New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 822546 | 49 (0.910) | 4 (0.080) | 4/250 | NT | 8.0% | coding (1917/2412 nt) | PP_0707 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 822572 | 45 (0.880) | coding (1943/2412 nt) | PP_0707 | hypothetical protein |
CCTGGCCATGTTGGTGATGTCGACCTTGCGTATCAACCTCACCAGCCTGACCTGGGTGGTCAGTGCCCTGTCGGTCGGTATCGGTTTCGGTTTGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCGGGTGTCGAGGGTGATATCCGCCGCATCAATGTCCGCGCCACCGAGATCCAGATGTCTGACCGTTCCACGGTGATCGTGCCCAATTCGCAGTTCATCTCGCAGAACGTGC > NC_002947/822408‑822694 | cctgGCCATGTTGGTGATGTCGACCTTGCGTATCAACCTCACCAGCCTGACCTGGGTGGTCAGTGCCCTGTCGGTCGGTATCGGTTTCGGTTTGCAGCAGTTCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCcagtcgccga > 6:206746‑M1/1‑139 (MQ=255) ggCCATGTTGGTGATGTCGACCTTGCGTATCAACCTCACCAGCCTGACCTGGGTGGTCAGTGCCCTGTCGGTCGGTATCGGTTTCGGTTTGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTg > 8:245660/1‑148 (MQ=255) gCCATGTTGGTGATGTCGACCTTGCGTATCAACCTCACCAGCCTGACCTGGGTGGTCAGTGCCCTGTCGGTCGGTATCGGTTTCGGTTTGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCTAGCGCCCGGTg > 6:53497/1‑147 (MQ=255) cATGTTGGTGATGTCGACCTTGCGTATCAACCTCACCAGCCTGACCTGGGTGGTCAGTGCCCTGTCGGTCGGTATCGGTTTCGGTTTGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAg > 4:60059/1‑136 (MQ=255) cATGTTGGTGATGTCGACCTTGCGTATCAACCTCACCAGCCTGACCTGGGTGGTCAGTGCCCTGTCGGTCGGTATCGGTTTCGGTTTGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAg < 3:60059/136‑1 (MQ=255) gTTGGTGATGTCGACCTTGCGTATCAACCTCACCAGCCTGACCTGGGTGGTCAGTGCCCTGTCGGTCGGTATCGGTTTCGGTTTGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCg > 3:76398/1‑149 (MQ=255) ttGGTGATGTCGACCTTGCGTATCAACCTCACCAGCCTGACCTGGGTGGTCAGTGCCCTGTCGGTCGGTATCGGTTTCGGTTTGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCgg < 8:54030/149‑1 (MQ=255) ggTGATGTCGACCTTGCGTATCAACCTCACCAGCCTGACCTGGGTGGTCAGTGCCCTGTCGGTCGGTATCGGTTTCGGTTTGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGc < 7:58745/148‑1 (MQ=255) tGATGTCGACCTTGCGTATCAACCTCACCAGCCTGACCTGGGTGGTCAGTGCCCTGTCGGTCGGTATCGGTTTCGGTTTGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGAc < 4:76398/149‑1 (MQ=255) aTGTCGACCTTGCGTATCAACCTCACCAGCCTGACCTGGGTGGTCAGTGCCCTGTCGGTCGGTATCGGTTTCGGTTTGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTg > 2:72200/1‑149 (MQ=255) gTCGACCTTGCGTATCAACCTCACCAGCCTGACCTGGGTGGTCAGTGCCCTGTCGGTCGGTATCGGTTTCGGTTTGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGa > 6:40333/1‑134 (MQ=255) gTCGACCTTGCGTATCAACCTCACCAGCCTGACCTGGGTGGTCAGTGCCCTGTCGGTCGGTATCGGTTTCGGTTTGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGa < 5:40333/134‑1 (MQ=255) gCGTATCAACCTCACCAGCCTGACCTGGGTGGTCAGTGCCCTGTCGGTCGGTATCGGTTTCGGTTTGCAGCAGTTCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCcagtcgccgaccttcaccgggcgctcggtcagcag < 5:206746‑M1/147‑36 (MQ=255) gTATCAACCTCACCAGCCTGACCTGGGTGGTCAGTGCCCTGTCGGTCGGTATCGGTTTCGGTTTGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCg < 5:188465/149‑1 (MQ=255) tATCAACCTCACCAGCCTGACCTGGGTGGTCAGTGCCCTGTCGGTCGGTATCGGTTTCGGTTTGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCgg > 7:301442/1‑149 (MQ=255) tATCAACCTCACCAGCCTGACCTGGGTGGTCAGTGCCCTGTCGGTCGGTATCGGTTTCGGTTTGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCgg > 7:120580/1‑149 (MQ=255) tATCAACCTCACCAGCCTGACCTGGGTGGTCAGTGCCCTGTCGGTCGGTATCGGTTTCGGTTTGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCgg < 8:301442/149‑1 (MQ=255) tCAACCTCACCAGCCTGACCTGGGTGGTCAGTGCCCTGTCGGTCGGTATCGGTTTCGGTTTGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCgg > 2:219359/1‑147 (MQ=255) tCAACCTCACCAGCCTGACCTGGGTGGTCAGTGCCCTGTCGGTCGGTATCGGTTTCGGTTTGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCgg < 1:219359/147‑1 (MQ=255) ccTCACCAGCCTGACCTGGGTGGTCAGTGCCCTGTCGGTCGGTATCGGTTTCGGTTTGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCGGGTGTc > 6:260186/1‑148 (MQ=255) gCCTGACCTGGGTGGTCAGTGCCCTGTCGGTCGGTATCGGTTTCGGTTTGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGg > 2:19040‑M2/1‑121 (MQ=255) gCCTGACCTGGGTGGTCAGTGCCCTGTCGGTCGGTATCGGTTTCGGTTTGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCGGGTGTCGAGGGTGat < 5:260186/149‑1 (MQ=255) aCCTGGGTGGTCAGTGCCCTGTCGGTCGGTATCGGTTTCGGTTTGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCGGGTGTCGAGGGTGATATccg < 1:72200/149‑1 (MQ=255) cTGGGTGGTCAGTGCCCTGTCGGTCGGTATCGGTTTCGGTTTGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCGGGTGTCGAggg > 4:62286/1‑138 (MQ=255) cTGGGTGGTCAGTGCCCTGTCGGTCGGTATCGGTTTCGGTTTGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCGGGTGTCGAggg < 3:62286/138‑1 (MQ=255) cTGGGTGGTCAGTGCCCTGTCGGTCGGTATCGGTTTCGGTTTGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCGGGTGTCGAGGGTGATATccgcc > 3:161707/1‑149 (MQ=255) cTGGGTGGTCAGTGCCCTGTCGGTCGGTATCGGTTTCGGTTTGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCGGGTGTCGAGGGTGATATccgcc > 5:228662/1‑149 (MQ=255) ggtggtCAGTGCCCTGTCGGTCGGTATCGGTTTCGGTTTGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCGGGTGTCGAGGGTGATATccgccg < 6:15827/147‑1 (MQ=255) ggtggtCAGTGCCCTGTCGGTCGGTATCGGTTTCGGTTTGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCGGGTGTCGAGGGTGATATCCGCCGCa < 7:245660/149‑1 (MQ=255) gtCAGTGCCCTGTCGGGCGGTATCGGTTTCGGTTTGCAGCAGATCGGGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCGGGTGTCGAGGGTGATATCCGCCGCATCaa < 5:265109/149‑1 (MQ=255) tGCCCTGTCGGTCGGTATCGGTTTCGGTTTGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCcagtcgccgaccttcaccgggcgctcggtcagc < 1:221224‑M1/109‑34 (MQ=255) tGCCCTGTCGGTCGGTATCGGTTTCGGTTTGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCcagtcgccgaccttcaccgggcgctcggtcagc > 2:221224‑M1/1‑76 (MQ=255) tGTCGGTCGGTATCGGTTTCGGTTTGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCGGGTGTCGAGGGTGATATCCGCCGCATCAATGTCCgcgc > 2:175688/1‑148 (MQ=255) ggtATCTGTTTCGGTTTGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCGGGTGTCGAGGGTGATATCCGCCGCATCAATGTCCGCGCCACCGAGAt < 5:53497/149‑1 (MQ=255) tATCGGTTTCGGTTTGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCGGGTGTCGAGGGTGATATCCGCCGCATCAATGTCCGCGCCACCGAGATc > 1:313072/1‑148 (MQ=255) tcggtttcggttTGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCGGGTGTCGAGGGTGATATCCTCCGCATCAATGTCCGCGCCACCGAGATCCa < 8:120580/148‑1 (MQ=255) ggtttcggtttGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCGGGTGTCGAGGGTGATATCCGCCGCATCAATGTCCGCGCCACCGAGATCCAGa < 1:175688/148‑1 (MQ=255) gtttGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCGGGTGTCGAGGGTGATATCCGCCGCATCAATGTCCGCGCCACCGAGATCCAGATGTCTGAc > 1:61102/1‑149 (MQ=255) ggtcgcagcaGAGCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCGGGTGTCGAGGGTGATATCCGCCGCATCAATGTCCGCGCCACCGAGATCCAGATGTCTGAc < 4:43776/145‑1 (MQ=255) cAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCGGGTGTCGAGGGTGATATCCGCCGCATCAATGTCCGCGCCACCGAGATCCAGATGTCTGACCGTTCCACGGTGATCGt < 2:313072/149‑1 (MQ=255) gAACTTCATTTCCTGCCTGATGCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCGGGTGTCGAGGGTTATATCCGCCGCATCAATGTCCGCGCCACCGAGATCCAGATGTCTGACCGTTCCACGGTGATCGTGc < 5:19085/149‑1 (MQ=255) gAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCGGGTGTCGAGGGTGATATCCGCCGCATCAATGTCCGCGCCACCGAGATCCAGATGTCTGACCGTTCCa > 4:236449/1‑137 (MQ=255) gAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCGGGTGTCGAGGGTGATATCCGCCGCATCAATGTCCGCGCCACCGAGATCCAGATGTCTGACCGTTCCa < 3:236449/137‑1 (MQ=255) aaCTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCGGGTGTCGAGGGTGATATCCGCCGCATCAATGt < 7:62169/101‑1 (MQ=255) aaCTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCGGGTGTCGAGGGTGATATCCGCCGCATCAATGt > 8:62169/1‑101 (MQ=255) ttCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCGGGTGTCGAggg > 5:90412/1‑77 (MQ=255) ttCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCGGGTGTCGAggg < 6:90412/77‑1 (MQ=255) tCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCGGGTGTCGAGGGTGATATCCGCCGCATCAATGTCCGCGCCACCGAGATCCAGATGTCTGACCGTTCCACGGTGATCGTGCCCAAt > 6:335082/1‑149 (MQ=255) tttCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCGGGTGTCGAGGGTGATATCCGCCGCATCAATGTCCGCGCCACCGAGATCCAGATGTCTGACCGTTCCACGGTGATCGTGCCCAATTCg > 4:315592/1‑149 (MQ=255) ttCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCGGGTGTCGAGGGTGATATCCGCCGCATCAATGTCCGCGCCACCGAGATCCAGATGTCTGACCGTTCCACGGTGATCGTGCCCAATTCg > 1:181151/1‑148 (MQ=255) cGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCGGGTGTCGAGGGTGATATCCGCCGCATCAATGTCCGCGCCACCGAGATCCAGATGTCTGACCGTTCCACGGTGATCGTGCCCAATTCGCAGt > 4:130685/1‑149 (MQ=255) cGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCGGGTGTCGAGGGTGATATCCGCCGCATCAATGTCCGCGCCACCGAGATCCAGATGTCTGACCGTTCCACGGTGATCGTGCCCAATTCGCAGt > 1:213707/1‑149 (MQ=255) aTCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCGGGTGTCGAGGGTGATATCCGCCGCATCAATGTCCGCGCCACCGAGATCCAGATGTCTGACCGTTCCACGGTGATCGTGCCCAATTCGCAGTTCAtc < 2:61102/147‑1 (MQ=255) ctgctgACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGggtcagcaggatcaggccggaaatgaagttctgcacgaactgctgcaaaccgaaaccgataccgaccgacagggcactgaccacccaggtcaggctggtgaggttgatacgc < 5:206746‑M2/147‑113 (MQ=255) gctgACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGggtcagcaggatcaggccggaaatgaagttctgcacgatctgctgcaaaccgaaaccgataccgaccgacagggca > 2:221224‑M2/1‑33 (MQ=255) gctgACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGggtcagcaggatcaggccggaaatgaagttctgcacgatctgctgcaaaccgaaaccgataccgaccgacagggca < 1:221224‑M2/109‑77 (MQ=255) ctgAGCGAGCGCCCGCTGTAGGTCGGCGACTGGGTGAGCCTGGCGGGTGTCGAGGGTGATATCGGTCGCATCAATTTGCGGGCGACCGTGATCCAGATGTGTGACCGTTCGACGGTGATCGTGCCCTATTCGGAGt < 2:56199/136‑1 (MQ=255) ctgACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCGGGTGTCGAGGGTGATATCCGCCGCATCAATGTCCGCGCCACCGAGATCCAGATGTCTGACCGTTCCACGGTGATCGTGCCCAATTCGCAGTTCATCTCGCAg < 2:213707/147‑1 (MQ=255) ctgACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCAGGCGGGTGTCGAGGGTCATATCCGCCGCATCAATGTCCGCGCCACCGAGATCCACATGTCTGACCGTACCACGGTGATCGTGCCGAATTCGCAGt > 1:56199/1‑136 (MQ=255) ccagtcgccgaccttcaccgggcgctcggtcagcaggatcaggccggaaatgaagttctgcacgatctgctgcaaaccgaaaccgataccgaccgacagggcactgaccacccaggtcaggc > 2:19040‑M1/1‑1 (MQ=255) cGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCGGGTGTCGAGGGTGATATCCGCCGCATCAATGTCCGCGCCACCGAGATCCAGATGTCTGACCGTTCCACGGTGATCGTGCCCAATTCGCAGTTCATCTCGCAGAACGTgc < 5:206684/149‑1 (MQ=255) | CCTGGCCATGTTGGTGATGTCGACCTTGCGTATCAACCTCACCAGCCTGACCTGGGTGGTCAGTGCCCTGTCGGTCGGTATCGGTTTCGGTTTGCAGCAGATCGTGCAGAACTTCATTTCCGGCCTGATCCTGCTGACCGAGCGCCCGGTGAAGGTCGGCGACTGGGTCAGCCTGGCGGGTGTCGAGGGTGATATCCGCCGCATCAATGTCCGCGCCACCGAGATCCAGATGTCTGACCGTTCCACGGTGATCGTGCCCAATTCGCAGTTCATCTCGCAGAACGTGC > NC_002947/822408‑822694 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |