=255) ggCCTTGGCCGAGCAGGTGCTGCGAGGGATCGATGCGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCGGTACAGGTAAGCACGGTc < 6:114767/149‑1 (MQ=255) ccTTGGCCGAGCAGGTGCTGCGAGGGATCGATGCGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCGGTACAGGTAAGCACGGTCgg < 3:256213/149‑1 (MQ=255) ccTTGGCCGAGCAGGTGCTGCGAGGGATCGATGCGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCGGTACAGGTAAGCACGGTCgg < 4:107652/149‑1 (MQ=255) ggCCGAGCAGGTGCTGCGAGGGATCGATGCGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCGGTACAGGTAAGCACGGTCGGGt < 7:45640/147‑1 (MQ=255) ccGAGCAGGTGCTGCGAGGGATCGATGCGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCGGTACAGGTAAGCACGGTCGGGTCAgg > 2:252562/1‑149 (MQ=255) aGGTGCTGCGAGGGATCGATGCGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCGGTACAGGTAAGCACGGTCGGGTCAGGCGCTaa < 8:191900/149‑1 (MQ=255) cGAGGGATCGATGCGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCGGTACAGGTAAGCACGGTCGGGTCAGGCGCTAAGGGCCAg < 4:250998/148‑1 (MQ=255) gAGGGATCGATGCGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCGGTACAGGTAAGCACGGTCGGGTCAGGCGCTAAGGGCCAgg > 4:304746/1‑148 (MQ=255) gggATCGATGCGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCGGTACAGGTAAGCACGGTCGGGTCAGGCGCTAAGGGCCAGGTaa > 7:181198/1‑149 (MQ=255) gggATCGATGCGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCGGTACAGGTAAGCACGGTCGGGTCAGGCGCTAAGGGCCAGGTaa > 4:129977/1‑149 (MQ=255) ggATCGATGCGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCGGTACAGGTAAGCACGGTCGGGTCAGGCGCTAAGGGCCAGGTAAc > 6:118713/1‑149 (MQ=255) gATCGATGCGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCGGTACAGGTAAGCACGGTCGGGTCAGGCGCTAAGGGCCAGGTAACg < 8:181198/149‑1 (MQ=255) tCGATGCGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCGGTACAGGTAAGCACGGTCGGGTCAGGCGCTAAGGGCCAGGTAACGGt > 5:288006/1‑149 (MQ=255) agaaccgttacctggcccttagcgcctgacccgaccgtgcttaccTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCgg < 5:22484‑M1/55‑1 (MQ=255) agaaccgttacctggcccttagcgcctgacccgaccgtgcttaccTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCgg > 6:22484‑M1/46‑100 (MQ=255) tGCGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCAGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGTCCGGTACAGGTAAGCACGGTCGGGTCAGGCGCTAAGGGCCAGGTAACGGTTCtt > 7:155851/1‑149 (MQ=255) cGGGTTTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCGGTACAGGTAAGCACGGTCGGGTCAGGCGCTAAGGGCCAGGTAACGGTTCTTg < 2:335427/148‑1 (MQ=255) gggTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCGGTACAGGTAAGCACGGTCGGGTCAGGCGCTAAGGGCCAGGTAACGGTTCTTGAt > 4:48015/1‑149 (MQ=255) gtgtTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCGGTACAGGTAAGCACGGTCGGGTCAGGCGCTAAGGGCCAGGTAACGGTTCTTGATg > 4:74197/1‑148 (MQ=255) cATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCGGTACAGGTAAGCACGGt < 3:234846/105‑1 (MQ=255) cATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCGGTACAGGTAAGCACGGt > 4:234846/1‑105 (MQ=255) aTGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCGGTACAGGTAAGCACGGTCGGGTCAGGCGCTAAGGGCCAGGTAACGGTTCTTGATGCTCggg > 4:216701/1‑148 (MQ=255) gTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCGGTACAGGTAAGCACGGTCGGGTCAGGCGCTAAGGGCCAGGTAACGGTTCTTGATGCTCGGGTCCt > 4:224056/1‑149 (MQ=255) aTCTCTACTGAAATTTCTGGGTTGCTTGTACCGGCCTTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCGGTACAGGTAAGCTCGGTCGGGTCAGGCGCTTAGGGCCAGTTATCGGTTCTTGATGCTCGGGTCCTcgc < 8:244315/148‑1 (MQ=39) tcCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCGGTACAGGTAAGCACGGTCGGGTCAGGCGCTAAGGGCCAGGTAACGGTTCTTGATGCTCGGGTCCTCGCgg < 3:48015/145‑1 (MQ=255) cTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCGGTACAGGTAAGCACGGTCGGGTCAGGCGCTAAGGGCCAGGTAACGGTTCTTGATGCTCGGGTCCTCGCGGAACTgc > 3:146965/1‑149 (MQ=255) cTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCGGTACAGGTAAGCACGGTCGGGTCAGGCGCTAAGGGCCAGGTAACGGTTCTTGATGCTCGGGTCCTCGCGGAACTGCGCCGCACTg < 3:74197/149‑1 (MQ=255) ggTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCGGTACAGGTAAGCACGGTCGGGTCAGGCGCTAAGGGCCAGGTAACGGTTCTTGATGCTCGGGTCCTCGCGGAACTGCGCCGCACTGccc > 6:332564/1‑149 (MQ=255) ggTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCGGTACAGGTAAGCACGGTCGGGTCAGGCGCTAAGGGCCAGGTAACGGTTCTTGATGCTCGGGTCCTCGCGGAACTGCGCCGCACTGccc > 2:255053/1‑149 (MQ=255) ggTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGCGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCGGTACAGGTAAGCACGGTCGGGTCAGGCGCTAAGGGCCAGGTAACGGTTCTTGATGCTCGGGTCCTCGCGGAACTGCGCCGCACTGcc > 2:201780/1‑148 (MQ=255) ttGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCGGTACAGGTAAGCACGGTCGGGTCAGGCGCTAAGGGCCAGGTAACGGTTCTTGATGCTCGGGTCCTCGCGGAACTGCGCCGCACTGCCCTg < 5:118713/149‑1 (MQ=255) cTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCGGTACAGGTAAGCACGGTCGGGTCAGGCGCTAAGGGCCAGGTAACGGTTCTTGATGCTCGGGTCCTCGCGGAACTGCGCCGCACTGCCCTGGt > 3:243477/1‑148 (MQ=255) ttGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCGGTACAGGTAAGCACGGTCGGGTCAGGCGCTAAGGGCCAGGTAACGGTTCTTGATGCTCGGGTCCTCGCGGAACTGCGCCGCACTGCCCTGGt > 1:18747/1‑147 (MQ=255) | CCCTTGGCGGTGGCGCCGAGTTGGGCCAGGTCCATCAATGATTGCCACAGGCGCTCGCGGTTGATCAGAGGGCCTTGGCCGAGCAGGTGCTGCGAGGGATCGATGCGGGTGTTCATGGTTCATCTCTCCTGAAATTACTGGGTTGCTTGTACCGGCCTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAGGCCTGGCAGTGGCCGGTACAGGTAAGCACGGTCGGGTCAGGCGCTAAGGGCCAGGTAACGGTTCTTGATGCTCGGGTCCTCGCGGAACTGCGCCGCACTGCCCTGGT > NC_002947/721080‑721372 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |