New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1025969 = | 51 (0.950) | 3 (0.060) | 3/256 | NT | 5.4% | coding (999/1593 nt) | dppA‑II | dipeptide ABC transporter substrate‑binding protein |
? | NC_002947 | 1026009 = | 55 (1.050) | coding (959/1593 nt) | dppA‑II | dipeptide ABC transporter substrate‑binding protein |
TTGTACGGGCGTTGCACCGGCATGGCCCACAGGGTGATCTCGGTGCCAGGTTTGACACCCGCCTGCTGGATCAGCTGTCTGGCCTTTTCCGGCGCGTACGGGGCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCTTCCTTGTTGACCGCCATGTCCATTGCCTGGCGCACTTCCAGGCGGTCGAATGGCGGGTGCTGGGTGTTGTAGGCGATGTAGCCGAGGTTGAAGCC > NC_002947/1025823‑1026115 | ttGTACGGGCGTTGCACCGGCATGGCCCACAGGGTGATCTCGGTGCCAGGTTTGACACCCGCCTACTGGATCAGCTGTCTGGCCTTTTCCGGCGCGTACGGGGCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGc > 3:96796/1‑149 (MQ=255) ctcaaggccgacagcacgctgcaggtgctccagcaaccaggcttcaacctcggctacatcgcctacaacacccagcacccgccattcgaccgcctggaagtgcgccaggcaatggacatggcggtcaacaaggaagccatcctccaGGc > 3:51818‑M1/147‑149 (MQ=255) tcaaggccgacagcacgctgcaggtgctccagcaaccaggcttcaacctcggctacatcgcctacaacacccagcacccgccattcgaccgcctggaagtgcgccaggcaatggacatggcggtcaacaaggaagccatcctccaGGCg < 8:57163‑M1/4‑1 (MQ=255) tACGGGCGTTGCACCGGCATGGCCCACAGGGTGATCTCGGTGCCAGGTTTGACACCCGCCTGCTGGATCAGCTGTCTGGCCTTTTCCGGCGCGTACGGGGCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGtt > 7:234334/1‑149 (MQ=255) cGGGCGTAGCACCGTCTTGGCCGAAAGGGTTATCTCGGTGCCAGGTTTGACTCCCGCCTGCTGGTTCAGCTGTATGGCCTTTTCCGGGGCGTTCGGGGCGTCCTTGATGGTGTCGTCATTGGACCACTGGGTCGGTGGCATGTCGTTg < 5:12132/148‑1 (MQ=255) aCCGGCATGGCCCACAGGGTGATCTCGGTGCCAGGTTTGACACCCGCCTACTGGATCAGCTGTCTGGCCTTTTCCGGCGCGTACGGGGCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTg < 4:96796/149‑1 (MQ=255) ggCATGGCCCACAGGGTGATCTCGGTGCCAGGTTTGACACCCGCCTGCTGGATCAGCTGTCTGGCCTTTTCCGGCGCGTACGGGGCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGcc < 5:160689/149‑1 (MQ=255) ccACAGGGTGATCTCGGTACCAGGTTTGACACCCGCCTGCTGGATCAGCTGTCTGGCCTTTTCCGGCGCGTACGGGGCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCt > 3:96726/1‑149 (MQ=255) aTCTCGGTGCCAGGTTTGACACCCGCCTGCTGGATCAGCTGTCTGGCCTTTTCCGGCGCGTACGGGGCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCg < 8:175257/148‑1 (MQ=255) tcGGTGCCAGGTTTGACACCCGCCTGCTGGATCAGCTGTCTGGCCTTTTCCGGCGCGTACGGGGCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTg > 1:142248/1‑149 (MQ=255) tcGGTGCCAGGTTTGACACCCGCCTGCTGGATCAGCTGTCTGGCCTTTTCCGGCGCGTACGGGGCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTg > 6:160916/1‑149 (MQ=255) tcGGTGCCAGGTTTGACACCCGCCTGCTGGATCAGCTGTCTGGCCTTTTCCGGCGCGTACGGGGCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTg > 8:30412/1‑149 (MQ=255) ggTGCCAGGTTTGACACCCGCCTGCTGGATCAGCTGTCTGGCCTTTTCCGGCGCGTACGGGGCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTgga < 5:160916/149‑1 (MQ=255) cttcaacctcggctacatcgcctacaacacccagcacccgccattcgaccgcctggaagtgcgccaggcaatggacatggcggtcaacaaggaagccatcctccaGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTgga > 6:70680‑M1/106‑149 (MQ=255) caacctcggctacatcgcctacaacacccagcacccgccattcgaccgcctggaagtgcgccaggcaatggacatggcggtcaacaaggaagccatcctccaGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTg > 3:2799‑M1/103‑144 (MQ=255) caacctcggctacatcgcctacaacacccagcacccgccattcgaccgcctggaagtgcgccaggcaatggacatggcggtcaacaaggaagccatcctccaGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTg < 4:2799‑M1/42‑1 (MQ=255) cAGGTTTGACACCCGCCTGCTGGATCAGCTGTCTGGCCTTTTCCGGCGCGTACGGGGCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATg < 3:328214/149‑1 (MQ=255) aGGTTTGACACCCGCCTGCTGGATCAGCTGTCTGGCCTTTTCCGGCGCGTACGGGGCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTg > 8:220556/1‑129 (MQ=255) aGGTTTGACACCCGCCTGCTGGATCAGCTGTCTGGCCTTTTCCGGCGCGTACGGGGCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTg < 7:220556/129‑1 (MQ=255) gTTTGACACCCGCCTGCTGGATCAGCTGTCTGGCCTTTTCCGGCGCGTACGGGGCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCt < 8:119696/149‑1 (MQ=255) gTTTGACACCCGCCTGCTGGATCAGCTGTCTGGCCTTTTCCGGCGCGTACGGGGCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCt > 2:182264/1‑149 (MQ=255) gTTTGACACCCGCCTGCTGGATCAGCTGTCTGGCCTTTTCCGGCGCGTACGGGGCGTCCTTGATACTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCCTTGGCCCGCGTCCTCGTACACCCCCTGGAGCATGGc > 4:42701/1‑148 (MQ=255) acCCGCCTGCTGGATCAGCTGTCTGGCCTTTTCCGGCGCGTACGGGGCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCTTCCttgt > 4:295369/1‑149 (MQ=255) ccGCCTGCTGGATCAGCTGTCTGGCCTTTTCCGGCGCGTACGGGGCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCTTCCttgttg < 7:30412/149‑1 (MQ=255) ccTGCTGGATCAGCTGTCTGGCCTTTTCCGGCGCGTACGGGGCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCTTCCTTGTTGAcc < 4:96726/149‑1 (MQ=255) ctgctgGATCAGCTGTCTGGCCTTTTCCGGCGCGTACGGGGCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCTTCCTTGTTGACCg < 8:234334/149‑1 (MQ=255) gATCAGCTGTCTGGCCTTTTCCGGCGCGTACGGGGCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCGTGGAGGATGGCTTCCTTGTTGACCGCCATGt > 2:317639/1‑149 (MQ=255) tCAGCTGTCTGGCCTTTTCCGGCGCGTACGGGGCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCTTCCTTGTTGACCGCCATGTc > 2:153429/1‑148 (MQ=255) aGCTGTCTGGCCTTTTCCGGCGCGTACGGGGCATCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCTTCCTTGTTGACCGCCATGTCCAt > 1:41901/1‑149 (MQ=255) gTCTGGCCTTTTCCGGCGCGTACGGGGCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCTTCCTTGTTGACCGCCATGTCCATTGcc > 7:143970/1‑149 (MQ=255) gCCTTTTCCGGCGCGTACGGGGCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCTTCCTTGTTGACCGCCATGTCCATTGCCTGgc < 4:240437/148‑1 (MQ=255) ccTTTTCCGGCGCGTACGGGGCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCTTCCTTGTTGACCGCCATGTCCATTGCCTGgcgc < 5:122353/149‑1 (MQ=255) ccTTTTCCGGCGCGTACGGGGCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCTTCCTTGTTGACCGCCATGTCCATTGCCTGgcg > 6:122353/1‑148 (MQ=255) cTTTTCCGGCGCGTACGGGGCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCTTCCTTGTAGACCGCCATGTCCATTGCCTGGCGCa > 7:105686/1‑149 (MQ=255) ttCCGGCGCGTACGGGGCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCTTCCTTGTTGACCGCCATGTCCATTGCCTGGCGCACt < 2:142248/148‑1 (MQ=255) cGGCGCGTACGGGGCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCTTCCTTGTTGACCGCCATGTCCATTGcc < 4:91173/136‑1 (MQ=255) cGGCGCGTACGGGGCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCTTCCTTGTTGACCGCCATGTCCATTGcc > 3:91173/1‑136 (MQ=255) cGGCGCGTACGGGGCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCTTCCTTGTTGACCGCCATGTCCATTGCCTGGCGCACTTcc < 1:182264/148‑1 (MQ=255) ggCGCGTACGGGGCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCTTCCTTGTTGACCGCCATGTCCATTGCCTGGCGCACTTCCAg > 5:333065/1‑149 (MQ=255) gcgcGTACGGGGCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCTTCCTTGTTGACCGCCATGTCCATTGCCTGGCGCACTTCCAgg > 4:181260/1‑149 (MQ=255) gcgTACGGGGCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCCGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCTTCCTTGTTGACCGCCATGTCCATTGCCTGGCGCACTTCCAGGCg > 5:280200/1‑149 (MQ=255) ggCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTg < 5:217788/63‑1 (MQ=255) ggCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTg > 6:217788/1‑63 (MQ=255) gCGTCCTTGATTCTGTCGTCATAGGACGACTGGGTGGGTGGCATGGCGTTGACCGGCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCTTCCTTGTTGACCGCCATGTCCATTGCCTGGCGCACTTCCAGGCGGTCGAATgg < 3:42701/149‑1 (MQ=255) attGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCTTCCTTGTTGACCGCCATGTCCATTGCCTGGCGCACTTCCAGGCGGTCGAATGGCGGGt > 3:227710/2‑149 (MQ=255) gATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCTTCCTTGTTGACCGCCATGTCCATTGCCTGGCGCACTTCCAGGCGGTCGAATGGCGGGTGCt > 8:163416/1‑149 (MQ=255) tGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCTTCCTTGTTGACCGCCATGTCCATTGCCTGGCGCACTTCCAGGCGGTCGAATGGCGGGTGCTgg > 3:327426/1‑149 (MQ=255) tGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCTTCCTTGTAGACCGCCATGTCCATTGCCTGGCGCACTTCCAGGCGGTCGAATGGCGGGTGCTgg < 8:105686/149‑1 (MQ=255) gCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCTTCCTTGTTGACCGCCATGTCCATTGCCTGGCGCACTTCCAGGCGGTCGAATGGCGGGTGCTggg > 6:283714/1‑149 (MQ=255) cATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCTTCCTTGTTGACCGCCATGTCCATTGCCTGGCGCACTTCCAGGCGGTCGAATGGCGGGTGCTGGGTGTTGTAg > 2:230820/1‑149 (MQ=255) aTAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCTTCCTTGTTGACCGCCATGTCCATTGCCTGGCGCACTTCCAGGCGGTCGAATGGCGGGTGCTGGGTGTTGTAgg < 1:153429/149‑1 (MQ=255) aTAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCTTCCTTGTTGACCGCCATGTCCATTGCCTGGCGCACTTCCAGGCGGTCGAATGGCGGGTGCTGGGTGTTGTAgg < 1:317639/149‑1 (MQ=255) aTAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCTTCCTTGTTGACCGCCATGTCCATTGCCTGGCGCACTTCCAGGCGGTCGAATGGCGGGTGCTGGGTGTTGTAgg > 2:201350/1‑149 (MQ=255) aTAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCTTCCTTGTTGACCGCCATGTCCATTGCCTGGCGCACTTCCAGGCGGTCGAATGGCGGGTGCTGGGTGTTGTAg < 3:181260/148‑1 (MQ=255) aGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCTTCCTTGTTGACCGCCATGTCCATTGCCTGGCGCACTTCCAGGCGGTCGAATGGCGGGTGCTGGGTGTTGTAGGc > 1:13082/1‑148 (MQ=255) ggACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCTTCCTTGTTGACCGCCATGTCCATTGCCTGGCGCACTTCCAGGCGGTCGAATGGCGGGTGCTGGGTGTTGTAGGCGa < 5:106314/149‑1 (MQ=255) gggTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACTGCCTGGAGGATGGCTTCCTTGTTGACCGCCATGTCCATTGCCTGGCGCACTTCCAGGCGGTCGAATGGCGGGTGCTGGGTGTTGTAGGCGATGTAGcc > 6:220171/1‑148 (MQ=255) aTGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCTTCCTTGTTGACCGCCATGTCCATTGCCTGGCGCACTTCCAGGCGGTCGAATGGCGGGTGCTGGGTGTTGTAGGCGATGTAGCCGAGGTTGAAGcc > 7:140601/1‑149 (MQ=255) aTGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCTTCCTTGTTGACCGCCATGTCCATTGCCTGGCGCACTTCCAGGCGGTCGAATGGCGGGTGCTGGGTGTTGTAGGCGATGTAGCCGAGGTTGAAGcc > 5:219608/1‑149 (MQ=255) | TTGTACGGGCGTTGCACCGGCATGGCCCACAGGGTGATCTCGGTGCCAGGTTTGACACCCGCCTGCTGGATCAGCTGTCTGGCCTTTTCCGGCGCGTACGGGGCGTCCTTGATGCTGTCGTCATAGGACCACTGGGTCGGTGGCATGGCGTTGACCGCCCGTTGGCCGGCGTCCTGGTACACCGCCTGGAGGATGGCTTCCTTGTTGACCGCCATGTCCATTGCCTGGCGCACTTCCAGGCGGTCGAATGGCGGGTGCTGGGTGTTGTAGGCGATGTAGCCGAGGTTGAAGCC > NC_002947/1025823‑1026115 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |